Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Info
Předmět
Období
jaro 2024

Předmět PB051 se přestavbou studia na FI rokem 2021 mění. Stává se na bakalářské úrovni praktickým doplněním k předmětu IV107 Bioinformatika I (1. polovina semestru) a PA052 Úvod do systémové biologie (2. polovina semestru).

Pokročilejší problémy řešené v bioinformatické části v minulých letech (např. profilové HMM) přechází do nového předmětu PV269, kde se rovněž probírá pokročilá práce s NGS daty a anotacemi genomů.

Týden 1 - Úvod - 19. 2. 2024
Přejít
Kapitola obsahuje:
4
PDF
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 19. 2. 2024 do 25. 2. 2024.
Týden 2 - Sběr a příprava sekvencí ZNF, zjišťování konsenzuální sekvence - 26. 2. 2024
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
1
Web
Učitel doporučuje studovat od 26. 2. 2024 do 3. 3. 2024.
Týden 3 - hledání u rostlin, mapování výskytu v genomech, anotace genomu - 4. 3. 2024
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 11. 3. 2024 do 17. 3. 2024.
Týden 4 - mapování anotace na strukturu proteinu - 11. 3. 2024
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 18. 3. 2024 do 24. 3. 2024.
Týden 5 - diskuse zadání hodnoceného úkolu a projektu, konec 1.části - 18. 3. 2024
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
3
Web
Učitel doporučuje studovat od 25. 3. 2024 do 31. 3. 2024.
Týden 6 - řešení projektu 25. 3. 2024
Přejít
Učitel doporučuje studovat od 4. 3. 2024 do 10. 3. 2024.
Týden 7 - Biologické sítě a genová ontologie
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
7
Web
Učitel doporučuje studovat od 25. 3. 2024 do 31. 3. 2024.
Týden 8 - Integrace dat prostřednictvím biologických sítí
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Další soubory
1
Studijní materiály
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 9. 4. 2024 do 15. 4. 2024.
Týden 9 - Analýza genové exprese a integrace dat
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní materiály
1
Studijní text
9
Web
Učitel doporučuje studovat od 16. 4. 2024 do 23. 4. 2024.
Týden 10 - Modelování regulace genové exprese
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Obrázek
1
PDF
1
Studijní text
3
Web
Učitel doporučuje studovat od 22. 4. 2024 do 6. 5. 2024.
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 29. 4. 2024 do 17. 5. 2024.
Týden 12 - Booleovské sítě s částečnou informací, motivy v sítích
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Odevzdávárna
1
PDF
1
Studijní materiály
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 14. 5. 2024 do 20. 5. 2024.
Předchozí
Následující