1. Alexandra Stanová a Jakub Horváth

Skladanie genómu archeónu Pyrococcus Furiosus:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX5558127[accn]
(DNA sekvenovaná pomocou nástroju PacBio RS II, ako nástroj na skladanie použijeme Flye : https://github.com/fenderglass/Flye)

2. Zuzana Tunegová a Daniel Bartulec

Porovnání transkriptomu zdravého a nemocného psa.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX6886135[accn?fbclid=IwAR09s_kqII1W7oZiCeQVXZeVpJjVV4iz7oEithTgktkLvtTJuSu_qKKG6NQ

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/85?fbclid=IwAR30ebnTwOEQvX-5IcvTjHOyxtvFWBi5GuMIyrn0BWZfIJ-8YkZWitgon8s

3. Ondřej Urbanovský a Eva Klimentová

Skládání genomu Lactobacillu gasseri

Data máme z této  stránky: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX6897166[accn?fbclid=IwAR2chhjLo_E4sUg3iO2p_G4h5yMlfuZ1Sfc059ywxKIMLhByCIAnj87sgFo

Ke skládání používáme program Velvet.

Na testování, jak dobře se nám genom poskládal, použijeme kompletní genom ze
stránky: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP000413

Na případný alignment používáme program STAR.

4) Natalia Sedlakova, Juraj Skandera

Mapovanie sekvencie plucneho tumoru na referencny genom cloveka (chr17)