Ústav výpočetní techniky
Masarykova univerzita
Botanická 554/68a
602 00 Brno
Telefon: 549 49 2100
E-mail: info@ics.muni.cz
Interim projekt: Úpravy a produkční instalace systému pro práci s
neurovědními daty.
Představení partnera
Ústav výpočetní techniky (ÚVT) je zodpovědný za rozvoj informačních a komunikačních technologií na
Masarykově univerzitě. Zabýváme se výzkumem a vývojem v oblasti IT (digitální knihovny, healthware, rozsáhlé
distribuované systémy, zpracování multimédií) a zajišťujeme také každodenní provoz IT služeb MU (systémy pro
kontrolu přístupů do budov, monitorování počítačových učeben, správu uživatelských účtů a další). Součástí ÚVT
je rovněž Centrum CERIT-SC pro podporou náročných výpočtů.
Cíle projektu
Pro neurovědný program CEITECu je třeba zajistit databázovou aplikaci pro ukládání medatat k nabíraným
experimentálním datum. V současnosti se záznamy vedou ručně, tento přístup ale již naráží na své meze.
Volba skupiny padla na systém XNAT: neuroinformatickou platforumu zaměřenou na schormažďování a práci s
neurověeními daty (převážně magnetická rezonanceé, která umožňuje mimo jiné řídit přístup, pracovat s daty v
úložišti PACS, a napojení na výpočetní zdroje pro dávkové zpracování analýz, viz http://www.xnat.org/case-
studies/institutional-repositories.php.
Před ostrým nasazením bude třeba systém upravit podle specifických požadavku naší skupiny. Systém je
implementovaný v jazyce Java a dusledně využívá XML pro definici datového schématu (které bude třeba
upravovat) a Apache Turbine model-view-controller pro prezentaci (do nějž bude také třeba zasáhnout).
Náplň práce
Konkrétní obsah bude postupně upřesňován diskusí s uživateli, bude ale třeba implementovat minimálně tyto
změny:
 možnost přidávat a editovat anotace k jednotlivým záznamum
 přidávat popisy experimentálních zařízení
 upravit generování unikátních identifikátoru tak, aby s nimi bylo možno pracovat i ručně
 rozšířit datový model o souběžná měření více modalitami (EEG+fMRI, EEG+EEG, ...)
Diskuse o zadání je vedena na https://groups.google.com/forum/#!topic/xnat_discussion/N34ewbFO2uE