IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie IV107 Bioinformatika I Přednáška 2 Katedra informačních technologií Masarykova Univerzita Brno Jaro 2010 DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS1 :|= -O^O Před týdnem IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie Bioinformatika ► zpracování hromadních molekularne-biologických dat ► posledních cca. 30 let ► data: genomika a proteomika - sekvence *■ struktury - interakce a jiné funkce - expresní data ► anotace cca 1000 prokaryotických genomů (http://www.cbs.dtu.dk/services/GenomeAtlas/) ► Galerie sekvenovaných genomů (http://www.genomenewsnetwork.org/) DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ ö :|= -O^O http://www.dnaftb.org/dnaftb/ ► Klasická genetika ► Genetické molekuly ► Organizace a řízení genetických procesů ► Princip rakoviny http://\AAAw.dnalc.org/home.html IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ► -š|= ■OQ.O' Hierarchie biologických struktur IVWBioinformatika I -Přednáška 2 < *W "7...........iff* -d ■—v^-)..............i.........r _|_ ]__ I <^ Unaided aw_______ ^-------1—r-^---------1 ■■;■■------------------r Electron fnicrnscope L-pkds. f? Protei Siíih=I mMeCUles Llghl microscope and |k äíltmäl I cells ľ> Ä >" f/f Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ ö :|= -O^O Outline IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNA je nosičem genetické informace DNA má strukturu antiparalelní spirály ální dogma a genová exprese kace DNA )ce Genetický kód uktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura (domény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Nástroje mol.biologie, genomiky a proteomiky Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomiky a :|= -O^O Kořeny genetiky Gregor J. Mendel V pokusech s rostlinami si všiml, že potomství dvou rodičů nezávisí na jejich vzhledu /fenotyp/, nýbrž na jakýchsi symbolicky popsaných faktorech, které do značné míry odpovídají dnešnímu označení gen /genotyp/ IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ ö :|= -O^O Molekula DNA ► Objevena 1869 , považována za příliš jednoduchou Polymerická molekula, monomerem je: deoxyribonukleotid /DNA/ * ribonukleotid /RNA/ ► Symbolické značení A,C,G,T,U ► Spirálovitá prostorová struktura IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNAje nosičem genetické informace DNAma strukturu artiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ^) C\ Q- Nukleotidy i- [A ĎH ŮH SUGAR "O-P-Ů—CH, ax i..-.- i „,, "V II i I >, «i I :CK- "0-P-0 —CH, O I haw 1 □ s> IV107Bioinformatika I -Prednáška 2 Struktura DNA Z historie DNAje nosičem genetické Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya :l= -O^O Zastoupení nukleotidů v různých organismech IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNAje nosičem genetické Organizmus %A %G %C %T A+G T+C A+T G+C E.coli 24.7 26.0 25.7 23.6 1.03 0.93 S.lutea 13.4 37.1 37.1 12.4 1.04 0.35 S.cerevisae 31.3 18.7 17.1 32.9 1.09 1.79 H.sapiens 30.9 19.9 19.8 29.4 1.00 1.52 Dedukce: Nukleotidy se vyskytují v párech Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya From A.L.Lehninger (1970), Biochemistry, Worth Publishers, New York □ rS1 M= -O^O Difrakce na molekule DNA IVWBioinformatika I -Přednáška 2 í* i ids t * Difrakce krystalické DNA z roku 1952 od Rosalind Franklin Svědčí o periodicitě 0.3nm a 3.4nm Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ ö :|= -O^O Struktura DNA IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie yy ty y / y> ~^X\ V^íj&Jí -O Tento obrázek a jedna stránka textu pomohli autorům k Nobelově ceně. Přínos Rosalind Franklin ve formě pečlivého zkoumání krystalů v té chvíli oceněn nebyl. Poštovní známka k 50. výročí objevení struktury DNA DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS1 :|= -O^O Struktura DNA iugar-phoipMe backbone ■in i .Ol, N'" ^C I | thymine S' ô rj n—h -H. ,N I í -c" ^c «v*, H M /" ^ ^ŕ -^ -**•... / S / S sugar-phosphate backbone □ S1 - IV107Bioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (í Sekundární struktura Terciárr struktura i domény) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky Struktura DNA IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky -š|= ■OQ.O' Uspořádání DNA v jádře IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie Uspořádání Lineární Plošné Prostorové Počet nukleotidů Relativní délka k jádru 10000 25 mil 62.5 mld 600000 240 0.1 Prostorové uspořádání DNA se 12000000 nukleotidy v jádře o rozměrech 0.0034 mm (rozměry jednoho páru nukleotidů dle modelu Watsona a Cricka jsou 1.36 x 0.34nm). DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura.;.:: i ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS1 M= -O^O Outline IVWBioinformatika I -Přednáška 2 DNA je nosičem genetické informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA )ce Genetický kód uktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura (domény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Nástroje mol.biologie, genomiky a proteomiky Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomiky a :|= -O^O Základní pravidla IV107Bioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie ► DNA -► RNA -► protein ► retroviry: RNA -► DNA ► jeden gen —> jeden protein ► RNA geny kódují RNA - alternativní sestřih umožňuje tvorbu několika proteinů post-translační modifikace umožňují vznik různých forem jednoho typu proteinu DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS1 M= -O^O Exprese genů ( DNA replication ) DNA 3' =; li--! l ■ ■ ■ ■ n 3' RNA synthesis (transcription) RNA l|ll|l|lll|l||l|||ll|l protein synthesis (translation) PROTEIN H7N- -COO H IV107Bioinformatika I -Prednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ^) C\ Q- Outline IVWBioinformatika I -Přednáška 2 DNA je nosičem genetické informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura (domény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Nástroje mol.biologie, genomiky a proteomiky Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomiky a :|= -O^O Replikace DNA Hlavní enzymy helikáza, DNA polymeraza Templát DNA Substrát deoxynbonukleotidy Produkt DNA □ rS1 IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky -š|= ■OQ.O' Replikace DNA strand A template strand A /,m ■a T * Ä ÍII strand B parent DNA double helix new strand B new strand A 3' y ú 0 O O tí 0 ó OTl' 5' template strand B □ ö IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ^) C\ Q- Outline IVWBioinformatika I -Přednáška 2 DNA je nosičem genetické informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura (domény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Nástroje mol.biologie, genomiky a proteomiky Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomiky a :|= -O^O Transkripce Hlavní enzymy RNA polymeraza Templát DNA Substrát deoxynbonukleotidy Produkt DNA □ rS1 IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ^) C\ Q- Transkripce přenáší část genetické informace z DNA na mobilní mRNA IV107Bioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie »t a &■ aie a a a^^rs- noncoding strand TRANSCRIPTION .v^VvVVvV1 DMA double helix newly svnthesized short region of RNA ■:..! soiipl DNA/ftNA hslrx DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ ö :|= -O^O Outline IVWBioinformatika I -Přednáška 2 DNA je nosičem genetické informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura (domény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Nástroje mol.biologie, genomiky a proteomiky Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomiky a :|= -O^O Translace Hlavní enzymy ribozom Templát RNA Substrát aminokyseliny Produkt protein (bílkovina, peptid) □ rS1 IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ^) C\ Q- Translace probíhá na ribozomech □ ö - IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ^) C\ Q- Triplety nukleotidů kódují jednotlivé aminokyseliny #\ %.# VttUoß /A U Aigin"» SC1 ,\neUU VT ŕS». U / IV107Bioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky ^) C\ Q- Kód sprostredkováva tRNA IVWBioinformatika I -Přednáška 2 (A) Struktura DNA Z historie attached amino acid (Pne) DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ ö :|= -O^O Kontrolní otázky IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNA určitého organizmu obsahuje 17% tymínu (T). Jaký je obsah cytozínu (C)? Jaká je komplementární sekvence k sekvenci 5'-ACGT-3'? Co je na těchto sekvencích zajímavé? Jaké vlastnosti by mohl mít protein, který se váže na DNA s takovou sekvencí? DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS1 :|= -O^O Outline IVWBioinformatika I -Přednáška 2 DNA je nosičem genetické informace DNA má strukturu antiparalelní spirály ntrální dogma a genová exprese plikace DNA inskripce Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura (domény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Nástroje mol.biologie, genomiky a proteomiky Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomiky a :|= -O^O Struktura proteinů IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie Primární sekvence aminokyselin Sekundární hlavně a-helix a /3-struktura Terciární 3-D uspořádání Domény jedna nebo víc na protein Kvartérní komplexy skládající se z více podjednotek DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura.;.:: i ény) Kvartérní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS1 :|= -O^O Skládání proteinů a druhý kód IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie Mnoho čerstvě syntetizovaných proteinů se poskládá do své finální podoby bez pomoci dalších faktorů. ► demonstrováno na konkrétním proteinu (Anfinsen, 1966, ribonukleáza A) ► terciární struktura je zakódována v primární struktuře (kód dodnes neobjeven!) DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS1 :|= -O^O Protein folding amino acid side chains unfolded protein I FOLDING binding site folded protein IVWBioinformatika I -Prednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ rS - _= = ^<\(y Fyzikálně-chemické vlastnosti aminokyselin Hydroxylic Hydrophobie Charged Amino Adds A alanine (alaj R arginine (arg) N asparagjne (ssn) D aspartic acid (asp) C cysteine (cys) Qglutamine (gin) E glutamic acid 14Li) G glycine (gly) H hřstidine (his} I isaleucine [lie) L leucine (inii) K lysine (lys) M metiůneine;[-;--t.; F phenyalanine (ph-n; P proline (pro) S serine (ser) T threonine (thr) Wtrytophan (trp) Y tyrosine (tyr) □ ö IV107Bioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinu Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr struktura i domény) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky Aminokyseliny můžou být vůči sobě různě orientovány IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie II! I II I ^Cvc/N3,öc-^N/C" II * v I Torzní úhly: ■ i kiirw OVOChí Nil* ii Ij-trjfjĽF (icíhI whidl Itiiiy rtltow ínr t.irgc (?H mu) **c|* f£lj (VB— h^ťm-t 0Mfli IV107Bioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr :■■ ...■:..■■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ ö :|= -O^O ATPáza intermembrane space bT\ä {b) Qúpyittffl ISM Jota Wi\ey ard Suns. Inc. M nghta re IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya □ g - _= = ^<\(y Kanál umožňuje iónům proniknout membránou IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciárr ;ti ji tui:-. ■ ény) jktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky -š = ^)Q,0 Receptor cyklického AMP (dimer a DNA) IV107 Bioinformatika I -Prednáška 2 Struktura DNA Z historie DMA je nosičem genetické Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Se Sekundární struktura Terciami äti I ra (domény) Kvartem i Funkce proteinů Příště □ S1 Í\= -OQ.O Prion ve formě PrPc a PrPsc 30% ct-helix 43% ß-siie&t □ s IV107Bioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie informace DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (E Sekundární struktura Terciárr struktura i domény) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomikya proteomiky Příště IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Struktura DNA Z historie Nástroje mol.biologie, genomiky a proteomiky DNA má strukturu antiparalelní spirály Centrální dogma a genová exprese Replikace DNA Transkripce Translace Genetický kód Struktura proteinů Primární struktura (Sekvence) Sekundární struktura Terciární struktura : ■ ény) Kvartórní struktura (komplexy) Funkce proteinů Příště Nástroje mol.biologie, genomiky a □ ö :|= -O^O Outline IVWBioinformatika I -Přednáška 2 Dodatek For Further Reading Dodatek □ g - _= = ^<\(y For Further Reading IVWBioinformatika I -Prednáška 2 Projekt SI MAP http://www.czechnationalteam.cz/view.php?nazevclanku= simap&cisloclanku=2007020002 http://www.rozhlas.cz/leonardo/priroda/_zprava/321214 □ ť_P - _= = >T)(\(y