22.2.2006 Zaměření a zpracování bakalářské práce Napsat dobrý vědecký text je umění svého druhu. Napsat první vědecký text je vůbec nejtěžší. „Vždyť ti, kteří budou usilovat o dokonalost, i když jí nedosáhnou, přece jen dojdou výš než ti, kteří se předem vzdají naděje, že by mohli dospět, kam by chtěli, a zastaví se hned dole. Nenajde se nikdo, kdo by vzdor úsilí nedosáhl ničeho." (M.F.Quintilianus) Zaměření a zpracování bakalářské práce 1) Co bude obsahem přednášky a cvičení 2) Literatura, podmínky zápočtu 3) Vědecká komunikace O čem to bude a o čem to nebude neexistuje model, podle něhož lze napsat úspěšnou bakalářskou práci nebo jiné vědecké sdělení Souhrn poznatků a doporučení Má to vůbec smysl? Jakou hodnotu mají taková doporučení: - specifika odborného textu - uplatňování pravidel a doporučení pak vede k postupnému zdokonalení, a to i v neodborném vyjadřování - ovládneme práci s textem (psaným i mluveným) - tvorba textu podle příjemce, logika textu, obsah sdělení, gradace, konečné sdělení „vědecká komunikace" Záplava informací a doporučení Co s tím budu dělat? 1. fáze: „začátečník" Informace na přednáškách a cvičení - zapamatuj, kde děláš chyby. 2. fáze: „pokročilý začátečník" Během tvorby textů „odříkávej desatera" 3. fáze: „téměř profesionál" Pečlivě pročítej prezentace z přednášek a dopiluj zbylé nedostatky Nikdy však nebudeš dokonalý. Neustále je potřeba na sobě pracovat. Čtenáři to ocení. Sylabus přednášky Oiientaciií plán prednášky vi úkolů: 1. Úvod, Vedecká komunikace 2. Prameny odborné literatury (typy vedeckých článků, vedecké články a internet) 3. Prameny odborné literatury (internetové zdroje, databáze, strategie hledání) 4. Prameny odborné literatury (získávání vedeckých článků, práce s literaturou) 5. Technika psaní, struktura bakalářské práce 6. Zpracování textu (odstavce, tvorba textu, kompozice textu) 7. Zpracování textu (pišme česky, nejčastější textové chyby) 8. Přehl e d lite ratury a její c itac e 9. Přílohy, grafické úpravy, psaní posudků 10. Rozbor BP1 aBP2 11. Posudky a obhajoba bakalářské práce 12. Zaměření bakalářské práce na Katedře genetiky a mol. biologie 13. Zápočet Cvičení - 15. a 22.3. - vyhledávání článků na internetu + dle požadavků Semestrální úkoly 1) Přečtení a zhodnocení vybrané bakalářské práce (BPl) 2) Vyhledání 2-3 odborných článků 3) Přečtení a vypracování posudku na vybranou bakalářskou práci (BP2) 4) Sepsání „malé bakalářské práce" IS - „Organizační pokyny k výuce" Plán uřednáškv a úkolů (časová osal Časovv olán a ookvnv k woracování úkolů Podmínky zápočtu - účast, vypracování úkolů Materiály na ISu Literatura JAK jJôCll »CADE«,» a přednášet o vede ZDENEK ŠESTÁK Academia, Praha 2000 LEDA Praha 1999 BÍ7401 Zaměření a zpracování diplomové práce - zimní semestr 1.ročníku magisterského studia - specifika diplomové práce - příprava ústní prezentace - základy správného přednášení (rétoriky), obhajoba DP - jiné formy vědecké komunikace - poster, žádost o grant atd. Základy vědecké komunikace Proč je důležitá komunikace - praktický pokus - komunikace je oboustranná - i u psaného textu komunikace se čtenářem Druhy vědecké komunikace: - ústní (rozhovor, přednáška, diskuse) - už v antice - dopisy (klasické, email) - publikace (knihy, časopisy - od 17. st., internet - od 20. st.) - plakát (poster) - populárně-vědecké sdělení (knihy, časopisy, TV pořady) - REKLAMA - musíme se naučit vědu podat srozumitelně nejen veřejnosti, ale i sponzorům - příliv financí Základy vědecké komunikace - správnému vyjadřování je třeba se naučit, aby nám posluchač nebo čtenář rozuměl, mějte tedy stále na paměti následující sdělení a vyvarujte se jeho dodržování: Jedině ten, kdo má absolutní znalost o zkoumaném jevu, může jej vysvětlit tak, aby jej nikdo jiný nepochopil. v USA - eseje, univerzitní kurzy, nezávislé kurzy, povinná výuka vědecké komunikace jako oboru v Evropě se v posledním desetiletí rozvíjí, uznána již jako obor Základy vědecké komunikace Proč je pro nás tato komunikace tak důležitá? Publikovat, publikovat, publikovat - „Publish or perish"; „Work, finish, publish" i Obr. 1.1. Nepublikovaná veda není řádnou védou. I kdyby badatel bádal sebevíce, jeho knihy a protokoly pokusů nakonec obmotají pavučiny, seíerou myši a výsledek je nulový. - jen známé mezi ostatními vědci může vést k pokroku (př. J.G.Mendel) „Ve vědě získá důvěru ten, kdo přesvědčí svět, ne ten, koho ta myšlenka napadla jako prvního" (A.F.Darwin) „Blázen sbírá fakta; chytrý je třídí" (A.J.W.Powell) Komunikace mezi vědci je nezbytná jako v každé jiné oblasti lidského života. Základy vědecké komunikace Vědecká komunikace - obor shrnující vědecké písemnictví, řečnictví a popularizaci přibližující se současnému rozvoji informační techniky Hovorový jazyk x jazyk vědy Jazyk vědy - normy, závazné modely vyjadřování atd. = nezáživný informativní styl (minulost) Vědecká komunikace - má více rétorický styl - nejde již o kázání pravdy, snaha vyvolat u (současnost) čtenáře pocity a emoce - snaha zaujmout - vychází to z mluveného slova, jehož význam v posledním století získal na významu (média) Základy vědecké komunikace Význam vědecké komunikace vzrůstá v současnosti, v éře internetu - rozhodující je rychlost a přesnost 21. století Nadbytek informací (nepřeberné množství časopisů, publikací, poznatky na Internetu) Příčiny: _ specializace jednotlivých oborů - velká vědecká centra bez hranic, nadnárodní výzkum, virtuální laboratoře - rychlá výměna poznatků, rychlý vývoj laboratorních přístrojů a laboratorních technik Důsledkem je zdvojnásobení počtu vědeckých publikací každých 15 let - v 90. letech 20. století vzniklo půl milionu nových článků, celkem jich bylo napsáno něco kolem 1 milionu) - v posledních letech vychází více než jeden milion článků ročně Řešení: schopnosti vyznat se v záplavě informací umět j e zpracovat komunikovat maximálně stručně a přesně Základy vědecké komunikace Jazyk vědy musí být univerzální pro zjednodušení komunikace - řečtina, latina, diplomatická francouzština, národní jazyky (19. a 20. století), ve druhé polovině 20. století se ustaluje angličtina. Angličtina - Basic English - kombinací základního jazyka s odbornými termíny (často odvozenými právě z angličtiny) se lze poměrně srozumitelně dorozumět - "latina současnosti". „Desatero" o psaní odborného textu: Pravidlo první: Dobře psaný text nezachrání špatnou vědu, ale dobrou vědu může zničit špatně napsaný text. Pramenv odborné literatury a ieiich zoracování Obsahová část BP - literární prameny a jejich zpracování Formální část BP - struktura, obsahová a jazyková správnost textu, citace a přehled literatury, grafická úroveň Pramenv odborné literatury a ieiich zoracování 1) Historie a současnost vědeckých časopisů 2) Jak vypadají články - druhy a struktura 3) Kde je hledat - knihovny a internet 4) Jak vyhledávat časopisy a články na internetu - databáze 5) Jak postupovat při vyhledávání literatury - kde začít a jak dál 6) Jak získat vyhledanou literaturu 7) Práce s literaturou - zpracování rameny odborne literátu Pravidlo druhé: Základem vědecké práce je studium literatury. ?? Proč ale číst něco, co již bylo objeveno ?? - neopakovat stejný pokus se stejným materiálem - vlastní nové nápady a myšlenky - správné postupy vedoucí k výsledku, styl odborného textu - nelze napsat vědeckou práci Zdroje: - ustni - psané - knihy, časopisy - elektronické - internet Pramenv odborné literatur Historie a současnost vědeckých easonisü 17. až 19. století - časopisy obecně vědecké - přírodovědné časopisy 19. století - specializace na obory - botanika, zoologie, matematika, chemie doposud - další specializace - např. anatomie, fyziologie, genetika fotosyntéza, učení a paměť (1665 F, VB) (1820) !!! Při vyhledávání starších ročníků - u časopisů s dlouhou historií mohlo dojít ke změně jeho názvu např. Plant Physiology and Biochemistry se dříve jmenoval Physiologie vegetable nebo Journal of Plant Physiology dříve jako Zeitschrift für Pflanzen-physiologie - 70. léta 20. století - „Studia Biophysica" zveřejňuje články jen jako mikrofiše (zmenšeniny na plochém filmu, lze číst pouze ve čtecím přístroji), v tištěné verzi jen rozšířená abstrakta konec 20. století - CD-ROM - cena stejná jako u tištěné verze, sleva při odběru obou (European Journal of Biochemistry) časopisy se začínají objevovat na internetu -jen obsah - spíše reklama = bezplatná služba, později kompletní přístup = placená služba Pramenv odborné literatur Pramenv odborné literatur Pramenv odborné literatur nemá shrnující charakter oproti review podává zprávu (protokol) o konkrétním výzkumném úkolu s konkrétními cíly a závěry struktura takových článkuje pevně daná: Nadpis (Title) Jména autorů s adresami Abstrakt (Abstract) Uvod (Introduction) Materiál a metody (Materials and Methods) Výsledky (Results) Diskuse (Discussion) Poděkování (Acknowledgements) Seznam literatury (References) TAIMRD x IMRAD -jsou ale i odchylky dle zvyklostí časopisu - - Materials and methods na konci článku (Cell) - Results and Discussion společně (viz. IMRAD) - + Summary na konci článku (nebo součástí Diskuse - Key words pod abstraktem Pramenv odborné literatur Co naideme v iednotlivvch částech Nadpis (Title) - vypovídá o obsahu samotné práce - hledání a výběr článku na základě slov uvedených v nadpise + o čem článek je F/ÍÍGZDAIndependeiit Variation iii Flowering Time of Natural Aixibid&psh iíutiimia Accessions Jonathan D. Werner,*4 Justin O, Borevitz,*'^ N. Henriette Uhlenhaut,*'1 Joseph R. Ecker,*& Joanne Chory*-** and Detlef Weigel*tti *Plant ütology Laboratctn, The Salli Instttute far Hi »logical Studies, Lajalla, California 92037, *Department nf Btalogy, University of Catijtmmta, San Diego, Ctdijarnia 9203.%, iDef>an'mgi?t af Ecology and Evolution, University aj Chicago. Chicago, Illinois 60637, ^Salk Institute, Genome Analysis Laboratory, La f alia, California 92037, ** Hmvarfl Hughes Medical Instituty-, The Salli Im titule for Btolngicid Studies, La [alia, California 92037 an ď*Departvteiit nj Molecular Biology, Mux Planch Institute for Divelaptiiental htcAagy, 72076 Tübingen, (Jermany Manuscript received September 20, 2004 Accepted for publication January 3. 2005 ABSTRACT FRICIDA {FRI) AnuFLOWFRINGLQCUSCAFLQ are two genes that, unäess plants are vernalized, greatly delay flowering time in Ambidopxis thahana. Natural loss-of-function mutations in FRI cause the early flowering growth habits of many A. tktdiana accessions. To quantify the variation among wild accessions due to FRI, and to identify' additional genetic loci in wild accessions that influence flowering time, we surveyed the flowering times of 145 accessions in long-day photo periods, with and without a 30-day vernalization treatment, and ge no typed them for two common natural lesion i in FRI. FRI is disrupted in at least 84 of the accessions, accounting for only ^40% of the flowering-time variation in long days. During efforts to dissect the causes for variation that are independent of known dysfunctional FRI alleles, we found new loss-of-function alleles in FLC. as well as late-flowering alleles that do not map to FRI or FLC An FIX. nonsense mutation was found in the early flowering Yan-0accession, which lias otherwise functional FRI. In Contrast, Lz-0 flowers late because of high levels of FLC expression, even though it has a deletion in FRI. Finally, eXtreme array mapping identified genomic regions lín ted to the veru aliľa.tion-independent. late-flowering habit of Bur-0. which has an alternatively spliced FLC, allele that behaves as a null allele. Pramenv odborné literatur Co naideme v iednotlivvch částech Jména autorů s adresami - lze využít při objednávání článku, případně při vyhledávání dalších publikací podle jména autora F/ř/GZDAIndependent Variation iii Flowering Time of Natural Aixibid&psh iíutiimia Accessions Jonathan D. Werner,*4 Justin O, Borevitz,*'^ N. Henriette Uhlenhaut,*'1 Joseph R. Ecker,*& Joanne Chory*-** and Detlef Weigel*tti *Plant ütalogy Laboratctn, The Salk fnstttute far Hi »logical Stitdies, Lajnllas California 92037, *Department nf Btalogy, University of Catijtnmta, San DiKgv, Ctdijarnia 92037s iDef>an'mgi?t of Fcalogy and Fcalutian, University aj Chicago. Chicago, Illinois 60637, ^Salk Institute, Genome Analysis Laboratory, Lajnlla, Cn-Ufomia 92037, "* Tlaioard Hughes Medical Instituty-, The Salli Institute for Btolngicn? Studies, La [alia, California 92037 and** Department nj Molecular Biology, Mux Planch Institute far Develapiwntfd htrAagy, 72076 Tübingen, (Jermany Manuscript received September 20, 2004 Accepted for publication January 3. 2005 ABSTRACT FRICIDA {FRI) AnúľLOWlilUNGLQCUSCAFLQ are two genes that, unäess plants are vernalized, greatly delay flowering time in Ambidopxis thaHana. Natural loss-of-function mutations in FRI cause the early flowering growth habits of many A. tktiliana accessions. To quantify the variation among wild accessions due to FRI, and to identify additional genetic loci in wild accessions that influence flowering time, we surveyed the flowering times of J 45 accessions in long-day photo periods, with and without a 30-day vernalization treatment, and ge no typed them for two common natural lesion i in FRI. FRI is disrupted in at least 84 of the accessions, accounting for only ^40% of the flowering-time variation in long days. During efforts to dissect the causes for variation that are independent of known dysfunctional FIU alleles, we found new7 loss-of-function alleles in FLC. as well as late-flowering alleles that do not map to FRI or FLC. An /■"/.(. nonsense mutation was found in the early flowering Yan-0accession, which has otherwise functional FRI. In Contrast, Lz-0 flowers late because of high levels of FLC expression, even though it has a deletion in FRI. Finally, eXt rente array mapping identified genomic regions lín ted to the vern alization-independent. late-flowering habit of Bur-0. which has an alternatively spliced FLC allele that behaves as a null allele. Pramenv odborné literatur Co naideme v iednotlivvch částech Abstrakt (Abstract) - nejdůležitější částí - výstižně sděluje co a na čem se zkoumalo, jakých bylo dosaženo výsledků a co z toho vyplývá (závěr) = strukturovaný F/ř/G/DA-Independent Variation iii Flowering Time of Natural Arabidopsis ihcüiana Accessions Jonathan D. Werner,]M Justin O. Borevitz,*^ N. Henriette UhIenha«tf*J Joseph R. Ecker, *5 Joanne Chory*1** and Detlef Weigel*ttí * Plant Biology Laboratory, The Salit Institute for litrtiagia.it Studies, Lafollas California 92037, *Department of Biology, University af Ctúijarnta, San Diego, California 92037s iOef>artmer/t of litnlogy and Fi>olutton, University af Chicago. Chicagu, IHttiais 60637, ^.Salh institute, Genome Analysis Ln f juratory, La folia, California 92037, '** Howard Hughes Medical Institute, 'The Satli institut? for Biological Studies, La, folia, California 92037 a,ndMDtif>a,rtiiu'nt of McJ-ecular Biology, Max Planch institute far Develop mental Rtdogy, 72076 Tübingen, Germany Manuscript received Septem bet" 20, 2004 Accepted for publication January 3, 2005 ABSTRACT FPJGIDA (FRI) and FLOWFRING LOCUS C (FLQ are two genes that, unless plants are vernalized, greatly delay flowering time in Arabidop.si.s thahana. Natural loss-of-function mutations in FRI cause the early flowering growth habits of many A. tk/diana accessions. To quantify die variation among wild accessions due to Fill, and to identify additional genetic loci in wild accessions that influence flowering time, we surveyed the flowering times of 145 accessions in long-day photo periods, with and without a 30-oľ et al. 200H. The study of floral induction in A. thaliana lias long Sequences data from this article have been deposited Tvitb Lne EMBI./ GenBiink Data U brinies undo" arcLsnion nos. AT/78lí)06-AY7BíiQfífi. ATO499S5J-AYSMM2, Ä5ŕS54971. Ä\WAÍ12, and AH0HSft6. 1 P/rsent oŕŕŕÍJEť.i'EMRL, Mejnerhctfsuaase 1, D-Ů9117Heidelberg, Germany. -CtinmfHmding twtksr. MPI for Developmental Biology, Spemamis-IraFSf S7-SÍ», D-7207li Tübingen, (Germany. H-inaili WĽigelíŠPwtígľlworld.org been approached through the isolation and characterization of mutants with altered flowering times. A large number of flo we ring-time genes have been identified and a scaffold of the underlying molecular network has been constructed (for review, see Mou RÁDOV et al 2002; Sim ['HON and Dean 2002; Siláku: and Con'land 2004: Sung and Amasino 2004). As may be expected, this network is complex. On the basis of an extensive body of physiological, genetic, and molecular studies, four main pathways that regulate the key flora] identity genes have been outlined: photoperiod, vernalization, autonomous, and gibberellin. The photoperiod pathway utilizes photoreceptors in conjunction with the circadian clock to strongly accelerate flowering in the presence of long-day photoperiods. Flowering is also accelerated when plants with high levels of the flora] inhibitor FLC are exposed to an extended period of winter-like temper a tit res. This process, called vernalization, causes epi-genetic silencing of the FLC locus and thereby relieves repression of flowering. Independently of vernalization, FLCh also negatively regulated by the autonomous pathway, which was originally thought to function independently of the environment. Recently, however, it has been found that this pathway may also mediate response to ambient growth temperature f B LA/QUIZ et al 2003). Renclio! 110: 1 ĽJ7-1207 (July 2005) Co naideme v iednotlivvch částech Pramenv odborné literatur používají MATERIALS AND METHODS Plan( material: A list of accessions and their phe noty pes can be found a.t http://natura Ivariation.org/werner. Most accessions were obtained from the Arabidopsis Biological Resource Center or Lehle Seeds. The LrrKand CviK accessions are parents of the Lw/Cvi recombinant inbred line set in which the EDI allele of CRY2via.s identified (El-Assal et hL 2001J and were kindly provided by Maarten Roornneef (Wageningen, The Netherlands). Combinations of Functional and nonfunctional i'Ri and FLC alleles in Col (I.o: ft al. 1994b: MirmAY.LS. and Amasino 2001) were kindly provided by Rick Amasino (Madison. Wl). All lines were propagated prior to genotypic and phenotypic analysis. Growth conditions: Seeds were suspended in 1 ml of 0.1% phytagar fInvitrogen. San Diego) a.nd imbibed at 4Ú in darkness for 4 days. Seeds were then sown onto presoaked Sunshine Mix no. 5 (McConkey, Garden Grove. CA) and thinned after 5 days. Plants were grown in a growth room at 2T under 16 hr of light provided by a 3:1 mixture of Cool-white ajid Cro-Lux (Syivania) fluorescent bulbs, followed by S hr of darkness. For the long-day surveys, six plants for each line were raised in one pot, except for several control genotypes grown in three blocks of six plants. Over the course of the experiment, the pots were randomized across all flats several times and flats were rotated across and between shelves on a daily basis. Vernalization treatments were performed at the seedling of Col, and two replicates each for the early and late-flowering pools. Analysis of the hybridization data was similar to that described previously (Wolyn et at 2004), For the Bur-0 X fk-% F, population {n = 330), the 05 earliest and the 65 latest plants, as measured by days to flowering were pooled and processed similarly. A total of eight samples were prepared and hybridized: three replicates of Eur-0 and fieri and one sample each for the pools. Lz-0 X Ler QTL mapping: A total of 178 F? plants from the cross of Lz-0 to Lew were grown in long days and genotyped for 32 markers distributed across all five chromosomes with an average distance of 15 cM, and a genetic map was determined using MapMaker/EXE13.0 (Laniiľh ft ei. 1987). Marker order was as expected from the physical locations of the markers in the Col reference sequence. For QTL analysis presented in the text, composite interval mapping was performed with QTL Cartographer l.lGc (Has [kn fit eiL 2002) using model 0 with a window size of 4.00 RESULTS Association of FBI deletions with flowering-time effects: We measured the flowering limes of 145 single-seed descent accessions in long-day photoperiods and genotyped them for the Col and Lei" FRI deletions. As observed in previous surveys (JüllANKUN et al. 2000; l.v. Corri: et al. 2002; Štinghcombe et al. 2004), the FRI deletions first described in the Col and L er laboratory strains occur with considerable frequency among accessions, with 34 having the Lfr-type and 46 the Col-type deletion (Figure 1). No accession has both deletions, as expected due to their vei"y tight linkage (253 bp). The effect of these deletions on flowering was obvious, 200 12 10 e E 4 2 D « t2 .2 tO (n jj__8 J. D. Werner ä al. A JMI 11 rp n n.-irrrl II B 1 is likely identical to *Indel2" found in the BUI accession (Is. Corkk et f d. 2002). Accession Or-0 was found to have a novel 1-bp deletion in exon 2 of FRf, causing a frameshift in the coding sequence that leads to a premature stop codon. While we found variation at the nucleotide and amino acid level in the remaining seven early accessions [Da(i)-12, Dra-0, Est, Shahdai a, Van-0, Wa-1, Willi, none had Pramenv odborné literatur Co naideme v iednotlivvch částech Diskuse (Discussion) - diskutuje - kriticky hodnotí a porovnává výsledky s výsledky jiných autorů a hypotéz - ověření správného pochopení obsahu abstraktu - uvádím citaci ve správném kontextu? DISCUSSION Previous studies of natural variation in flowering time in A. thalifma either have focused on a small number of accessions {?..£■> Cazzaní et al. 2003) or did not include genetic analyses (e.g., STlNCllfJOMBE et al. 2004). Here, we examined variation of flowering time in a large collection of single-seed descent accessions available from stock centers. We have confirmed and extended previous observations regarding the frequency and magnitude of effect of two natural FATdeletion s. Furthermore, we not only have estimated the extent of variation likely to be due to genetic loci other than FRl, but also have carried out initial genetic and molecular analyses of accessions that have interesting flowering phenotypes with respect to their genotype at FRL With the identification of the O r-Oßri allele, there are now at least 10 different mutations known to disrupt the F/tf coding region (Joiianson et til. 2000; Le Corre et al. 2002 ; Gazzani et)d 2003). At least 84 of the 145 accessions that we surveyed carry FR! loss-of-function alleles, with the Col and L er deletions being, by far, the most prevalent. At a minimum, the presence or absence of natural fri alleles are responsible for 40% of the variation in long-day flowering time seen in our experiment.. Pramenv odborné literatur Co naideme v iednotlivvch částech LITERATURE AljQNSO-BlANGO. C,P S. E, El-Auk AL, G, GoiJťl.ANH and M. KtJOHNNhJJ-", 1998 Analysis of namral allelic variation at flowering nine loci in ihe I^andsbcrg ŕnerta and Cape Verde Islands etotypea oi'Amlri- dapsis thaliová. GĚrtéUtí 149: 719-764. Bas-íxn, C.]., B. S. Weir and Z-B. Zľng, 2002 QTL Carljcigrnplicr. Version l.lb\ Department, of Sialiades, Nonh Carolina State Uni- u'ľsiiy. Rnlí'i^hj NC, liiAzqutJC, M, A., J, H. Ahn and D. Wľigel, 200ÍJ A Lbcrmoaensory pathway comrolling flowering ijme in Ambkíafisis iheitiamt, NaL GeneL 33: 168-J7L Woreyitz, jt O^J, N, Malooi, J, Lutes, T. Dadi, J. L Rednern el aL> 2002 Qu an diali ve trak loci controlling light and lioiTnonc response in two accessions of Ambidopúa tkfíUajia. Generics 160: 65 3-ť©6, Horevitz, L 0„ D, Liang, D, Plouffe, IL-S. Ceiang, T. Zwn pŕ ň£. 2003 Large-scale identification of single-feature po lymo i phisms in cpnaptes genorrwa. Genome Res- 13: 513-^23. ClarkeJ. H.. R. Mitukn,J. K. M, Brown and C. Dean, 19í>E QTL analvsis of f lowering ume in Arážiujktp&th&ki&m. MoL Gen. Genet 248: "27fL2iSe. El-Assal, lS. E,-Du C. Alqnso-Wi.angcí. A, J, PEifrERSj, V. Raz and M. KooRNNi:Ľt-"4 2001 A QTL, for Flowering dme in Avab'trfupsis reveal.H a no«-1 allele of CRY2, NaL Cene L 29: 435-440. Cazíani, S., A. R Gunľall. C. Lister and C. Dlah, 2003 Analysis of die molecular basis of iloweiing lime variation in Arabulop.m accessions. Plam PliwioL 132: I HIT-1 I 1-1. Pramenv odborné literatur Co naideme v iednotlivvch částech Vvznam (shrnutO: - dle nadpisu vyhledávám - dle abstraktu se rozhoduji, zda článek objednám - na základě rychlého čtení (obrázky a tabulky s příslušnými popiskami) se rozhoduji, zda-li má pro mne článek nějaký význam a zda budu číst dál Pramenv odborné literatur - podává přehled o současném stavu problému na základě již publikovaných článků - shrnující review nebo informuje o hlavních oblastech pokroku, ukazuje budoucí směr výzkumu, vytyčuje nové hypotézy - ideální přehled literatury skloubí oba typy dohromady - existují ještě další typy přehledných referátů a také tzv. minireview Pramenv odborné literatur r - člení se na: Úvod (Introduction), vlastní text členěný na kapitoly, Závěr (Shrnutí), příp. Závěr a nastínění budoucnosti; součástí může být i abstrakt Severe acute respiratory syndrome (SARS)—paradigm of an emerging viral infection* A. largeril-*,C"h. Droslcnb, It.W. Doerr\ M Stürmer1, W. Preiser3 1 Jyuiilittejbr iWŕtÄrcrJ FSfrrfnfiy, .kihůun ffíAfgwg Gntihd University Hospital Paul Ehrlich Sir er t-4Ů. tJ-ÓQSVó FwdtikJKrl a. M., (íem/utn * Jft-Tfíitíiitf täx-íjf iitettftUťJiw Tropical Mddiritw, Hamburg, Genjfttsy Accepted 9 M arch 2 003 AhsIľiLťt An acute mid often severe respiratory illness emerged in acuftiHD China in late 2002 and rapidly s plead to different areas of the Fax East as well as several countries around tine globe. When the outbreak of this apparently novel infectious, disease termed severs acute respiratory syndrome (SARSl came to an end in July 200}, it had caused over S000 probable cases worldwide and more than 700 deaths. Starting in March 2003. the World Meal tli Organization [WHO) organised an unprecedented international effort by leading laboratories working together to find the causative agent. Little more than one week later, three research groups from this WHQ-eoordinated network simultaneously found evidence of a hitherto unknown Coronavirus in SAUS patients, tiling different approaches. After Koch's postttlate&had been fulfilled, WHO officially declared on ] 6 April 2003 that this vims never before seen in humans is the cause of SARS. Ever since, progress anoundSArlS-associaťedconjnavirus (SARS-CoV) has been swifl. Within weeks of the first isolate being obtained , its complete genome was sequenced Diagnostic teats based on the detection of SARS-CoV RNA were developed and made available freely and widely: nevertheless the SARS case definition still remains based on clinical and epidemiological criteria. The agenr/seuviromuental stability, methods suitable for inactivntiou and disinfection, and potential antiviral compounds liave been s tud i ed. and development of vaccines and immune therapeutics is ongoingL Despite its grave consequences in humanitarian, political and economic terms, SARS may serve as an example of how much can be achieved through a well-coordinated international approach, combining the latest technological advances of molecular virology with more "traditional" techniques carried out to an excellent standard, ■£■ 2003 Elsevier B. V. Al 1 rights reserved KEyVowtb: Stvcrc acul c respiratory syndrome "SARS): Corona vi ma; SA-RS-associabed Coronavirus i'SARS-CoV]: Laboratory diagnosis; Trans mission: Emending infection: Epidemiulogry: Antiviral b^ajnunitj World Health Organization I WHO} I. InŕľG-duťtion Severe acute respiratory syndrome (SARS) is tlie latest in a series of emerging infectious diseases., and certainly one of the most widely publicised. This acute and often enormous scales, and when the disease's ability to spread to distant areas within a very short period of time became obvious (World Health Organization. 2003d). A definition was developed for suspected and probable SARS cases, based on clinical and epidemiological criteria: it has since 2. Search for the tausative a*cnt On 17 March Z&Ö3-, the WHO set up a worldwide network of virological laboratories investigating SARS cases (World Health Organization* 2003a], The hivestigations coaducted by the members of these networks wiere coordinated bv WHO's Department of Communicable Disease Surveillance and Response (CSR) through normally daily telephone conferences and a password-protected internet website. Tims results and planned further studies were communicated and views and comments exchanged almost in :ireal-Linie " which made possible Hie rapid progress in elucidating the aetiologieal agent, In its final form, this network comprised 13 parücipaLing laboratories from tea countries ("World HealLh Organization M.ul ticeulie Collaborative Network for Severe Acute Respiratory Syndrome Diagnosis. 2O03). Investigations had soon mied out a novel influenza virus, strain, possibly of avian origin, as. the cause of SARS, and then fooussed on members of the Ptiriimvxavtriifae family, including buman metapueumovirus (hMFV). and Ctihimytfitľ-Wke organisms, including Chkimvdia pneumoniae. However, further investigations did not confirm these findings: the said agents were indeed found in a number of SARS patients but not in all (WHO multicentre collaborative networks for severe acute respiratory syndrome (SARS) diagnosis, 2003). Almost nobody knew at that stage thai virologists in Beijing had already discovered a new virus in samples trom some of the earliest SARS patients. However, die official line in China at the tinie was lhaL the novel underwent sctollíiiwi">i,'I1 li ■_:■: i i i i sL thii Coronavirus, using cells infected with patient isolates as antigen for indirect immunofluorescent antibody tests (Drosten et aL 2ÜG3ar Ksiazek et al,. 2ÖÖ3; Fig. L), Furthermore, no evidence of present or past infection with this a^ent could be detected in limiled surveys of healthy control individuals not suffering front SARS (fCsiazek et ak, 2003). Tins strengthened the case for die novel Coronavirus being the cause of SARS, bul only after iL had been shown to cause a similar illness in artificially infected macaques could it be regarded as fulfilling all four of Koch's postulates (Fouchier et al., 2ÜÜ.T; World Hea Ith Organisation Multicentre Collaborative Networks for Severe Acute Respiratory Svudrouie Diagnosis, 200."). On April Jri. 200."), less lhau a month after the laboratory network had been brought into existence, WHO officially announced that a new cononavirus, never before seen in humans or animals and now provisionally termed SARS-associated Coronavirus (abbreviated as SARS-CoV'k was the cause of SARS (Kuikeu et ak. 2003). 3. Vii'olosy Corona vi ruses are large, enve loped, positive-stranded RNA viruses with a diameter of 60-220 um. Most but not all viral particles display the characteristic appearance of surface projections, giving rise to the vims family's name [corona, katiu. - crown), They have Hie largesL genomes of all RNA viruses. Based on their unique transcription strategy lltat involves Lhe formation of "nested" m RNA molecules Fjy. 1. SerocaiTvcníiĽin during die ODurae of SARS demonstrated by I FA usin|i SAR-S-CoV-inferred Venn cells. Serum samples from ivife of Frankfurt inde\ Pramenv odborné literatur r - člení se na: Úvod (Introduction), vlastní text členěný na kapitoly, Závěr (Shrnutí), příp. Závěr a nastínění budoucnosti; součástí může být i abstrakt 8. Antiviral treatment No specific treatment recommendations can be made at this time. Primary measures include isolation and the implementation of s b- i tigs tit infection control measures to 9. Conclusion*! and outlook The rapid success in identifyi n g the causative agent of SARS results from a collaborative efľort—rather than a 20 A. Bvrgfr ní ni. /JbumalqfClitiira! VnaliisylS (1004) 13-11 competitive approach—by high-level laboratory investigators ma king use of all available techniques, from cell culture through electron microscopy (Hazelton and Gelderblom, 2003) to molecular techniques, i ji order to identify a novel ageiiL Hopefully Hi is approach coordinated by WHO, will serve as a model for future instances of emerging; infections that will undoubtedly take place (Ludwig et al., 2003). Despite the exemplary efforts thai led to the idejibfication of the causative novel Coronavirus and allowed enormous knowledge about it to be accumulated within only a few months, it is maybe surprising lliat this success in temii-nating the outbreak has to be attributed to '"old-fashioned" measures such as rapid and strict isolation of suspect cases and thorough con tic t tracing (World Health Organisation. 2Ü0.1C): one is left wondering whether the same might also lave hŕ-Ľ>n n rhu* vo d ni Mini it knnudedgl' °f fhť aetiolnnv For this purpose. WHO has defined three geographical zones according to their presumed risk for a SARS recurrence: a potential zone of re-emergence, comprising Guangdong and other areas where animal-to-human of SARS-CoV might occur; nodal areas, comprising Hong Kong, Vietnam. Singapore. Gaíiada, and Taiwan, with sustained local transmission in spring 200.1 or entry of numerous persons from tine potential zone of re-emergence; and low hsk areas. SARS-relaled vigilance should be staged according to the zone in which a particular area is situated; for low risk areas, surveillance slrould be for clusters of "alert" cases among health caie workers, other hospital staff, patients and visitors in the same health care unit. A SARS Alert is defined as two or more health care workers or hospital-acquired illness in at least three individuals (health care workers and'or other lu"Knir.'il slnff and'iir nniiisnfs and'nr vi^itorsl j n r h e same unit Pramenv odborné literatur Kde j e hledá Pramenv odborné literatur roie: klasické knihovny 1 katalogy elektronické internet databáze - kapacita omezená knihovnou - vyhledávání je pomalé + časopis, článek lze nejdříve prohlédnout + kopii mám ihned - negativa papíru + neomezená kapacita1 + vyhledávání je rychlé - objednávám jen článek, podle abstraktu - může trvat i týdny (email je rychlejší) + výhody el. verze - např. vyhledávání v textu Do knihoven už dnes téměř nikdo nechodí. Kde j e hledá Pramenv odborné literatur Časooisv v éře internetu - časopisy se začínají objevovat na internetu -jen obsah - spíše reklama = bezplatná služba - vznikají databáze s bibliografickými údaji - Current Contens, Web of Science atd - přístup k abstraktům - „zdarma" - „fulltexty" - v databázích, na stránkách časopisů - placená služba - přístup k fulltextům přes institucionální prostředky - MU, AVCR - zejména ke konci kalendářního roku v rámci „náborových akcí" ze strany časopisů a databázových společností pravděpodobně prvním pouze on-line časopisem byl v roce 1987 nepravidelně vydávaný a zdarma dostupný časopis Flora Online. - 1992 - The Scientist - přístup zdai na a jsou převáděny do el. podoby i jeho starší ročníky Kde j e hledá Pramenv odborné literatur 1991 USA - e-print archive - zveřejňování nových informací v oblasti fyziky vysokých energií a její teorie (financován národní vědeckou nadací (NSF)) - tvoří ji tzv. preprinty - články, které neprošli recenzním řízením žádného časopisu a autoři v nich průběžně údaje opravují a doplňují ,Literatura nemusí být zmražena v čase, jako je tomu v papírových médiích, ale může téci tak jako výzkum sám" (P. Ginsparg) - obdobou je forum pro výměnu recenzovaných informací v biologických vědách - World Wide Web Journal of Biology (http://www.epress.com/w3jbio/) - příspěvky se posílají emailem (MS Word), plný přístup zdarma, rychlé recenzní řízení, neimpaktovaný - prezentace na osobních webových stránkách - nemá budoucnost, obsah není recenzovaný, záplava neověřených poznatků = zhroucení systému - pravděpodobně však časem zaniknou papírové publikace a budou nahrazeny elektronickými ať už na internetu nebo na elektronickém papíře Pramenv odborné literatur Kladv a záoorv časooisů na internetu rychlost zveřejnění a získání (často dříve než vyjde tištěná verze) neomezená dostupnost odkudkoliv vyhledávání článků nebo částí textu podle klíčových slov emailová anonce Nevvhodv: - nemožnost číst články v libovolné poloze (tzv. 3 b: bed, bath, beach) - menší přehlednost článku na obrazovce - ztráta grafické kvality při tisku (mimo .pdf s kvalitní tiskárnou) - životnost CD média - asi 15 až 50 let x papír (mimo xerox) Pramenv odborné literatury a ieiich zoracování 1) Historie a současnost vědeckých časopisů 2) Jak vypadají články - druhy a struktura 3) Kde je hledat - knihovny a internet 4) Jak vyhledávat časopisy a články na internetu - databáze 5) Jak postupovat při vyhledávání literatury - kde začít a jak dál 6) Jak získat vyhledanou literaturu 7) Práce s literaturou - zpracování Jak vyhledávat časooisv a články na internetu - databáze ^ A.Prior: „Dobrou stránkou WWW stránek je obrovské množství informací; a jejich špatnou stránkou je obrovské množství informací" Jak tedy na internem vyhledávat literaturu, aby zbyl také čas na výzkum a psaní textů? írreifymi - abstrakty jsou zdarma - další služby (info-email atd.) Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur Stránkv knihovnv Přírodovědecké fakultv MU - httt>://www.sci.muni.cz/knihovna/ v Časopisy elektronicky - http://www.sci.muni.cz/web/main.php?stranka=319840&podtext=ID Physiologia Plantarum, Cell (1996-2003) EHE Os v r - Výhody: emailové anonce s obsahem vycházejícího čísla často s několikatýdenním předstihem - Nevýhody: placený přístup, jen jeden časopis z mnoha Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur Oficiální strankv casomsu Roční Deriodicita: Annual Review of... (Biochemistry, Genetics, Plant Physiology and Plant Molecular Biology) http ://www.annualre views. org/ Current Opinion in .... (Biotechnology, Genetics and Development) http://www.current-opinion.com/ (zdarma v SD) Přehledové časopisy s častější periodicitou: Current Biology (http://www.current-biology.com/) Trends in Biological Sciences (http://www.lib.monash.edu.au/subjects/biol-sciences/ann-rev.html) v Z databáze Science Direct (review zdarma) - Cas L(IS) Jak vyhledávat literatur 2) Databáze casooisu. abstraktu a clanku - v databázích se nej častěj i vyhledává pomocí klíčových slov Klíčová slova - slova vyskytující se v nadpise, mezi klíčovými slovy článku (Keywords), případně v abstraktu Drosophila and sex and chromosome Sex and chromosome not Drosophila Yeast and cell or ccl2 flower* = flower, flowering, flowered Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur 2) Databáze casooisu. abstraktu a clanku Science Direct SCIENCE DIR E C - více jak 7 milionů plných článků - lze vyhledávat v databázi 1 800 časopisů nebo 7 milionů abstraktů plných článků - výborný zdroj review httü ://info. sciencedirect. com/usins/# Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur 2) Databáze casomsu. abstraktu a clanku Science Direct SCI E NCE DIREC hledání dle názvu časopisu Časopisy s přístupem k plným článkům v databázi Science Direct. Webové adresy vedou přímo na klikatelný seznam jednotlivých časopisů, u kterých je přístup k „fulltextům". http://www.suweco.cz/online/cz3/konsorc/konsor tit.asp?konsor=ELS&kolekce=UTL3 http://www.suweco.cz/online/cz3/konsorc/konsor tit.asü?konsor=SPR&kolekce=ll&show http://www.suweco.cz/online/cz3/konsorc/konsor tit.asü?konsor=WIL&kolekce=ll nebo lze využít vyhledávač podle názvu časopisu: http ://www. suweco.cz/online/cz3/konsorc/konsor srchO.asp (lze hledat také přímo v Science Direct pod položkou Journals - po kliknutí na daný časopis, jednotlivá čísla označené symbolem I = subscribed - !! !plný přístup funguje jen pod doménou www.muni.cz!!!) Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur 2) Databáze casomsu. abstraktu a clanku ĚSs Current Contents ISI CURRENT CONTENTS connect. - týdenní aktualizace - 7 řad - např. Life Sciences, Agriculture, Biology Environmental Sciences atd. - pouze časopisy schválené odborníky z amerických univerzit - „kvalitní vědecké časopisy" - u bibliografických údajů (název článku, časopisu, Abstract) je k dispozici poštovní a e-mailová adresa na autory(y) - vyhledávání podle klíčových slov, jmen autorů, názvu časopisu - služby - osobní databáze vybraných citací, objednání plného textu, zaslání emailové žádanky apod. httü://thomsonscientific.com/suüüort/üroducts/ccc/ - v současnosti nemáme institucionální přístup ani k abstraktům Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur 2) Databáze casomsu. abstraktu a clanku Web of Science® - vydávaný ISI - Institute of Scientific Information - obsahuje citace článků zveřejněných ve 22 000 časopisech, ze 230 vědeckých disciplín - data od roku 1945 (asi 17 milionů záznamů v roce 2000) - v průměru 19 000 nových odkazů týdně (asi 975 000 ročně) a 423 000 citací v nich uvedených - u 70% citací od roku 1991 je uveden abstrakt -!! Obory jako antropologie, psychiatrie, veřejné zdraví atd. jsou součástí báze Social Sciences Citation Index !! Manual.pdf http://isilO.isiknowled2e.com/portal.c2i ukázka hledání Jak vyhledávat literatur Scodus Pramenv odborné literatur 2) Databáze casomsu. abstraktu a clanku CC2PUE - v současnosti největší světová abstraktová a citační databáze s denní aktualizací - poskytuje informace o článcích z 12 850 vybraných vědeckých časopisů z oblasti přírodních věd, technických věd, medicíny, společenských věd (27 milionů abstraktů) - větší pokrytí časopisů (zejména evropských) než má WoS - předplatné zatím do 30.9.2006 (poté Scopus nebo WoS) http ://www. scodus . com/scopus/home .url Quick Tour httü://helü.scoüus.com/robo/üroiects/schelü/tutorials/sc menu.html Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur 2) Databáze casomsu. abstraktu a clanku PubMed rMedline Publica - databáze americké Národní lékařské knihovny - citace z 3700 vědeckých časopisů - od vzniku v roce 1966 již zachytila více než 7 milionů vědeckých statí - 75% citací je doplněno abstrakty -je součástí Science Direct (i WoS) httD://www.ncbi.nlm.nih.20v/entrez/auerv.fc2Í?DB=Dubmed iQukk Tour 1=1 httD ://www.nlm.nih. sov/bsd/viewlet/search/subi ect/subi ect. swf Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur 2) Databáze casomsu. abstraktu a clanku Soecializované databáze: AGRICOLA - databáze americké Národní zemědělské knihovny EMBASE - lékařská databáze Excerpta Medica Current Biotechnology Abstracts nebo Derwent Biotechnology Abstracts soustředěné na biotechnologie - vyhledání článků tykajících se např. nějakého modelového organismu lze také využít jeho databázi (Arabidopsis - TAIR, Drosophila - Fly base apod.) Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur 2) Databáze casooisu. abstraktu a clanku BioMedNet - profesní vědecké kluby - po registraci umožňuje vyhledávat články s biologickou a medicínskou tematikou - další služby: pořádání konferencí burza volných pracovních míst oběžníkové emaily, novinky, reklama, obchod Již zrušen!!! ^ materiály z vědeckých kongresů, sympozií, konferencí, workshopu, nerecenzovaná sdělení na internetu = tzv. šedá zóna literatury (efemera) většinou se jedná o abstrakty - posílány s předstihem několika měsíců - často jen průběžné příp. neověřené výsledky - chybí tabulky, výpočty, diskuse - využívat jen jako zdroj předběžných informací nebo informací, které se chystají k publikaci + informace o autorech zabývajících se příslušnou problematikou Pramenv odborné literatur Další zdroie informací Google Scholar - httü://www.scholar.2002le.com/ SCIRUS - httü://www.scirus.com/ Ifor scientific information cnlyl - prohledává více než 200 milionů webových stránek s vědeckými záznamy hledá také konference, abstrakty, patenty - .pdf - preprinty - „peer-reviewed article" Velké množství odkazů, nesnadné hledání konkrétního článku, malá úspěšnost = využívat spíše databáze. Pramenv odborné literatury a ieiich zoracování 1) Historie a současnost vědeckých časopisů 2) Jak vypadají články - druhy a struktura 3) Kde je hledat - knihovny a internet 4) Jak vyhledávat časopisy a články na internetu - databáze 5) Jak postupovat při vyhledávání literatury - kde začít a jak dál 6) Jak získat vyhledanou literaturu 7) Práce s literaturou - zpracování Pramenv odborné literatur Jak postupovat při vyhledávám Pramenv odborné literatur Primární zdroje - původní vědecké práce Sekundární zdroje - shrnuté znalosti v knihách, přehledných referátech (reviews), v databázích, učebnicích, Diplomových a Disertačních prácí - tyto zdroje se necitují (samy zprostředkovávají původní informaci), jako zdroj primárních pramenů Jak DostuDovat? Záleží na tom. s čím začínáme: 1) zvolím téma a nemám literaturu _________________________________________________________________________________________________________________________________________i metoda koncentrických kruhů vyjdeme z nějaké základní informace z učebnice, monografie nebo přehledného referátu od této informace pak hledáme další literaturu všemi směry = široký přehled 2) mám „minimální" literaturu k zadanému tématu pavoukovy postup Pramenv odborné literatur ■čebnice monografie učebnice, review specializovaný článek review Jak postupovat při vyhledávám Pramenv odborné literatur Sekundární zdroje - shrnuté znalosti v knihách, přehledných referátech (reviews). databáze Primární zdroje - původní vědecké práce Jak postupovat? Záleží na tom, s čím začínáme: 1) zvolím téma a nemám literaturu ___________________________________________________________________________________________________________________________________i metoda koncentrických kruhů vyjdeme z nějaké základní informace z učebnice, monografie nebo přehledného referátu od této informace pak hledáme další literaturu všemi směry = široký přehled 2) mám „minimální" literaturu k zadanému tématu pavoukovy postup - od výchozího zdroje postupujeme jen určitým směrem výchozí zdroj - zajímavé citace specializovaná práce - zajímavé citace citace —► článek výchozí zdroj citace —► článek < - nutno pečlivě vybírat - 50 % i více se opakuje - zaměřit se na aktuálnější články Pramen v odborné literatury pavoukovy postup » citace — ► článek citace citace - -> článek < citace — ► článek < citace - -> článek citace citace - -► článek citace - -►článek citace - -► článek < citace citace - -> článek < citace Strategie hledání článku v doDorucenvch databázích zvolit klíčová slova hledat v doporučených databázích dle klíčových slov nejdříve review, následně původní vědecká sdělení Strategie hledaní clanku v doDorucenvch databázích dle klicovvch slov Science Direct (Google Scholar) stažení zdarma článek j e placený nenašli jsme, co hledáme na stránkách časopisu najít e-mail na autora Web of Science Scopus stažení zdarma elektronická žádanka papírová / elektronická žádanka Strategie hledání článku v doDorucenvch databázích zvolit klíčová slova hledat v doporučených databázích dle klíčových slov nejdříve review, následně původní vědecká sdělení TragžT m im k dispozici něiaký článek (např. z Literatury v vyhledávat konkrétní citace v něm uvedené (Science Direct, WOS, Scopus - dle autora a časopisu) Pramenv odborné literatur Jak získat vyhledanou literaturu (separátová korespondence) Jak získat vyhledanou literatur Pramenv odborné literatur Získání vvhledanvch článku rseoarátu nestačí jen abstrakt - nutno přečíst celý článek - zdroj omylů a chyb, nelze opakovat pokus (materiál a metody), statistické zhodnocení (Výsledky), význam objevu a jeho správná interpretace (Diskuse) Pravidlo třetí: Lepší je článek v hrsti, nežli abstrakt na internem. Necituj jen podle abstraktu - nechceme zpravidla celý časopis, ale jen jeden článek - separátní článek, separátní výtisk1 - placený přístup k fulltextům - kopie článku z knihovny, MVS - objednání separátu - separátová korespondence - zdarma (x fotokopie) - poštou - papírová žádanka - ukázka - elektronicky Prameny odborné literátu Ukázka oanírové žádankv a ieiího vvolnění MASARYK UNIVERSITY BRNO Faculty of Sciences Department of Genetics and Molecular Biology Kotlářská 2,61137 Brno Czech Republic Dear Colleague, I would appreciate receiving a reprint of your article entitled: which appeared in Sincerely in; o^ü m Issg SP s 8 öd 31 Pramenv odborné literatur pokud oslovujeme - používáme obecně titul Dr. - nikdy však v angličtině nespojujeme s oslovením pan nebo paní jako v češtině nebo francouzštině velmi důležitá je správná citace - název časopisu, ročník, číslo a rozsah stran (či alespoň první strana) Dear Dr. Bush, please send me a copy of your article: název článku published in Physiol Plant 113/1 (2001) p. 121-127. Best regards Jiri Napadny Masaryk University Brno Faculty of Sciences, Department of Genetics and Molecular Biology Kotlářská 2, 611 37 Brno Czech Republic Jak vyhledávat literatur Pramenv odborné literatur Získání vvhledanvch článků rseoarátů - není možné vycházet jen z informací uvedených v abstraktech - nutno přečíst celý článek - zdroj omylů a chyb, nelze opakovat pokus (materiál a metody), statistické zhodnocení (Výsledky), význam objevu a jeho správná interpretace (Diskuse) - nechceme zpravidla celý časopis, ale jen jeden článek - separátní článek, separátní výtisk - placený přístup k fulltextům - kopie článku z knihovny, MVS - objednání separátu - separátová korespondence - poštou - papírová žádanka - ukázka - elektronicky - doručení separátu - poštou - elektronicky - soubor .pdf (Acrobat Reader) Pramenv odborné literatur Práce s literature Pramenv odborné literatur UsDorné čtení literatury: - obvykle do 10 stran textu (poč. 20. st. standardně 30 i více stran) - nutno rychle zjistit, zda-li má cenu článek číst L - 5-10 minut na přečtení nadpisu, abstraktu, klíčových slov, obrázky a tabulky s příslušnými popiskami - podrobné čtení celého článku - výsledky, diskuse, úvod Vvoiskv (abstrahování) z literatury 1) Poznámky na papír - stejný formát - lze zakládat s článkem nebo uchovávat v pořadačích 2) Poznámky v PC -jednoduché vyhledávání, lze kombinovat poznámky z různých článků podle určitých kriterií apod. '. - špatná orientace pří samotném sepisování textu - hromada papíru - časový faktor 3) Zvýrazňovaní textu (vlastní materiál) - jedna barva - střídmost - velká sdělení - vztah k problému Arabidopsis Body Plan 1459 to vegetative development. In addition, early flowers of Sy-0 plants regularly show reversion of the floral to an inflorescence meristem, which is seen as formation of a branch from the middle of the flower (Figure IF). If Sy-0 morphology is viewed in terms of metamer structure, it can be described as VI -»V2* <-► R* —► R, where V2* corresponds to the aerial-rosette-bearing nodes, R* to reverting flowers, and the double-headed arrow to the reversion of an inflorescence meristem. Therefore, in Sy-0, all shoot apical meristems—the primary shoot apical, axillary, and floral meristems—have delayed establishment of reproductive development leading to modulation of either number or identity of Arabidopsis metamers. The heterochronic shift in shoot meristem development has a profound effect on plant morphology (Figure 1, A, B, G, and H). A consequence of this morphological change is the extension of vegetative development beyond the transition to flowering. This change in the life history strategy increases the life span of the plant to >1.5 years compared to the three-month life span of the Ler plants (Figure 1, G and H). It also enables Sy-0 plants to form a greater number of secondary branches as a greater number of leaves and axillary meristems form. This affects overall plant fitness, since Sy-0 plants produce more seed per plant than many other Arabidopsis strains, giving Sy-0 an adaptive advantage at least under some environmental conditions. Identification of genes underlying changes in morphology of Sy-0 plants: The EAR locus corresponds to the FRI-Sy-0 allele: In our previous work, we determined that EAR, a gene required for the aerial rosette phenotype of Sy-0, maps on chromosome IV in the vicinity of the FRI gene (Grbic and Bleecker 1996). This led to the possibility that a dominant allele at the FRIlocas, might be involved in specification of the Sy-0 phenotype. To test this hypothesis, we investigated the nature of the FRI-Sy-0allele. A survey of 40 Arabidopsis accessions by Johanson et al. (2000) established a correlation between the early flowering phenotype and loss of FRI function due to the two independent deletion events. When the FRI-Sy-0 allele was tested for the presence of these deletions, neither was found, indicating that FRI-Sy-0 could be an active allele (Figure 2A). In addition, Northern blot analysis revealed that FRI-Sy-0 RNA is expressed, further suggesting that the FRI-Sy-0 allele may be functional (Figure 2B). FRI is a putative transcription factor that activates the floral repressor FLC, leading to delayed flowering only if functional alleles at both loci are present (Michaels and Amasino 1999; Sheldon et al. 1999). Therefore, we tested the ability of the FRI-Sy-0 allele to delay flowering in the presence of a reference FLC-Col allele. Ft plants derived from a cross between FRI-Sy-0 and FLC-Collines flowered much later than either of the parents, Figure 1.—Morphology of Ler and Sy-0 plants. (A) A 30-day-old Ler plant. Its body plan can be described as VI —► V2 —» R, where VI and V2 vegetative metamers form a basal rosette and the bottom of the inflorescence stem and reproductive metamers (R) designate solitary flowers at the top of the inflorescence stem. (B) An 80-day-old Sy-0 plant that can be described as VI — V2* *-» R* — R. VI metamers form a basal rosette of leaves, V2* marks aerial-rosette-bearing nodes at the bottom of the inflorescence stem, and R represents solitary flowers at the top of the inflorescence. (C) Vegetative rosette of a 55-day-old Sy-Oplant. (D) Detail of an aerial rosette borne on an Sy-0 plant illustrating V2* metamer. (E) Detail of the apex of the Sy-0 primary shoot that has reverted to vegetative development. (F) Detail of the flower from Sy-0 that has reverted to the inflorescence meristem, an R* metamer. (G) A 50-day-old Ler plant. (H) A 1.5-year-old old Sy-0 plant. (from Kazakstan), and Wil-2 (from Russia). These have been categorized as early flowering accessions that do not contain either of the FRI deletion alleles present in Landsberg erecta (Ler) or Columbia (Col; Johanson et al., 2000). Previously, we had shown that the earliness of Shakhdara was probably due to allelic differences at FLC (Johanson et al., 2000). Therefore, we have analyzed allelic variation at FLC in a number of accessions including the previously characterized weak allele present in Ler. We have detected several single-nucleotide polymorphisms plus a 30-bp insertion and a nonautonomous Mwtaror-like transposable element (TE) both within the first intron of FLC, a region shown to be important for FLC up-regulation (Sheldon et al., 2002). The distribution of these insertions and their correlation with FLC activity has been analyzed in a range of accessions. Sequence Analysis of FRI in Early Flowering Accessions We sequenced approximately 3.6 kb of the { region covering FRI in five accessions: Cvi, Wil-2, Shakhdara, Kz-9, and Kondara. These had been characterized as early flowering accessions, flowering at <75 d or <10 leaves (Karlsson et al., 1993; Nordborg and Bergelson, 1999) but did not contain either the Ler- or Col-type deletion alleles (Johanson et al., 2000). The sequenced region contained 573 bp upstream of the ATG putative translation start codon and 870 bp downstream of the putative translation stop codon. The sequences were compared with the same region from the active H51 FRI allele (GenBank accession no. AF228499). Within the FRI coding sequence, Cvi (GenBank accession no. AY198404) showed five nucleotide differences in comparison with H51, four in the first and one in the third exon (Fig. 1). Four resulted in amino acid differences, Pro-12 to Thr, Arg-74 to Cys, Asp-167 to Glu, and Lys-377 to Gin, whereas one, in the second half of the first exon, changed amino acid residue Lys-232 to an in-frame translation stop codon (TAA). This would cause premature termination approximately halfway through the protein. The other differences included three nucleotide changes, a three-nucleotide indel 5' to the coding region and one polymorphism in intron 1. No differences were found in intron 2 or in the 3'-flanking sequence (Fig. 1). The FRI alleles from Shakhdara (GenBank accession no. AY198401), Kz-9 (AY198402), and Kondara (AY198403) were found to encode identical proteins that differed by only one amino acid (amino acid residue Phe-55 to lie) from the H51 FRI allele. This may be a functionally silent substitution because Phe and He are both hydrophobic amino acids. Again, in comparison with H51, several polymorphisms were found 5' to the coding region, one in intron 1 but none in intron 2 or 3' to the gene. Two differences were detected between the predicted FRI proteins of H51 and Wil-2 (GenBank accession no. AY198405; Fig. 1). These resulted in changes in amino acids Arg-74 to Cys and Asp-167 to Glu in the first exon. The same amino acid differences were also present in the Cvi allele. Depending on whether the Wil-2 FRI allele is active or inactive affects the interpretation of the loss-of-function Lys-232 to stop codon mutation in the Cvi allele. If Wil-2 FRI is functional, then the in-frame stop codon could be the primary cause of FRI loss-of-function in the Cvi accession. Alternatively, if the Wil-2 allele is inactive, the stop codon could have arisen as a sec- Figure 1. Nucleotide and amino acid changes in the FRI gene of the five accessions Cvi, Wil-2, Shakhdara, Kondara, and Kz-9 relative to the active FRI allele from H51 (accession no. AF228499). Sequences containing a stop codon are underlined, a.a., Amino acid; Nucl., nucleotide; nd, not determined. The asterisk indicates an insertion. *a, *b, and *c are the first, second, and third nucleotide insertions after nucleotide 459 from H51. These changes have been used to infer the evolutionary relationship between the different FRI alleles, and this is represented schematically. The Wil-2 allele is represented as arising irom a recombination event between a Cvi-like and a Shakhdara/Kondara/Kz-9-like allele. 8 8 8 k S & S V ■» ■* * in io r- [ntron 1 Exon 3 R f 1 Q. I M 3 O i 1 £ < f t s. H51 T T T C T c • A C T C I A G A Cvi C A A T A G A 1 A 1 A c Wil-2 A G C A T T A A Shakhdara G C A T A A Kondara nd G C A 1 A A Kz-9 nd G c A T A A s— Plant Physiol. Vol. 132, 2003 Pramenv odborné literatur Výhody zvýrazňovaní textu: - v ruce celý separát - text kolem zvýraznění - při nejasnosti rychlý přístup k výsledkům a diskusi - lze využít další citované odkazy - nespletu se v citaci 4) Kartotéky - význam pro orientaci v získané literatuře - při zpracování textu mají nevýhody jako v případě 1) a 2) Obecně: Výhodný je systém „jedněch desek" nebo „více hromádek" - - všechen materiál týkající se určitého problému ukládat do jedněch desek a třídit až při jeho použití; - hromádky separátu podle zvoleného kritéria (např. homeotické geny x známé mutace v homeotických genech x vývojové abnormality x review) Bakalářská práce je přehledem literatury na dané téma - literární rešerše -jsou sepisovány a kompilovány výsledky jiných, není vyžadována vlastní experimentální práce Přebal - pevná vazba MASARYKOVA UNIVERZITA V Přírodou» de dá fakulta BAKALÁRSKA PRACE B mo 3002 Hana UJtázhná Titulní list - pod přebalem EAKALAESKAPEEMHAPRACE MASARYKOVA UNIVERZITA V BRNE EŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ODDĚLENÍ GENETIKY A MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE TRANS GENNI ORGANISMY PRO PRÍPRAVU FARMAK BRNO, 2002 Hana Ukadsova Členění bakalářské d ráče Poděkování autoři jsou povinni uvést pracoviště, resp. pracovníky poskytující konzultace Komentář jednoho studenta k oponované DP: „V práci poděkovat pouze školitelům a (možným) spolupracovníkům. Spíš ne rodičům, prarodičům a jiným rodinným příslušníkům, přátelům, manželům/ manželkám, milencům/milenkám, sousedům za vytvoření dobrých studijních podmínek dodržováním nočního klidu a nepoužíváním těžké techniky (frézy, sbíječky), domácím zvířatům a státu za bezplatné financování vysokého školství podle zákona č. 111/1998 Sb a v neposlední řadě T.G.Masarvkovi za založení PřF v roce 1919." . [jůdítB^aJfi, a*í čtoucí Ľ4J OBSAH I. Ú TOD.............................................................................................__J i. a rorroiA....................................................................................__4 II UŕfiŕSŕí*™1 *)™bj «jMiainl.............................................■* l.T FVHbíb MSKJŕíj........................................................J u S^WlflSSrrňfí&ř.......................................................£■ ^^UI^iífflSSMlíJd^TIfMlfKTdv^gg^................................7 3- f IR V A A POFTÓIA______.....................................................................S 3-1 UrnSS&Jijairocü-TaiidyitHcbfliiiatijaffi virion iďfeŕci........................£ D.í Uirya*1i**JuJclbxjd4ťdcu «fywyiívľy........................................i 3.í.I ftííilĚSiX......................................................* D.I.: V,ruaifriCt4bIMÍltTfrllBI(A3FV)...................................p 3"t«W.......................................................ID ^AtiSUiWUß!.......................................................ID m viťTuífaLůif....................................................n ^-^ÍMilWWia-....................................................13 3.17 ííWfip,.......................................................14 MJSV4D............................................................lt. 3.1.í>^V((S(SKsA.UÍMW.v,rl,ä).........................................It, ^■id&ssjo.......................................................i6 D.? .11 ■ irua.ľbŕiftT..................................................u 1.1 M Dojal v,,^ crtlivdu^íl tUddťdCU 44^j^|JL..............................11 4. IÁ * ĚR................................................................................................ HJ i.5EIň AM Pt)UÍ] TÉ LITERATU R í..........................._..............................II PR I LOB T................................................................................................!3 Členění bakalářské d ráče Uvod - v rozsahu maximálně jedné strany - aktuální stav problematiky zadaného tématu, s vytýčením hlavního cíle, který bude v práci sledován - může se psát v 1. osobě singuláru Pravidlo čtvrté: Ujasni si, co je nové a co ses sám naučil. řj.ídíD-:lrK 1Ťlťoj ů^diaiaíl je prontucd auilradů ±j x upioLdüß d>a ryp-y kiiúi-iúi aĽrn - pť&fyOiĽ&vaiib, fťojťmJc\ m jflJůu^jQjjqf^ a. fMiolc^ctB, Ěi dů2j™aik. dítťůoa.. Gbů.ffi\xasy ací ledoj fre atrii fciudtj, oJc t^hľuí *: od xtw liä. vjŕ2dfljíuj] k díjed rúľ'UldtdJ dXťfolBgjtt^ä ú. hKbídáít^dj IdiridiUii vtudíí, OJ« i ddj, 3e AjEftäJfrfl je dirTDZdJI MdítWŕEJ- ^edeDCty LödHülffVBdu, TT^fldlJje [flaJd Cdtfr^e d. detT^Dtb.'v&.^ddE vctdl [jft ůdJ&Todůiůdl ůdijdaftljňch Ľudít.Nfllflíofl. k u^olJujz [ŕ- pMĽcJc^ít^ch auroeb vůr^diatu, budtf Uderili v ddiidfcu puäfclOHdl I|jdactíd4bu áĽllbidJ YůijStCb füCIQrd JflJüD je dflfrf-. ■wyaülfil KplüIH, CEilKdl, CCmctí CUCiĽikraJie, dCfcö pt> rLEaiblidJ fůSfclCÍHdl ve ürtui. Mij^pMlf, t fljKi#pS£. důCHinl v pŕdfc-žuu dürwäJdlcb fj^idc^ctycbi prircead ■vCdtfiTTiidilJdldJ i pOJíitilTTĽdilJdliĽi *J™ÜJj LTjildiatU, drf3e ť>I Olu ^-»dildů. i ddJädä fokLCry, tierí apnncoedj^ö *J™üjedJ Oť^fUiAOl [Jfliöu d«dDU^J. J-Z-ldil S, [Bdůfcdí JfltC U detrtEJŕ1, OjjdflDfc-Zdl ■vuíjälCb v\ivů -dafJr.MfJlüCdlbu iütlJ, CEdftdl detOCbCdůCtCrttfMUDlf. ZbiDlC^CtjTCb fatlůrd JI ELdfljiůaťji ^rTffvÍLidfelflCí. aiirü tiCü tůt-ilJilíií prfljCí je ľilitjíht H dfl. qßQßjf^JI. X TZEflJjU t Arilin tMrí J S*Jiü jedůT^Ui prTHÜJtrf UríiEfUi SpdflDfcHiĽi ffwli^dllj], EĽ- ľdiitMdia, de k HůfcUjl defcO vyvda.1^. V [YT^Jl 'JUJ je frTDID äuUČde" d. üfc-Kde" pCftfUO. fljJQßJjfgd^, üdilf iďfiluunfljje fcudfcj- v pjAjjurii důjU-d-ídl ^rtdu iOli Jfliľu CtrTflddJ- dLiC'ľUildiiĽiJJ, tHŕJ- CbrŮdl hiľíIiMlí 0ŕíd íŕíditfldú dQvycb ^ffififlj^lJlJCti aťídl f» tílí, iJCtLijlOU ib^TtyĽUdíkľ rJCblí ťa^pCjmtyviUjr. VirTi dJe lyi^dUljf v j>rTJb>abU e^UCC ťlflrtlJ ZpdflDfcd fl-dJecbudiädad, JfllfOrMrWr^U .pbíjlC"'. Tfljt^ tue dJßQßg$£d,delbd.ih1 ľdurtMdii p>ŕed*Hjlcl idÚtUVUde budtj ZiJfljŕdfl rtlitů fJrTD teljf ĽT^OmdEtUd. UdüüiJujl EüCiS itMC-ildl ^rll, r02*ÜJ idfefroe dít» Hľdib: dfljlůrtl, Iíjduedfl.* pflpadí diltiEJ-Cv. ^d^^HJ^d^, ^r-ir. auium *1i*H ^ťÚ dl flj$ß#$JJL Ľ^ Kij" dtttllü ^ŤZdfljtMÍ ffiflf-i[ tliíĽ-d i firtivídiii ri-ihiĽ. F:Ti:'Ľj:J.iiiJi4ĽiJädí:J.iiLVd|.:ii xarů. řJídíD-llrK 1ŤlťOJ Ci*g£diaĽáI je prTu^íOed ľuditedj ijLIi tUdílf. Ph D>±j K UpJiUdiJ^ d*a EflíJ-bUddídí *ĽrH -prTütyBitlffvifldi, p-Ujevujkl M JfllůD^fJQjjqfg^L fl. fMIDlC^Ctí^ Ěí diĽľ+-*iliJÍl dfltťŮQfl.. QtM.p>rlü«af aCí iQdjDU ti atrii fcHJdtj, OJC TjHĽdí dC üd XtH lid. Vjr^dOjíuJ Ä díjed rúľ'UldtdJ tiůĎťfůiCQttyiLM ů. hKbídáít^dLi IdiridiUJ vtudíí, OJ« i ddj, 3e qßQßijrrfl je dlrTDldJI MdClCMrEJ- ^deDCt^ LlOdriOlOTfldb, TjifljiUje [fliJd Cdů^í d. detT^Dtd.iŮ, aiďdC vctdl [jft ůd»-Tadů>ůdl ůdudaftljňch Ľudít.NíIflíofl. k u^JílJují [jŕ ť*ĽcJojít^h aoroeb vür^fljJiatU, bUdtf UddrúJ vdJiidtu puätTOHdl ľjjdaCfcídÍHú áĽllbidJ iŕflíjäCb fuCIQŕd JOliü je dflfJŕ. ■wyaülffl. KplüEfl, ĹEilKdl, CCOTiCtí CbeiĽitUJie, dCtť> pt> ŕĹEäuJjlídJ pĽdfcraedl *í briui. Mflj^pMlf, t fljKi#pS£. locbinl v pŕdfc-ibu dürwüJdlcb fj^idc^ctycb prTKíiJ víd^TTĹdilJdlttJ i pOJíitilTTĽdilJdliĽi *J™DJj ĽY$0dia±U, drf3e ť>I OJú ^-»dildů. i dilJdiťi foklDry, tierí 2ffiťu3tayiu *J™üjedJ Cr^fUifttU (Jťldůů diSüU1^ J . Jeldil X, půiCtiH" Jflfcü U dítrtEJŕ1, OjtflflDfc-Zdl ■vuí^älCb ,*1i,"tl - dflfŕ. MfJlüüdlbu iütlJ, CC »"í d I dítO CbCdůCMrttfM UDlf. ibiDlC^Ct^Cb fatBuŕd^ EĽdíJČi^iji i^rTffVH. idfílíICC . aiirü tiCü tůt-ilJilíií prtĽfl je ľilitjíht H dB. tygQßflggjJ, X i^EflJjU t ^ríliH tMrí Jj S*Jdi JídůT^Ui prTHÜJtrf UríiEfUi SpdflDtíiĽi ffwli^dllj], EC- ľdiitMdia, de Ji HůfcUj] dfltů ■vji^DliĽi^fljl. v pr*u\ 'Suj je friüiD anjídí act-zcde" [>c^ua.a^gQ^vZdJiilf iďAtnonad« tudty v pjAjjadi d ufU.de d I triedi JiľUS Jfltü CtrTflddJ- dM'ľbudiiĽiJä, tHŕJ- CbrŮdl biľíIiMlí 0ŕíd í^ditedä dQvycb íij^ftd^ajejjcb a fed I po cíle, pcfcudjjou ib^rtybudít rycbl« ťagpcjrotyviuj. v^j dJe ly^duljf v j>rTJi>abu e-ľduoe radu zpdflcfcd adjecbadiiĽd, jalfOrMrwr^u .pbíjlc"'. Tait^ tdí ů^jjjjfgifl.aelbfl.ifl, ľdurtMdii p>ŕed*Hjlcl iďAtOTUŮ budtj ZdOjťdé rtZitufJrTDtelJfůr^niaLiJa. UdüüiJujl EüCiS du Ľ-i! d I ^rU, r02*ÜJ idfefroe dflfclO Hľdit dflduŕtl, Ifljdüidfl.1* pflpadí diltiEJ- EV ^d^mHj^d^, -viry. 3udiUdä ^i^ v,rí| da |ßQß#$jjL bj Kdj- «cHIö yfedaitMe" ffi*j-2[ tliíĽ-d i firtvídiii ri-ibiĽ. F:Ti:'Ľj:J.iiiJi4ĽiJädí:J.iiLVd|.:b xarů. Členění bakalářské d ráče Vlastní text Dráče ■ je přehledem literatury na dané téma - literární rešerše ■jsou sepisovány a kompilovány dostupné výsledky, minulost - vseje podloženo citacemi původních prací současný stav - vyjádření je neosobní (bylo zjištěno, v práci xy je vyvozováno apod.) - pasivní konstrukce Př. V následujícím článku jsou nejprve připomenuty základy teorie rozlišovací schopnosti optického mikroskopu a kontrastu zobrazení, doplněné o výklad nejdůležitějších metod pozorování fázových objektů. Třetí, závěrečná část je věnována principiálně novým metodám, jako jsou videomikroskopie a konfokální mikroskopie. Kvůli přijatelnému rozsahu byly z přehledu vypuštěny běžné metody inferenční a polarizační mikroskopie, neboť lze předpokládat, že mezi fyzikální veřejností by měly být dobře známy. nebo - 3. osoba plurálu (autoři dokládají, zjistili, potvrdili atd.) Př. V následujícím článku autoři nejprvepojednávají o základech teorie rozlišovací schopnosti optického mikroskopu a kontrastu zobrazení a doplňuji jej o výklad nejdůležitějších metod pozorování fázových objektů.......... vlastní text oráče Členění bakalářské d ráče Příklady z bakalářské oráče: pasivní konstrukce Při studiu příčin všech prionových chorob a tedy i CID je využíváno myši, kterým je do těla injikováno určité množství prionů. Po injikaci lze sledovat cesty, kterými se priony dostávají do centrální nervové soustavy (CNS). Taje hlavním cílem všech prionových infekcí. V závislosti na množství injikovaných prionů, místě injikace a druhu podaných prionů (Aguzzi, 2001) byly prokázány dva způsoby pronikání do CNS. 3. osoba plurálu V roce 1920, nezávisle na sobě, popsali chorobu rakouský neurolog Alfons-Maria Jakob a německý neurolog Hans Gerhard Creutzfeldt. Oba lékaři uveřejnili popis celkem šesti případů degenerativního onemocnění mozku, kterému dali jméno „spastická pseudoskleróza". Dnesy'č známo několik jejích variant, specifických především způsobem svého vzniku. Neosobní forma - üoüisuie. vvsvětluie. vvimenovává atd. Nejznámějšími genetickými chorobami vázanými na chromozom X jsou hemofílie (snížená srážlivost krve v důsledku nedostatku srážlivého faktoru IX), daltonismus (chybí neboje omezena schopnost rozlišit červenou a zelenou barvu) a oční albinismus (nepřítomnost pigmentu melaninu pouze v očích, zapříčiňuje zvýšenou propustnost duhovky pro světlo a tím poruchy vidění). vlastní text oráče Členění bakalářské d ráče POZOR! - v odborných článcích je sice ve Výsledcích a Diskusi používán tzv. autorský plurál, avšak v textu BP se nesmí použít (pozor na opisování či doslovný překlad článku) 1) na zjištěných výsledcích nemáte podíl 2) text je pak často vytržen z kontextu !!! Informaci v textuje nutno přepracovat do pasivní, neosobní konstrukce nebo do 3. osoby plurálu !!! neboli neopisuj cizí práci, ale vytvářej nové (vlastní) dílo Jak se píše samotný text - tedy jaká je skladba textu, dějová linie, kompozice bude pojednáno v kapitole Zpracování textu. vlastní text oráče Členění bakalářské Dráče - rozsah kolem 15 stran textu -jednotlivé části opatřeny číslovanými nadpisy se sestupnou logikou l.Xx l.l.Xxvv 1.1.1. Aa 1.1.2. Bb 1.2. Xx zz 3.VIRYAAPOPTÓZA 3.14^!pppfra:a.jaJtG ohraiiJ\y:mechajiisTmis piivii™* infekci ŮťflPS&Wi ^">J^I J*^ LfcrTflddJ1 itM-ltiliJiiĽiJä Or^diiBiJ JC-li důfůďZd «Irtriů. U vyjeti dbťaůcFCÚ x xůcůMiitx x ili^íitH. řepy tDdů-irtr ^ntyií idfckc«, u dbeu jaou laiitovani tüJdlTK íhdidDvädjr ftfä&teWr Fr-iTdl typ fťCtíbí 2d. IJ.ÍÚJJ gtSpffiS&íWífiL T Ij^ťfocjlll, tlírí ŕúľpOSdilViií virü-ui fňfůiy vjaavídi dfl. pfM-'lbU dflpfljdCdJflCb tUdílf v tůd^>lí]ílJ d W HC ddDJídy d. vydiiHli AjddJ t djÉQOQř££. L4Jdty. TliLCD 2[jddC4>2dl H 20brfaijl rtpJitBCi 'Virtl d. äľíal idfcrCí v ůr^fljJiitU bCrliKlí. V dŕubiiĽi [tf1|Jäj4í trioví prTHSidf dJCDTUj bHJdíČdJ CyfclU^ MtíED iiJdilJ JC Vblf idjCdD-fitüVfljJ JflJüD deprldtffedjr d. bUdtU I it» dli je sdúd. *ZĽí djj^fj^y. (pAajJ-dMchfldiaĽua dídl 2ůiJi±j ľdiiitjj. NítWrí JídDVÍ prTOllJtlf^ŕtl ďUbiDU idMrlflŕCl d lüDd^Cdfidl^ dj^J^j^^ 4^ tUddťdĽXJ a±xl Ľ--*1|Vdi[ (ObT. 5| OtiT. ?). LKidíĽ ľiivij d d. -QCabU ^rUd-bůdůMl, Ľf[JU ĽiJdtT d. virU. iijuv,rí| půdůCíl jvycb fTLtíidd tíDtlJJC flfWÍSCff.Mj ddú iI-l-lúJI 4ĽrT kaidtT d. UdüCddl 'liltuJÍiĽ JKdECľU dtfi^tb ?JlrtňdJt iHtO ť^^JiU. In i<2ditll pJr^iiXedCdl iďfalPH. Víriví [JrTDÍíidJ-iJrCiCbiLl WOptVV ddj, 3í idbitHlJ flJCDTfljCi [ÜD díĽO iJTTüCHüJjllCti tfiuUlT, díĽCK CbQWdJ JfliüD ^7"2. NítErí vwy, pŕedCVfliĽi díiltoilfcďi ^r^, X ■vj^dfljčlij flCbCpdOal iddlilnffVHI djJQß[#£U. bCrliKlir^rb k41d4t d. ĽMH2i[ iitUldiUl C-lfM^i'ür^fljJiüMJ dd. idfclOCi, 2&rTQ»Cd^iĽi KdĽOdMCbddiadäUfliJuduiUlrTraiŕĽ^BI'iľditli Wj^qdV v uŕ^ďjiiamj ÍCLĚŮu I Wfi) . 3.2 \^yo^lh™jid1jmieaM)u^ppto^ Uvii-iíiĽi tiĽďií tlflpiEüJy víduifliJhľ ^'liJĽtii-hŤdJ ťílí'UiĽi viril, tlů-i Ľ^livdu^ djJQßjfjy. líW, Rlliíťtuvä, IWía, Rlliiitü*, I WW|. 3.2.1 MgWWUK ra^itacH iJrTutíbd. v^Ldŕc bi>jjKlA-í budtj. U Élcmítd. *T¥dö>fl1l [jŕedjeicäiĽi idfílra rTC^JirTflŕdlbi CriiTlJ (dí/*lM flJfUUl r^^ri^dl udídúDídídl), tlírí 'íiäĽ' pĎUbUj íLíÍCÍÍ L-dh:tTi-*T díto dc^ÍLÍty vocdi-i dudby. DoJí ipdaobuj 2iiďdĽ>- cťdkb ^o^ík: (*CWJW#50(iftJ^ a MíduKdídl d^j^dif^dJ^b^lbßiMflJciiJ. tfí^ísyt cícbED i^ríl jaai naJcí f:n díbŕdťdbca, u lúlvriUĽTdkb i-^ŕidi Ckŕíítíl) iddutuj friajafürttaii iďAtcwudjcb t*jdít. Členění bakalářské d ráče Vlastní text Dráče rozsah kolem 15 stran textu jednotlivé části opatřeny číslovanými nadpisy se sestupnou logikou l.Xx l.l.Xxyy 1.1.1. Zz 1.1.2. LI 1.2. Xxvv - jednotlivé části by měly zahrnovat: ... charakteristiku předmětu tématu, .. .historický vývoj řešení dané problematiky, ... analýzu současného stavu a metodické přístupy řešení problematiky v celosvětovém měřítku, ...posouzení závažnosti předmětu tématu z hlediska zdraví lidské populace apod. Pravidlo páté: Nikdy nesděluj víc než víš (nebo než chce čtenář vědět). Závěr rozsah 1-2 stran zhodnocení tématu z hlediska praktického přístupu do budoucnosti může se psát v 1.osobě singuláru Pravidlo šesté: Vyhni se velkým slovům; okouzlí a vystraší jen malé mysli. Členění bakalářské d ráče Z4VER Ziirhlr taj d ty iďAlnOTuä virídj v fractal Můaůafi.aoil todMiedl idfítcí a. a řídl dCrt^Ch í*ťLW& CCdZd^ůAjJC UrTÍíCJ/aQlfHd C£briUvbĽtXiKlat4b0Ľ<31dia£U. U ViťŮ X bdhídii ívdUCí ^-»idUlilŕtt'ljl dJZCbOdilťll, JHt ij^SjltíKU.. ÖCtüVul, flJíflpcd vrfldjŕich ŤiĽlCU idtít« . Twjďj poácynijt -vyti&lu, íĽctiai x ťtfAita*ai, Hin vcť$piii*ui díboudrfu^iai fíťsiawdul i d tí L-.: i. Uľ Ľ^lu ZldlAdC tOdůtiů idfürtüÄil ů Viry tŮdů*ad>>:b idbíhCůTOCb, ĽKit H 30^JJj dů rthdjtb tiel ißflßSPrJC *■ dflŕuauj huCbediCtí pťCCtZf XdiXJCl tí *ĽťD tHldtT/. JdOU «UiůJQvíujf ddJál íLcEfljljf ľ> idfebclcb lyiriuladjcb viry, tia-í budoi daakdtf*Hi pcadaity Ľ> idKJriLi i^rTQvycb p>rt>ÜJtllJ dů ^l^^J^Jtj. 4rUb d. ,*1i1*TJ dfl. JC^Cb rtglJlfcCi. UiťCflG idhihcůrT iflaabuj ríhdft tuďpůdídrr ajsetyqV^ diüb. Na. [fltloxl b^ssytjijqp^ idbihcurj EÍU& íabnaduj atn^i LudiidJ^cb b^apjj^. ICE, twrt ríjuluj fljseqŕsji. fŕífl riWfttrT a±jTj.Ů^^r>;H;:i;!?:ii;.fiTiiííidy iňFpjoiŕl důricízafllil4 ťcdiůy 2ohťů\ifc\ tujďdídi fiťcmidy, tiírí MutiĽiuJjfltutlkc^í ngiiltaiar íeasftíJIfllSĚb, diab. virua P,^ffi^d^ a ^jrHJŕ IüWjjjc pnocíid LMFI, tKrŤflc ebovu. jiico pemebc-vy fťaaiů CD4D dillíärK pno folfMru rflaii a [read & I j-djfc-: jul. Wdubů ^rtl ůOůpůlC OjJQjjqpg^l. "tytfdiyi, ^rTü™C ÄldlüM C-lfOvídiíC 10. iddUkEi LftJddídG 4±xTi JSOi vaouíoidi íŕt-í ZlnCflriŮdp. VJTĽUiľ^ dttfaCIJ [^J^LdCUC 2*1aÍÍ £4dd4 idÍDťdUW o iďliitci qßQßJrpjc bíbcda Ijuctí idfcloc« d. aiiaic not MjüJjiüu pťllíiEůa: p™ dataci f/ťzpůrtiiů f+i |,4í W t1idicty^3daitidjňcb id-fefrídkbcborTDb. Pufctffljíujcl w^tud^ vJdOViiri i1iwu víri] d i ŕíJUliĽi Qf&tti&X düCbüll *4a[ t vjrv,y dDvycb lííítMjCb poaQJpťl U MíiBLXdíiSl, tMŕí JflüU flptyCdí SdípftdJÍfedutJ ißQßjfSfJJ. (ň ID5 «Wß^^WdWOtK purueb*/). Zde bj- x dal t/ ryalt v,rTü*4 fnc«idy, tiírt pcdaíu^ lj£Q|3$$JJ. O. pť&UullJ ivc£ fcUddt. A Důjl^ai", ^rTu^í [l-TC-illtiy, tlů-í fK-lfJůrU^ t4Jd4íduU atirT, dúĽ4ii>j bjT i^ajirK tliíW cbůňubipdflut-zdjcb aelbiuliu Ofoc^nr^v bdbíit dCrtKüJdicb fj^idüJCtycb [tfOCCdl, JůiCOJKAl dufrjlULntUdiliJl CbürTübT/ d. rfOJttmdd.. '■'irCiVí ^jjf^j aj^g^K düCbüU bfl djdd{Xü^Ujl>/ t «lítL^dlitlI zatí^edl rUlüQv^dd>/Cb hjUdílf. rtítlírí ^ŕT/ 111^ dli J bUdtT/ ddii, íí fOlfJůrUj 4jOO^ŕ7U dí2ilvideu dd. püD. Jycb prTC-llltlT/ důCbuU tdT [jfiľjjdaCÍMd^tílididfljíi dildůrTůfcŤCb t4Jdít d dítUdťídldJ OJdůůr JJJj^ríWííliWLŕrTMí'dfldi. ^íÄ*Hľdí Ik Niy mnbrtiĽi ĽĽiiajUĽ'Vui, ía viry q, jajíb (^odutuj/ »yidflíujíl k apíci^ctai ndl v qß#$$$. ck*ýůJ radu d^2dcdl *7iJid v (3lftdj§d^|d^)uŕ priam. Členění bakalářské d ráče Literatura uvádí se únlné citace článků, které bvlv citovány v textu 5. SEZNAM POUŽITE LITERATURY ECTJZT, J. TXO. BiClogjC budky, 11 I 3. *frťdflJcifljlJKlI*!, Č. EqjdjíJD^CÍ tííls^C.M. imi.^í!ll.ň#jJÍJílu#(íiaÉi)^ VifaJiiiijpM DC. amsuisxí.A.íHB. fí: «44 iGFP&D..$ťififK^^ÍJMJew,M(ít$íj^^ (4SÍ(!?J9iíC5ll4w^F^í^íJtaať!l^^ lil - IFJ. C blloup fcl, J. IW6. FVlD&rUilůatiailiLrarTtxJdlirK. Btdü&iflrt liXK. ůl! 24P-17I . Cbilanpki, J. IW. AddfXocc a proyadůa«iai& aürT - -lyií c-ifK«iídj budky da [Xdlracdl. Jc^cb T^ydtHjV *2nb a «^7dddú [>ttd g*fe2d ar^dirad za macfvyäi pOiaJůít. Eidŕi.i.ľti [.if.«: ji - im. fijHX el «a 5üHijt t. 1™. wňiiij»». et ««Jsaíi ty W&ímim- 5í*m*cíi ef QjWfll. v,fůogf.S:*}l-aD. LíCtmkI, EL K-icm.i!wi)wmMtMzwmM&'#^&^&™W'#fmm,i>°* ■lsfsua.(j(Sř)fSílHiJ(iSpsltijí*yi.i4! JDI -Jí*. J^SUUJI). H, D. Eiimnare, A.fljjjt a. 1_*Sb«4jí, F". MttfflíttH*. W*J- flWWJt I™. U4ffyJj£cell bclojj-, p. 1344.5(iídjLř &W3W* ft#3 íflft- t*ÍW Vů*- 50KM*r5iid guH( ainijjf.?! ni? -:w. Mííí*iw c-^ ««j*™-! ^™-*™ ĚííWflWMaaÉí^^ ViťOl^F. S: 42P-442. (JUjIHJHSISI, A. I KU. aijdiudi ft-liEldit dvuiijcki aar diiůrtní budtj- tyjo&gwji- 41 . M. H. M-, A. A. A. M. Iljjp-VH ftSJ.K.ftjt, HO. A. J. Ul *T £Jt i™. Gto^Ad^^^rija.Jjtdj^^tfMiö^ piüM.d efiadjJs-ítJWjfel DNA i*rua. 330^44^ id VirTdüJf. S! 4P7 -ÍD4. 5. SEZNAM POUŽITE LITERATURY BergcT, J.TXD. BtcAůQt budky, 7.1 I d. *ffrdoJriojldElxvl, C. Budjdjowcc trHtfj,C.rtl. IÍW.^;!ll.ň#jJÍJíl^#(íiaÉiB!^p.6ľ:.A^(JíW ^"Juajf" Díl. L»5iWmM-OlfflR-SíímJt!.C-S3*«Mff.*S«LB. Dí l^jpst I ™>- #ŕňŕK(fŕ. *WMÍ^[*Mrtíi*ISIJ^Íi*^^ Hl v (jíŔSWfr ífflJWWWfSlC!" ÍWÍWM-"T: DD4 - : 11. amsulsxí.A.íHB. pí: 444 iGFP&:i..$ťififK^^ÍJÍ*^,Mfír$íj™.w^^ *** WKíMj«!- "">•■ " - W- wxws■c<||<^'™*&VKMe9lm■I>■'J^K>ozr■'s^^■ iw -■"■ Cbtk>üpfci, J. IW6. Fro&ruiiůatiaiiiLrarTbijdlirK. Btdü&itlrt hxp. ůl! 24P-7.7I. Cbilaiipki, J. IÍW. AddfXacc a proyoiua"iai& aürT - -lyií c-ifK«iídj kudty da [XrHracdl. Eidŕi.i.ľti r.ijv.M! ji - im. fiJHX EL «a 5JjHiJt T. i™. MftDU»». et íeí(Jsajl bj- luWSWlíWSíl. 5í*M*5l íf QjWfll. v.fůogf. I: 471 - «O. LiCTilld, EL K.T[™. JjWí^w^^íj^^ííiíhw^^íj^ ■lsfsua.(j(Sř)fSílHiJ(iSpstjjí*yi.i4! JDI -Jí*. J^SUUJI). H, D. Eiimnare, A.i&jjt a. L-i^p^ F-..|J$(*EJljtlW*«4J- flWWJt I™. (jdjjLS^ItVcsll bolojj-, P. 1344. ywwí- mXM ft#3 JöÄ- t*ÍW Vů*- 50ÍM*r51id guH( Bidogjr.?! DJ7 -:w. Mííí*IW c-^ fl«J*M-! ^™-4?>W ĚÍÍÍWWMfliaÉÍ^^ Viťdc^f. S: 47.P-447.. (JUjIHJHSISI, a. IWJ. aiidiiida ftualdít dAraiijckb aaťi dilůrtní budtj- tyjo&gwji- 41 . M. H. M-, A- A. A. M. Iljjp-VH ftSJ.K.ftjt, HÖ. A. J- »111 *T £Jt IWJ. G&SKXA.&Mjtwi v.riiä.Jjtdjij^fl^ífMíÉJj^jiläj-aadjJs pioK.d (í i i d j) i-:KW#Jt DNA ^rUd.^jf^j^id VirTdüJf. S! 4P7 -iE>4. Členění bakalářské d ráče Literatura - uvádí se úplné citace použité v textu Literatura BergeT, J.TXO. Btclogjc budky, 11 I d. *frťdfllcifljljjEli*!, Č. EqjdjíjD^cí G****. ftíSttSJÍHSA. tíílS^C.M. im^.^lill.ňd^jjjjs^^^ti^^ ViraJlidjpM DC. £ŕ»«*a- a, c.utiflfjfljji, r. Jjjuäjfl, n-•■ " - w- f.a.m.jjji^jm; Li^j^t^f^p.JjHisj^imí.iä^sd^ij^í^y^ MÍS?»í=íll*W^^«^í)taaf¥61íl^ Ivl - Iv7. C biloup fci, J. IW6. FrogrUiiůatiadiLrarTtxjdltrK. BtdügjfLrt hxp. ůl! ^4Í> — Tľ I. Cbilanpkí, J. im?. AddfXacc a proyaduOTadä *ĽrT - 4\4 u&qľk44i budty da [XrHracdl. Jc^cb T^ydüd^ viKh í vyidaiĽi pro fteiti ar^dirau1 za macfvyäi poiaJdet. Eidŕl.i.ľti l,l>'.&i! Jl - ID3. UM, E. W3 WWUt T. im. MfttjO»». et W38SM t/f W&ímim- 5í*M*5l «f Gftlftgl. "inoioär. S! 4T i - «D. LiCTilld, EL K.THE. JjWí^w^^íj^^ííiíhw^^íj^ ■lsíídl. Wfljl^ flJjapjllj(3Sjl. i4! ií>l -JKB. J^SUUJI). H, D. Biltnnar«, A.fljjjt E. !_*#?($#, P. (H*)MStJH* w*J. flMW* I mi. UgffyJjýcelI faolojj-, P. 1344.5(iííSLř &WJW* ft#3 íflft- t*ÍW v°*- 50íM*(aid tjmtt aaosr.f. m? -:vi. Uiťdoif-I; 4W-44Í. (JUjIHJHSISI, A. I mi. audiiidi ft-liEldit daraiijckb üsrt dilůrtní Ľiidtj- ty&]i&$ji- 4i . M. H. M-, A. A. A. M. fl.tJK.p-v±u ppj^b^f, ^^. A. J. Hl *T i^fc I ml. G&í^&«&Wu'™JjfŕilWmtf«lKl^^ piüM.d efiadjjs-ítjjd^jl DNA i^rUd.^jd^d^]id YirTdü£K. S! 4P7 -ÍD4. Příloh nestránkované listy s obrázky, tabulkami, schématy apod. opatřenými legendou Přílohy -!1 Číslovaní stránek - na titulní straně (Titulka, první stránka pod přebalem) se neuvádí číslo strany r - další stránky se již číslují v pokračujícím pořadí (Poděkování = 2, Obsah = 3, Úvod = 4) - stránky Přílohy se nečíslují vůbec Formát textu bakalářské oráče velikost písma 12 font Times New Roman (Arial - tabulky) řádkování 1,5 okraje: vlevo 3 cm vpravo 1,5 cm nahoře 2,5 cm dole 2 cm píše se vždy jednostránkově (respektive se tiskne jednostránkově) text se zarovnává do bloku číslování stránek (vyjma přílohy) Pravidlo sedmé: Nikdy neopisuj práce svých předchůdců, opisuješ s nimi i chyby, kterých se dopustili. ill HE D Příorava materiálů 2^ Příorava na vvkon 3^ Jak Dsát a čeho se vwarovat 1) Príprava materiálu (co s vagónem separátu) IIJHiy.BliFiragTTIllBIlEitffCfillillllliüllBlk^lllll Jaký zvolit Dostu Nahromadit veškerý materiál ----► roztřídit ----► pak psát Sbírat materiál----► průběžně psát----► nápad----► sbírat materiál Dle libosti - praxe a čas ukáže 2) Příprava na výkon (vlivy prostředí) Jak začít psát? Vlevo nahoře. (G.B. Shaw) AllevM. ŕ 1996 Pohoda, klid — např. i funkční PC, pravidelná záloha, Hudba - klasická Jídlo, pití — zda vůbec ©, kolik, jak často, co nejlépe pro rychlé psaní Každému vyhovuje něco jiného, začněte experimentovat „Jednou mi řekli, že nejjistější pomůcka k psaní je trochu lepidla na mé židli. Určitě věřím víc na to lepidlo než na inspiraci." (Anthony Trollope, spisovatel) Termíir Dostatek času na psaní „Přírodovědec by byl šťastný, kdyby musel jen pozorovat a nikdy nemusel psát." (A.C.Darwin) Neodkládejte psaní textu, text vzniklý v časové tísni se sám prozradí. Za hodinu lze napsat až 2000 slov, ale jen když vás políbí múza.. 3) Jak psát a čeho se vyvarovat (strategie tvorby textu a jak nerozčílit oponenta) echnika nsaní 3^ Jak Dsát a čeho se vwarovat Z historie: - tužkou a hojně vymazávat - psát perem, rukopis rozstříhat a znovu sestavit - jednotlivé odstavce nebo dokonce věty psát na zvláštní list papíru, a ty potom sestavovat do logických celků - text nejdříve namluvit (tok myšlenek může být rychlejší než psaní rukou) a teprve později psát a vylaďovat text často je mluvený text srozumitelnější -jednoduché výrazy, věty - pište a nehledejte vhodnější slova, ztratíte myšlenku - psát jen po jedné straně papíru (platné i v současnosti) Současnost: - éra PC - debata výše je částečně bezpředmětná (tedy v tom jak to udělat, nikoliv zda-li to vůbec dělat) Výhody PC pro tvorbu textu - v textových editorech lze přesouvat slova, věty i odstavce, kopírovat - jednoduchá příprava tabulek, grafů, obrázků a rejstříků - kontrola pravopisu !!!! 1 echnika psaní i IP i:^p-ř Nevvhodv aneb na co si dát oozor oři nsaní na PC - na obrazovce vidíme najednou jen malou část textu (strany), nevidíme začátek a konec, nelze jednoduše listovat apod. (x vyhledávání) - překlepy*, chybně nakopírovaný text - automatické opravy !!! alela - Alena: znak je determinován dominatními Alenami genom -jenom: podrobně byl studován jenom bakterií delece - dalece ve 2. Generaci ~* ve druhé generaci, v generaci F2 na 5. Chromozomu ~* na pátém chromozomu, na chromozomu č. 5 - dobrá znalost používaného textového editoru např. dvojité řádkování, text psaný v indexu Cim zacit a íak ookracovat? 1) zvolit téma 2) sestavení osnov úvod stať zaver Výhody: zrychluje psaní, vytváří logiku textu Pravidlo osmé: Udělej si osnovu dříve než začneš psát. it tem; 2) sestavení osm 3) DřÍDrava literatury a zi získání (literární prameny) zpracovaní (literární prameny) iracovani roztřídění dle osnovy Vhodné je si materiály rozložit do jednotlivých hromádek, dle osnovy roztřídit a uspořádat v daném pořadí a nakonec postupně zpracovávat Stejně tak lze pracovat i v PC: - odstavce v jednom souboru - více souborů - funkce copy, paste, cut it term 2) sestavení osnovy 3) příprava literatury a zpracování 4) seosani textu Zpracování textu (později) jazyk a gramatika logika návaznost vyváženost obsah sdělení srozumitelnost, jednoduchost a přijatelná stručnost 5) text nechat ..uležet" „Nic se nestane, uložíme-li hotovou práci na nějaký měsíc do zásuvky". (H Sikl) (babiččina četba) Pravidlo deváté: Máš-li velké potíže s přesným vyjádřením něčeho, asi tomu moc nerozumíš. ,Věci skutečně nerozumíte, dokud ji neumíte vysvětlit vlastní babičce" (A. Einstein) r echnika nsaní Pri revizi textu dbei dalších Dravidel: Pravidlo desáté: Buď stručný - LITERA SCRIPTA MANET „Na vědcích by se mělo chtít, aby své práce tesali do kamene" (W.A.Arnold) „Omlouvám se za tak dlouhý dopis; neměl jsem čas napsat kratší" (napsal B. Pascal) / Pravidlo jedenácté: Téměř každá věta se může zkrátit, aniž by se snížilo množství obsažených informací. Dlouhé věty se špatně čtou, ztrácí se v nich smysl sdělení - velká chyba jsou tzv. odstavcové věty nebo jednověté odstavce. it tem; 2) sestavení osnovy 3) příprava literatury a zpracování 4) seosání textu jazyk a gramatika logika návaznost vyváženost obsah sdělení srozumitelnost obsah sdělení (plynutí myšlenky) zbytečná slova a věty srozumitelnost a jednoduchost it terna 2) sestavení osnovy 3) příprava literatury a zpracování 4) sepsání textu 5) text nechat „uležet" 6) 1. revize textu 7) Oprava textu 8) opět nechte text „uležet 9) tisk téměř hotové verze a 2. revize textu konečná oprava chyb, hlasité čtení Pravidlo dvanácté: Text si vždy přečti nahlas. Máš-li při jeho čtení nějaké potíže, bude je mít i čtenář. 10) odevzdání školiteli 1) zvolit téma 2) sestavení osnovy 3) příprava literatury a zpracování 4) sepsání textu 5) text nechat „uležet" 6) 1. revize textu 7) Oprava textu 8) opět nechte text „uležet" 9) tisk téměř hotové verze a 2. revize textu 10) odevzdání Proč se tím budeme zabývat? úkol č. 3 je sepsání posudku na předloženou BP někdy v budoucnu budete vyzváni k vypracování posudku např. diplomové nebo doktorské práce oponent = dobrý posudek se všemi náležitostmi hlavička = Bakalářská práce: DNA markery u leguminóz Autor: Jana Ukázková - úvod = o čem práce pojednává, co je cílem předložené práce a j ej í členění - odstavec Předložená bakalářská práce je zaměřena na popis genetických map u některých zástupců leguminóz z tropických, subtropických a mírných zeměpisných oblastí. Práce je prezentována na 15 stranách textu, dle přehledu literatury je v ní citováno 13 prací a doplněna je obrazovou přílohou dvou konkrétních genetických map. - charakteristika jednotlivých částí s vvtčením chvb a nedostatků = - závažnější věcné chyby - kvalita jazyka (ne překlepy a technické nedostatky, pokud jich není příliš mnoho) - nedostatky a chyby konkretizovat, stejně tak případné návrhy - dbát na etiku - neurážet x žádná shovívavost - plná kritika nedostatků, ve prospěch kvality práce i autora V úvodní části práce je vysvětlena problematika detekce polymorfismu u RFLP markerů a u DNA markerů využívajících polymerázovou řetězovou reakci (PCR). V další části bakalářské práce je vždy pro dané zástupce uvedena charakteristika sestrojených genetických map, pojednáno je o struktuře genomu a jsou uvedeny výsledky lokalizace genů pro hospodářsky významné znaky. Obsahově je práce spíše výčtem popisných údajů a členění často na sebe nenavazujících odstavců znesnadňuje čtení a orientaci v textu. V úvodní části chybí popis konstrukce genetických map s uvedením obecných cílů či důvodů těchto konstrukcí......................... K závažnějším nedostatkům patří chyby v souvislosti s citovanou literaturou. Šest citovaných prací v textu není uvedeno v souhrnu literatury (Kolchinsky a spol, 1995; Bai a spol, 1997; Torres a spol., 1993; Brummer a spol., 1993; Kiss a spol, 1993 a Echt a spol., 1994).......... Stavba textu 1) Odstavec jako základní jednotka - „Odstaveček prosím" 2) Tvorba textu - rozvíjení tématické linie (obsah textu) 3) Kompozice textu - „jako v detektivce" (děj textu) 4) Pišme hezky česky 5) Nejčastější chyby, které by se nemusely opakovat, kdyby Stavba textu Obecně o celkovém textu: 1) Přímočarost bez zbytečných odboček (typické pro češtinu nebo němčinu) - větvení textu = nepřehlednost textu 2) Kanonizace textu - členění na strukturní jednotky - IMRAD, mezititulky, číslování, odstavce a kapitoly (ať každý odstavec obsahuje jednu myšlenku a odstavce v rámci kapitoly na sebe navazují - čtenář vám budě vděčný a text se mu bude líbit) tavce Stavba textu Od větv k odstavci a finálnímu textu - nejdůležitější jednotkou textuje odstavec - co odstavec to myšlenka - tedy nový prvek (téma) v textu by měl začínat novým odstavcem - každý odstavec má svoji vnitřní strukturu - první věta zahajuje, uvozuje hlavní myšlenku odstavce - další věta(y) logicky navazují na první větu odstavce a blíže popisují představený problém - poslední věta ukončuje myšlenku, může i shrnout pokud je myšlenek více a případně uvozuje, „chystá půdu" pro další myšlenku v následujícím odstavci - odstavce by neměly být ani příliš dlouhé, ale ani příliš krátké („jednověté odstavce") Stavba textu Příklad neořehlednosti textu, kterv není členěn na odstavce Buněčný metabolismus zahrnuje procesy získávání energie i procesy, při nichž se za spotřeby energie syntetizují organické látky. Pro syntetické procesy je klíčový zejména zdroj uhlíku, neboť základem organických molekul je vždy uhlíkový řetězec. Podle zdroje uhlíku dělíme organismy na litotrofní, které získávají uhlík z C02, a organotrofní, které získávají uhlík z organických sloučenin. Kromě se organismy často značně liší ve svých schopnostech využívat různé zdroje ostatních biogenních prvků. Podle způsobů získávání energie dělíme organismy na fototrofní, které dovedou převádět energii slunečního záření na energii chemických vazeb, a chemotrofní, které energii získávají oxidací organických či anorganických látek Při oxidaci je elektron postupně předáván molekuly na molekulu, přičemž se uvolňuje využitelná energie, která je tím větší, čím větší je energetický rozdíl mezi molekulou donoru (primárního zdroje elektronu) a akceptoru (konečného příjemce). Donorem a akceptorem elektronu mohou být různé organické či anorganické molekuly. Při oxidaci se molekuly donoru i akceptoru pochopitelně mění: donor odevzdáním elektronu, akceptor jeho přijetím. Vzniklé produkty buňka buď využívá v dalších procesech, ukládá v cytoplazmě, nebo vylučuje do vnějšího prostředí. Metabolický proces fototrofie je označován jako fotosyntéza. Při fotosyntéze probíhá také předávání elektronů mezi molekulami přenašečů, elektron se však získává fotolýzou (rozštěpením molekuly prostřednictvím energie fotonu), nikoli oxidací. Rozlišujeme dva značně rozdílné typy fotosyntézy, rostlinného (sinicového) typu a bakteriálního typu. Stavba textu Příklad téhož textu členěného na odstavce Buněčný metabolismus zahrnuje procesy získávání energie i procesy, při nichž se za spotřeby energie syntetizují organické látky. Pro syntetické procesy je klíčový zejména zdroj uhlíku, neboť základem organických molekul je vždy uhlíkový řetězec. Podle zdroje uhlíku dělíme organismy na litotrofní, které získávají uhlík z C02, a organotrofní, které získávají uhlík z organických sloučenin. Kromě se organismy často značně liší ve svých schopnostech využívat různé zdroje ostatních biogenních prvků. Podle způsobů získávání energie dělíme organismy na fototrofní, které dovedou převádět energii slunečního záření na energii chemických vazeb, a chemotrofní, které energii získávají oxidací organických či anorganických látek. Při oxidaci je elektron postupně předáván molekuly na molekulu, přičemž se uvolňuje využitelná energie, která je tím větší, čím větší je energetický rozdíl mezi molekulou donoru (primárního zdroje elektronu) a akceptoru (konečného příjemce). Donorem a akceptorem elektronu mohou být různé organické či anorganické molekuly. Při oxidaci se molekuly donoru i akceptoru pochopitelně mění: donor odevzdáním elektronu, akceptor jeho přijetím. Vzniklé produkty buňka buď využívá v dalších procesech, ukládá v cytoplazmě, nebo vylučuje do vnějšího prostředí. Metabolický proces fototrofie je označován j ako fotosyntéza. Při fotosyntéze probíhá také předávání elektronů mezi molekulami přenašečů, elektron se však získává fotolýzou (rozštěpením molekuly prostřednictvím energie fotonu), nikoli oxidací. Rozlišujeme dva značně rozdílné typy fotosyntézy, rostlinného (sinicového) typu a bakteriálního typu. Stavba textu Tvorba textu aneb i ak se tvoří text a odstavce - rozvíjením tématické linie téma (T) - o čem se tu mluví réma (R) -jádro výpovědi, vlastní obsah tématu 1) Tvorba vět v rámci odstavce = dílčí téma, dílčí réma Tepelné vzduchové hmoty se při pohybu nad pevninou odspodu ochlazují. Toto T2 R2 ochlazování vede ke stálé se zmenšujícímu rozdílu teploty v různých výškách. Nazýváme \ R3 T4 R4 jej teplotní gradient. Tento gradient se v takových případech pohybuje zpravidla v mezích 0,2 - 0,4 °C na 100 m výšky. Srdeční infarkt představuje nekrózu myokardu. Toto ischemické postižení buněk je výsledkem procesu, který začíná obvykle trombózou některé z větších věnčitých tepen. V oblasti danou tepnou zásobované vznikají nejprve reverzibilní změny, které.... Tvorba textu Stavba textu Věty se pak skládají samy, neboť réma (Rl) generuje nové téma (T2) na začátku další věty, která pokračuje rématem (R2) tohoto tématu, a to generuje téma (T3) další věty. věta 1 věta 2 věta 3 2) Stejným mechanismem se skládají i odstavce 1. věta = téma odstavce další věty = réma odstavce poslední věta = navozuje nové téma dalšího odstavce Příklad textu členěného na odstavce a reorezentuiícího vztahu téma a réma na odstavcích. Tvorba textu Stavba textu Příklad textu členěného na odstavce a reorezentuiícího vztahu téma a réma na odstavcích. hypertéma Buněčný metabolismus zahrnuje procesy získávání energie i procesy, při nichž se za spotřeby energie syntetizují organické látky. Pro syntetické procesy je klíčový zejména zdroj uhlíku, neboť základem organických molekul je vždy uhlíkový řctězeflHMJHB ft uhlíku dělíme organismy na litotrofní, které získávají uhlík z C02, a organotrofní, ktM?Í!ISÍ9WjRhlík z organických sloučenin. Kromě se organismy často značně liší ve svých schopnostech využívat různé zdroje ostatních biogenních prvků. Podle způsobů získávání eneHIIM§HB|ganismy na fototrofní, které dovedou převádět energii slunečního záření na energii chaBHuMpillillb, a chemotrofní, které energii získávají oxidací organických či anorganických látek. Při oxidaci je elektron postupně předáván molekuly na molekulu, přičemž se uvolňuje využitelná energie, II mezi molekulou donoru (primárního zdroje elektronu) a _________ceptorem elektronu mohou být různé organické či anorganické molekuly. Při oxidaci s^BIJ^BB^^^^^BSMíB^^^BBW^^BB^TOÍWBByzdáním rozvíjí hypotéma nižšího stupně - lze i do nového odstavce cytoplazmě, nebo vylučuje do vnějšího prostředí. Metabolický proces fototrofie je označován j ako fotosyntéza. Při fotosyntéze probíhá také předávání on se však získává fotolýzou (rozštěpením molekuly eme dva značně rozdílné typy fotosyntézy, rostlinného (sinicového) typu a bakteriálního typu. 2. hypotéma nižšího stupně (fototrofie) Tvorba textu Stavba textu Rozvíjením tématické linie vzniká text, který má obsah a logiku a tím pádem se dobře čte. !!! Proto pozor jen na skládání vět z jednotlivých článků -jsou vytrženy z takového obsahového kontextu a pokud je nezpracujete do kontextu vašeho odstavce, pak je text nečitelný a nepřehledný - čtenář se v něm ztrácí. Pravidlo třinácté: Neopisuj věty z článků, ale tvoř věty nové, které padnou do toku myšlenek tvého textu. Tvorba textu Stavba textu - v rámci textu nemusí být jen vztahy tematické vztahy obsahově logické, příčinné, časové apod. (viz. Cmejrková a kol., kapitola 7) -jednotlivé odstavce reprezentují jednotlivé myšlenky (subtémata) nějakého tématu, které je jim společné - kapitola, podkapitola 2. APOPTOZA........................................................................ 2.1 Apoptóza ve vývoji organismů................................................ 2.2 Průběh apoptózy................................................................ 2.3 Regulaceapoptózy............................................................... 2.4 Úloha cytotoxických T lymfocytů v apoptóze.............................. 3. VIRY A APOPTÓZA.............................................................. 3.1 Apoptóza jako obranný mechanismus při virové infekci.................. 3.2 Viry ovlivňující buněčnou apoptózu......................................... 3.2.1 Adenoviry................................................................ 3.2.2 Virus africké horečky prasat (ASFV)................................. ...................4 ...................5 ...................6 ...................7 ..................8 ...................8 ..................8 ..................8 ...................9 Stavba textu KomDOzice textu celého textu časti textu Osnova Každá část textu pojednává o nějakém problému, který se vztahuje k tématu BP. Jeden z příkladů kompozice fděie) textu 1) Vyslovení hypotézy, teorie nebo dogmatu 2) Nesoulad nebo neplatnost pro jiné případy 3) Příklady nesouladu 4) Hledání způsobu jak to vysvětlit 5) Nový model - hypotéza Komnozice textu Stavba textu Dogma Svůj nebo můj? Pravidlo české gramatiky zní: Přivlastňujeme-li podmětu věty, používáme tzv. zvratné neboli reflexivní zájmeno svůj. Když jsem nedávno pročítala seminární práce, ve kterých studenti psali o svém vysokoškolském studiu, zaujala mne v nich vysoká frekvence zájmena můj namísto očekávaného zájmena svůj. Uvedu několik příkladů: Chtěl bych se zamyslet nad mojí odbornou kvalifikovaností. - Během mého studia jsem měl problémy se sháněním odborné literatury. - V mojí diplomové práci se budu zabývat několika současnými českými autory. Krize Ve všech uvedených pracích - a chtěla bych připomenout, že šlo o studenty oboru český jazyk, tedy budoucí učitele češtiny - bychom podle pravidla české gramatiky na místě zájmena můj očekávali zájmeno svůj. Dopustili se snad studenti svými výroky závažné gramatické chyby? Jejich výroky svědčí o tom, že volba mezi zájmenem můj a svůj není podřízena jen jednoduchému gramatickému pravidlu o podmětu věty. Pravidlo o reflexivnosti se pravděpodobně v češtině důsledně nedodržovalo nikdy, ale v současné češtině, nejen mluvené, ale i psané, se působnost tohoto pravidla hodně oslabuje. Proti tomuto pravidlu totiž působí jiné tendence. Např. ta, že mluvčí chce použitím přivlastňovacího zájmena můj podtrhnout své vlastnictví věci, o níž mluví, svůj mimořádný zájem na ní, svůj citový vztah k ní apod. Tak tomu bylo v uvedených studentských pracích. Uveďme si více příkladů, tentokrát z řeči politiků a literátů: Podrobil jsem se té nejtěžší zkoušce mého života. - Jak jsem řekl v mém projevu ve sněmovně. - Navážu na mé předchozí vyjádření. - Měl jsem můj byt vystěhovaný. - To je věc, kterou bych rád připomněl pro mé kolegy. Ve všech těchto případech vyhrává zájmeno můj nad zájmenem svůj proto, zeje subjektivnější, silnější a důraznější. Komnozice textu Stavba textu Hledání - varianta 3 Ale do užívání zájmena svůj zasahují i další okolnosti. Velký podíl na vytlačování zájmena svůj má také jiná tendence, s níž se setkáváme v současné češtině, totiž snaha zdvořile oslovovat adresáta, např. v novinových a časopiseckých rozhovorech: Co považuiete za Vaši první významnou zakázku? - Můžete uvést některé konkrétní výsledky z Vaší práce? Nový model Gramatické pravidlo o užívání zájmena svůj bylo odvozeno z analýzy výpovědi neutrálního oznamovacího typu, v nichž má nepochybně svou platnost. Analyzujeme-li texty laděné subjektivně či texty s výraznou orientací k adresátovi, zjišťujeme, že pravidlo gramatické je tu potlačeno tendencemi diskursními, které mohou být interpretovány v termínech expresivity, zdvořilosti a apelativnosti. Komnozice textu Stavba textu Další charakteristiky komoozice odborného textu ■ uvození tématu - o čem bude následující text - využito pro celou práci, tak i v jejich částech např. Apoptóza je aktivní, geneticky řízený proces, spojený s expresí nových genů a se syntézou a aktivací určitých enzymů.......Apoptóza začíná spuštěním kaskády intracelulárních proteolytických enzymů, které.... Z mitochondrií jsou uvolňovány reaktivní kyslíkové radikály, napadající... použití definic - podávají vysvětlení čtenáři např. Chaloupka (1996) charakterizuje apoptózu jako způsob, kterým se realizuje programovaná smrt, tedy geneticky řízená eliminace některých tkání a buněk, během vývoje organismů. - kritický přístup k výsledkům jiných autorů např. Ne vždy jsou cílové buňky eliminovány přímým kontaktem v důsledku interakce ligandu s receptorem. vyjadřování pochybností a nejistot např. Zatím není známo, jestli protein E3 11.6K , zvaný adenovirus death protein (ADP), podporuje apoptózu. Komnozice textu Stavba textu - prostá prezentace pozorování např. Protein reguluje transkripci buněčných a virových genů a ukázalo se také, že potlačuje expresi p53, což podporuje jeho schopnost blokovat apoptózu (O'Brien, 1998). - diskusní rozbory např. Na základě hybridizační analýzy pozdních ekotypů s časně kvetoucími ekotypy byly identifikovány lokusy FRIGID A (FRI) a Flowering Altered (FIA) podmiňující pozdnost v přírodních populacích (Napp-Zinn, 1957; Lee et al., 1993). Později bylo zjištěno, že lokusy FRI a FIA představují tentýž lokus, který byl lokalizován na konec krátkého ramene chromozomu 4 (obr. 1) (Clarke a Dean, 1994). - uvádění příkladů příkladem může být....// Např. u erytrocytu.....//na obrázku je .... Komnozice textu Stavba textu vyjadřování předpokladů vysvětlování Např. Pokračující výzkumy věnované vlivu virů na regulaci apoptózy mohou vést k vývoji nových léčebných postupů u onemocnění, které jsou spojené s nepřiměřenou apoptózou (AIDS, neurodegenerativní poruchy). To, jestli dojde k apoptóze v buňce, záleží na poměru mezi hladinami všech regulačních proteinů. Poměr mezi Bcl-2 a p53 pak také rozhoduje o vzniku nádorů (Obr. 7). Pokud převažuje hladina p53, tak je v buňce se silně poškozenou DNA aktivována apoptická dráha a buňka je eliminována. Převaha Bcl-2 naopak vede k mutaci DNA a transformaci v nádorovou buňku. Karcinogeneze je často spojována s defektním tumor supresorovým proteinem p53, který mutací ztrácí schopnost interakce s poškozenou DNA a apoptóza je tak zablokována hned na začátku. Léčba nádorů formou chemoterapie je často postavena na indukci apoptózy, která v nádorové buňce selhala (Chaloupka, 1996; Chaloupka, 1999; Grimberg, 2000). r r r v O vyvozovaní záveru Uvedené skutečnosti ukazují // naznačují // dokládají // dokumentují // svědčí o tom, že... Komnozice textu Stavba textu hodnocení a shrnutí výsledky nejsou nijak přesvědčivé // výsledek vypadá velmi nadějně pro léčbu ... Apoptóza je tedy vyvolána faktory, které vyplývají z přirozeného vývoje organismu, ale jako její induktory působí i faktory původu exogenního (Obr. 1). Buněčná smrt pak funguje jako obranný mechanismus a likviduje buňky potencionálně škodlivé pro tělo - infikované viry či bakteriemi nebo s nenávratně poškozenou DNA. Stavba textu Pišme hezkv česk - ve vědě se píše anglicky, čeština přežívá jen na místní úrovni - republikové konference, bakalářské, diplomové a disertační práce - ale i těch v angličtině přibývá to vede ke zhoršování kvality češtiny - neumíme se správně vyjadřovat odbornou češtinou Z fyzikálních mutagenů stojí za zmínku zejména X paprsky.....paprsky X Jedná se o skupinu vir genů. Jedná se o skupinu genů vir. anglické termíny a hantýrka Byl prováděn Southern blotting - Byl prováděn Southernův přenos DNA je možné pozorovat jako výrazné bandy na agarózovém gelu. DNA je možné pozorovat jako výrazné proužky na agarózovém gelu. Přítomnost DNA ve vzorku byla prokázána pomocí PCR reakce. Přítomnost DNA ve vzorku byla prokázána pomocí PCR. Přítomnost DNA ve vzorku byla prokázána pomocí polymerázové řetězové reakce. Pišme hezkv česk^ Stavba textu Anglicko-české odborné a terminologické slovníky TEEíVilitOEOGiE iVIDEEEUEÁEi Ú El DE D DIE Stanislav Rosypal &kol. CESKĚ ODBORNÉ TERMÍNY. JEJICH DEFINICE A ANGLICKÉ EKVIVALENTY BRNO 2001 PRVNÍ VYDANÍ Pišme hezkv česk^ Stavba textu Anglicko-české odborné a terminologické slovníky - větv ořevzaté z angličtiny nemají v češtině často smysl: Geny přenášené z bakterií do rostlinného genomujsou lokalizovány na plazmidu označovaném jako Ti (angl. tumor inducing) u Agrobacterium tumefaciens. Geny přenášené z bakterií Agrobacterium tumefaciens do rostlinného genomujsou lokalizovány na plazmidu označovaném jako Ti (angl. tumor inducing). kupení slov - ?? Krásy českého jazyka ?? Umožňuje relativně velice snadnou identifikaci genů. Stavba textu 1) Odstavec jako základní jednotka - „Odstaveček prosím" 2) Tvorba textu - rozvíjení tématické linie 3) Kompozice textu - „jako v detektivce" 4) Pišme hezky česky 5) Nejčastější chyby, které by se nemusely opakovat, kdyby v Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely onakovat, kdvb Ve své podstatě nejde o chyby, avšak nedostatky, které mohou srážet obsahovou kvalitu práce v očích oponenta nebo korektora. 1) Používání „vyčpavkových" obratů omezit na minimum, pozor na několikanásobného opakování stejné „vycpávky" v jednom odstavci. Lze tedy konstatovat, že .... Je ale potřeba si uvědomit, že ... Ukázalo se, že ... Bylo prokázáno, že ... Je zřejmé, že ... Existují práce, které ... Dále bylo zjištěno, že ... netřeba je nahrazovat, v 99% případů jsou zbytečná - opravit při průklestu textu Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemuselv ooakovat, kdvb 2) Zbytečné užívání cizích slov, máme-li výraz český. komponenta - složka experiment - pokus separace - oddělení klastr - shluk radiace - záření bandy - proužky trítment - působení eluce - vyloučení permanentně - stále intracelulární - vnitrobuněčný exitovat - umírat viabilita - přežití, životaschopnost částečný gain na chromozómu Cizí slova s českými předponami, spojování latinských a řeckých slov s českými vyeluovat - oddělit, vyloučit předtrítovat (treatment) látkou X - předpůsobit, ošetřit látkou X vyzoptimalizovat - optimalizovat, vyladit naizolovat - izolovat, oddělit (izolovat DNA je zažito) zaočkovat - očkovat hyperjemný - velmi jemný Ve složitých větách plných anglických slov nepřeložitelných do češtiny pomáhá každé české slovo zvýšit srozumitelnost textu. v Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely onakovat, kdvb 3) Kupení přívlastků bez předložek + správné pořadí. teplem indukovaná funkční separace komplexů - funkční oddělení komplexů indukované teplem kyslík vyvíjející komplex - komplex vyvíjející kyslík DSC maximum - maximum DSC X paprsky - paprsky X vir geny - geny vir Kupení předložek .. .bylo uvedeno v před několika lety publikované práci... 4) Časté opakování popisů složených z několika slov. Lze je většinou nahradit vhodnou zkratkou - při prvním výskytu v textu se zkratka uvede do závorky a při dalších výskytech je (musí být) důsledně používána - práci lze opatřit také seznamem použitých zkratek s vysvětleným významem - nevysvětlujte všeobecně známé zkratky - např. DNA, PCR apod. - ale s jejich množstvím to nepřehánět - výslovnost (obhajoba) v Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely onakovat, kdvb 5) Přílišné používání - pasivních vazeb, které lze nahradit aktivní formou je předmětem zkoumání = zkoumá se je prokázáno za platné = platí - zbytečných pomocných sloves prováděli inkubaci = inkubovali použili metodu měření = změřili dochází k poklesu = klesá Příklad významových změn při použití pasiva a jeho odstranění: a) Králíci byli chováni v kleci... Tito králíci byli očkováni = zbytečná pasiva b) Králíci se chovali v kleci... Tito králíci se očkovali = neúspěšný pokus odstranění pasiva: králík, který se sám očkuje © c) Králíky jsem choval v kleci... Králíky jsem očkoval v Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely onakovat, kdvb 6) Slova zamořující text - snažit se je nahradit jinými ekvivalenty, provádět = dělat, udělat nebo významové sloveso v pravidelných intervalech se provádělo měření aktivity a po skončení se provádělo hodnocení vlivu jednotlivých faktorů v pravidelných intervalech se měřila aktivita a po skončení byl hodnocen vliv jednotlivých faktorů bílkovina hraje významnou úlohu v... bílkovina je významná v .... Neičastěiší chvbv, které bv se nemuselv ooakovat, kdvb 7) Používání laboratorního slangu (žargonu) - hlavně v DP, pozor ale i na výrazy v BP odposlechnuté v laboratoři bandy, trítment, iritovat teplotní inkubace na listech teplota 50% inaktivace ve 49 °C destilované vodě v Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely onakovat, kdvb 8) Používání mnohomluvných obratů - často se vkrádaj í při interpretaci z angličtiny ve snaze „vyšperkovat" sdělení „krásou' českého jazyka ... nemusí být nutně ... ... nutně musí... ... prakticky nedochází... naprosto analogický = v češtině shodný - v biologii však málokdy = podobný nalezli detekovatelnou aktivitu = zjistili aktivitu modelové schéma = model oba dva = oba dochází ke změně = mění se v délce trvání 2 sekundy = trvající 2 s soustředěná pozornost = pozornost (nesoustředěný nemůže být pozorný) Každou větu si pozorně přečtěte a vyškrtejte všechna zbytečná slova, aniž ovšem porušíte srozumitelnost textu. Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely ooakovat, kdvb 9) Vědecké (latinské) názvy organismů. - píší se správně kurzívou Escherichia coli - při prvním výskytu se uvádí rodový i druhový název, při dalších výskytech je možné zkrácení rodového jména E. coli - jsou nesklonná - používat jen v nominativu, neskloňují se podle českých vzorů u Salmonely typhimurium = u Salmonela typhimurium U Drosophily melanogaster = u Drosophila melanogaster pokusy s Vicif= pokusy s bobem (Viciafaba) © Pozor pak v mluveném slově - „sklereidy u Pira" zní jako sklereidy upíra © - česká transkripce - u drozofily (spíše nedoporučuji - raději použít české názvy, pokud existují - např. u octomilky, u myši, u šimpanze apod. v Neičastěiší chvbv, které bv se nemuselv ooakovat, kdvb 10) Nepřesné časové údaje - práce je uchována, význam časuje pak relativní, letos, loni = v roce 2004, v roce 2003 Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely ooakovat, kdvb 11) Nepřesná vyjádření. „extrémní velikost" - může značit příliš velký i příliš malý „díky" -- označuje kladný jev - nepoužívat např. ve spojení „díky poškození" „shodný", „stejný" - znamená skutečnou shodu* - „podobný", „obdobný" nesmysly - přibližně identický, téměř zcela shodný, zcela nevratná, částečně přesná podle vzoru „částečně těhotná" „nebylo nezbytně nutné" - dvojí zápor - „nebylo nutné" „citlivost jsem prováděl kapkovou metodou" „Jako příklady zdroje kontaminace jsou nejčastěji uváděny štěpy tvrdé pleny mozkové, transplantované rohovky, neurochirurgické nástroje a mrtvolné růstové hormony (Browner**/, 1992)." v Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely onakovat, kdvb 12) Synonyma s mírou - nejde o beletrii, ale o vědecký text, který má být jasný a strohý. 13) Vynechávání slov „před a po měření" znamená vlastně „před měření a po měření" správně - „před měřením a po měření" nebo „před měřením a po něm' „nad a uvnitř porostu" = „nad porostem a v něm" v 14) Čárky oddělující vedlejší věty. - čárka musí být na jejich začátku i na jejich konci - umístěna na správném místě - poruší smysl věty Příklad z literatury „...když vstoupil baron do pokoje na hlavě, cylindr na nohách, lakovky v ruce, hůl se stříbrným kováním na pravém oku, monokl dal se do hlasitého smíchu a zvolal: Dobrý den, starý kamaráde!" (!! záludnosti PC!!) v Neičastěiší chvbv, které bv se nemuselv ooakovat, kdvb Stavba textu 15) Pomlčky a spojovníky. Pomlčka 5.-10. ledna protiklad znělé - neznělé souhlásky s mezerami z obou stran (mezerník), nahrazuje až, až do, proti s. 66-69 kap. 3-5 1999-2003 bez mezer, při uvádění číselného rozsahu jen číslicemi SDoiovník RNA-viry Rh-faktor hygienicko-epidemiologický -viry = RNA-viry ....RNA- viry = RNAviry .....RNA- Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemuselv ooakovat, kdvb 16) Značky j ednotek. - mezi číslem a jednotkou se píše mezera 10 ul vzorku, 200 mg listů, 37 °C, 50 % vyšetřovaných jedinců - mezi číslem a jednotkou se nepíše mezera, pokud jednotka nahrazuje přídavné jméno s 50% přesností = s padesátiprocentní přesností 6V baterie = šestivoltová baterie 17) Seskupování podstatných jmen - často je lze spojit se slovesem pomohla k určení rozdělení = pomohla určit rozdělení v Stavba textu Neičastěiší chvbv, které bv se nemusely onakovat, kdvb 18) Věty nesmí být ani příliš krátké (jen holé věty) ani příliš dlouhé. - srozumitelné věty přiměřené délky - nelze se naučit - přečíst nahlas, špatně postavené Věty Se Špatně ČtOU (viz. pravidlo: Text si vždy přečti nahlas. Máš-li při jeho čtení nějaké potíže, bude je mít i čtenář.) 19) Další nesmysly: ... detekce prionu podobného genu koně... ... VRN1 kóduje DNA-vazebný protein a VRN2 protein zinkového prstu. ... budoucí práce na poli molekulární biologie... ... bakterie buď nemají nebo tvoří malou kapsulu... Pravidlo čtrnácté: Nepoužívej cizí slova, slogany a laboratorní žargon, nepoužívej dvojí zápor, vyhni se nepřesným vyjádřením, překlepům a gramatickým chybám. Stavba textu Srozumitelnost textu: Text je členěn do kapitol a odstavců. - rozdělení na kapitoly musí sledovat logiku celého textu - co odstavec to myšlenka - 1. věta uvede odstavec, další obsah, poslední věta navazuje na další odstavec - anglosaský styl = odstavce na sebe navazují větami i smyslem, autor píše tak, aby tomu každý rozuměl x německý styl - čtenář musí pochopit text, sám se v tom vyznat (není to chyba, ale vliv jiné kultury) - zamyslet se, zda je tam to, co chci sdělit - zda nejde o výňatky beze smyslu „Jsou knihy, jež nejsou napsány k našemu poučení, nýbrž aby se vědělo, že autor něco věděl.' (J.W.Goethe, spisovatel) Stavba textu Jak zaiistit srozumitelnost textu, minimalizovat stvlistické nedostatk další chvbv? - kontrola pravopisu v PC - text nechat uležet - před korekcí si přečíst „desatero" nebo prostudovat nejčastější chyby - při prvním čtení textu se zaměřit na chyby - oči korektora - při druhém hlasitém čtení se zaměřit na obsah a srozumitelnost - oči oponenta nestyďte se požádat o přečtení nebo korekturu vaše kolegy, školitele, přátele, manžele, manželky, milence a milenky a buďte jim vděčni, jsou-li jako posuzovatelé přísní. Kdo se za kritiku uráží, neměl by pracovat ve vědě. - vhodná je také znalost normy CSN 01 6910 s pravidly pro úpravu písemností (.pdf v ISu) .4.2006 Přehled literatury a ieií citace v textu - správná a přesná citace je předpokladem snadného nalezení příslušného literárního pramene 1) Citace v textu -2) Citace v přehledu literatury Přehled literatury a i ei í citace v textu D Citace v textu A) Klasické zdroje Používá se tzv. harvardské citování - uvede se jméno autora bez iniciál a rok publikace A) Novák (1998) zjistil, že..... B) ... bylo zjištěno, že ... (Novák, 1998) u dvou autorů Obě jména spojená spojkou a, and, et, + rok vydání publikace A) Novák a Janoušek (1998) zjistil, že..... B) ... bylo zjištěno, že ... (Novák a Janoušek, 1998) u třech a více autorů - jmenuje se jen první autor a za něj se přidá zkratka et aL, aj., a spol., a kol. + rok vydání publikace - !!!zvolit a používat vždy jen jeden typ uvádění kolektivu autorů!!! A) Ptáček aj. (2001) zjistili, že..... B) ... bylo zjištěno, že ... (Ptáček aj., 2001) Vhodnější je forma B) 1) Citace v textu Přehled literatury a ieií citace v textu Pokud je v souvislosti s poznatkem citováno více prací: ... diagnostika původců onemocnění je založena na metodě PCR (Novák, 1998; Málek a Pátek, 2000; Ptáček aj., 2001) Pozor na autory, kteří v daném roce publikovali dva a více článků - citace jsou opatřeny malými písmeny a,b,c atd. (Králik, 2001a) (Králík, 2001b) - nutno zjistit již na začátku psaní vlastního textu (Králik, 2001; Králík a spol. 2001) 1) Citace v textu Přehled literatury a ieií citace v textu Vancouverské citování - odkazy v textu se číslují první citovaný odkaz dostane č.l, v souhrnu literatury je tedy na prvním místě, při dalším výskytu v textuje opět zastoupen odkazem 1 Bylo prokázáno, že kvasinky utilizují ještě další významné látky (Houser aj., 1991). Bylo prokázáno, že kvasinky utilizují ještě další významné látky [1]. Bylo prokázáno, že kvasinky utilizují ještě další významné látky1. Přehled literatury a i ei í citace v textu V bakalářských pracích používáme harvardské citování. CHYBY v citacích v textu: - neuvádí se tituly, křestní jména ani iniciály Bylo prokázáno, že kvasinky..........(A. Houser aj., 1991). ...bylo zjištěno, že ... (Ptáček, Špaček a Drozdová, 2001) - necitlivé kladení citací Přehled literatury a i ei í citace v textu Správné kladení citací „citlivé" kladení citací - tedy tam, kam patří = jakmile je zmíněn poznatek uvedený v nějakém článku, nejpozději na konci věty se uvádí citace tohoto článku pokud v dalších větách čerpáme informace z téhož článku, již citaci znovu neuvádíme až do chvíle, kdy uvádíme informaci z jiného zdroje chybou je kladení citací až na konec poslední věty odstavce nebo až za poslední větu odstavce včetnč člověka, a také u jednobuněčných organismu a u rostlin. U rosrlin je ale k dispozici ménč udajü. Apopróza hraje klíčovou roli především v ontogen/zi mnohobuněčných organismu. Je indukována u buněk nepotřebných pro organismus a/řispívá tak k tvarování orgánu během morfogeneze, např.: zánik buněk, které spojují prsty. Zapojuje se též do vývoje imunitního sysrému - v thymu jsou eliminovány ty T Lymfocyty, které nevytvořily specifický membránový receptor TCR nebo nerozeznávají vlastní a cizí antigény. Přežití takových buněk by vedlo k poškozování vlastní imunitní soustavy a vzniku autoimunirních chorob. Apoprózou je odstraněna i část nervových buněk při vývoji nervového systému (Lodish a kol., 1990). Apoptóza je tedy vyvolána faktory, které vyplývají z přirozeného vývoje organismu, ale jako její indiiktory působí i faktory původu exogen mho (Ohr. 1). Buněčná smít pak funguje kondenzaci chromatins fragmentaci DNA a rozpadu buňky. To jsou charakteristické morfologické znaky provázející tento typ buněčné smrti [Cooper, 1997). Apopróza začíná spuätcním kaskády intraceiuiárních proteofytických enzymu, které uvolňují blokádu bunečné smrti, tj. inaktivují enzymy opravující poškozenou DNA. Zároveň rozkládají proteiny jádra a cyroskeletu, což vede k zahušťování objemu cytoplazmy, buňka ztrácí vodu a smršťuje se. Proteázy zodpovědné za tyto děje byly dříve označovány jako ICE (interleukin-1 -beta converting enzymes), dnes se nazývají kaspázy. Je to skupina cysteinových proteináz, které hydro lyžuj í bílkoviny. Enzymy piisobí v kaskádu a moliou se aktivovat navzájem. Současna s aktivací proteolytické kaskády docliází k poškození mitochondrií a ke ztrátŕ koordinace energetických pochodu. Z mitochondrií jsou uvolňovány reaktivní kyslíkové radikály, napadající proteiny a hlavne DNA. a také ionty Ca2-, které aktivují Ca1+- a Mg1+-dependenfní endonukleázy. Tyto enzymy hydroJyzujf chromozomální DNA v místech mezi navázanými nukleosomy za vzniku ruzní velkých fragmentu DNA. které vytváří při elektroforéze v gelu charakteristický profil otisku DNA (Ohr. 3). Mitochondrie si i přes poškození zachovají svoji strukturu (Chaloupka, 1996; Chaloupka, 1999; Bergen 2000). Fragmentací DNA, kondenzací chromatinu nebo rozpadem celého jádra pak začíná terminálni fáze apoptózy, ve které dochází k vychlipování buněčné membrány a vzniku 1) Citace v textu Přehled literatury a ieií citace v textu B^ Elektronické zdroie Většinou není nutno uvádět v přehledu literatury. 2) Články v elektronickém časopise - stejně jako u textových zdrojů (odlišnost až v přehledu literatury 1) Citace v textu Přehled literatury a ieií citace v textu Citace v textu - zkrácená citace A) Ptáček aj. (2001) zjistili, že..... B) ... bylo zjištěno, že ... (Ptáček aj., 2001) Citace firaiirgHli atur - úplná citace Adcock, R.L.: Effect of moisture stress on soybean pod development. - Crop J. 95: 342-345, 1988. - existuje velké množství různých forem - používat vždy jen jeden typ dle doporučení nebo výběru Literatura BergcT, J. 1X0. BcÁufyt tudty, lila. Kfíf"úalňaAaE\xv\, Č. BjIíjovicí SíSB^C.M.IOT.^cill.ňflpJS^Íiäe^^ ^aJiidäJiM DC. («im. <*-. c-otfflüw, if- «iímw. "-(MeBsftTítP. c-om, j- wwbi f- sswm (ÍÍSSWSv ÍS»)ffiSj(f9|,C!M SfflWffM- 347! DD4 - : 11 . íerm^í. Kirk-Othmer Encyclopedia of Chemical Technology [online]. 3rd ed. New York : John Wiley, 1984 [cit. 3. ledna 1990]. Dostupné v DIALOG Information Services, Palo Alto (Calif.). Citace v ořehledu literatur Přehled literatury a ieií citace v textu II. Článek v elektronickém časooisu Autor, název. Název časopisu, [druh nosiče]. Vydání. Označení čísla. Datum aktualizace/revize. Datum citování. Dostupnost. Churá, M. Atlas roztahuje křídla. Chip [online]. Březen 2001 [cit. 19. března 2001]. Dostupné na WWW: < http://www.chip.cz/texty/2001_l/0319/alt.shtml >. Vojtásek, F. Vyhledávací služba Google začala indexovat soubory PDF. Ikaros [online]. 2001, č. 3 [cit. 2001-01-03]. Dostupný na WWW: < http://ikaros.ff.cuni.cz/2001/c03/pdf.htm >. Citace v ořehledu literatur Přehled literatury a ieií citace v textu II. Článek v elektronickém časooisu Autor, název. Název časopisu, [druh nosiče]. Vydání. Označení čísla. Datum aktualizace/revize. Datum citování. Dostupnost. Novák, K., Lisá, L and Skrdleta, V. Rhizobial nod gene-inducing activity in pea nodulation mutants: dissociation of nodulation and flavonoid response. Physiol. Plantamm 120 [online]. 2004, Vol. 4, [cit. 14. dubna 2004]. III. Článek v elektronickém časonisu - citace nanírového zdroie Pokud je u článku uveden svazek, číslo a stránky obdobně jako v tištěném časopise, citují se jako články v časopise Novák, K., Lisá, L and Skrdleta, V. 2004 Rhizobial nod gene-inducing activity in pea nodulation mutants: dissociation of nodulation and flavonoid response. Physiol. Plantamm 120 (4): 546-555. Citace v ořehledu literatury 1) Časopis 2) Kniha 3) Elektronické dokumenty IMJMfitfiLJlĚgl Přehled literatury a ieií citace v textu I.) citace podle citace v článku („citace v citaci") - nevlastním separát - nepřímá citace (maximálně 2-3 na celou práci, spíše dohledat původní zdroj) Cox, C. S., B. R. Brown, and J. C. Smith. 1999. False-positive ß-lactamase results with Staphylococcus lugdunensis in the Vitek Auto Microbios system. J. Gen. Genet. 85: 55-63. In Agger, W. A. and Maki, D. G. 2001. Efficacy of direct Gram-stain in differentiating staphylococci from streptococci in blood cultures positive for gram-positive cocci. J. Clin. Microbiol. 7:111-113. II.) citace abstraktu ze sborníku abstraktů (výjimečně - konečná platnost výsledků, dostupnost) Autor. Název (článku). In Název sborníku. Nakladatelské údaje (místo, nakladatel), rok. rozsah (strana od do). ISBN (ISSN) není povinné. Fazekas, F. Matrix algorithms and methods (MAM) to analyse stochastic chains and processes. In Proceedings of the 6th Mini Conference on Vehicle System Dynamics, Identification and Anomalies. Budapest, 9-11 November, 1998. Budapest: Technical University, cl998, p. 477-483. ISBN 963-420-635-2. Citace v ořehledu literatur Přehled literatury a ieií citace v textu III.) citace disertační práce Autor. Název práce. Označení druhu práce (Disertační, rigorózní apod.). Místo vydání. Název vvsoké školv. Rok vvdání. Počet stran. Vychodil, M. 1989. Přesné opracování křehkých materiálů diamantovými nástroji. Disertační práce. Praha, ČVUT Fakulta strojní,. 127 s. I.) a II.) - citovat jen střídmě a výjimečně III.) - obvykle se necitují předchozí bakalářské nebo diplomové práce CHYBY v ořehledu literatury: - chybějící nebo přebývající citace oproti citacím v textu práce - uvádění et al. namísto uvedení všech autorů včetně zkratek křestních jmen - neuspořádání dle abecedy a roku publikace - nesouhlasí rok nebo jméno (komolení) v textu a v přehledu literatury - nejednotná forma citací - uvádění akademických a vědeckých titulů Citace v ořehledu literatim Přehled literatury a ieií citace v textu Vyhledávání zkrácených názvu časooisu - názvy časopisů se v přehledu literatury udávají ve zkrácené podobě 1) Podle přehledu literatury v review a původních vědeckých sděleních 2) V rámci Web of Science (na úvodní stránce) je odkaz „Journal Citation Reports" - lze dohledat na základě ISSN (viz abstrakt článku ve WoS) nebo pomocí slov v názvu časopisu httü://isil0.isiknowled2e.com/üortal.c2i httü://üortal.isiknowled2e.com/üortal.c2i?DestAüü=JCR&Func=Frame Přímý odkaz na „Journal Citation Reports" Citace v ořehledu literatur Přehled literatury a ieií citace v textu Citace zdroiů obrázků a tabulek - odkazování na obrázky a tabulky = viz. následující kapitola - v legendě obrázku nebo tabulky by měl být uveden zdroj (pokud není naším dílem) Obrázek 1: Alternativní dráhy uvolňování kyseliny arachidonové (Lewis, 2003). Tabulka 1: Geny účastnící se přenosu signálu přes prostanoidní receptor (Black aj. 1999; upraveno). tento zdroj tedy musí být uveden také v přehledu literatury - problémy: - pokud je tento zdroj citován také v samotném textu = žádný problém pokud není tento zdroj citován v samotném textu = uvést vedle odkazu na obrázek nebo tabulku např.....má význam především v metabolizmu kyseliny arachidonové (obr. 1; Lewis, 2003) Přehled literatury a i ei í citace v textu Zdroie v angličtině x Dráče v češtině Citace (název článku) se obvykle nepřekládá, lze doplnit překladem v hranatých závorkách Pokud se (např. na přání redakce) uvádí pouze překlad citace, pak se za citací uvádí jazyk, ve kterém je práce napsána, např. [in English] Jména autorů Asijská jména se uvádějí buď v příslušné jazykové formě: -příjmení na 1. místě - Mao Ce Tun je tedy pan Mao a abecedně se citace řadí pod M. nikoliv pod T nebo v evropské formě: Mao C.T. (!!!TunM. C.) Mao-Ce-Tun Španělská jména Castro y Ruez = Castro R. vlastní jméno jméno po matce Přehled literatury a i ei í citace v textu Necitu i í se: - všeobecně známé poznatky (většinou uvedeny v učebnicích) - učebnice a skripta - práce předchůdců (BP a DP) - abstrakta z konferencí (obvykle) Pravidlo patnácté: Poznatky uvedené v učebnicích se necitují. Pravidlo šestnácté: Před vazbou bakalářské práce důkladně zkontroluj, zda jsou všechny citace v textu citovány také v přehledu literatury a naopak. 9.4.2006 1) Přílohy, dodatky 2) Grafická úprava BP 3) Posudky a obhajoba BP Příloh - dříve se obrázky tiskly odlišnou technikou než text - mezi archy textu se vkládaly samostatné listy s obrázky - zvlášť jako příloha na konci textu - v současnosti tento trend více méně přetrvává, ale již není nezbytný a je velmi obtížný pro čtenáře -jednotlivé stránky přílohy se nečíslují u každého obrázku nebo tabulky musí být uvedena její hlavička a s číselným označením uvedeným v textu (číslování dle výskytu v textu, zvlášť pro obrázky a zvlášť pro tabulky) Příloha Text Obr. 1 Tab. 2 Příloha Obrázek 1: Alternativní dráhy uvolňování kyseliny arachidonové. Tabulka 1: Geny účastnící se přenosu signálu přes prostanoidní receptor. Obrázek 1: Alternativní dráhy uvolňování kyseliny arachidonové (Lewis, 2003). Tabulka 1: Geny účastnící se přenosu signálu přes prostanoidní receptor (Black aj. 1999; upraveno). hlavičkuje vhodné doplnit legendou - popisuje, co znázorňuje obrázek nebo tabulka legenda by měla pomoci čtenáři pochopit, co vyplývá z uvedeného obrázku nebo tabulky a to bez nahlížení do textu - pozor na kvalitu vkládaných obrázků a tabulek - práce může být doplněna seznamem příloh (první strana přílohy) Označení: stručný popis (hlavička bez legendy, ta až u samotné přílohy), strana v textu, kde se na uvedenou přílohu vyskytuje odkaz. Seznam příloh Obrázek 1: Alternativní dráhy uvolňování kyseliny arachidonové (Lewis, 2003). Obrázek 2: Zjednodušené schéma .... Tabulka 1: Přenos signálu přes prostanoidní receptor (Black aj., 1999; upraveno). Tabulka 2: Přehled antigénu u jednotlivých kmenů Staphylococcus aureus (Black, 2000) Citace zdroiů obrázků a tabulek: - není-li zdroj (článek) citován v textu, pak není citace uvedena ani v přehledu literatury = chyba (zdroj musí být dohledatelný) řešení uvést citaci v textu za odkaz na tabulku nebo obrázek ......(Tab. 1; Prospal et al, 2003). Zkracování názvů ěasonisu v kanitole Literatura: - využít přehledu literatury článků, které mám k dispozici k vyhledání zkráceného názvu konkrétního časopisu - časopis nemusí být citován, velmi pracné, riziko chyby - dohledání v Journal Citation Reports (JCR), který je součástí Web of Science (WoS) pomocí ISSN Postup: - ve WoS vyhledat příslušný článek a v informacích o něm zjistit ISSN - v JRC vyhledat konkrétní časopis podle ISSN - po vyhledání je název časopisu uveden ve zkrácené formě http://isil7.isiknowledge.com/portal.cgi/ - pokud se nepodaří dohledat zkrácený název (není součástí ISI konzorcia) - uvést celý název časopis než vymýšlet vlastní zkrácenou verzi popisy použitých matematických nebo analytických postupů a modelů, které byly převzaty od j iných autorů seznam zkratek - při prvním výskytu v textu se uvede celý název a v závorce zkratka, která bude používána dále v textu např. Za tímto účelem byl izolován stafylokokový enterotoxin A (SEA)... ... sekvence genu pro SEA nebyla doposud stanovena ... ... byl studován LDL receptor („low density lipoprotein", lipoprotein o nízké hustotě' ... gen pro FLC (Flowering Locus C)......gen pro FLC (Flowering Locus C) ... pokud je použito velké množství zkratek a nejsou v textu řádně vysvětleny - nezbytné vytvořit seznam zkratek - zkratky se nevysvětlují a neuvádějí v seznamu pro již zažité termíny - DNA, PCR apod. Grafická úorava textu V PC lze na začátku psaní přednastavit všechny požadavky na grafickou úpravu textu jako celku. - velikost písma 12 - font Times New Roman (Arial - tabulky) - řádkování 1,5 - okraje: vlevo 3 (4) cm vpravo 1,5 cm nahoře 2,5 cm dole 2 cm - píše se vždy jednostránkově (respektive se tiskne jednostránkově) - text se zarovnává do bloku - číslování stránek - pro jednotlivé nadpisy je vhodné využít přednastavený formát nadpisu a podnadpisu nebo - nadpisy psát větším fontem, tučně či podtržené ■ nadpisy větších celků (hlavní nadpisy) se od ostatního textu oddělují dvěma volnými řádky ■ pod nadpisem se obvykle ponechává jeden volný řádek (na konci nadpisu se nepíše tečka) !!!Pozor!!! Na nadbytečné volné řádky, zejména na začátku textu. ■ odsazení začátku odstavce - tabulátorem nebo mezera o pěti znacích - dbát na odsazení u všech nových odstavců - zvýraznění jednotlivých slov v textu tučným písmem se obvykle nepoužívá - kurzívu v textu vyhradit jen pro latinské názvy organismů nebo označení genů Pozor na chybějící či přebytečné mezery mezi slovy a větami !!! . bylo sledováno u myší a potkanů ... . což bylo potvrzeno v předchozích výzkumech( Dychtil aj. ).Důležité však bylo zjištění, že . autoři uváděj í,že jej ich pozorování ... Pevná vazba (ne kroužková) v pevných deskách (doporučeno, nevyžadováno) Odevzdání papírové verze ve dvou provedeních (školitel a oponent) Odevzdání elektronické verze - dříve CD, dnes se ukládá na IS Posudky a obhaioba bakalářské práce Posudek školitele (.pdf na ISu) Posudek oponenta (.pdf na ISu) Obhaioba: 5 minut - prezentace bakalářské práce 5 minut - diskuse (otázky oponenta, komise, případně hostů a publika) Známka: oponenta školitele obhajoba Zaměření bakalářské práce (témata BP) Obor: Buněčná a molekulární diagnostika zadává katedra studenti si témata losují - většinou méně specializované téma Obor: molekulární biologie a genetika - témata BP vychází z vybraného tématu DP - téma si studenti vybírají úzce specializované téma dle zaměření budoucí DP - dle výzkumného zaměření jednotlivých pracovišť Obor: Buněčná a molekulární diagnostika Obecně formulovaná témata Modelové organizmy využívané v biologii Drosophila melanogaster jako genetický modelový objekt 20. století Mendelovy pokusy s dalšími rostlinnými objekty Využití výpočetní techniky v biologii a v medicíně Internet jako zdroj informací pro molekulární biology Genetické databáze na internetu a jejich využití Co dnes víme o apoptóze Poznatky o mimojaderné dědičnosti Mikrosatelity a jejich význam Využití molekulárních markem Genomika - nejnovější obor molekulární genetiky Genetika a životní prostředí Eugenika Genetické příčiny mentálních retardací Dědičné založení pohlavní identifikace a sexuální orientace Využití genetiky v lékařství Nové testy v genotoxikologii Nové metody v ekotoxikologii Nové trendy v genové terapii Obor: Buněčná a molekulární diagnostika Genové inženýrství Genové inženýrství v praxi Genové inženýrství v humánní medicíně Příprava vakcín metodami genového inženýrství Využití bioreaktorů Etické problémy genových terapií Viry a virová onemocnění AIDS - celosvětový problém Nové poznatky v terapii AIDS Nová a znovu se objevující virová onemocnění Priony - původci nemocí lidí a zvířat Virová onemocnění lidí a zvířat způsobená arboviry Hmyz jako vektor bakteriálních původců nemocí Virus hepatitidyB - jeho role ve vzniku karcinomu jater Přenosné spongiformní encefalopatie Molekulární biologie a epidemiologie viru SARS Obor: Buněčná a molekulární diagnostika Patogenní mikroorganismy - diagnostika, terapie Vývoj metod v diagnostice patogenních mikroorganismů Molekulární diagnostika infekčních agens Metody studia polymorfismu genomu Molekulární typizace prokaryot Význam plazmidů pro multirezistenci bakterií Molekulární epidemiologie toxinogenních kmenů Escherichia coli 0157 Projekty sekvencování genomu patogenních bakterií Současný stav řešení projektů bakteriálních genomu Využití analýzy sekvencí rRNA v molekulární diagnostice stafylokoků Molekulární diagnostika stafylokoků pomocí PCR metod Fágová terapie Transgenoze, transgenní organizmy Možnosti klasické a molekulární genetiky ve šlechtění Možnosti využití transgenních organizmů Transgenní rostliny: obavy nebo perspektiva? Transgenní organismy pro přípravu farmak Transgenní zvířata jako producenti farmak Retrotranspozony v rostlinném genomu a jejich význam Současné úspěchy klonování rostlinných genů Obor: Buněčná a molekulární diagnostika Genetické poradenství Využití cytologie v oblasti prenatální diagnostiky Preimplantační genetická diagnostika Nádorová onemocnění Leukémie v lidské populaci Co nás chrání před nádorovými chorobami? Genetické poruchy a leukémie Způsoby klasifikace leukemických onemocněni Význam proteolýzy v řízení buněčného cyklu Úloha proteinu p53 při vzniku nádorových onemocnění Obor: molekulární biologie a genetika Vědeckovýzkumné zaměření KGMB = témata DP = témata BP - Laboratoř molekulární diagnostiky mikroorganizmů (http://orion.sci.muni.cz/kgmb/LMMD) - Laboratoř molekulární genetiky rostlin (http://orion.sci.muni.cz/kgmb/LMGR) - Laboratoř buněčné diferenciace - Integrovaná laboratoř molekulární cytogenetiky (http://www.cba.muni.cz/cytogenlab) - Laboratoř molekulární analýzy mutací (prof. Doškař, doc. Pantůček, doc. Růžičková) A. Analýza struktury a funkce genomu patogenních bakterií *■ molekulární identifikace klinicky významných stafylokoků ■■ studium genů zodpovědných za patogenitu a virulenci kmenů ^ molekulární taxonomie »• molekulární epidemiologie B. Analýza genomu stafylokokových fágů ^ objasnění úlohy fágů v biologii stafylokoků ■* využití fágů v léčbě stafylokokových infekcí (fágová terapie) > fenotypová charakterizace bakterií > komplexní analýza genomů bakterií - izolaee bakteriální, p laz m klové a fágové DNA - reštrikční a sekvenční analýza DNA - klonování DNA, PCR, DNA-hybridizace - analýza sekvenčních dat v PC - analýza prokaryotic Miio a fágového proteomu laboratoř molekulární genetiky rostlin Arabidopsis thaliana http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin rod Trifolium http: //orion. sci .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin rod Hordeum http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Arabidopsis thahana Identifikace senu determinujících: - embryogenezi (Genetická kontrola embryogenéze) - délku vegetativní fáze (Genetická kontrola indukce kvetení) - morfologii orgánů, biochemické dráhy syntézy chlorofylu 1) Izolace a charakterizace mutantů: - embryonálně letálních - pozdně-kvetoucích - morfologických a chlorofylově-defektních http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ Standardní linie Mutantní linie Embrya Columbia Mutantní Standardní VIII-64 X 1 ■ l-.art,..■■ I 1 VIII-41 \ K 280-4-4 w i, »•■ y '.>-'•* 6t f iél ^^|i ^rar/:' H( N VIII-111 VIII-82 ^Kk \ VIII-75 Mutantní linie Standardní linie Col teš,« laboratoř molekulární genetiky rostlin Genetická kontrola indukce kvetení faktory vnějšího prostředí geny kvetení 3-4 týdny 6-8 listů v růžici vegetativní fáze reprodukční fáze Bližší informace na webových stránkách: http://orion.chemi.muni.cz/kgmb/LMGR/Kveteni.html http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Arabidopsis thahana Identifikace senu determinujících: - embryogenezi (Genetická kontrola embryogenéze) - délku vegetativní fáze (Genetická kontrola indukce kvetení) - morfologii orgánů, biochemické dráhy syntézy chlorofylu 1) Izolace a charakterizace mutantů: - embryonálně letálních - pozdně-kvetoucích - morfologických a chlorofylově-defektních 2) Genetické mapování identifikovaných genů (DNA markery) http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ Genetická mapa Arabidopsis thaliana 3.6 Vfíf-111 9.1 -23 1 -nga63 G23S5 28 9: - 2S0-44 31.2 49 6- UFO 81.7-83.2- nga2S0 dn II 9.6 nga1145 34.5 50.7 555 73.8 93.3 115.8 —AthATPASE PHYB nga1126 TV nga168 Vtfí-41 III 8.4 8.8 9.9 19 4 Víft-Bľ H ■# C/?ÍT|3 Ä1-22 43.8 GAPC 2o.6Mnga162 AthGAPAb 69.6 66.4 280-4-8 nga6 29.6 57.6 -H- G4539 62 V IWVí-64 73.9 83 4 84 7 95 9 93.3 1047 A nga1111 PRHA nga1139 /cŕS> nga1107 143 23.7 33.7 nga225 nga249 R89998 50.5'""nga139 63 4 77.1 79.9 1251 nga76 Vill-75 AthSOl91 G236S http: //orion. sci .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Arabidopsis thahana Identifikace senu determinujících: - embryogenezi (Genetická kontrola embryogenéze) - délku vegetativní fáze (Genetická kontrola indukce kvetení) - morfologii orgánů, biochemické dráhy syntézy chlorofylu 1) Izolace a charakterizace mutantů: - embryonálně letálních - pozdně-kvetoucích - morfologických a chlorofylově-defektních 2) Genetické mapování identifikovaných genů (DNA markery) 3) Identifikace příslušného genu, detekce mutačních změn na úrovni DNA. expresní analýzy http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Část sekvence genu FLC I Marker( s ) 3173001 3173201 3173401 3173601 3173801 3174001 3174201 3174401 3174601 3174801 3175001 3175201 3175401 3175601 3175801 3176001 3176201 3176401 3176601 317Ě801 taaaaggtgattaatgacaatggcgtctggaactgttgatctaaattaatataaatacgagcgtaactttttctattctatatgtgaattatatttatac atataatgtctaaaagtattatcattttagtgggaaaaaaagaagtgttatcattatataaatgtggattagtttaagggatccttcatggatgacggaa ctacggaagtgaatttagtccaaagaaaatatggaagaggtcggtcacgttaacagcaatgactttaagaactaagcttattgggccgaatgtgaccgac at-aggcccaaaaaacccatgccaaccatacgcgt-ttaggataaaaacaaatt-aattacgacgagagaaaaaacgcgcagagagagagagagagccacgtc c et gtt gc aaaat aage c gt aggctt ctt c act gt gaagc aaac ac aagttttt gac agaagt gaagaacacatac act c aagat et c gat gc aatt ct c acacgaataaggtacaaagttcatcaaccttttgtcttaaaacagatagtattgacttagttccgtctacttaagtatcacacacaaagtctcttggcca aagagagagtattaagatatacaaacgctcgcccttatcagcggaataattacatatct-tatttt-tttttt-cttcataattatatatgtt-ttggat-t-ttg atttcaaccgccgatttaagcjtggHE^TTAAG-TAGTGG-GAGAGTCACCGG-AAGATTG-TCGGAG-ATTTGTCCAGCAG-GTGACATCTCCATCTCAG-CTTCT GCTCCCACATGATGATTATTCTCCATctgtacgataatcataggtcaaaatcactattcactttctctttttgtcttctatccaaggaatatctttttca caccaccaaataacaaccattaaaaaacactacagaaggttatgtttctcataatttgtgtgttctttatgtttaagcttttaagtttggaagcagtatc t at aat ctttt ac c agttt at aattt at aat ct aac ct at at at age at gt aaaagt age act actt ct agac actt ggagtt ggaact gage c act c gg atccaaacctaaccataacaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaactaatcggtccataaacttttttttttggttaaaaggtgattaacttaaatatagacaa cgtttacacaaccttcaaggaaaccaatattgaactaaactagactgaaccagaccataacctgaaagagaatcaagaaatcttattgaatctctaccaa acccagacttaaccagactataaaaggttcataaatctccaaatgaaccaaaacctaattaaacactttaacatgaaaaaaacgaagaagaagaaccaaa acctagttatgtccaacaaccggaatttttttttcttaatttagtaaaatgatatagcaatcatgtaatttatactcgataaaaaataaaaaaataactt catctgatttcccttaactctaaccagccgttatcaaaattctgttcttattcagtaataatctcactaaccctaataaaccaaactaccaacaaccaaa at-gccctaatcttgagaagaattgtct-agaatacaactat-acaagacaggaaagtgctaactagt-gaatgattgaaat-gcactgactatatatatat-ata tatatatctgcaagcataagagtgtgtatctatgtccatgtacatggacattggacacacaacacgcagtgcttattagttatgcatatatatttttagg .G-CATTTTCTCctgatttaaagatcaaaatgttcagcaattaccgatcaag aaatgtagctttcgttacCTGGCTAG-CCAAAACCTGGTTCTCTTCTTTCAG-CAT' tt-tctaaacctaacaacttcagaattt-ggaatccaaaacatatgaagaaagt-t-gcaaat-atgtgt-gcaagctcgttaagcagacttaaagtaacagagac aacacagaagaggatatatctgatgtacaataaaattggtagcaaatatctgacCTTTTCTTTAAGATTCTCAACAAGCTTCAACATGAGTTCGGTctgc aacaaacaaaagcagcacggttgttctcagcaaacaaaattcagaaaggagtagacattacgaaatcaacttacCTTCTTGGCTCTAGTCACGGAGAGGG CAGTCTCAAGGTGTTCCTCCAGTTGAACAAGAGCATCGATACTCACATTTTTGACATTTGATCCCACAAGCTTGctgcatatattcatagtttgacaaaa aaaaaactaattcctttgtaatcaaaggtggagagcaaatatagtcttagttagtagtactaacCTATCCACAAGTTCAAGTAGCTCATAGTGTGAACCA TAGTTCAGAGCTTTTGACTGATGATCctgcccatgaaaaagggacagaagaagcggtaaaagacaagggctatgaaaattgcggtatgcataatgcatgt ggagccaccacctcattttatatttaggatcactcggcaaactaatagtaaatttacgccttataaaactccatcagggaaaagattcaaaatgtttgta ttacCAAGGCTTTAAGATCATCAGCATGCTGTTTCCCATATCGATCAAGGATCTTGACCAGGctggagagatgacaaaaaaaataaaaatatgttaggat caaaactactagctaacccttgaaaaggccactggaaactatgaaacattgagagaacaccttaccttttacatatatataacacgctagtattcgtaac atttcagaaaaacaataatcttaatattcatgtttaagcagtagcacatctgaatttccactttttcaaaaaagttttaacttgttcttagctttgtaag caatatttaataatatctgatattttt-tttctct-ctcaagaaaagaaaagaaccaaaacatttaccaaaaattgctcaaagatt-agttat-ccaatgaatt atgtgggctaacatgtatttattatatatttcggcagattgaaaatgacattttccctcaaagaaaagtcatacaaaggcatacagataaagtttagtga tagcgctggctttgattaacttaaagtcaaactagttaaggtacataagaaccctaaacataagcctctactgtccagattgtttctatgcatttatgtt tgtgaatct-atgttgaaataattgatgcaatataaaatgt-aaacgcagccccaatcttaaatgcaaacaagcaatttt-tatttt-tccagaaatcat-atat act c at gaat gt at at ac ac ac at at att gat gage c ac aat gt gat gac at ggaagt aaac c gaagt aaaatt c c aagt ac ac agact gagt ct agaaa gtcatatttctcttaattttctgaaattaactgaaagacttccctaacaatagcaaatagtggaagactgcttccaattcatttgcaaattaacttatat aattctaattgcaacctctatcagagattcagagcttccattttggttttgatccataccacaacttttageatc£ ac ct at at c cttt ac a gcgtgttatcaaaaccattataagaacaaaacctatttaccctctattttctatcatgtttacccttataacatttgatcaggactacgaacaatggtat caaattattagttacctcttttctttttgtatcccagttttaaaaagaattttttaaaaacgcctctttcatgagttcattagtaatctcgtgtcaaaat tggtaacatcagctctttgtttgtaagtaataccatatcaacatatacgagaaaacttttcggatttttcaatgaaccttgaggacaaggttttttccag cgatagagctagtattgatgacccataagatgataatgatgatgtggcggtaaccagataaccataagtatgaggaagccaaactccaaatacatggacc Výsledky expresní analýzy genu FLC u mutanta L4 po působení vernalizace a 5-azacytidinu FLC—> C24 Ler L4 Non-treated C24 Ler L4 Vernalization C24 Ler L4 5-azacytidine 20 30 40 50 601 70 20 30 40 I 50 60 70 20 30 40 50 60 j 70 — ------------------------------------------ ----------------------------------- — ----------------------------------- http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Arabidopsis thahana Identifikace senu determinujících: - embryogenezi (Genetická kontrola embryogenéze) - délku vegetativní fáze (Genetická kontrola indukce kvetení) - morfologii orgánů, biochemické dráhy syntézy chlorofylu 1) Izolace a charakterizace mutantů: - embryonálně letálních - pozdně-kvetoucích - morfologických a chlorofylově-defektních 2) Genetické mapování identifikovaných genů (DNA markery) 3) Identifikace příslušného genu, detekce mutačních změn na úrovni DNA, expresní analýzy 4) Izolace genů, klonování, charakterizace transkriptů http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Rod Hordeum Genetická determinace rezistence iečmene k oadlí travnímu 1) Identifikace nových odrůd ozimého ječmene (Hordeum vulgare) rezistentních k padlí travnímu {Blumeria graminis f. sp. Hordeí) - Zemědělský výzkumný ústav Kroměříž, s.r.o. 2) Identifikace genů navozujících tuto rezistenci a lokalizace nových genů rezistence do genetické mapy. 3) Vývoj markem v těsné vazbě s identifikovanými geny rezistence pro „marker assisted selection". http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Postup 1) Výběr originálních a výkonných zdrojů rezistence k padlí - Hordeum vulgare ssp. spontaneum 2) Křížení s H. vulgare cv. Tiffany 3) Studium dědičnosti genů \¥l a F2 generaci 4) Lokalizace genů rezistence pomocí DNA analýzy 1H(5) 2H(2) 3H(3) 4H(4) 5H(7) 6H (6) 7H(1) 5 - - Bmcic0134 10 - - Bmac01E3 6 - - Bmac031 6 0 -r t- EBmac0713 17 - - GMS021 14- - HVM40 13 - - Bmag0021 25 -, - Bmac0399 25 - - EBmac07O5 21 - - HvOle 27 - - HVM04 28 - - Bmac0213 33 - - Bmac0218 37, , Bmag0014 30 ~ 42 x V EBmac054C - Bmao0303 51 \ i Bmac0063 /, Bmac0032 i, EBmoc0501 - Bmac0090 42 N / Bmcig03S1 42 - - Bmag0603 - EBmac0B71 38 - - BmagOSOO 11 44 --50 / "- Bmag0140 N Bmao0093 52 - 45 --48- - HVMUJ 4.7 -, EBmac066Ě - Bmag0357 50 - - EBmae0603 58 Js 61 -70 - - BmagOSOBA - BmogOl 12 52 ' \ Bmog0490 5B - - EBmac0684 59 - - AF022725A 62 -J 63^ í- Bmag021 1 ^ EBmocQ656 \ Bmaa0345 S3 - - Bmag0125 82-76 N - EBmoc085£ 6g s y HVM30 y EBmac0701 69 ^'s Bmag0223 73 , / Bmag0516 85 ,Y, HVCMA 66 ' 74 -" ~- Binag0225 76 - h FRmarflfiM ^\\ /, Bmao0187 81 / x Bmac0154 84 - - Bmag0219 tú L Bmas0582 L BmaqOOll 97 -112 - - Bmag0382 - HvHVAl 95 -105 - - EBmag0793 - EBmac0415 99 - - BmagOB41 108- - WUS6 114- - HvLDX 101 -109 - - EBmac0674 - EBmac0602 98 --I-- Bmac0064 1 100 -Jř:N Bmag0321 101 A-\ Bmag0341 118- - HVMS7 119 - - EBmac0806 111 ', 0 Bmag0507 125 - - Bmag0606 126 - - GMS061 118 ':■'■ Bmag0120 127 / \ HvAMY2 135 - - EBmotc0003 142 - - Bmag0749 141 - - BmagQQ13 141 -14B - - EBmocOS24 - GMS027 142 -, 145 - - EBmag0757 -, EBmac0755 151 - - Bmaa0749 154 - - HVM62 151 - - Bmoc0040 156 s / Bmao0156 164 - - WMC1EB 161 -169 - - EBmac0541 - EBmag0705 162 - - Bmag0222 164 \ , Bmag0004 165 -J;^ Bmag0135 | 175 - - Bmag0579 167 ' \ HVPRP1B 1B0 -1 L- EBmoc0783 182 - - HvID 187 - - SMS001 http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Rod Trifolium Studium Drezvgotickvch a Dostzvgotickvch barier krizitelnosti http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin laboratoř molekulární genetiky rostlin T. pratense 4 DAP 6 DAP 8 DAP http: //orion. sci .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin T. pratense x T. medium 7 DAP 7 DAP 7 DAP ■ 7 DAP http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ laboratoř molekulární genetiky rostlin Metody využívané v Laboratoři molekulární genetiky rostlin: metodv klasické genetiky - indukce nových mutantů, analýza přírodních populací - křížení, analýza Fl a F2 generace metodv molekulární genetiky - izolace a analýza DNA, RNA - PCR (DNA markery, delece...) - RT-PCR (expresní analýzy) - sekvenace DNA http: //orion. sei .muni. cz/kgmb/LMGR/ ratoř výzkumu genomu Drosophila melanogaster detekce mutací asociujících se syndromem prodlouženého QT intervalu v lidském genomu (dr. Chroust) Práce s Drosopľrítemelanogaster Transgenoze - lidské geny pro metabolizační enzymy - sledování stability transgenu Toxicita a genotoxicita - čisté chemické látky - environmentálni vzorky Použité testy - test na somatické mutace a rekombinace - test na letální mutace vázané na pohlaví Detekce mutací asociujících se syndromem Syndrom prodlouženého QT intervalu - Prováděné v genech SCN5A a KCNE2 - Připravované CACN1A a KCNL1 Použité metody -PCR -TGGE - Sekvencování Laboratoř buněčné diferenciace (prof. Šmarda, dr. Beneš) Odborné zaměření Obecně: Výzkum mechanismů, které se podílejí na regulaci diferenciace, proliferace a smrti živočišných buněk Konkrétně: • výzkum funkce onkoproteinu v-Myb • možnosti suprese onkoproteinu v-Myb a jejich molekulární podstata Experimentální strategie • využití modelové linie ptačích monoblastů transformovaných onkogenem v-myb (BM2) • transfekce buněk BM2 geny, kódujícími potenciální supresory v-Myb • selekce stabilních transfektantů • indukce exprese exogenních genů • studium fenotypových změn • studium funkční interakce mezi produktem cizorodého genu a proteinem v-Myb <§Q STEH CELL ® A COHHITTED PROGENITORS ■to] ® PRE-T C-MVB THVHÜS ® 1 ^Wm E26(cag-nyb <§ # PRE-B HVELOMONQBLAST ERVTHROBLňST ■^"INSERT ^^l/ \j BURSA """ ® ® ®