Příloha 6: Posudek oponenta habilitační práce
Masarykova univerzita Fakulta
Habilitační obor
Přírodovědecká fakulta MU Biochemie
Uchazeč Pracoviště Habilitační práce
RNDr. Ondřej Slabý, PhD
Středoevropský technologický institut, Masarykova univerzita MikroRNA u solidních nádorů
Oponent Pracoviště
prof. MUDr. Aleksi Šedo, DrSc.
1. Lékařská fakulta Univerzity Karlovy v Praze
Text posudku
RNDr. Ondřej Slabý, PhD, předkládá habilitační práci formou uceleného souboru vlastních publikací (celkem 23 přehledových a originálních prací) a integrujícího vysvětlujícího textu. Vzhledem ke kvalitě obojího mi bylo potěšením seznámit se s obsahem práce a vypracovat posudek.
Práce kandidáta se zabývá problematikou významu miRNA (zejména) v onkológii a pojímá toto téma s přihlédnutím ke všem relevantním aspektům: biologickému/funkčnímu, diagnostickému, prognostickému, prediktivnímu a (individualisovaně) terapeutickému. Této problematice se věnuje zejména v kontextu nádorů kolorekta, renálních nádorů a glioblastomu.
Popravdě řečeno, vzhledem k naprosté dominanci autorových publikací v časopisech se stringentním oponentským řízením a významným impaktfaktorem, nezbývá pro oponenta habilitace mnoho prostoru. O tomtéž vypovídá slušná a v něktolika případech úctyhodná citovanosti prací, vedoucí, s přihlédnutím k délce profesionálního působení autora k vysokému H indexu. Nicmnéně na rozdíl od oponentů jednotlivých sdělení oponent habilitační práce má možnost nahlédnout též dlouhodobě koncepční přístup předkladatele a jeho spolupracovníků a pozoruhodnou celkovou produktivitu tohoto týmu. Domnívám se, že jak vlastní zpracovávaná problematika, tak svým způsobem i předkladatel sám jsou velmi dobrým příkladem zrychlování tzv. "objevitelského cyklu" v biomedicíně. Mám tím na mysli zkracování času od popisu fenoménu po jeho využití, cesty "from bench to bedside". První miRNA byla popsána v roce 1993. Vedla k poznání principiálně nového, zásadního a univerzálního regulačního mechanismu v buněčné biologii s přímou využitelností v klinické medicíně. Autor sám narozen v roce 1981 publikoval svůj první významný přehledný (a špičkově citovaný) článek v renomovaném časopise v roce 2007 a od té doby přispívá kvalitními originálními publikacemi, které přispívají k diagnostickému využití miRNA. Je zřejmé, že rychlý rozvoj biologie je ideální příležitostí právě pro mladé badatele, kteří se vlastně u jednotlivých významných témat mohou pohybovat od samého počátku.
Oceňuji filosofii předložené práce, která je v jednotlivých oblastech koncentrována od přehledného Článku, na němž se skupina perfektně zorientuje a identifikuje oblasti, které vyzývají k dalšímu bádání. Tyto přehledné články jsou skutečně velmi dobře prezentované, s vtipnými schématy umožňujícími rychlou orientaci i jen částečně poučeným laikům (např Vogelsteinuv model kancerogeneze crc s projekcí možných rolí jednotlivých miRNA). V dalším bádání se pak autor opírá především o high throughput metody, které umožňují
pozorované výsledky y dostatečně velkých souborů asociovat s klinickým významem. Za přínosné považuji ovšem i další krok, v němž autor analyzuje nejen populačně-klinický fenomén, ale i biologický program (invaze, migrace, proliferace atd) asociovaný s pozorovaným miRNA fenotypem. Ačkoli většina prací se již dále nevěnuje detailní funkčně-mechanistické studii popisující molekulární kontext biologické události, nepovažuji to za nedostatek. Tyto aspekty nepochybně budou objektem dalších studií dalších případných autorů. Navíc pro případné klinické diagnostické či terapeutické aplikace není poznání detailního molekulárního mechanismu v řadě případů zcela nezbytné. Nezbytná je ovšem otevřená spolupráce odborníků několika disciplin, kterou předkladatel zjevně dokáže velmi úspěšně katalyzovat.
Práce petenta rovněž prokazuje nejen jeho mezinárodní vazby a aktivitu, ale i respekt odborné komunity. Je zřejmé že je samostatnou osobností, s vysokou vědeckou kapacitou ale i organizačním potenciálem.
Dotazy oponenta k obhajobě habilitační práce (počet dotazů dle zvážení oponenta)
V tomto případě se skutečně jedná o dotazy a výzvy k debatě, nikoli výtky.
1. Uvažujete o dalších mechanistických studiích, zaměřených na popis funkčního mechanismu zprostředkovávajícího důsledky asociované s pozorovanými změnami miRNA fenotypu. V některých případech by to patrně umožnilo posoudit kauzalitu vztahu příčina-následek
2. Jaké jsou Vaše zkušenosti s intratumorovou heterogenitou tkáňových vzorků GBM a jejím dopadem na Vámi studované parametry?
Oponent zpravidla vyhledává i formální nedostatky. Přiznám se, že i v tomto ohledu shledávám práci jako perfektní; podařilo se mi najít jediný překlep na straně 14.
Závěr
Habilitační práce Ondřeje Slabého „MikroRNA u solidních nádorů" EXCELENTNĚ splňuje požadavky standardně kladené na habilitační práce v oboru Biochemie.
Praha,.....£t£,É^
AleksfŠedo