ULOHA 2

1. Najdite v PDB molekulu, ktora tvori dimer, trimer alebo tetramer. Vyuzite Pymol k vytvoreniu animacie, ktora od seba v nekonecnej slucke podjednotky vzdiali a zas priblizi do povodnej polohy. 

2. Napiste program (je mozne, ze budete musiet pouzit niekolko prikazov z Pythonu), ktory vyfarbi aminokyseliny v nejakej rozumnej reprezentacii lubovolneho proteinu stupnami sivej farby tak, ze odtien bude zodpovedat poctu susednych aminokyselin do vzdialenosti (CA<->CA) 8 A.

U kazdej ulohy odovzdajte do 29.10.2012 kod a obrazok alebo video vysledku. Konkretny protein, na ktorom sa maju ulohy pocitat urceny nie je.