IV108 Bioinformatika II

4.týden 20.10.2014

Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/1433/podzim2014/IV108/um/IV108-03-lab.txt
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/1433/podzim2014/IV108/um/pymol.tgz

ULOHA 3extra

1. Najdite v PDB molekulu, ktora tvori dimer, trimer alebo tetramer. Vyuzite Pymol k vytvoreniu animacie, ktora od seba v nekonecnej slucke podjednotky vzdiali a zas priblizi do povodnej polohy. 

2. Napiste program (je mozne, ze budete musiet pouzit niekolko prikazov z Pythonu), ktory vyfarbi aminokyseliny v nejakej rozumnej reprezentacii lubovolneho proteinu stupnami sivej farby tak, ze odtien bude zodpovedat poctu susednych aminokyselin do vzdialenosti (CA<->CA) 8 A.

U kazdej ulohy odovzdajte do 2.11.2014 kod a obrazok alebo video vysledku. Konkretny protein, na ktorom sa maju ulohy pocitat urceny nie je.