1. Historie a zamereni bioinformatiky. Jmenujte a strucne popiste dulezite mezniky v historii bioinformatiky, jak z obdobi, kdy se disciplina jeste nesformovala, tak i pote. https://academic.oup.com/bib/article/20/6/1981/5066445
2. Popiste mikroskopickou a biochemickou/molekularni strukturu zive hmoty s durazem na nukleove kyseliny/proteiny. FCB 2-19 UB 5-13 25-44
3. Jmenujte Vam zname metody molekularni biologie/genomiky/dalsich -omik (krome sekvenace nukleovych kyselin). Blize popiste XY. FCB 19-27
4. Jmenujte Vam zname metody sekvenace nukleovych kyselin. Blize popiste XY. G 13-56
5. Jmenujte metody studia a anotace biologickych sekvenci. Blize popiste algoritmy na globalni/lokalni porovnavani sekvenci zalozene na DP. FCB 35-53 UB CH4
6. Popiste verejne zdroje dat bezne pouzivane v bioinformatice (nazev - jaky typ dat poskytuji). UB 46-67
7. Popiste v bioinformatice bezne pouzivane formaty dat, jak pro predavani/uchovavani sekvenci, tak molekulovych struktur i jejich anotaci. WIKI https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_file_formats#Scientific_data_(data_exchange)
8. Popiste typickou strukturu prokaryotickeho/eukaryotickeho genu. FCB 118-143 UB 377-380
9. Blize popiste jeden algoritmus pro online prohledavani sekvenci, porovnejte jeho slozitost s naivnim pristupem. WIKI boyer-moore
10. Blize popiste jednu datovou strukturu pro offline prohledavani sekvenci. Jak by vypadalo jeji algoritmicke pouziti? UB 141-150 157-159 WIKI lookup table, hash table, suffix tree, suffix array
11. Na jakem principu je zalozena a k cemu slouzi hmotnostni spektrometrie proteinu (MALDI-TOF nebo MS/MS) FCB 184-188 UB 621-622
12. Popiste problematiku tvorby fylogenetickych stromu. Algoritmy, formaty dat? Jak se vytvari UPGMA strom? FCB 78-94 UB276-285
13. Co vite o predpovidani struktury proteinu ze sekvence ? FCB 156-176 UB CH13