PřF:Bi7420 Metody analýzy genomu - Informace o předmětu

Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu

Rozsah

1/0/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

MVDr. Boris Tichý, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D. (přednášející)
prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Lenka Humpolíková Adámková, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Terézia Kurucová (přednášející)
Mgr. Filip Pardy (přednášející)
Bc. Jana Jedličková (pomocník)

Garance

MVDr. Boris Tichý, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 15:00–16:50 B11/305

Předpoklady

Bi1700 Buněčná biologie && ( Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie ) && ( Bi4020c Molekulární biologie - cv. || Bi6400 Metody molekulární biologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 40 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 2/40, pouze zareg.: 0/40, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/40

Mateřské obory/plány

• Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, N-LGM)
• Lékařská genetika a molekulární diagnostika pro odborné pracovníky v laboratorních metodách (program PřF, N-BI)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-MBG)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen s orientovat v moderních mmolekulárně-biologických metodách a vysvětlit principy čipových technologií a sekvenování nové generace

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - aplikovat metodu CRISPR ve svém výzkumu - popsat princip sekvenování nové generace - navrhnout experiment s využitím sekvenování nové generace - analyzovat data získaná sekvenováním nové generace

Osnova

• 1. Microarrays - technologické aspekty čipových technologií; expresní, CGH, SNP čipy, resekvenační, a proteinové čipy 2. Sekvenování nové generace (NGS) – technologické aspekty různých NGS platforem 3. Příprava knihoven pro sekvenování nové generace 4. Metody pro analýzu nekódujících RNA – miRNA, lncRNA, příklady využití v onkologii 5. Analýza dat – bioinformatické přístupy a statistické metody hodnocení 6. Aplikace - Využití čipových a NGS technologií, design experimentů

Literatura

• Koubková L, Vojtěšek B, Vyzula R. Next generation sequencing -  application in clinical practice. Klin Onkol. 2014;27 Suppl 1:S61-8.

Výukové metody

Teoretická příprava.

Metody hodnocení

písemný test

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (podzim 2021, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2021/Bi7420