IV108 Bioinformatika II

8.týden 27.11.2012

Retroviruses
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/1433/podzim2014/IV108/um/genometools.pdf
Genometools Homepage
GypsyDB
InterProScan
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/1433/podzim2014/IV108/um/gydb.pdf

Za pomoci vhodnych nastroju naleznete a analyzujte nukleotidovou sekvenci libovolneho LTR-retrotransposonu. Identifikujte minimalne LTR opakovani a sekvence kodujici gag a pol geny nebo jejich zname casti. Vytvorte GFF3 soubor popisujici hierarchickou strukturu tohoto LTR elementu a za pomoci aplikace AnnotationSketch z balika Genome Tools element vizualizujte.

Předchozí
Následující