Psoriatici --- datový soubor 07_priklad Psoriatici.sta --- řešení úkolů Soubor pacientů s diagnostikovanou psoriázou je rozdělen na výzkumnou a kontrolní skupinu. U psoriatiků byl sledován jejich psychologický stav v průbehu léčby pomocí dotazníku životní spokojenosti DŽS na začátku léčby, po třech měsících a po šesti měsících léčby. Stav psoriatiků byl hodnocen podle PASI (Psoriasis Area Severity Index) a PDI (Psoriasis disability index). Poznámky k testování hypotéz: --------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------- Důležitá poznámka: při nastavování testů vždy zkontrolujte, jak máte nastavené selection conditions. --------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------- Ve všech třech úkolech jde o srovnání hodnot u těch samých pacientů, tj. jde o párově uspořádaná data. Ke srovnání hodnot na začátku léčby a po třech měsících léčby budeme používat párový t-test (a to pouze v případě, když jsou splněny předpoklady normality rozložení rozdílů hodnot na začátku léčby a po třech měsících – toto otestujeme Shapiro-Wilkovým testem) anebo neparametrický test – zde bude vhodnější znaménkový test (protože máme pouze 19 pacientů). Všechny hypotézy testujeme na hladině významnosti α = 0,05. --------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------- Úkol 1: Zjistěte rozdíl v hodnotách DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby. Srovnání proveďte samostatně pro kontrolní a výzkumnou skupinu. Kontrolní skupina: H[0]: DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny neliší. H[A]: DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny liší. Normalita rozložení DŽS na začátku – DŽS po 3 měsících (SW test): P = 0,001 … normalita se zamítá Nemůžeme použít párový t-test, musíme použít znaménkový test: Pair of Variables skupina=kontrolni Sign Test (12_priklad Psoriatici.sta) Marked tests are significant at p <,05000 No. of Non-ties Percent v < V Z p-value DŽS_v0 & DŽS_v3 13 53,84615 -0,000000 1,000000 P = 1,000; H[0] nezamítáme. Závěr: DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny neliší. Výzkumná skupina: H[0]: DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny neliší. H[A]: DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny liší. Normalita rozložení DŽS na začátku – DŽS po 3 měsících (SW test): P = 0,134 … normalita se nezamítá Můžeme použít párový t-test: Variable T-test for Dependent Samples (12_priklad Psoriatici.sta) Marked differences are significant at p < ,05000 Include condition: v2=101 Mean Std.Dv. N Diff. Std.Dv. Diff. t df p Confidence -95,000% Confidence +95,000% DŽS_v0 3,789474 1,652572 DŽS_v3 4,368421 1,770453 19 -0,578947 1,773753 -1,42273 18 0,171914 -1,43387 0,275974 P = 0,172; H[0] nezamítáme. Závěr: DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny neliší. (ak by jsme chtěli být konzistentní a k oběma skupinám přistupovat stejně, tak použijeme i v tomto případě znamékový test. Na výsledku se nic nezmění, jelikož výsledek znaménkového testu P = 0,181 znamená, že DŽS na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny neliší. Úkol 2: Zjistěte rozdíl v hodnotách PASI na začátku léčby a po třech měsících léčby. Srovnání proveďte samostatně pro kontrolní a výzkumnou skupinu. Kontrolní skupina: H[0]: PASI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny neliší. H[A]: PASI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny liší. Normalita rozložení PASI na začátku – PASI po 3 měsících: P = 0,077 … normalita se nezamítá Můžeme použít párový t-test: Variable T-test for Dependent Samples (12_priklad Psoriatici.sta) Marked differences are significant at p < ,05000 Include condition: v2=102 Mean Std.Dv. N Diff. Std.Dv. Diff. t df p Confidence -95,000% Confidence +95,000% Pasi index_v0 20,11053 10,65431 Pasi index_v3 14,44211 8,38658 19 5,668421 14,09622 1,752816 18 0,096649 -1,12574 12,46258 P = 0,097; H[0] nezamítáme. Závěr: PASI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny neliší. Výzkumná skupina: H[0]: PASI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny neliší. H[A]: PASI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny liší. Normalita rozložení PASI na začátku – PASI po 3 měsících: P = 0,142 … normalita se nezamítá Můžeme použít párový t-test: Variable skupina=vyzkumna T-test for Dependent Samples (12_priklad Psoriatici.sta) Marked differences are significant at p < ,05000 Mean Std.Dv. N Diff. Std.Dv. Diff. t df p Confidence -95,000% Confidence +95,000% Pasi index_v0 14,32105 10,60223 Pasi index_v3 8,00000 6,56633 19 6,321053 9,935155 2,773266 18 0,012534 1,532461 11,10964 P = 0,013; H[0] zamítáme. Závěr: PASI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny liší. Úkol 3: Zjistěte rozdíl v hodnotách PDI na začátku léčby a po třech měsících léčby. Srovnání proveďte samostatně pro kontrolní a výzkumnou skupinu. Kontrolní skupina: H[0]: PDI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny neliší. H[A]: PDI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny liší. Normalita rozložení PDI na začátku – PD po 3 měsících: P = 0,116 … normalita se nezamítá Můžeme použít párový t-test: Variable skupina=kontrolni T-test for Dependent Samples (12_priklad Psoriatici.sta) Marked differences are significant at p < ,05000 Mean Std.Dv. N Diff. Std.Dv. Diff. t df p Confidence -95,000% Confidence +95,000% PDI_v0 27,47368 9,383013 PDI_v3 24,21053 8,148476 19 3,263158 4,369619 3,255153 18 0,004395 1,157069 5,369247 P = 0,004; H[0] zamítáme. Závěr: PDI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u kontrolní skupiny liší. Výzkumná skupina: H[0]: PDI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny neliší. H[A]: PDI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny liší. Normalita rozložení PDI na začátku – PD po 3 měsících: P = 0,240 … normalita se nezamítá Můžeme použít párový t-test: Variable skupina=vyzkumna T-test for Dependent Samples (12_priklad Psoriatici.sta) Marked differences are significant at p < ,05000 Mean Std.Dv. N Diff. Std.Dv. Diff. t df p Confidence -95,000% Confidence +95,000% PDI_v0 24,84211 6,759875 PDI_v3 22,84211 6,946327 19 2,000000 5,537749 1,574249 18 0,132842 -0,669110 4,669110 P = 0,133; H[0] nezamítáme. Závěr: PDI na začátku léčby a po třech měsících léčby se u výzkumné skupiny neliší.