Pokročilé metody bioinformatiky

Týden 9 - transkripční faktory, anotace genomů - 27. 4. 2021


UKOL

Pomoci knihoven TFBSTools a JASPAR2018 (R/Bioconductor) nebo modulu Bio.motifs (Biopython) vytvorte program, ktery pro mnozinu TF zjisti, ktere primo nebo zprostredkovane (max 1 prostrednik - TF nebo gen) pravepodobne reguluji svou transkripci (9bodu). Aplikujte program na skupinu ZNF genu (6bodu).