Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii

Týden 4 - Markovovy modely v bioinformatice - teorie

Instalace lokalnich balicku (napr. "HMM"):

> install.packages("HMM")

System se Vas zepta, jestli chcete instalovat lokalne, odpovezte "y".

Ukol

Navrhnete jednouduchy HMM pro klasifikaci sekundarni struktury v proteinech.

Model by mel rozpoznavat: H : a-helix

                                        E : b-sheet     

                                        N : ostatni