R
Patrik Rudolf, Petra Hubatková
R101: Praktický úvod pro používání statistického programu R
Výsledek obrázku pro sims

simr
•power analýzy pro MLM (v rámci lme4) za užití simulace dat
Green, P., MacLeod, C., & Alday, P. (2019). Package ‘simr‘: Power analysis for generalised linear
mixed models by simulation. R package verze 1.0.5. Dostupné z:
https://cran.r-project.org/web/packages/simr/simr.pdf




Přehled funkcí
•makeGlmer a makeLmer
•modify (+ extend)
•powerSim
•powerCurve
•doSim
•
•+ další

makeGlmer a makeLmer
•makeGlmer(formula, family, fixef, VarCorr, data)
•makeLmer(formula, fixef, VarCorr, sigma, data)
•
•formula jako u lmer() nebo glmer()
•fixef jako vektor
•rozptyl a kovariance random efektů; pokud víc -> parametry jako list
•sigma – reziduální SD

modify a extend
•fixef(object_model)[“x“] <- value
•
•extend(object, along, within, n, values)

powerSim
•odhad založen na Monte Carlo simulaci (defaultní počet simulací 1000)
•
•powerSim(object_model, nsim)
•% v kolika případech vyšla simulace jako signifikantní (nulová hypotéza byla zamítnuta) při dané
velikosti účinku
•
•

powerCurve
•powerCurve(object_model)


powerCurve
•powerCurve(object_model, along = „y“)


Zdroje
•Green, P., MacLeod, C., & Alday, P. (2019). Package ‘simr‘: Power analysis for generalised linear
mixed models by simulation. R package verze 1.0.5. Dostupné z:
https://cran.r-project.org/web/packages/simr/simr.pdf
•Green, P., McLeod, C. J. (2016). SIMR: an R package for power analysis of generalised linear mixed
models by simulation. Methods in Ecology and Evolution. 7, 493-498. Dostupné z:
https://doi.org/10.1111/2041-210X.12504

Děkujeme za pozornost.