Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Cvičení
- rozklad na SCC
- cviceni repressilator
- atraktory v asynchronních modelech
- zobecnění na parametrizované sítě
Cvičení
V nástroji AEON vytvořte model schématu aktivační soustavy signální dráhy z předchozího úkolu.
1) Plně specifikujte logické funkce pro variantu AND, spusťte analýzy a zobrazte atraktor(y).
2) Plně specifikujte logické funkce pro variantu OR, spusťte analýzu a zobrazte atraktor(y).