PřF:Bi7921 Pokročilé zpracování biol. dat - Informace o předmětu

Bi7921 Pokročilé zpracování biologických dat

Rozsah

0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.

Vyučující

Ing. Marek Brabec, PhD. (přednášející), prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (zástupce)
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

( Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biology ) && Bi7920 Analýza dat
Základní biostatistické metody, obecný lineární model, zobecněný lineární model.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20

Mateřské obory/plány

• Biosystematika rostlin (program PřF, N-BOT)
• Botanika (program PřF, D-BI4)
• Ekologie (program PřF, D-BI4)
• Fykologie a mykologie (program PřF, N-BOT)
• Fyziologie živočichů (program PřF, D-BI4)
• Hydrobiologie (program PřF, D-BI4)
• Parazitologie (program PřF, D-BI4)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
• Zoologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, N-ZOL)

Cíle předmětu

Cílem přednášky je představit vybrané metody pokročilé analýzy dat, zaměřené na analýzu dat s korelacemi.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - charakterizovat metody GLS, LME a GEE - sestavit lineární prediktor z dostupných vysvětlujících proměnných - navrhnout správný experimentální design - aplikovat uvedené metody na data

Osnova

• 1) Korelované data. 2) Experimentální design: Nested, Split-plot, Pseudoreplikace. 3) Analýza časových řad. 4) Prostorová analýza. 5) Smíšené modely: GLS, LME a GEE. 6) Fylogenetické korekce.

Literatura

povinná literatura
• Pekár S. & Brabec M. 2012. Moderní analýza biologických dat. 2. Lineární modely s korelacemi v prostředí R. Masaryk University Press, Brno.

Výukové metody

Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů.

Metody hodnocení

Ústní zkouška.

Informace učitele

Literatura: Pekár S. & Brabec M. 2012. Moderní analýza biologických dat. 2. Lineární modely s korelacemi v prostředí R. Masaryk University Press, Brno.

Další komentáře

Předmět je vyučován jednou za dva roky.
Poznámka k periodicitě výuky: jarní semestr lichých let.
Výuka probíhá každý druhý týden.

• Statistika zápisu (jaro 2021, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2021/Bi7921