Pouzite niekolko sposobov ako zistit kde v sekvencii DNA je umiestneny citaci ramec urciteho proteinu:
0) Z uz vykonanej anotacie
1) Manualne
2) BLASTX
3) Zmena pHMM pre protein na pHMM pre DNA
4) Wise2 (genewise)

Aplikujte vymenovane metody pre "zinc-finger" domenu BRCA1 z (N-konca) --> Pfam ID: PF00097 na ludsku sekvenciu DNA chr17:43,115,000-43,130,000

Pre riesitelov projektu: Pre pochopenie prace s HMM: Prejdite si tutorialom na stranach 18-24 (hmmbuild, hmmsearch), 27-28 (phmmer), 33-35 (hmmscan), 36-37 (hmmalign).