vědní disciplina, studující historické procesy odpovědné za současné rozšíření organismů; kombinuje informaci o&nbsp;<span class="linked_term" onclick="showTermNamed('fylogeneze')">*fylogenezi</span> organismů s&nbsp;informací o&nbsp;jejich geografickém rozšíření. Na rozdíl od tradiční <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('fylogenetika')">*fylogenetiky</span> se však nezabývá druhy ani jedinci, ale výhradně kopiemi <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('gen')">*genů</span>. Metodicky vychází z&nbsp;koalescence (doslova „splynutí“), která stopuje osudy jednotlivých genových kopií zpět v&nbsp;čase až do okamžiku, kdy existoval jejich jediný společný předek. Tento přístup umožňuje do <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('analýza')">*analýzy</span> <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('genealogie')">*genealogie</span> genů začlenit i&nbsp;další faktory (<span class="linked_term" onclick="showTermNamed('mutace')">*mutace</span>, <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('rekombinace')">*rekombinace</span>, změny <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('velikost populace, efektivní')">*efektivní velikosti populace</span> atd.) a&nbsp;tím získat přesnější informace o&nbsp;vlivu různých historických procesů (například populační <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('bottleneck effect')">*bottleneck effect</span> nebo expanze, <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('migrace')">*migrace</span>).$Fylogeografie sehrála významnou úlohu při ověření <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('hypotéza')">*hypotézy</span> o&nbsp;africkém původu moderního člověka (<span class="linked_term" onclick="showTermNamed('člověk moudrý')">*člověk moudrý</span>) a&nbsp;jeho migraci na ostatní kontinenty, kde nahradil starší formy (//out-of-Africa hypothesis, replacement hypothesis//). Analýza <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('DNA, mitochondriální')">*mtDNA</span> ukázala, že společný předek současných lidí žil přibližně před 150 000 lety v&nbsp;Africe a&nbsp;potvrdila tak hypotézu o&nbsp;africkém původu (viz <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('antropogeneze')">*antropogeneze</span>, teorie mitochondriální Evy). Následné analýzy 25 různých molekulárních znaků (markerů) naznačily, že původní expanze //<span class="linked_term" onclick="showTermNamed('Homo erectus')">*Homo erectus</span>// byla následována přinejmenším dvěma hlavními expanzemi mimo africký kontinent. Otázka, zda při kontaktu <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('homo sapiens')">*moderních lidí</span> s&nbsp;populacemi <span class="linked_term" onclick="showTermNamed('Homo neanderthalensis')">*neandertálců</span> docházelo ke vzájemnému křížení, není dosud spolehlivě vyřešena. (<span class="linked_term" onclick="showTermNamed('Macholán, Miloš')">Miloš Macholán</span>)