Jakmile máme staženy záznamy do Zotero, můžeme z nich vytvářet bibliografické citace. Postup si ukážeme na příkladu MS Word, ve kterém po instalaci pluginu se vytvořila nová záložka Zotero s příslušným panelem.

Stažené záznamy budeme jako bibliografické citace vkládat do reálného textu převzatého z článku Koincidence kožní a plicní formy pyoderma gangraenosum (Česká dermatovenerologie, 2017, 7(2):106-110).

Před vložením citace umístíme kurzor na místo, v němž se má citace zobrazit. Vždy si proto v citačním stylu, který máte dodržovat zjištěte, kde mají být citace umístěny. Při psaní článku do časopisu se podívejte do již vydaných článků.

Při prvním vkládání se vždy zobrazí okno s nabídkou přednastavených citačních stylů, ze kterých zvolíme námi požadovaný (později si vysvětlíme, jak přidat další styly).

Jak se můžeme přesvědčit, citace i soupis literatury se přeformátovaly a namísto čísel v textu a řazení soupisu literatury podle nich, je nyní v textu jiná forma odkazů a soupis literatury je řazen abecedně podle příjmení prvního autora.

Základní nabídka přednastavených citačních stylů je značně omezená, protože na Internetu v repozitáři je dostupných dalších více než 8 000 citačních stylů. Ukažme si nyní, jak je do Zotero přidat.

V internetovém prohlížeči otevřeme adresu www.zotero.org/styles a otevře se repozitář citačních stylů. Doporučujeme vyhledávat v seznamu stylů ručně namísto vyhledávačem této webové stránce - ne vždy je název stylu uveden, jak jej předpokládáme.

Biomedicínským oborům doporučujeme bez ohledu na to, ze kterého webu stáhnou plný text publikace, stahovat její záznam z databáze Medline PubMed. Nejenže jsou v této databázi záznamy dostupné ve vysoké kvalitě, ale téměř vždy obsahují celý i zkrácený název časopisu. A v biomedicínských časopisech se právěže upřednostňuje zkracování názvů časopisů podle Medline PubMed. V případě českých článků doporučujeme záznamy stahovat z databáze Medvik.

V případě citování českých knih doporučujeme stahovat záznamy ze Souborného katalogu ČR (na http://aleph.nkp.cz zvolte SKC - Souborný katalog ČR), který je spravován Národní knihovnou v Praze a jsou do něj importovány záznamy většiny knihoven v Česku.

Jinak do Zotera lze stahovat záznamy z řady databází jako např. Web of Science, Scopus, Science Direct aj., ale i běžně z webových stránek zobrazných v internetovém prohlížeči.

Poslední ukázku stažení demonstrujeme na databázi Medvik, kterou doporučujeme ke stahování biomedicínských článků vydaných v Česku.

Nyní ale stáhneme záznam knihy, abychom si vysvětlili postup doplnění chybějících údajů.

Aplikace Zotero umožňuje správu citačních údajů, jejich vkládání do textu v MS Word nebo Open Office a jejich naformátování podle požadavků konkrétního citačního stylu nebo vydavatele časopisu.

Zotero je volně k dispozici zdarma na https://www.zotero.org a k jeho používání je třeba mít nainstalovaný prohlížeč Mozilla Firefox, Google Chrome nebo Safari.

Celý proces zahrnuje instalaci panelu Zotero a následně instalaci Zotero Connectoru zajišťujícího propojení aplikace s webovým prohlížečem kvůli stahování záznamů. Zotero Connector se přitikom propojí s tím prohlížečem, ve kterém byla instalace spuštěna, tj. např. uživatelé Google Chrome musejí instalaci provést v tomto prohlížeči.

Po instalaci doporučujeme provést ještě nastavení zajišťující, že se při citování online document v citaci vygeneruji pro něj typické údaje (forma dokumentu, datum citování, webová adresa).

Po všech předchozích krocích doporučujeme zkontrolovat, že se instalace zadařila a že v MS Word či vámi užívaném textovém editor se vytvořila záložka Zotero s jeho tlačtíky a že přes nabídku Start lze ve Windows spusit panel Zotero.

Pokud by se po spuštění MS Word nezobrazila záložka Zotero, jsou dvě nejčastější příčiny:

1. Po otevření MS Word se nahoře zobrazuje žlutý řádek s tlačítkem Povolit obsah. Kliknutím na tlačítko se obvykle záložka Zotero zobrazí.

2. Záložka Zotero se vůbec nezobrazuje a tedy zřejmě se při instalaci něco nepovedlo. Doporučujeme – jak je zobrazeno níže – v panelu Zotero kliknout na Úpravy, zvolit Předvolby a v následně otevřeném okně vybrat nahoře Citování, pak záložku Textové procesory a kliknout na Nainstalovat add-in Microsoft Word (či níže LibreOffice, používáte-li tento textový editor). Tím přeinstalujete plugin textového editor a obvykle se v něm pak již záložka Zotero zobrazí.

Citujete-li dokument, k němuž nelze stáhnout záznam z žádné databáze či katalogu, ani s pomocí funkce kouzelnické hůlky, je třeba záznam vytvořit ručně.

Před vytvářením záznamu si vždy ujasněte, který typ dokumentu se chystáte citovat (knihu? kapitolu v knize?) a v jakém formátu jej máte (tištěný? online?). Jakmile si toto ujasníte, je třeba podívat se do citačního stylu, ze kterých údajů se skládá bibliografická citace pro danou publikaci, a tyto údaje pak v ručně vytvořeném záznamu vyplníte.

Vytvoří se prázdný záznam, do něhož podle - v tomto případě - knižní předlohy doplníme nezbytné údaje:

Při citování webové stránky lze její záznam do Zotero stáhnout, ale vždy je třeba některé její údaje doplnit ručně.

V době přípravy této části tutoriálu Zotero neobsahuje v šabloně záznamu webové stránky pole pro místo vydání a nakladatele. Pakliže by citační styl tyto dva údaje vyžadoval, je třeba je dopsat ručně do soupisu literatury.

Ne vždy se záznam z databáze nebo katalogu stáhne v potřebné podobě. V případě potřeby něco v citacích opravit, vždy nejdříve hledejme systémové řešení problému, než abychom citace opravovali ručně - to má být opravdu až ta poslední možnost. Jedná se o to, že jakmile ručně upravené citace znovu přeformátujete podle jiného stylu nebo je aktualizujete, vše se vrátí do předchozího stavu s chybami.

Ukažme si proto, jak se snažit řešit případné chyby v citacích.

Příčinou první chyby s webovou adresou a citováním je, že při stažení záznamu z Medviku se stáhla webová adresa odkazující nikoli na plný text knihy, ale na její bibliografický záznam v Medviku. To je samozřejmě chyba, kterou odstraníme přímo v záznamu uloženém v panelu Zotero.

Tento typ chyby tedy nelze opravit systémově, např. dopsáním dvojtečky a interpunkce přímo do záznamu v Zotero, protože pro jiné styly by záznamy těchto knih byly nepoužitelné.

V takovýchto případech nezbývá, než do soupisu literatury zasáhnout ručně, jednu dvojtečku umazat a mezi nakladatele a rok vydání doplnit příslušnou interpunkci. Připomínáme, že toto ale dělejte vždy až před vlastním odevzdáním textu.

Vysvětleme si na příkladu online časopiseckého článku, nač při citování online dokumentů nezapomínat.

Při citování online dokumentů je nezbytné mít ve staženém záznamu vyplněna pole Přístup a buď DOI, nebo URL (zcela ideálně je mít vyplněna obě pole a nechat na citačním manažeru, aby podle parametrů citačního stylu vypsal do bibliografické citace požadovaný údaj - v současnosti se požaduje primárně DOI).

Občasným problémem je nevypsání některého z autorů do bibliografické citace. Příčinou je chybné nastavení pole se jménem autora.

Po stažení záznamu do Zotero si tedy vždy zkontrolujte, zdali u jmen osob máte uvedenu jejich správnou roli, tj. aby editor měl zvoleno Editor, autor měl Autor atd.