PřF:C8980c Příprava proteinů - cvičení - Informace o předmětu

C8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Rozsah

0/2. blok 5 dnů. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: kz. Jiná možná ukončení: z.

Vyučující

RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C8980 Exprese a purifikace proteinů
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie. Student musí před cvičením absolvovat předmět C8980 Exprese a purifikace proteinů.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB)
• Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB, směr Bioanalytická chemie)
• Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB, směr Biotechnologie)
• Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB, směr Klinická biochemie)
• Biofyzika (program PřF, N-FY)
• Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Aplikovaná biofyzika)
• Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Molekulární biofyzika)
• Biochemie (program PřF, B-BCH)
• Biochemie (program PřF, D-BCH4)
• Biochemie (program PřF, N-BCH)
• Molekulární a buněčná biologie (program PřF, D-BI4)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
• Obecná a molekulární genetika (program PřF, D-BI4)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Ekotoxikologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie rostlin)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Student po absolvování cvičení zná základní praktické poznatky jak exprimovat a purifikovat rekombinantní proteiny, má zkušenosti s různými expresními systémy a umí použít různé purifikační metody. Během kurzu se student seznámil s různými metodami detekce a je schopen značit proteiny pro NMR analýzu nebo krystalografii.

Osnova

• 1. Strategie klonování do expresních plasmidů. 2. Exprese a purifikace scFv produkovaných do cytoplasmy nebo do periplasmatického prostoru. 3. Exprese a purifikace rostlinných proteinů (A. pET32 – thioredoxin - chaperon/B. pRSET – His.tag/ C. pET161DEST – Gate way technologie – Lumio.tag/D. pET28 – bez kotvičky.)

Literatura

doporučená literatura
• PRICE, Nicholas C. a Jacqueline NAIRN. Exploring proteins : a student's guide to experimental skills and methods. Oxford: Oxford University Press, 2009, xv, 512. ISBN 9780199205707. info

neurčeno
• Protein purification : principles, high resolution methods, and applications. Edited by Jan-Christer Janson. 3rd ed. Hoboken, N.J.: John Wiley & Sons, 2011, xiv, 517. ISBN 9780471746614. info
• HARDIN, Charles. Cloning, gene expression and protein purification : experimental procedures and process rationale. New York: Oxford University Press, 2001, viii, 435. ISBN 0195132947. info
• Guide to protein purification. Edited by Richard R. Burgess - Murray P. Deutscher. 2nd ed. Boston: Elsevier/Academic Press, 2009, liii, 851. ISBN 9780123749789. info

Výukové metody

Hlavní výukovou metodou je laboratorní cvičení, které navazuje na přednáškový cyklus předmětu s názvem Exprese a purifikace proteinu (C8980).

Metody hodnocení

Předmět je úspěšně ukončen po absolvování blokového cvičení a odevzdáním laboratorních protokolů, které byly schváleny vyučujícím.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

• Statistika zápisu (podzim 2014, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2014/C8980c