GSEA (4.část přednáškového PDF) = Gene Set Enrichment analysis

Zopakujte si princip a obsah Gene Ontology http://geneontology.org/

Podivejte se jak s GO pracuje GProfiler https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost

Jak dopadne analýza pro sadu genů CDK1, CDK2, TP53, BCL2, MDM2?

Přidejte k nim 6 náhodně vybraných lidských genů, jak dopadne analýza teď?

Ukol 10:

O které GO identifikátory je obohacena množina genů se změnou expresi po infekci Mycobacteriem v článku https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2021.685237/full Table_2 v Supplementary files? Zvolte a vysvětlete vhodnou analýzu, uveďte top 5 GO termínů.