Cvičení se vztahuje ke slidům minulé přednášky.

Zdrojové soubory COPASI k probíraným klíčovým tématům:

1) Modelování sítě s více kompartmenty.

2) Srovnání kinetiky pro transportní (mezikompartmentovou) reakci a lineární přechod uvnitř kompartmentu.

3) Kinetika transportní reakce 2. řádu.

Dále byla probírána stechiometrická matice a kinetika reakcí se stechiometrií reaktantů >1.

Nesestříhané video celého cvičení je k disposici u přednášejícího. V případě nezbytné studijní potřeby prosím zaslat požadavek na email. Cvičení primárně sdílet nebudu zejména z důvodu, že zahrnují nahrávky individuálních obrazovek studentů.

Ke starší verzi COPASI je k disposici tutoriál, základní koncepce zůstává i v nových verzích zachována. Může tedy být pro začátečníky užitečný.