Projekt z bioinformatiky I

Týden 1 - Organizace vyuky (I+P)

Prihlaseni do skupin:

 

Skupina I (priprava webservru, databaze CHADO, prohlizece GBROWSE, potrebnych skriptu a navodu):

1. Jiri Danek: Apache + Homepage projektu (+prepojeni na GBrowse?)

2. Matej Hajnal: Apollo + Xorg

3. Martin Zitnik: GBrowse

4. Martin Demko: CHADO

5. Pavlina Krecmerova: GFF + vizualizace pres genometools

6. Vladimir Horsky: Virtual Box + admin

 

Skupina P (prace na individualnich projektech analyzy intergenove/mobilni DNA nebo promitnuti informace o regulacnych sitich do anotace genomu):

1. Katerina Bekova: LTR retrotranspozony

2. Petr Horacek: LTR retrotranspozony

3. Jiri Kratochvila

4. Jakub Vallo: non-LTR retrotranspozony LINE

5. Jana Zuczkova: Nádorové geny a translokace v lidské DNA

6. Adam Krejci: Helitrony v lidském genomu

7. Kateřina Kratochvílová

8. Marek Vavruša: Anotace mezigenových oblastí ve včelím genomu

9. Matej Hajnal: anotace regulacnich siti v genomovem prohlizeci