Příloha 6: Posudek oponenta habilitační práce Masarykova univerzita Fakulta Přírodovědecká fakulta MU Habilitační obor Fyzikální chemie Uchazeč Mgr. Markéta Munzarová, Dr. rer. nat. Pracoviště Přírodovědecká fakulta MU Habilitační práce Relationships between Structure and Magnetic Properties in Biomolecules, Inorganic, and Bioinorganic Systems Oponent prof. RNDr. Petr Bouř, DSc. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie AVČR, Praha Dr. Markéta Munzarová předkládá k habilitaci soubor vysoce kvalitních výpočetních studií zaměřených na modelování související s EPR a NMR spektroskopií. Jedná se o aktuální téma, jehož rozvoj posouvá možnosti experimentálních technik a teoretických simulací. Podrobné porozumění chování molekul může v budoucnu např. usnadnit vývoj nových biologicky aktivních látek. V práci jsou tvořivě použity moderní postupy kvantové a molekulové mechaniky, často v poslední době označované jako "multiscale", tj. kombinace více výpočetních metod nutná při modelování složitějších systémů. Habilitační práce dokazuje, že autorka se v tématu velice dobře orientuje a je schopná dlouhodobé koncepční práce. Jen kladně lze také hodnotit navazování spoluprací s ostatními špičkovými laboratořemi, a předávání zkušeností studentům a doktorandům. Jedním z hlavních přínosů je např. vypracování vhodných modelů pro simulace magnetických parametrů nukleových kyselin, což často zahrnuje pracné zpracovávání rozsáhlých výpočetních dat, ovšem evidentně vede k hlubokému porozumění spektrálním i jiných fyzikálně-chemických vlastnostem těchto biologických komponent. Práce a přiložené články dokazují, že Dr. Munzarová se spolu s ostatními autory nespokojí s provedením výpočtů, ale je schopna je detailně analyzovat a konfrontovat s experimentálními daty. Práce je logicky členěná a mimo českého úvodu je psána dobrou angličtinou se zanedbatelným množstvím gramatických a stylistických chyb ("systems" s velkým S v nadpisu, str. 8 then®than, str. 14 faint ® fine ...). Jako obecný čtenář ovšem vytýkám některé vágní formulace, nevysvětlování zkratek a zejména symbolů v rovnicích. Některé věci by se daly prezentovat s větším nadhledem, např. ve dvou větách vysvětlit co to "DFT" je, že pro magnetické vlastnosti má některé výhody, ale i nevýhody, v závěru trochu chybí výhled do budoucna. To mě také inspirovalo k níže uvedeným dotazům. Přes tyto drobnosti velký záběr práce, poctivé zpracování, a dobré výsledky dokazují, že autorka prokázala schopnost tvořivé vědecké a pedagogické práce. Její habilitační práce tak splňuje požadavky standardně kladené na habilitační práce v oboru Fyzikální chemie. Dotazy oponenta k obhajobě habilitační práce (počet dotazů dle zvážení oponenta) 1. Obyčejně se za "zlatý standard" ve výpočetní chemii označuje přístup coupled cluster, např. CCSD(T). Jaký vztah k tomu má Vámi použitá metoda DDCI (v kapitole B6)? 2. Jaký je v současnosti největší problém omezující simulace NMR parametrů, např. nukleových kyselin? Je to nepřesnost DFT funkcionálů, špatný model rozpouštědla, vibrační průměrování, apod.? Závěr Habilitační práce Markéta Munzarové „Relationships between Structure and Magnetic Properties in Biomolecules, Inorganic, and Bioinorganic Systems“ splňuje požadavky standardně kladené na habilitační práce v oboru Fyzikální chemie.. Praha, 6. prosince 2013