IV108 Bioinformatika II
9.-11.týden 7.12 - 21. 12. 2020
Rodriguez-Ezpeleta et al. (2012). Bioinformatics for High-Throughput Sequencing. Springer
- ch6 De novo short-read assembly
- ch13 Analysis of metagenomic data
- ch14 High-throughput sequencing data analysis software: current state and future developments
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/fi/podzim2020/IV108/um/lecture_09b.pdf
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/fi/podzim2020/IV108/um/cviceni_metagenomika.txt
Soubory pro MEGAN a DIAMOND na stroji hedron.fi.muni.cz:
/mnt/nas/software/megan/data #Soubory pro MEGAN s mapovanim na nr.faa (taxonomie nebo funkce)
/mnt/nas/biodata/nr.dmnd #Soubor vytvoren z neredundantnich sekvenci proteinu z NCBI nr.faa
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/fi/podzim2020/IV108/um/cviceni_ngs.txt