Příloha 6: Posudek oponenta habilitační práce
Masarykova univerzita Fakulta
Habilitační obor
Uchazeč Pracoviště Habilitační práce
Oponent Pracoviště
Přírodovědecká fakulta MU Molekulární biologie a genetika
Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat.
Přírodovědecká fakulta MU a CEITEC-MU
Úloha domén a jejich interakcí v aktivitách proteinových
komplexů
Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta Národní centrum pro výzkum biomolekul
Text posudku (rozsah dle zvážení oponenta)
Habilitační práce Dr. Palečka je založena na 9 velmi kvalitních publikacích otištěných
v dobře impaktovaných časopisech. Dvě z těchto publikací jsou prvoautorské, u jedné je Dr. Paleček uveden jako korespondující author. Zejména publikace v časopise Plos One a Mol Cell Biol působí velmi pozitivně a bezpochyby staví autory na vysokou úroveň. Vědecké meritum habilitační práce je tedy splněno a zaslouží ocenění.
Co se týká formální úpravy práce, je kvalitní stejně jako vědecký obsah. Čtenář je vhodně uveden do problematiky, nicméně habilitační práce je vypracována na velmi obšírné téma a místy je pro čtenáře obtížně přehledná. V prostoru daném rámcem habilitační práce může být celá problematika jen ztěžka dostatečně detailně a v plném kontextu popsána. Zaměření na určité téma, např. Architektura a aktivity komplexu SMC5-6 by, podle mého názoru, práci prospělo.
Dotazy oponenta k obhajobě habilitační práce (počet dotazů dle zvážení oponenta)
1. Autor zmiňuje možnost p53 proteinu stimulovat vznik Rad51 nukleoproteinového vlákna a regulovat tak rekombinaci. Jsou nějaké vědecké výsledky, které toto tvrzení mohou podepřít?
2. Autor uvádí, že p53 protein je schopen výměny řetězců (str. 9), nicméně tato aktivita může být spíše připsána schopnosti katalyzovat nasedání komplementárních řetězců, jak bylo popsáno v článku Jean a spoluautoři v roce 1997. Jiné články popisuji spíše jeho negativní vliv na rekombinaci (Yoon et al 2004). Mohl by autor rozvést svou
úvahu, která ho vedia k jeho tvrzení?
3. Mohl by autor spekulovat, jakou úlohu může mít SUMOylace a SUMO-interakční doména na proteinové interakce a jejich funkci?
4. Podjednotka Seci podléhá štěpení, tak aby umožnila uvolnění sesterských chromatid. Je možne předpokládat, že proteinové interakce zporstředkované kleisenovou podjednotkou komplexu SMC5-6 mohou být rovněž regulovány (ne proteolyticky), tak aby docházelo k uvolnění hlavových domén? Podobně i interakce pantové domény může být regulována. Existuji mutace v této oblasti, které tento scénář naznačují?
Habilitační práce Mgr. Jana Palečka, Dr. rer. nat. „Úloha domén a jejich interakcí v aktivitách proteinových komplexů" splňuje požadavky standardně kladené na habilitační práce v oboru Molekulární biologie a genetika.
Závěr
Brno, 12.1.2012