IV108 Bioinformatika II
4. týden - Jednoduché skripty pro Pymol, popis a předpovídání struktury - proteinů 4. 10. 2021
# cviceni 4.10.2021
1) Nactete protein 4wo5.
2) Zobrazte kostru proteinu sede s oranzovymi bocnymi retezci vsech cysteinu
3) Spocitejte pres Pymol a Python API atomy, aminokyseliny,...
https://pymolwiki.org/index.php/Iterate
https://pymolwiki.org/index.php/Pymol.stored
3a) Vypis aminokyseliny selekce s vyuzitim C-alfa uliku
3b) Spocitej...
4) Zjistete kolik je retezcu a smazte jeden z retezcu
5) Spojenim funkci near, iterate a dist muzete zmerit vzdalenosti mezi pary aminokyselinovych C-alfa uhliku. Dokazete neco vymyslet co spocita a zobrazi vzdalenosti mezi dvema aminokyselinami?
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/fi/podzim2021/IV108/um/IV108-03-2012.pdf
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/fi/podzim2021/IV108/um/bok_3A978-1-59745-574-9.pdf
Chyba: Odkazovaný objekt neexistuje nebo nemáte právo jej číst.
https://is.muni.cz/el/fi/podzim2021/IV108/um/PIIS2405471219300766.pdf