Je nám to líto, ale toto téma se letos nestihne probrat, protože tento semestr má letos jen 12 týdnů.

Témata: 

• co je reproducible research
• jak zajistit, aby vaše analýza byla reprodukovatelná
• R Markdown (co to je a k čemu to je, jak se to udělá, hlavní značky, hlavní parametry )
• slides

• není

• cílem je vytvořit Rmd, který půjde zkompilovat na html a pdf  (zdrojový kód, UTF-8)

• reproducible research:
  • Hennigsen's Guidelines
  • Ten Simple Rules
• R Markdown:
  • cheatsheets: základní, ​starší a reference guide
  • RStudio: R Markdown (základy a ukázky)
  • Yihui Xie, J. J. Allaire, Garrett Grolemund: R Markdown: The Definitive Guide (ultimátní zdroj)
  • Pandoc (detailní popis klonu markdownu, nad kterým R Markdown stojí, plus konvertoru do mnoha různých formátů)
  • Yihui Xie​: knitr (detailní popis konvertoru z R do Pandoc Markdownu, zejména všech chunk a global options)
  • Yihui Xie: bookdown (systém, který umožňuje v R Markdownu psát knihy v PDF, HTML a ebook)
  • Yihui Xie, Amber Thomas, Alison Presmanes Hill: blogdown (tvorba webových stránek v R Markdownu)
• LaTeX (stačí matematika):
• mnoho zdrojů na webu
• git:
  • https://www.atlassian.com/git
    

• není

Výuka tématu na Podzim 2020 neprobíhá!