Příloha 9: Stanovisko habilitační komise k návrhu na jmenování docentem Masarykova univerzita Fakulta Habilitační obor Přírodovědecká fakulta MU Biomolekulární chemie Uchazeč Pracoviště Habilitační práce Složení komise: Předseda Členové Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D. Středoevropský technologický institut MU DNA structure: code in non-coding genome prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D. Masarykova univerzita - Přírodovědecká fakulta prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc. Univerzita Karlova v Praze doc. Ing. Richard Hrabal, CSc. Vysoká škola chemicko-technologická v Praze prof. Ing. Antonín Lyčka, DrSc. Univerzita Hradec Králové prof. RNDr. Ľubomír Tomáška, DrSc. Univerzita Komenského Bratislava Stanovisko habilitační komise: Komise pracující ve shora uvedeném složení vycházela z: 1) materiálů předložených uchazečem v souladu s odst. 2, par. 72 zákona 111/1998 Sb. 2) vyžádaných oponentských posudků, které zpracovali: doc. Ing. Richard Hrabal, CSc, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze prof. Ing. Jozef Nosek, DrSc, Univerzita Komenského Bratislava prof. Miroslav Fojta, CSc, Biofyzikálni ústav AV ČR, v.v.i., Brno 3) monitorování průběhu veřejné habilitační přednášky s názvem „DNA conformational polymorphism", konané dne 12. května 2016 (82 posluchačů; z komise a oponentů přítomni prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc, prof. Miroslav Fojta, CSc, doc. Ing. Richard Hrabal, CSc, prof. RNDr. Ľubomír Tomáška , DrSc, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.) Hodnocení vědecké / umělecké kvalifikace uchazeče Text hodnocení (rozsah dle zvážení komise) Dr. Lukáš Trantírek se ve svých výzkumných aktivitách zabývá základními vztahy mezi strukturou a reaktivitou polymerů, a to především na poli studia nukleových kyselin pomocí nukleární magnetické resonance (NMR). Aktuálním objektem jeho zájmu je studium polymorfísmu a hledání aktivních konformací G-kvadruplexů, které představují možný terapeutický cíl při léčbě nádorových onemocnění, a identifikace evolučně konzervovaných strukturních znaků u DNA centromer a telomer. Habilitační práce je postavena na 16 vybraných článcích publikovaných ve velmi kvalitních mezinárodních časopisech, v 10-ti případech je i korespondujícím autorem. Dlužno dodat, že v době podání habilitační práce (listopad 2016) byl Dr. Trantírek autorem či spoluautorem 42 prací se 753 citacemi dle WOS bez autocitací. V době hodnocení jeho vědecké činnosti je na kontě Dr. Trantírka již 46 publikací s 832 nezávislými citacemi, což svědčí o vysokém vědeckém potenciálu kandidáta. Jeho publikační výstupy zahrnují články v renomovaných časopisech jako Cell, Nucleic Acid Research, Angewandte Chemie-International Edition, Journal of Biological Chemistry, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, a další a průměrný IF jeho prací převyšuje hodnotu 6. Dr. Trantírek získal několik vědeckých ocenění, mimo jiné v poslední době EMBO Instalation grant či Marie Curie Career Integration Grant. Dr. Trantírek byl řešitelem či spoluřešitelem pěti domácích (GACR. MSMT) a řešitelem šesti mezinárodních grantových projektů (EMBO, EU Research Executive Agency, Netherlands Organisation for Scientifíc Research, Austrian Science Fund) a dokázal si vybudovat vynikající renomé jak v domácí tak zahraniční komunitě. Během své profesionální kariéry pobýval na různých pracovištích po celém světě, ať už v pozici vědeckého pracovníka (University of California. Los Angeles, USA, Johannes Kepler University, Linz, Rakousko) nebo jako univerzitní docent (Utrecht University, Nizozemsko). Nyní je vedoucím vědecké skupiny s názvem Nekódující genom, která je součástí programu Strukturní biologie Středoevropského technologického institutu Brno - CEITEC. Závěr: Vědecká kvalifikace uchazeče odpovídá požadavkům standardně kladeným na uchazeče v rámci habilitačních řízení v oboru Biomolekulární chemie na MU. Hodnocení pedagogické způsobilosti uchazeče Text hodnocení (rozsah dle zvážení komise) Dr. Lukáš Trantírek se věnuje pravidelné výuce od roku 2004 (s přetržkou v letech 2009-2011, kdy pobýval na univerzitě v Utrechtu jako vědecký pracovník). V letech 2004-2008 vyučoval předmět Bioinformatika (přednáška a navazující cvičení) v rámci magisterského oboru Molekulární a buněčná biologie a genetika na Přírodovědecké fakultě Jihočeské Univerzity v Českých Budějovicích. Od roku 2012 pravidelně vyučuje předměty na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity v rámci bakalářského a magisterského oboru Biofyzika. Jedná se o přednášky Strukturní biologie: biofyzikálni aspekty a Základy molekulární biofyziky, a Biofyzikálni praktikum UFKL. V roce 2015 vypracoval pro přednášku ze Základů molekulární biofyziky stejnojmenné učební on-line materiály. Dr. Trantírek se aktivně podílí i na vědecké výchově pregraduálních studentů. Dosud vedl 8 bakalářských a 11 diplomových prací. Na univerzitě v Utrechtu byl vedoucím dizertační práce MSc. Andrey Vavrinske, která byla úspěšně obhájena v roce 2016. V současnosti Dr. Trantírek vede 5 PhD studentů. Závěr: Pedagogická způsobilost uchazeče odpovídá požadavkům standardně kladeným na uchazeče v rámci habilitačních řízení v oboru Biomolekulární chemie na MU. Hodnocení habilitační práce uchazeče Text hodnocení (rozsah dle zvážení komise) Habilitační práce splňuje věcné i formální požadavky kladené na habilitační práci. Jedná se o anglicky psanou soubornou práci postavenou na 16 vybraných autorových prací, které tvoří jednotný celek zaměřený na konformační polymorfismus DNA. Jedná se o práci mimořádně úspěšnou, o čemž svědčí kvalita publikací vybraných jako podklad pro habilitační práci. Všechny tři došlé posudky jsou doporučující. Velmi pozitivně hodnotí přehlednost a způsob podání složité problematiky formou přístupnou i pro čtenáře, kteří nemusí být erudovanými odporníky v dané oblasti. Pozitivně hodnotí objem nových poznatků, dosažení prioritních výsledků, kvalitní publikační výstupy i vynikající formu zpracování habilitačního spisu. Doporučují habilitační řízení a jmenování Dr. Trantírka docentem pro obor Biomolekulární chemie. Závěr: Úroveň habilitační práce uchazeče odpovídá požadavkům standardně kladeným na habilitační práce v oboru Biomolekulární chemie na MU. Výsledek tajného hlasování komise počet členů komise 5 počet členů komise přítomných hlasování 5 počet odevzdaných hlasů 5 z toho kladných 5 záporných 0 neplatných 0 Návrh komise Na základě výsledku tajného hlasování následujícího po zhodnocení vědecké / umělecké kvalifikace, pedagogické způsobilosti a úrovně habilitační práce uchazeče předkládá komise Vědecké radě Fakulty sociálních studií Masarykovy univerzity návrh jmenovat uchazeče docentem v oboru Biomolekulární chemie. ] na zastavení řízení. Brno, dne 5. 9. 2016 prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D. U. J~—^yf prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc. 7 ^7 doc. Ing. Richard Hrabal, CSc. prof. Ing. Antonín Lyčka, DrSc. prof. RNDr. Ľubomír Tomáška , DrSc.