Nativní XML databáze

Tamino, což je zřejmě nejznámější komerční nativní XML databáze.

BaseX je volně dostupná nativní XML databáze vyvíjená na platformě Java 6 týmem Univerzity Konstanz. Je jednoduchá pro instalaci a vhodná pro interaktivní práci s XML daty a XQuery!

eXist, což je open source podporující mimo jiné XQuery, XUpdate, XML:DB API a XML-RPC. Jde dle mého názoru o nejlepší existující open source databázi. Je šířena pod licencí GNU LGPL.

Apache Xindice, cože je open source nativní XML databáze od Apache Software Foundation. Podporuje XPath, XUpdate, XML:DB API a XML-RPC. Není však nadále seriózně vyvíjená a podporovaná.