Klinická mikrobiologie Jana Juránková OKM FN Brno Septické stavy • Sepse X Bakteriémie, virémie, fungémie – Bakteriémie, virémie, fungémie: přítomnost bakterií, virů nebo hub v krevním oběhu – Sepse: těžké onemocnění, reakce makroorganismu na přítomnost mikroorganismů v krevním oběhu Diagnostika sepse • Klinické příznaky: zvýšení i snížení teploty, zvýšení dechové frekvence, zrychlení tepu, zmatenost • Hematologické příznaky:zvýšení i snížení počtu leukocytů, snížení počtu trombocytů • Biochemické příznaky: hemokoagulační poruchy, metabolicko-respirační acidosa, zvýšení CRP Diagnostika sepse • Bakteriologická diagnostika: pozitivní hemokultivace Sepse • Primární – patogen jen v krevním řečišti – po i.v.aplikaci léčiv, drog • Sekundární – v těle je primární ložisko a sekundárně se patogeny vyplaví do krevního oběhu • Katetrové – původce pochází z kolonizace zavedeného cévního katetru Původci sepse • Ranné sepse – Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus • Urosepse – Escherichia coli • Intraabdominální sepse – enterobakterie, anaeroby • Nosokomiální sepse – Pseudomonas aeruginosa, enterobakterie s produkcí beta-laktamáz, kvasinky, Staphylococcus koaguláza negativní Infekce centrálního nervového systému • Zdroj – Hematogenní – meningokoky – Per continuitatem – pneumokoky, hemofily – Podél nervů – virus herpes simplex, virus vztekliny – Přímo – při poranění hlavy Meningitidy • Meningitidy aseptické – virové – Enteroviry, virus herpes – simplex, varicella-zoster, virus klíšťové menigoencefalitidy • Meningitidy purulentní – Streptococcus agalactiae, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Listeria monocytogenes Meningitidy • Chronické meningitidy – Mycobycterium tuberculosis (bazilární meningitida), Cryptococcus neoformans Encefalitidy • Akutní encefalitidy virové etiologie – Virus klíšťové encefalitidy, virus herpes simplex, enteroviry, virus parotitidy Mozkové abscesy • Akutní – bakteriální – Smíšená aerobní a anaerobní flóra, Staphylococcus aureus, nokardie • Chronické – bakteriální, mykotické, parazitární – Mycobacterium tuberculosis, Nocardia asteroides – Cryptococcus neoformans, Aspergillus spp. – Cysticerkosa (Taenia solium), echinokokosa Respirační infekce • Infekce nosu a nosohltanu – Rýma, zánět nosohltanu • Rhinoviry,koronaviry • Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus,Streptococcus pneumoniae • Nosičství • Neisseria meningitidis Infekce dutiny ústní a mandlí • Virové – Rhinoviry, koronaviry, adenoviry, EB virová tonsilitida, herpangína • Bakteriální : angína – Streptococcus pyogenes, Corynebacterium diphteriae, anaerobní Plautova-Vincentova • Kvasinkové – soor Infekce středního ucha a vedlejších nosních dutin • Akutní zánět středního ucha a dutin – Respirační viry – bakteriální: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Branhamella catharralis, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Bacteroides spp., Peptostreptococcus spp. Infekce středního ucha a vedlejších nosních dutin • Chronické – bakteriální: Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, peptostreptokoky Infekce příklopky hrtanové • Epiglottitis – Haemophilus influenzae typ b Infekce laryngu a trachey • Virové – Viry influenzy, parainfluenzy, RS virus • Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae • Bakteriální – Corynebacterium diphteriae, ostatní infekce sekundární po virech Infekce bronchů • Virové – Viry chřipky, adenoviry, RS virus • Bakteriální – primární: Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Bordetella pertussis – Sekundární: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Branhamella catharralis, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia Infekce plic • Akutní zánět – Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus, Branhamella catarrhalis, Klebsiella pneumoniae – Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae – Chřipka A,B, RS virus Infekce plic u oslabených jedinců • Enterobakterie – Klebsiella pneumoniae • Legionella pneumophila • Pneumocystis jirovecii • Nocardia asteroides • Aspergillus spp. • Cytomegalovirus Pneumonie chronické • Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis • Aspirační pneumonie - anaeroby Infekce ran, kostí a měkkých tkání Infekce ran • Povrchové zranění – Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes • Anaerobní traumatosy – Clostridium perfringens, Clostridium septicum, Clostridium tetani (toxin) Infekce operačních ran • Infekce endogenní – z okolí rány: Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, čeleď Enterobacteriacae, Bacteroides sp. Infekce po kontaktu se zvířetem • Pokousání - ústní mikroflora zvířete – Stapfylococcus aureus, Pasteurella multocida, Capnocytophaga canimorsus • Kontakt bez kousnutí – Francisella tularensis, Erysipelothrix rhusiopathiae, Bartonella henselae Osteomyelitidy • Akutní: Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Salmonella spp. • Chronická: Pseudomonas aeruginosa, enterobakterie, Mycobacterium tuberculosis Infekce kůže • Bakteriální – Impetigo: Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes – Folliculitis : Staphylococcus aureus – Acne vulgaris: Propionibacterium acnes – Erysipel: Streptococcus pyogenes Bakteriální infekce projevující se na kůži • Produkce toxinů způsobujících vyrážky: – Spála – Streptococcus pyogenes – Syndrom toxického šoku – Staphylococcus aureus – Neisseria meningitidis – Erytema chronicum migrans – Borrelia spp. Virová onemocnění kůže • Exantematické virózy – Spalničky, zarděnky, erytema infectiosum (5.dětská nemoc, parvovirus B19), exantema subitum (HHV 6) • Vesikulární exantém (puchýřky) – Herpesviry, poxviry • Bradavice – Papillomaviry • Petechie – Hemoragické horečky (Lassa, Ebola, u nás Hantaan) Kožní mykosy • Candida albicans – intertrigo, vulvovaginitida, soor • Dermatofyta – tinea pedis (Trichophyton rubrum) Parazitární onemocnění kůže • Svrab • Pedikulóza – zavšivení • Poštípání členovci Infekční průjmy • Bakteriální – Salmonely, shigely, kampylobaktery, yersinie – Enterotoxická, enteroinvazivní enterohemoragická Eschericha coli – Clostridium difficile – Aeomonas spp., Plesiomonas shigeloides Infekční průjmy • Virové – Rotaviry, adenoviry, kaliciviry (Norwalk), astroviry • Parazitární – Giardia lamblia, Entamoeba hystolytica, Cryptosporidium parvum Otravy z potravin • Bakterie vylučující toxiny – Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, Clostridium botulinum Močové infekce • Escherichia coli, Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae • Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis • Candida albicans • Trichomonas vaginalis Sexuálně přenosné infekce • Bakteriální – Neisseria gonorrhoeae, Treponema pallidum,(Haemophilus ducrey, Calymmatobacterium granulomatis • Chlamydia trachomatis • Virové – HIV, HSV 2, papilomaviry, molluscum contagiosum, Hepadnavirus (hepatitida B) • Parazitární – Trichomonas vaginalis, ektoparazité Infekce v souvislosti s těhotenstvím • Virové infekce se závažným průběhem – Hepatitida E, chřipka • Bakteriální infekce – Streptococcus pyogenes (porod či potrat, horečka omladnic), Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae (mastitidy) Infekce plodu a novorozence • Vrozené – Virové: zarděnky, cytomegalovirus,varicella-zoster, HIV – Bakteriální: syfilis, listeriosa – Parazitární: toxoplasmosa Infekce plodu a novorozence • Perinatální a neonatální – Bakteriální: Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus agalactiae, Listeria monocytogenes – Chlamydia trachomatis – Virové: hepatitida B, HIV, Nosokomiální infekce • Nákazy získané v souvislosti s pobytem ve zdravotnickém zařízení • Endogenní – infekce vlastní mikroflórou • Exogenní – infekce zavlečená zvenčí (ruce personálu) Nosokomiální infekce • Bakteriální – Bakterie citlivé na ATB – Bakterie rezistentní na ATB • Selekce rezistentních kmenů působením ATB na citlivé kmeny – MRSA, VRE, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia • Indukce tvorby betalaktamáz působením ATB – Širokospektré batalaktamázy, induktivní betalaktamázy Nosokomiální infekce • Virové – Hepatitidy, rotaviry, adenoviry • Parazitární – Roupy, svrab