Circular visualization of
relationships and
dense data
Andras Marczell, B.Sc.
Friday, 30 September 11
Využitie
•Vizualizácia mnohodimenzionálných dát (>3)
•Prírodzené kontinuálne zobrazovanie
•Zobrazenie relácií
Friday, 30 September 11
Vizualizácia relácií
•Príklad
Friday, 30 September 11
Friday, 30 September 11
Conservation info
Friday, 30 September 11
Biomarkery
Friday, 30 September 11
Vizualizácia relácií
Relácie: uni- a bidirekcionálne Pomer relácií indikované
šírkou pásku
Friday, 30 September 11
Príklady
Friday, 30 September 11
Friday, 30 September 11
Cross-Speciesgeneconservation
Friday, 30 September 11
Vizualizácia
BLAST query
Friday, 30 September 11
Vizualizácia
BLAST query
Friday, 30 September 11
References
• Krzywinski, M. et al. Circos: an information aesthetic for comparative genomics. Genome Res. 19, 1639–1645 (2009).
• Roux-Rouquié, M. & Soto, M. Lecture Notes in Computer Science. 3380, 28–43 (Springer Berlin Heidelberg: Berlin, Heidelberg, 2005).
• Symons, S. MGV: A Generic Graph Viewer for Comparative Omics Data. Bioinformatics (2011).
Friday, 30 September 11