Bioinformatika I

Veřejná data a přístup k nim - 24.11.2022 - Zakladní formáty dat - 7. 11. 2023

FCB: 48-55 || UB: CH 3

Prednaska 5
Bioinformaticke databaze
Online skripta - bioinformatická data

Zajemci o bonus 3b za rozsireni online materialu o 3 polozky, poslete e-mail. Pridam Vas do gitlabu, svuj prispevek pridejte ve vlastni vetvi a pozadejte o "merge".

EBI
NCBI
Ensembl
Expasy Protein Server
Database info and training
UCSC Genome Browser
PDB
NCBI BLAST
Gene Ontology
KEGG
Clustal Omega
SRA

ZAKLADNÍ FORMÁTY DAT

FASTA (+IUPAC symboly)

FASTQ
ALN (a další)

SAM (a BAM, CRAM)
VCF (a GVCF)
GFA

GFF3
BED
Coordinate counting systems

GeneBank

Newick (a NEXUS)
SBML

Priklad: 

Předchozí
Následující