MUNI Úvod do základů psaní odborného článku: příprava na psaní a redakční proces Jiří Kratochvíl Knihovna univerzitního kampusu 2 Dnes si řekneme... 1. proč se píší vědecké články 2. jak se připravit s ohledem na výzkum 3. o odevzdání článku a 4. redakčním procesu s odevzdaným článkem Příprava článku 4 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu Proč se píší vědecké články 1. Přispět svým názorem do diskuse o vědecké otázce 2. Vzbudit zájem ostatních o výzkumnou otázku 3. Informovat o výsledcích svého výzkumu 4. Získat zpětnou vazbu 5. Legitimizovat výzkum 6. Doložit vědeckou aktivitu 7. Financování výzkumu THE EVOLUTION OF HCHDEMIH fWtat ^ AKiO Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Která aplikace dělá nejméně chyb v citacích. 6 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Ptají se mne, kterou aplikaci doporučuji. 7 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Stanovení tématu Výzkumná otázka Který z citačních manažerů generuje nejméně chyb v bibliografických citacích? Pracovní název Srovnání správnosti bibliografických citací vygenerovaných citačními manažery EndNote, Mendeley, RefWorks a Zotero pro vybrané citační styly 8 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Definování klíčových slov Comparison of the Accuracy of Bibliographical References Generated for Medical Citation Styles by EndNote, Mendeley, Název anglicky + klíčová slova RefWorks and Zotero Alternativní slova correctness, bibliographical citation, reference manager, citation manager, citation tool, citation generator Vyhledávací dotaz (accurac* OR correct*) AND bibliograph* AND (reference* OR citat*) AND (EndNote OR Mendeley OR RefWorks OR Zotero OR manager* OR tool* OR generat*) Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Specifikace vyhledávaných informačních zdrojů Datum vydání K manažerům max. 5 let, jinak všechny roky Typy publikací Všechno Jazyk dokumentu CZE, SLO, ENG Rozsah přístupu Všechno 10 Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Volba vyhledávače informačních zdrojů WoS Scopus Discovery Google Scholar 11 Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Organizace vyhledávaných informací Moje potřeba CitacePRO EndNote Mendeley Refworks Zotero Jaká je výše nákladů za pořízení/užívání aplikace? Je aplikace v desktopové nebo online verzi? Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Organizace vyhledávaných informací Accuracy of References in Four Pediatric Nursing Journals Marilyn H. Oermann, PhD, RN, FAAN Sarah L. Cummings, MSN, RN .\ancy A. Wilmes, BS, MS, MSLS Inaccurate- references hinder retrieval of documents, may prevent researchers from examining all ofllie woifc hy an author, nni fnav resufl in author* nol setting credit for their work. This study determines the numlirr .Mid typei of orion in icteiences ir lour Middy read potd Jtric nursing journals. Of the 190 references examined, 70 [hem r_t rate of 41,6% Vtdjrjt errors, which prevent I he rapid retrieval of infoirnSlinn, c occurred ar halt the rate f T 3,7%) of major« oť rriisiaAe ibllt»*-fd by errors in suihori' names. Copyright O 200! by IVB Säuňdcn Company s in the lilies or" articles, chapters, ŕinrl hocki n Lhert'i'prencsr*. Mif.ar e; REFEREN'CE CITATIONS are an integral component m any publication and serve many useful purposes. The primary purpose is to give credit for the orig]naf author's work. Citations also serve as a means to evaluate the thoroughness of a literature review; a complete and careful review of the literature establishes thai the author is knowledgeable about the subject matter and has examined the research available on a topic- Another important purpose of references in an article j< to direct reader; to information about a content area, enabling them to conduct their own literature review*, examine research cm the topic, identify * *trirrtr u needed, and gain knowledge inon last name, it may subject the researcher tn looking through multiple documents containing other authors with Hie same last name and first initial (Taylor, 1998). Not nil clinicians have a large library .it their disposal, and a missing part of a reference citation may make an article irretrievable. There also are monetary costs to citing inaccurate references. Libraries and document delivery services often verify references before sending the requested material. Patrons may incur the additional costs in the form of higher loan Tecs or reduced resource staff. There arc few studies in nursing thai have Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Píše se jen o funkcích, ale ne o správnosti citací. 14 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Je problém mezerou? Ano, o správnosti citací se nepíše. 15 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Je problém mezerou? Co na problému může zajímat ostatní? Kterou aplikaci používat. 16 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Stanovení tématu a zhodnocení jeho přínosu Který problém chci řešit a o čem chci psát? Proč chci problém řešit? Co o problému vím a co chci zjistit? Je problém mezerou? Co na problému může zajímat ostatní? Výsledek zhodnocení V literatuře jen o funkcích. Praxe, průzkumy i diskuse ukazují, že je žádoucí zjistit aplikaci mající nejméně chyb v citacích. 17 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Volba chystaného článku Typ článku Original article Systematic review Literature/Narrative review Opinion article Popis Rozsah Struktura 18 Systematické vyhledávání, Článek vyjadřující Zveřejnění výsledků zpracování a kritické Přehled poznatků autorův názor na původního výzkumu. 3 500 slov Introduction Methods Results and IDiscussion Conclusion Literature zhodnocení studií k tématu ze studií k danému určitý aktuální za účelem zodpovězení Itématu. výzkumné otázky. 5 000 slov Introduction Methods Results and Discussion Conclusion Literature 4 500 slov Introduction Methods Results and IDiscussion Conclusion Literature problém v daném oboru. 2 000 slov Introduction Opinion Conclusion Literature Jak se připravit na výzkum a psaní Volba chystaného článku Typ článku Original article Systematic review Literature/Narrative review Opinion article Systematické vyhledávání, Článek vyjadřující Zveřejnění výsledků zpracování a kritické Přehled poznatků autorův názor na Popis původního zhodnocení studií k tématu ze studií k danému určitý aktuální výzkumu. za účelem zodpovězení výzkumné otázky tématu. problém v daném oboru. Rozsah 3 500 slov 5 000 slov 4 500 slov 2 000 slov Introduction Introduction Introduction Methods Methods Methods Introduction Opinion Conclusion Literature Results Results Results Struktura and Discussion and Discussion and Discussion 19 Conclusion Conclusion Conclusion Literature Literature Literature Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu Byl jsem realista 20 Příprava vědeckého článku / Knihovna Journal name 2016J1F JF Quartile 1 MIS Quarterly 7.268 Ql 2 Journal of Information Technology 6.953 Ql 3 Information Systems Journal 4.122 Ql 4 Journal of Computer-Mediated Communication 4.113 Ql 5 Government Information Quarterly 4.090 Ql 28 Journal of the Medical Library Association 1.638 Q2 33 College & Research Libraries 1.515 Q2 40 Portal-Libraries and the Acadeny 1.290 Q2 41 Journal of Academic Librarianship 1.287 Q2 42 Library & Information Science Research 1.185 Q2 46 Information Technology and Libraries 1.029 Q3 Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu Byl jsem realista Pročetl jsem si informace o časopise a prolistoval jedním číslem 21 Příprava vědeckého článku / Knihovna Journal name 2016JF JIF Quartile 28 Journal of the Medical Library Association 1.638 02 33 College & Research Libraries 1.515 02 40 Portal-Libraries and the Acadeny 1.290 02 41 Journal of Academic Librarianship 1.287 02 42 Library & Information Science Research 1.185 02 46 Information Technology and Libraries 1.029 03 Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu Byl jsem realista Pročetl jsem si informace o časopise a prolistoval jedním číslem Zjistil jsem si typ vydávaných článků 22 Příprava vědeckého článku / Knihovna Journal name 2016JF JIF Quartile 28 Journal of the Medical Library Association 1.638 02 33 College & Research Libraries 1.515 02 40 Portal-Libraries and the Acadeny 1.290 02 41 Journal of Academic Librarianship 1.287 02 42 Library & Information Science Research 1.185 02 46 Information Technology and Libraries 1.029 03 Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu Byl jsem realista Pročetl jsem si informace o časopise a prolistoval jedním číslem Zjistil jsem si typ vydávaných článků Přečetl jsem si podmínky publikování nF Journal name 2016JF guartile 23 Příprava vědeckého článku / Knihovna 28 Journal of the Medical Library Association 1.638 02 33 College & Research Libraries 1.515 02 40 Portal-Libraries and the Acadeny 1.290 02 41 Journal of Academic Librarianship 1.287 02 42 Library & Information Science Research 1.185 02 46 Information Technology and Libraries 1.029 03 Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu Byl jsem realista Pročetl jsem si informace o časopise a prolistoval jedním číslem Zjistil jsem si typ vydávaných článků Přečetl jsem si podmínky publikování Journal name 2016JF 28 Journal of the Medical Library Association 1.638 33 College & Research Libraries 1.515 40 Portal-Libraries and the Acadeny 1.290 41 Journal of Academic Librarianship 42 Library & Information Science Research 24 Příprava vědeckého článku / Knihovna 46 Information Technology and Libraries 1.029 Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu Byl jsem realista Pročetl jsem si informace o časopise a prolistoval jedním číslem Zjistil jsem si typ vydávaných článků Přečetl jsem si podmínky publikování Zjistěte si indexaci časopisu Poradte se se zkušenými kolegy Dodržujte pokyny pro autory Zkuste nakouknout do fungování časopisu 25 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu - vyhněte se predátorským časopisům - Zkontrulujte dodržování fonnálních kritérií - Posuďte odbornou kvalitu publikovaných článků - Nahlédněte pod pokličku časopisu 26 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Výběr časopisu - vyhněte se predátorským časopisům - Zkontrulujte dodržování fonnálních kritérií - Posuďte odbornou kvalitu publikovaných článků - Nahlédněte pod pokličku časopisu - Zjistěte si způsob odevzdání článku https://is.muni.cz/go/predator 27 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Jak se připravit na výzkum a psaní Seznámení se s instrukcemi pro autory Příprava vědeckého článku / Electronic artwork General points • Make sure you use uniform lettering and sizing of your original artwork. • Preferred fonts: Arial (or Helvetica), Times New Roman (or Times), Symbol, Courier. • Number the illustrations according to their sequence in the text. • Use a logical naming convention for your artwork files. • Indicate per figure if it is a single, 1.5 or 2-column fitting image. • For Word submissions only, you may still provide figures and their captions, and tables within a single file at the revision stage. • Please note that individual figure files larger than 10 MB must be provided in separate source files. A detailed guide on electronic artwork is available. You are urged to visit this site; some excerpts from the detailed information are given here. Formats Regardless of the application used, when your electronic artwork is finalized, please 'save as' or convert the images to one of the following formats (note the resolution requirements for line drawings, halftones, and line/halftone combinations given below): EPS (or PDF): Vector drawings. Embed the font or save the text as 'graphics'. TIFF (or JPG): Color or grayscale photographs (halftones): always use a minimum of 300 dpi. TIFF (or JPG): Bitmapped line drawings: use a minimum of 1000 dpi. TIFF (or JPG): Combinations bitmapped line/ha If-tone (color or grayscale): a minimum of 500 dpi is required. Please do not: • Supply files that are optimized for screen use (e.g., GIF, BMP, PICT, WPG); the resolution is too low. • Supply files that are too low in resolution. • Submit graphics that are disproportionately large for the content. Color artwork Realizace výzkumu Sběr dat AWLAl K1TVIIT.WS OF ÍMUIINOITKÍY - VZOK 1'řispřvek v i i! !t n t ni sLhíijií1í.u * mriiř- jiei 3 ;iuiury přispěvku domes P. r.iip.u-1 IV. c'20l)9. The Role ol'íi Nation-Wide Informal ion Sysiem in improving Hic Alices lo Siirfi^iv in Pom.igal. In: Madicat Informatici i/i :.i United atu.1 IĽ.alíhy Fvn/pc: Vroasedinas oj' MIH 201)9, ei. K.-P Adlasstiig; II rilolwl, .1 Manias, 1 Masic, pp. 71-75. Amsterdam, NI.: IDS Press ľŕísprvck v tištřium sborníku s vice jak 3 autm-y príspevku Foumel 1. SoinvuratiL'ŕr M. BinqueiBenzenirve b. Hill C. Qua n I in C, c2009. ConLribillion of Ke.'tord Linku at' lo Vital Sŕiuius LMcTmimilion in Canter ľaiit-nis. In; Medical Inivrimttics in a United mid Ucalthy Europe: Proceeding of Mít 20(1% od. K-P Adlassiiig, B BLobd. J Manias, I Masiť, pp. 91-95. Amsterdam. XL; ICS Prosa Přispí vek v online sborníku n mrněnei 3 aulury príspevku ťiňrnc-ř. P. Lapán I.V. c20IW. Tlií Role oťn Xnr.ioii-W'i.ic rnťormution System in Improi Access to Surgerv in Portugal. In: Xfedicai Informatici in u Unincl unci Hnali hy l ľroccedings af MIH 201)9, ei. K-P Adlasstiig, 13 Blohel, .1 Mantas, 1 Masic. pp Amaffirclam. NI.: I()S Ľress. 1 ittp: lx M>k s. ío spre s a. n I -'"'puh I icat i o n -■' 12f»i) íl ľfispivtk v {inline sborníku s vít« juk 3 autory príspevku J-'oumd J. Scliwarzingc-r M. Binquci C, Beníenine t. Hill C. Qujiilín C. e-2009. Contribution ol Record Linkuje kí Yilal Slulus Dclcnniiialion in C:mcer Palionls. In; Medical Informatics' i/r a Untied and Iknhky Europe; Proceedings of ME 200.9. al. K-P AclhíyyniĽ. D Blobd. J Mamas, 1 Masic, pp. 91 -95. Amsterdam. NT.: IOS Pres.s. lil.ipľ/.'chool.s.iosjtľĽsi.til.-'jMiW ica1iriri/r2ň 12 TiMénä kniha s 1 autorem Sadler iW. 2012. Eaii^maii'.(' tí I lealth/Lippiricott Williams & Wilkin Tištěná kniha s 2 siurciry Beauchäirap TL. Children JF. 21)09. Principles University Press. 6lh ed. lištŕ-rui knih.ii s 3 autory Murray PR, KobnyasM OS, Pľall Louis: Mosby. 2nd ed. ■ MA. Rosuiihul KS. 1994, mhrubiuhgy; Si, kľ.KwoitKS-a^miai, ki:vii:w IMMUNOLOGY LITERATURE CITED (.iomes 1-', i apao IV e"00'l. PIUNT the role of a rati on-wide information system in improving the access Lo surgery in porlujjal. In Medicul Iniormalics- in a United and Healthy Eumpe: Proceeding nf'MIE 2i>i'fJ. the XXIInd htiernatiorMl Congress tit'die Eitroiiean be duration for Medical Infbrmaiics. eds. k Adlassnig. II Bio be J, J Mantas, I Masic. 71-5. Amsterdam: TOR Press I'onrncl 1, ScliwarziiigcrM, Binquct C, Bcnzeniiic L, Hill C, Quanriii C. c2uTO. PRINT contribution of record linkage lo vilal sl.nl.ns cleLevminatinn in cancer palients. Tn Medical Infonnttlicy. in cr Untied and Healthy Europe: Proceeding ofMIF. 2009. iht XMlnd International £'cwj>n\w of •die European Federal ion far Medical l;rjor,-riatia.. eels. K Adlassriig, H Hlohel. .1 Miintiis. I M-iisic. CH -5. Amsterdam: IOS Press tiomc-s P. I.ypao LV. 2009. DOI Lbc role ol'u n;iLion-widc irLloTiiialitui -v.|v: i in iniprovirig the access to siugeiy in poitiigal. iiL Medical informatics m a IJmh'd and Jlcalihy Europe: Proceedings of WE 2()(r9, the XXJInd Jniarmitimial CuTigress id ihc I'.ttropenn l-eJumiiurt [or Medical Informatics: cds. K Adlassnig, B Blobcl, J Manias, I Masic, 7 lo. Amucrdam: IOS Press Gomes P, Lapao LV. c2009. URL the role ol'a nation-wide inliirinalioii system in improving, the access to snrgcrv in poilugiil. In Medical informatics in a Untied and Healthy Europe: Proceeding ofM1E 2009. the XXHnd international Congress of the European Federation/»r Medical hiformulics, K Adlassni^ B BlobeL J ManLa^. T Mi-; 71o. Amsk-rdiim: IOS Pruss I'onrnel I, SdiHwingerM, Rinqnet C, Ren^nine F.„ (Till C, Oiumtin C. c2009, DQ1 conlriliLiLHin oCrLcord linkage; lo vital status doLeTmuiiiLinn m cancer palicin^. In Medical Informatics in a Untied and llcutfthy Ewupv: Proceedings ofMIE 10')9. dtc XXllird limnmrional Crui»rn.s:<. of The European l-'admniim for \-U-dif.nl Informcii/cf, «h- l< A(llas™ig, B Blobel. .1 Manias, T Masic, 91 -5. Amsterdam: TOS Press I'onrncl I, Schwarzitiger M, liiLHiuci C. BcLizcnitic L. Hill C, Quanriii C. c2U09. URL contribution of record linkage to vital status detenniimti on in cancer patients. In Medical Informatics in a Untied and Healthy Europe.: Proceedings ofMIE 2009. the XXJInd International Ccmgrfx* of die European l-c.de rati, in for Medical /nfbrmatic.v, cds. K Adlassnig. I! Lilobei, J Mantas, i Masic. 91-5. Amsterdam: IOS Press Sadler TW. 2012. Eangman':- medical emhryola^y. Pliiladclphia: Wollers KIliwlt Hcallli/Lippincotl Williams & Wilklns. JS3pp. 12th ed. ■i O ä -II" -1 ľ «■ |Ob.,.í -1 B m m s m S Ľ""" ' P S"3 B C,..,..,.-,...,,, -1 m • % '■' Tvp dokumentu Chyby v interpunkci .d page pied _ C^ycój'c'zkr;tk: p;goi p'cd " -v-ej : --.r:i-. ť p.rgps prpri Chybějíc! UR7DOI. _ C^ycíj'c'zkr;tk: p;goi p'cd C-ycej ( UtiVDOI. o Udaj o rozsahu stran naiíc. Chybná interpunkce za sílu stri~ ravlc. C^ycrí inerpjrkcs z.= Eiihu otrai navíc. Chyhná interpunkce za sáhu strai navíc. Ciy-ná interpunkce za Ciy:ějicilJR_/DOI. 0 udaj o roiíahu =tr = - rav c. C^ycrč inerpjrkcs za Chybné to r máto u á ni pec,; tec r" rr písmeny Ne:ev pf';přve * -Typ článku - Údaje o článku 35 liverzitního k (D A h1tps://www.evÍ5e,rom/evÍ5e/(ace&/pages/5ubnni^ion/Subnnission.jsp W ÍT Q» Hledat Í lll\ HD = Enter Manuscript Information Upload Files Provide Additional Information Article Type: Full Length Article Enter Manuscript Information Select an article type from the dropdown list. Enter the required information into the fields that then appear. Review 8, Submit Guice for -uthcis Compliance with ethical rules fci scientific pu Wishing in biomedical Open Access journals indexed in Journal Citation Reports Abstract:* This study examined compliance with the criteria of transparency and best practice in scholarly publishing defined by COPE, DO.AJ. OASP.A and YVAME in Biomedical Open Access journals indexed in Journal Citation Reports (JCR). 259 Open Access journals were drawn from the JCR database and on the basis of their websites their compliance with 14 criteria for transparency and best practice in scholarly publishing was verified. Journals received penalty points for each unfulfilled criterion when they failed to comply with the criteria defined by COPE. DO.AJ, OASPA and WAME. The average number of obtained penalty points was 6, where 149 (57.5%)journals received 6 points or less and 110 [42.5%) journals 7 or more points. Only 4journals met all criteria and did not receive any penalty points. Most of the journals did not comply with the criteria declaration of Creative Commons license [164-journals), affiliation of editorial board members (116), unambiguiry of article processing charges [115), anti-plagiarism policy (113) and the number of editorial board members from developing countries [99). The research shows that JCR cannot be used as a whitelist of journals that comply with the criteria of transparency and best practice in scholarly publishing. Taxonomy:* Add minimum of 2 AND maximum of 6 topics Add Topics Keywords:1* Keywords should be separated by semi-colons, e.g. capillary electrophoresis; liquid chromatography. Odevzdání článku Redakční systém -Typ článku - Údaje o článku - Nahrání souborů 36 Příprava vědeckého článku / Knihovna3©iiverzitního k CD A https:/Avww.evÍ5e.com/evÍ5e/race&/pages/BubmÍ5sion/SubmÍ55Íonjspŕ.- W Ú Q* Hledat The Journal of Academic Librarianship Provide Additional Iniorrnation Review & Submit Giiice for Authors ± \\\\ m EVISE" Upload Files Click Upload Files to select and upload submission files. • Check the assigned File Type for each submission file and edit if needed. • Select a File Type if none has been assigned. Mandatory File Types are indicated in the drop-down list. • Click Order Files to automatically update the File Order as required by the journal. • Manually update the order of files of the same type, e.g. Figures or Tables, if needed. • Click Save to preserve the new order before proceeding. • The Manuscript File size should not exceed 15QMB. • The total size of your submission files must not exceed 7QDMB. LaTeX Instructions: Upload all LaTeX files as a single zip fHe and select Manuscript as the File Type OR upload a PDF with File Type Manuscript alongside a bundled zip of your ail LaTeX files with File Type LaTeX Source Fife. See ourlaTeXsubmission instructions for more information. Data Visualization: Include interactive data visualizations in your publication and let your readers interact and engage more closely with your research. Follow the instructions here to find out about available data visualization options and bow to include them with your article. Click Save R Continue to proceed to the next step. Upload files j | Order flies j File Order 4o data to display, ■■ File Type Description Download File I Order files j ( Save ] Share your research data (Optional) In this section, you can make your research data available with your article. Sharing research data helps other researchers evaluate yourfindings, and increases trust in your article. Research data can include, [but is not limited to): raw data, processed data, software, algorithms, protocols, methods and materials. Please cite your research data within your article, consult your journals Guide for Authors for instructions. The following options are available: Odevzdání článku Redakční systém -Typ článku - Údaje o článku - Nahrání souborů - Potvrzení Příprava vědeckého článku / Knihovna^iverzitního kar (?) -> e tír © A h1tps://Www.evÍ5e.com/evÍ5e/faces/page5/5ubmission/Submission.jsp O journal.pone.0147913 Accessed 18 May 2017 46. Yessirkepov. M., Nurmashev, B., & Anartayeva. M. (2015). A Scopus-Based Analysis of Publication Activity in Kazakhstan from 2Q1Q to 2015: Positive Trends. Concerns, and Possible Solutions. Journal of Korean Medical Science, 30(12). 1915-1919. https://doi.org/10.334S /jkms.2015.30.12.1915Accessed 23 May2017. Funding acknowledgement Please confirm that you have acknowledged all organizations that funded your research, and provided grant numbers where appropriate.' All funding sources hive been acknowledged. Publishing Open Access In addition to publishing subscription content, this journal also publishes Open Access articles, which both subscribers and the general public may freely access and reuse. Publishing Open Access is optional. If the article is published Open Access, a fee is payable by the author or research funderto coverthe costs associated with publication/ OI wish to publish this article Open Access if it is accepted ® I do not wish to publish this article Open Access. This journal has a double-blind reviewing policy. Please ensure that your name, affiliation details, and any other identifying information appears only on the title page and covering letter, which cannot be seen by reviewers. Have you removed all identifying information from the manuscript file and uploaded your title page as a separate file?* 0 I have uploaded my title page separately and removed all personal identifiers from the manuscript. Previous Save ^^^^^^^^ Copyright© 2013 Elsevier B.V. f Terms ofUse | Privacy Policy | AbcutUs Cookies are set by this site. ~c ne or learn more, visit our Cookies page. v "Blind Manuscript (No Author Identifiers) Click here to view linked References Odevzdání článku Redakční systém -Typ článku - Údaje o článku - Nahrání souborů - Potvrzení - Kontrola Příprava vědeckého článku / Knihovna;-ujiiverzitního kampusu Comparison of the accuracy of bibliographical references generated for medical citation shies by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zorero 33 34 35 4 5 46 59 60 Abstract Bibliographical references to online and printed articles, books, contributions to edited books and web resources generated by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zotcro were compared with manually written references according to the citation instructions in 15 biomedical journals and the NLM citation style. The fewest mistakes were delected in references generated by Zotero for 11 journals and the NLM style, while the second fewest number of mistakes was found in Mendeley. The largest number of mistakes for 9 journals was found in references generated by EndNote and in the other 4 journals the largest number of mistakes was detected in RefWorks references. With regard to the individual types of resources, the lowest number of mistakes was shown by Zotero, while RefWorks had the greatest number of mistakes. All programs had problems especially with generating the URL and the date of access in the reference to online documents. It was also found that several mistakes w:ere caused by technical limitations of the reference managers, while other mistakes originated due to incorrect setting of the citation styles. A comparison showed that Zotcro and Mendeley arc the most suitable managers. Introduction Bibliographical references are an integral part of all scientific publications. However, dieir authors constantly struggle with generating them and repeatedly make mistakes in creating them. These mistakes should not be treated lightly, because they may lead the reader to doubt the quality of the author's research; the author might also have shown the same carelessness in the references in the following parts of the article or in the research itself (Bicbuyck, 1992). In the past, some authors have been revealed to have mentioned sources in the list of references which they had not read. Some authors have also brought over incorrectly formatted bibliographical references from different articles (Cronin, 1982: Garfield, 1990: Sweetland, 1989; Wyles, 2004). As a result, not only the reputation of the authors but also the reputation of the journals can suffer when poorly produced articles featuring mistakes are published (Spivey & Wilks, 2004). Mainly the cited authors and the cited journals are affected. Indexing these authors in citation databases can become more complicated or even impossible due to such mistakes (Garfield, 1990). The causes of mistakes in references can vary. Apart from unethical ways of citing as mentioned, mistakes have also been reported for decades now to have been caused by mere carelessness and the authors' inconsistent waiting (Bahar ct al., 2012; Dc Laccy, Record, & Wade, 1985; Lok, Chan, & Martinson, 2001; Ocrmann, Cummings, & Wilmcs. 2001). The blame lies with the journals themselves, because they do not contain very detailed citation instructions for authors. They may also refer to already invalid versions of the citation styles or they do not give any citation styles at all (He l.ac-ey et al., 1985; Onwuegbuzie, Hwang. Combs, & Slate, 2012). Another reason for errors is the existence of too many citation styles where the autliors cannot be sure what the best approach is (Liu> 1993; Moorthy, 1988; Park. Mardis, & Ury, 2011). Standardisation of reference rules could provide a way out of this situation (Freimer & Perry, 1986: Garfield, 1990: Mansfield, 1984; Sweetland, 1989; Terbille, 1990). However, the situation in medical journals shows the reverse. Despite the Uniform Requirements for Redakční proces Typ recenzního řízení DOUBLE BLIND SINGLE BLIND OPEN 39 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Redakční proces Délka recenzního řízení Autor: odevzdání článku Editor: vrátit, nebo recenzent? Editor: který recenzent? Recenzenti: accept minor major reject Editor: rozhodnutí 40 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu Březen po Út st Čt pá so ne 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 Duben po út st Čt pá SO ne 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 Květen po út st Čt pá SO ne 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 Redakční proces Od Elizabeth Blakesley © ^Odpovědět 3^ Odpovědět všem v t& Preposlat ^Archivovat í£) Nevyžádaná pošta ©Smazat Více v Komu Jiří Kratochvil® 23.07.20160:13 Předmět Your Submission Ms. Ref. No.: DACALIB-D-16-00097 Title: The comparison of the accuracy of bibliographical references generated for medical citation styles by the EndlMote, Mendeley, RefWorks and Zotero The Journal of Academic Librarianship Dear Dr. Dirí Kratochvíl, The reviewers have commented on your above paper. They indicated that it is not acceptable for publication in its present form. However, if you feel that you can suitably address the reviewers' comments (included below), I invite you to revise and resubmit your manuscript. Please carefully address the issues raised in the comments. ***Please note that reference style for the Journal recently changed to APA style. Therefore, if you paper is not currently in APA style, please make this change. Complete instructions are available on the Guide for Authors (http://www.elsevier.com/journals/the-journal-of-academic-librarianship/0099-1333/guide-for-authors#68Q00). Příprava vědeckého článku If you are submitting a revised manuscript, please also: a) outline each change made (point by point) as raised in the reviewer comments Redakční proces Od Elizabeth BlakesJey i Komu Jiří Kratochvil © Předmět Your Submission ■Si Odpovědět ^ Odpovědět všem v PreposJat ^ Archivovat (í) Nevyžádaná posta © Smazat Vice v 23.07,20160:13 2. Method: It is very clear how the journals which are focused on were chosen, although less so about why the specific types of references tested (other than purely for variety) were selected. As stated on pg. 12, lines 43-44 "the tests include the types of publications which are not often cited in medical journals," and thus some of the choices feel superfluous. In Table 1, which illustrates the number and type of mistakes made by each rererence manager per journal, my only suggestion is that the columns denoting the total errors for each type of mistake would make more sense at the end of the rows rather than the beginning. 3. Results and Discussion: This section thoroughly compares the different citation managers and the supporting tables/figures help illustrate the findings well. This section also does a great job at pointing out various reasons why errors may occur (pgs. 10-11), however, the content of both sections is sometimes marred by unclear writing. 42 Příprava vědeckého článku 4. References: Good variety, but four of the links provided did not work and one was incomplete, and thus did not lead to the correct page (p. 16, line 49; p. 17, lines 13-14, 49-59; p. 18, line 16 and 58). The topic of this article is definitely of importance to academic librarians, as Redakční proces Pár rad k obdrženým posudkům - Oba vytkli stejnou věc? Mají pravdu! I když... 43 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Redakční proces Pár rad k obdrženým posudkům - Oba vytkli stejnou věc? Mají pravdu! I když... 1. The first version of paper was accepted by one reviewer^ two others requested a minor revision^ the fourth reviwer requested a major revision. Now both reviewers request a major revision. Did my corrections to the first draft made the paper worse than before? I do not understand how this happened. Hello Dirij That is confusing. Please let me look at it more thoroughly. When I saw major revision by the reviewers, I accepted their opinion without looking further. Could you please send me the original file? I am likewise rather concerned about the discrepancies between the reviews. Thank you for letting me know about your concerns. I may need to be more diligent in my processes. Thanks} I Redakční proces Pár rad k obdrženým posudkům - Oba vytkli stejnou věc? Mají pravdu! I když... - Myslíte si, že vám křivdí? Pište srozumitelně! 45 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Redakční proces Pár rad k obdrženým posudkům - Oba vytkli stejnou věc? Mají pravdu! I když... - Myslíte si, že vám křivdí? Pište srozumitelně! - Nerozumíte připomínce? Nechejte si ji vysvětlit. „ ^ Archivovat $ Nevyžádaná pošta fŕfí Smazat Více v 10.02.2020 14:26 ec-0117 [email ref: DL-SW-2-a] Pippa Smart, Learned Publishing 46 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampilisu ,„ 1 (S> Learned Pubhsh Hi Sorry, this was referring to Table 1 which appears on p.26/27 on the PDF that our system creates and the PDF had a problem with the table layout which caused the reviewer confusion, so you can ignore these comments - I should have spotted this, my apologies! Pippa Redakční proces Pár rad k obdrženým posudkům - Oba vytkli stejnou věc? Mají pravdu! I když... - Myslíte si, že vám křivdí? Pište srozumitelně! - Nerozumíte připomínce? Nechejte si ji vysvětlit. - Korespondovalo téma článku s tématem časopisu? 47 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Redakční proces Pár rad k obdrženým posudkům Point 2, Round 2: A systematic review presents descriptive evidences without statistical analysis. However, the meta-analyzes, beside to have descriptive evidences, also provide a quantitative review through statistical techniques. Therefore, a meta-analysis is a more complex study than a systematic review. Furthermore, your study groups a number of 13 articles, however, the study number 1 (DOI: 10.1007/s40279-016-0617-7) groups 28 studies, beside 22 time to exhaustion studies and 8 graded-exercises test studies. Thus, this study already published (DOI: 10.1007/s40279-016-0617-7) is more original, complete and of higher quality. Sorry, but I do not consider your systematic review relevant for publication in this journal, mainly because there are already published works with this topic. The luthors should have carried out a first search to check if the topic they wanted to work on was already done. 48 i i ipi civet vcucorvci i u oiai irvu i \w m iu vi\a ui n vci z_iu in iu rva 11 ijju.su IUI V III X Redakční proces Revize článku Responses on reviewers' comments All changes are highlighted with the yellow color in the revised draft: Introduction 1) Information about analyzed journal issues were added (p. 2). 2) In the part Introduction the paragraph with detailn information about technical aspects of the reference managers was excluded and substituted by short information (p. 2) advising a detail discussion in the part Discussion. The detail discussion in the part Discussion (p. 12-13) has not been changed because with the results found in the study it offers a comprehensive overview of the quality of reference managers. Method: I 1) A reasoning of testing various types of documents was added (p. 2 and 13). 2) Columns „ Total errors" were moved at the end of each reference manager part in the tables 1 a 2. Currently column order for each reference manager in the tables 1 a 2 is: Data, Punctuation, Formatting, Average, Total Errors. Other adjustment of the table is impossible because of the range of data. For better orientation the total errors is now written with boldface. 3) An example of comparison of references was added (p. 4). 4) Information about versions dates was not added because it suggests from the first sentence of the part Method (p. 3, „Between December 2015 and January 2016). 5) An information about writing titles in capital/case sentence etc. was added to the second paragraph in the part Method (p. 3). 49 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu 15 16 17 18 19 22 23 24 25 26 27 23 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 4 9 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 Method Between December 2015 and January 2016 the quality of bibliographical references generated for 15 medical journals and the National Library of Medicine (NLM) citation style by the reference managers EndNote (version X7.4, Bid 8818), Mendeley (version 1.15.2), RefWorks (version 4.4.1376) and Zotero (version 4.0.28.10) were compared. The journals (see Table 1) were chosen in the following way: the ten medical journals with the highest number of published articles in Journal Citations Reports in 2014 were added to the ten medical journals with the highest impact factor in Journal Citations Reports in 2014. These journals were chosen either because of tire need for the medical authors to publish their articles in the most-referred journals or because the journals publish a high number of articles and therefore a large number of authors work with these journals' reference instructions, From these 20 journals, the following 5 titles were then excluded: CA: A Cancer Journal for Clinicians, Frontiers in Human Neuroscience, Molecular Medicine Reports, Oncology Letters and Oncotarget. This was done because in some citation managers it was not possible to generate the bibliographical references for these journals. The NLM style was added to these 15 journals for comparison. The format and how to adhere to NLM was agreed on by the editors of medical journals (ICMJE, 2015; Patrias, 2007). In this way, a list of journals and the NLM reference styles was created. The authors of medical journals very often follow these instructions. Once the choice of the journals and the reference styles was made, the publications representing the commonly-mentioned types of print or online resources were chosen. As llomol (2014) pointed out, an analysis of other sources is needed. Although journal articles are and will probably continue to be the most frequently cited type of resources, various studies show that 16.5% of 81,834 references published in ten medical journals were to sources other than an article (Barrett, Helwig, & Neves, 2016; Delwiche, 2013: Rethlefsen & Aldrich, 2013). Therefore, references for various types of resources were tested in this study. These types were a journal article, a contribution to an edited book, a book, an edited book and a web resource. In addition, in the case of a journal article, a contribution to an edited book and a book, publications with different numbers of authors were also chosen. In the case of a journal article, a contribution to an edited book and a book, publications were chosen with different numbers of authors so that it could be verified whether the reference manager is able to generate the number of authors' names determined by the journal style. In this way, 17 publications (Table 2) were chosen. Bibliographical references were manually created Redakční proces 50 Přijetí článku §5 Odpovědět Odpovědět všem v c& Prep o slat Archivovat ň Nevyžádaná pošta Smazat Více v Od Elizabeth Blakesley Komu Jiří Kratochvil @ Predmet YourSubmission 03.09.Z016 23 Cil Ms. Ref. No.: JACALIB-D-16-00097R1 Title: Comparison of the accuracy of bibliographical references generated for medical citation styles by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zotero The Journal of Academic Librarianship Dear Dr. Jiří Kratochvíl, I am pleased to inform you that your paper "Comparison of the accuracy of bibliographical references generated for medical citation styles by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zotero"Jia^eej^cc^ted^ojr^u^liMtnon in The Journal of Academic Librarianship.Your accepted manuscript will now be transferred to our production department and work will begin on creation of the proof, If we need any additional information to create the proof, we will let you know. If not, you will be contacted again in the next few days with a request to approve the proof and to complete a number of online forms that are required for publication. Below are comments from the editor and reviewers. When your paper is published on ScienceDirect, you want to make sure it gets the attention it deserves. To help you get your message across, Elsevier has developed a new, free service called AudioSlides: brief, webcast-style presentations that are shown (publicly available) next to your published article. This format gives you the opportunity to explain your research in your own words and attract interest. You will receive an invitation email to create an AudioSlides presentation shortly. For more information and examples, please visit http://www.elsevier.com/audioslides, UNI Redakční proces 51 Konečne úpravy Soubor Úpravy Zobrazit Historie Záložky Nástroje Nápověda Í5 Jak citovat: citačnľ: X Q Predplatné na 1022 X t Můj disk-Disk Goc X Q Fond Fa F - e-prezen X Odhlašuji... I Jednoť X Q lnet MLfc Smlouvy X Q Online Proofing Sys X G ť2t O ů h1tps://wiley.eproofing.in/Proof.aspx?tol Í lll\ © X + » CD O statni záložky Proof Initiated Corresponding Aifthor Production Editor b i si x* x» af *t <♦ [j- nj 100% ORIGINAL ARTICLE Query Response ✓ X Update Cancel AQ3: "AUTHOR: Please check and confirm that short title is OK as typeset Citation rules through the eyt Jiří Kratochvíl1 ■* | Helga Abrahámova 1 University Campus Library, Masaryk Universy Corresponding author Jiří KratotirvíL University E-mail: kratec@ukb.rnunL.cz Abstract This research analysed the citations styles used in 1r100 high-impact biomedical journals and the importance attributed by their editors and other members of the editorial office to individual reference components, the citation format and method. We found 70(6.5%) use the current American Medical Association or NLM/Vancouver style; 425 (39.2%) use their older versions or a variation; 73 {6.7%) use a standard non-biomedica! style; and 432 [39.9%) have their own house style. According to 125 respondents who answered the surveyrthe most important reference Help Attach Files Save Submit Saved at 11/11/2021 5:36:32 PM(UTQ Journal & Article Information AQ1:"AUTHOR: Pleasecheckand confirm that corresponding information is OK as typeset." B It is correct. AQ2: "AUTHOR: Please checkand confirm that article title is OK as typeset." E Jt is correct. AQ3: "AUTHOR: Please check and confirm that short title is OK as typeset." Answer AQ4: "AUTHOR: Please check if link to ORCID is correct." Comments (1) Image Comments (0) rg/1 D. 1DC-1 / j a m a. 1544. C-2 e 5 5 C 2 3 a | Zvýraznit vše Q Rozlišovat velikost Q Rozlišovat diakritiku Q Celá slova UÍJ1 Redakční proces Vydání postprintu ACALlB-01779; No. of pages; 10; 4C: The Journal of Academic Librarians hip xxx (2016) xxx-xxx Contents lists available at ScienceDirect The Journal of Academic Librarianship ELSEVIER Comparison of the Accuracy of Bibliographical References Generated for Medical Citation Styles by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zotero Jiří Kratochvíl Masaryk University Campus Library, Brno, Czech Republic ARTICLE INFO Article history: Received 2G April 2016 Received in revised form 18 August 2016 Accepted 8 September 2016 Available online xxxx KEYWORDS: Accuracy Bibliographical references Citation styles EndNote Medical journals Mendeley Reference managers RefWorks Zotero ABSTRACT Bibliographical references to online and printed articles, books, contributions to edited books and web resources generated by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zotero were compared with manually written references according to the citation instructions in 15 biomedical journals and the NLM citation style. The fewest mistakes were detected in references generated by Zotero for 11 journals and the NLM style, while the second fewest number of mistakes was found in Mendeley. The largest number of mistakes for 9 journals was found in references generated by EndNote and in the other 4 journals the largest number of mistakes was detected in RefWorks references. With regard to the individual types of resources, the lowest number of mistakes was shown by Zotero, while RefWorks had the greatest number of mistakes. All programs had problems especially with generating the URL and the date of access in the reference to online documents. It was also found that several mistakes were caused by technical limitations of the reference managers, while other mistakes originated due to incorrect setting of the citation styles. A comparison showed mat Zotero and Mendeley are the most suitable managers. © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved. UNI Redakční proces Vydání postprintu The Jo Comparison of the Accuracy o Medical Citation Styles by Enc Jiří Kratochvíl Masaryk University Campus Library, Brno. Czedi Republic ARTICLE N F O Article lustory: Received 26 April 2016 Received in revised form 18 August 2016 Accepted 8 September 2016 Available online xxxx 53 KEYWORDS: Accuracy Bibliographical references Citation styles End Note Medical journals Mendeley PřípravavwlďeBl^ého článku / Knihovn Zotero A B gene cord i were bero genei e rem cause tinge TheJoumalofAcademicLibrarianship43 (2017) 57-66 Contents lists available at ScienceDirect The Journal of Academic Librarianship ELSEVIER Comparison of the Accuracy of Bibliographical References Generated for Medical Citation Styles by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zotero (D CnossMark Jiří Kratochvíl Masaryk University Campus Library, Brno, Czech Republic ARTICLE INFO Article history: Received 26 April 2016 Received in revised form IS August 2016 Accepted S September 2016 Available online 15 September 2016 KEYWORDS: Accuracy Bibliographical references Citation styles EndNote Medical journals Mendeley Reference managers RefWorks Zotero ABSTRACT Bibliographical references to online and printed articles, books, contributions to edited books and web resources generated by EndNote, Mendeley, RefWorks and Zotero were compared with manually written references according to the citation instructions in 15 biomedical journals and the NLM citation style. The fewest mistakes were detected in references generated by Zotero for 11 journals and the NLM style, while the second fewest number of mistakes was found in Mendeley. The largest number of mistakes for 9 journals was found in references generated by EndNote and in the other 4 journals the largest number of mistakes was detected in RefWorks references. With regard to the individual types of resources, the lowest number of mistakes was shown by Zotero, while RefWorks had the greatest number of mistakes. All programs had problems especially with generating the URL and the date of access in the reference to online documents. It was also found that several mistakes were caused by technical limitations of the reference managers, while other mistakes originated due to incorrect setting of the citation styles. A comparison showed that Zotero and Mendeley are the most suitable managers. © 2016 Elsevier Inc. All rights reserved. UNI Co nedělat - Zákaz fabrikace či falšování dat - Neuvádějte mezi autory, kdo se na článku nepodílel - Neposílejte text do více časopisů najednou - Nezveřejňujte text před jeho vydáním - Neposílejte text bez přepracování jinam 54 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu MU N I Děkuji za pozornost 55 Příprava vědeckého článku / Knihovna univerzitního kampusu □ □ □ UÍJl