Předmět ochrany - Chráněné oblasti (6 kategorií):
národní parky (NP) (Krkonoše, Šumava, Podyjí, České Švýcarsko, celkem 1,4 % území)
chráněná krajinná oblast (CHKO) (celkem 24, 13 % území)
národní přírodní rezervace (NPR),
národní přírodní památka (NPP),
přírodní rezervace (PR),
přírodní památka (PP)
Celkem představují cca 15 % území ČR.
Dalším typem ochrany jsou biosférické rezervace, zahrnuty v celosvětové síti UNESCO:
NP: Krkonoše, Šumava, Podyjí
CHKO: Křivoklátsko, Pálava, Třeboňsko, Bílé Karpaty
Specifickým (nižším) typem území "hodného zřetele" jsou tzv. přírodní parky (např. Halasovo Kunštátsko).