Posudek oponenta habilitační práce
Masarykova univerzita
Fakulta Lékařská fakulta
Habilitační obor Lékařská biologie
Uchazeč RNDr. Lenka Fajkusová,CSc.
Pracoviště Interní hematologická a onkologická klinika LF MU a FN Brno- Centrum
molekulární biologie a genové terapie
Habilitační práce Molekulární diagnostika vybraných dědičných nemocí
Oponent Prof. MUDr. Viktor Kožich, CSc.
Pracoviště Univerzita Karlova v Praze-1.lékařská fakulta, Ústav dědičných
metabolických poruch 1.LF UK a VFN
Posudek
Dr.Fajkusová předložila jako habilitační práci komentovaný soubor článků otištěných
v zahraničních recenzovaných časopisech. Práce se skládá ze 13 vydaných článků a jednoho
rukopisu (článek autorky K.Stehlíkové a spol. je v době sepisování posudku již vydaný v BMC
Neurology 2014, 14:154) a dále z komentáře o rozsahu 20-ti stran. Na všech uvedených
pracích je Dr.Fajkusová korespondující autorkou nebo autorkou první.
Ve své práci se uchazečka věnuje třem okruhům dědičných nemocí-vybraným
neuromuskulárním chorobám, genodermatózám a třem dědičným metabolickým poruchám.
V části věnované neuromuskulárním nemocem se zabývá facioskapulohumerální svalovou
dystrofií, dystrofinopatiemi, pletencovými svalovými dystrofiemi, spinální muskulární atrofií
a kongenitální myotonií. Dva články jsou věnované kožní chorobě epidermolysis bullosa
(dvěma různým formám této nemoci). Dlouhodobý zájem dr.Fajkusové o některé dědičné
metabolické je patrný ze zařazení třech prací o familiární hyercholestrolémii, dvou prací o
kongenitální adrenální hyperplázii a jedné práci o hyperfenylalaninemii.
Převážná většina prací uchazečky shrnuje výsledky mutační analýzy v rozsáhlých
souborech pacientů s výše uvedenými nemocemi. Práce ukazují zvládnutí širokého spektra
metod a přinášejí unikátní informace o alelické variabilitě řady vyšetřovaných genů v české
populaci. Dr.Fajkusová se svým týmem narazila při běžných molekulárně genetických
analýzách na řadu pacientů s obtížně vysvětlitelnými nálezy a podařilo se jí následně
objasnit složité přestavby genů nebo analýzou RNA prokázat poruchy sestřihu či mutace
vedoucí k nestabilitě RNA. Analýza výše uvedených velkých souborů pacientů zákonitě vedla i
k nalezení celé řady dosud nepopsaných mutací se záměnou jedné aminokyseliny a
dr.Fajkusová se proto věnovala intenzivně též analýzám jejich patogenity pomocí predikčních
programů a in silico modelování. Publikace zahrnuté do habilitační práce pokrývají období od
roku 2001 až do současnosti a ukazují tak i vývoj oboru molekulární genetiky- v poslední
práci z roku 2014 autorka Stehlíková a spol. již využívá metody sekvenování nové generace,
které jsou pro diagnosticky obtížnou skupinu neuromuskulárních onemocnění zcela jistě
zásadním přínosem. Za vědecky vynikající považuji práce, v nichž se uchazečka věnovala
detailnímu studiu mechanismů velkých přestaveb genu (např.práce Goldmanna a spol.
týkající se LDL receptoru) nebo v nichž se zabývala s týmem spolupracovníků modelováním
mutantního keratinu u epidermolysis bullosa (práce Jeřábkové a spol.) či modelováním
dimerizace chloridového kanálu u kongenitální myotonie (práce Skálové a spol.).
Po stránce formální nenacházím v práci žádné nedostatky, komentář k pracím je
poměrně stručný a postrádám v něm zdůraznění vlastního a zcela nepochybného přínosu
uchazečky k pochopení molekulární patologie celé řady dědičných nemocí v mezinárodním
kontextu.
Předložená habilitační práce Dr.Lenky Fajkusové ukazuje široký rozhled uchazečky
v oboru molekulární genetiky a prokazuje vědeckou kvalifikaci pro udělení titulu docent.
Dotazy oponenta
1. Velkým problémem při interpretaci molekulárně genetických výsledků jsou dosud
nepopsané aminokyselinové záměny. Může uchazečka porovnat klinickou užitečnost
predikčních programů, které v praxi používá? A jak často využívá pro interpretaci
informace z databází typu 1000Genomes?
2. Jaké systémy pro expresi transmembránových proteinů (typu chloridových kanálů či
LDL receptoru) bude uchazečka používat pro ověřování patogenity mutací?
3. Existují v genech vyšetřovaných týmem dr.Fajkusové oblasti kódující známé regulační
RNA (např.typu miRNA) a setkala se v nich s potenciálně patogenními mutacemi?
Závěr
Habilitační práce RNDr. Lenky Fajkusové, CSc. „Molekulární diagnostika vybraných dědičných
nemocí“ splňuje požadavky standardně kladené na habilitační práce v oboru Lékařská
biologie.
V Praze dne 7.října 2014 ………………………………………………