Opakování: princip dynamiky reakcí 1. a 2. řádu, ukázky stabilních stavů (viz prvních 10 slajdů z následující série):

Příklady:

dynamika elektronů při fotosyntéze: http://www.e-photosynthesis.org/projects/ , model: Lazár_2009

cirkadiální rytmy sinice - https://www.e-cyanobacterium.org/models/model/26/

cirkadiální rytmy vyšších rostlin - https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rsif.2013.0979 , model: https://fairdomhub.org/models/245

signální dráhy lidských buněk: https://www.ebi.ac.uk/biomodels/BIOMD0000000049

K enzymové kinetice se vrátíme v další lekci, nyní procvičíme zobecnění principů používaných v oblasti populačních modelů:

Zajímavé odkazy:

Cvičení v COPASI:

1) Vymodelujte v nástroji COPASI jednoduchý model SI (pouze interakce přenosu nákazy).

2) Doplňte model na SIR (zavedení stavu uzdravených imunních vůči nákaze).

3) Rozšiřte model o restrikční opatření pomocí mechanismu EVENTS. 

Řešení: