Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii

Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy


Cvičení


  • rozklad na SCC
  • cviceni repressilator

  • atraktory v asynchronních modelech
  • zobecnění na parametrizované sítě


Cvičení


V nástroji AEON vytvořte model schématu aktivační soustavy signální dráhy z předchozího úkolu. 

1) Plně specifikujte logické funkce pro variantu AND, spusťte analýzy a zobrazte atraktor(y).   

2) Plně specifikujte logické funkce pro variantu OR, spusťte analýzu a zobrazte atraktor(y).