MASARYKOVA UNIVERZITA
Posudek oponenta habilitační práce
Masarykova univerzita Fakulta
Obor řízení
Uchazeč
Pracoviště uchazeče Habilitační práce (název)
Oponent
Pracoviště oponenta
Lékařská
Lékařská mikrobiologie
Mgr. Martina Lengerová, Ph.D.
Sekce oportunních infekcí CMBGTIHOK FN Brno a LF MU
Včasná diagnostika oportunních infekcí pomocí molekulárně biologických metod
Doc. Ing. Jaroslav Hrabák, Ph.D.
Biomedicínské centrum, Ustav mikrobiologie, Lékařská fakulta v Plzni, Univerzita Karlova
Text posudku
Habilitační práce Mgr. Martiny Lengerové, Ph.D. je zaměřena na molekulární detekci patogenů u hematoonkologických pacientů. Především se jedná o mykotické infekce, na něž se předkladatelka a její pracoviště významně specializují. Je však zmíněna i detekce bakteriálních agens a virů. Vlastní text habilitační práce je shrnut na 18 stranách s celkem 86 referencemi. Dále je zahrnuto 13 příloh, přičemž se jedná o 10 článků, jednu kapitolu v knize, jeden udělený patent a jeden užitný vzor. V textu habilitační práce jsou dosažené výsledky částečně komentovány (např. kapitola 3.1.1 - diagnostika Aspergillus spp., 3.1.2 -diagnostika mukormykózy, 3.1.3 a 3.1.4 - panfungální PCR a zkušenosti z pracoviště). Na příklad u imunokompromitovaných pacientů je zajímavá diagnostika pneumocystové pneumonie, přičemž PCR metody jsou náročné z hlediska interpretace kvantitativního stanovení. V textuje tato problematika zmíněna velmi stručně, avšak je uvedena příloha č. 8, která se tomuto dostatečně detailně věnuje.
Obecně lze říci, že habilitační práce je psaná poměrně stručnou formou. Zároveň by bylo vhodné každou přiloženou práci okomentovat a zařadit do kontextu celé práce více detailněji. Přesto se však jedná o ucelený text, který splňuje podmínky obecně kladené na habilitační práci.
Dr. Martina Lengerová je autorkou více než 40 prací indexovaných v PubMedu, přičemž řada z nich byla publikována v prestižních mikrobiologických časopisech (např. Journal of Clinical Microbiology). Rovněž je známá v mikrobiologické komunitě, především právě v oblasti molekulárně-genetické diagnostiky oportunních infekcí.
Dotazy oponenta k obhajobě habilitační práce
1. Jak může ovlivnit molekulárně-mikrobiologickou diagnostiku zavedení sekvenace nové generace a využití metod metagenomické analýzy mikrobiální populace u hematoonkologických pacientů?
2. Jaké jsou interpretační limity PCR metod pro detekci oportunních patogenů u imunokompromitovaných pacientů?
3. Co si myslíte o zavedení technologie microarray v mikrobiologii (v současném uspořádání a technických možnostech)?
i
MASARYKOVA UNIVERZITA
Závěr
Habilitační práce Mgr. Martiny Lengerové „Včasná diagnostika oportunních infekcí pomocí molekulárně biologických metod" splňuje požadavky standardně kladené na habilitační práce v oboru lékařská mikrobiologie.
V Plzni dne 7.1.2017
podpis
2