Mikrobiologický pohled na infekce dýchacího ústrojí Mikrobiologie a imunologie – BSKM021p + c Týden 6 Ondřej Zahradníček Noc [USEMAP] Obsah této prezentace Ú v o d Infekce HCD Infekce DCD Infekce plic Vyšetřování u dýchacích infekcí Úvod Význam infekcí dýchacích cest (respiračních nákaz) •Jsou to nejběžnější infekce v ordinaci praktického lékaře (mikroby se v dýchacích cestách snadno pomnožují) •Mají obrovský ekonomický dopad (neschopenky, OČR) •Mají sklon vyskytovat se v kolektivech a občas probíhat v podobě epidemií •Tři čtvrtiny respiračních infekcí (a u dětí ještě více) vyvolávají viry Umístění nákazy v rámci dýchacích cest •Není jedno, kterou část dýchacích cest infekce postihuje (liší se vyšetřování, léčba i závažnost). –Příznaky infekcí různých částí dýchacího traktu jsou různé (smrkání u rhinitid, kašel u infekcí DCD) –Různí jsou také původci •Proto je třeba rozlišovat infekce: –horních cest dýchacích (plus anatomicky i středního ucha, které s nimi souvisí) –dolních cest dýchacích, včetně plic (někdy se plíce kladou zvlášť, nejde už o „cestu“) –Je ale potřeba počítat také s tím, že infekce může postihovat více částí dýchacích cest současně. Rozdělení dýchacích infekcí •HCD a přilehlé orgány •infekce nosu a nosohltanu •infekce ústní části hltanu (faryngu) včetně mandlí •infekce vedlejších dutin nosních •většinou se sem přiřazují z anatomických důvodů také infekce středního ucha •DCD a plíce: •infekce příklopky hrtanové •Infekce hrtanu (laryngu) a průdušnice (trachey) •infekce bronchů (průdušek) •infekce bronchiolů (průdušinek) •infekce plic Není chřipka jako „chřipka“ •Většina běžných akutních onemocnění dýchacích cest probíhá jako rhinitidy, faryngitidy nebo smíšené rhinofaryngitidy (záněty nosu a hltanu). Epidemiologové používají zkratku „ARI“ – acute respiratory illness (akutní respirační onemocnění). Lidé často mluví o „chřipce“, ale o tu tady nejde •Pravá chřipka sice postihuje dýchací cesty, ale spíše dolní, projevuje se suchým kašlem a také celkovými příznaky (schvácenost, horečka). Podobně se ovšem mohou projevovat i například tzv. parachřipky. Epidemiologové tady používají zkratku „ILI“ (influenza-like illness, chřipce podobná onemocnění). •. Normální osídlení dýchacích cest •Nosní dutina nemá specifickou flóru, přechází tam však mikroflóra z kůže (přední část) a hltanu (zadní část) •V hltanu (stejně jako v ústní dutině) nacházíme ústní streptokoky, neisserie, nevirulentní kmeny hemofilů aj. Mnohé další tam jsou, ale většinou je nevykultivujeme •Plíce a dolní dýchací cesty jsou za normálních okolností bez většího množství mikrobů •Na ostatních místech (hrtan) jsou různé přechody (hrtan – jako v hltanu, ale méně) [USEMAP] Infekce HCD Infekce nosu, popř. i nosohltanu (rhinitis, rhinopharyngitis acuta) •Původci jsou nejčastěji viry. Virová rhinitida je obyčejná rýma („common cold“). Přes 50 % případů způsobují rhinoviry (viry rýmy), zbytek tzv. koronaviry, zbytek ostatní respirační viry (ne ale viry chřipky!) •Bakterie se mohou u akutních infekcí druhotně pomnožit, často jde o bakterie z kůže nebo z hltanu. Samy ale zmizí, antibiotická léčba je zbytečná a většinou stejně neúčinná. •Antibiotika se podávají jen tehdy, když hlenohnisavý (ne jen hlenovitý) sekret trvá několik dní a pacient má výrazné potíže, což jsou zcela výjimečné případy Vyšetřování a léčba infekcí nosu a nosohltanu •Vyšetřování je zbytečné. Ani hlenohnisavý sekret není důvodem provádět bakteriologické vyšetření, pokud netrvá delší dobu. •Léčba je symptomatická (při ucpaném nosu kapky, jinak tekutiny, např. čaj; ani antipyretikum není příliš vhodné, protože zvýšená teplota pomáhá proti virům). Antibiotická léčba není indikována. Nanejvýš je možno zkusit lokální léčbu framykoinem. •Pouze pokud infekce trvá déle než 10–14 dnů, je vhodné vyšetřit výtěr z nosu (vyhnout se kontaminaci z kůže!) a léčit cíleně antibiotiky dle citlivosti Co praví odborníci •„Více než 80 % rhinitid je provázeno změnami na sliznicích dutin, proto toto onemocnění bývá nazýváno také rhinosinusitida. Kašel provází asi 60–80 % rhinosinusitid. Hlenovitá sekrece z nosu se do tří dnů od počátku onemocnění mění v hlenohnisavou, obsahující deskvamované epiteliální buňky a kolonizující bakterie běžně se vyskytující v nose. Tato kvalitativní změna sekrece, která bývá často v ambulantní praxi nesprávně považována za bakteriální komplikaci, zejména provede-li se kultivační vyšetření hlenu nebo výtěru z nosu, však patří k přirozenému průběhu virové rhinosinusitidy.“ •(Respirační infekce – doporučený postup ČLS JEP) Záněty přínosních dutin (sinusitis acuta) •Přechodný zánětlivý nález v dutinách je normální při klasické rýmě a není důvodem k léčbě (ani při rtg nálezu) •Důvodem k léčbě je bolestivý zánět dutin, který se projevuje bolestí zubů, hlavy, horečkou a trvá aspoň týden, nebo je podrážděný trojklanný nerv (pak ani tak dlouho trvat nemusí •Původcem bývá Streptococcus pneumoniae či Haemophilus influenzae Vyšetřování a léčba infekcí přínosních dutin •Léčba sinusitidy pravděpodobného bakteriálního původu by měla být zahájena neprodleně, i bez vyšetření. •Lékem volby je amoxicilin (např. AMOCLEN), alternativou může být doxycyklin (DOXYBENE), u dětí kotrimoxazol (např. BISEPTOL) •Vyšetřovat výtěr z nosu či krku je k ničemu. •Pokud máme pochybnosti o úspěšnosti léčby a chceme léčit cíleně, jediná možnost je správně provedená punkce či výplach dutin na ORL, samozřejmě pokud výplach, ne borovou vodou!! Na žádanku nutno uvést, zda jde o čistý punktát, nebo proplach fyziologickým roztokem Zánět středního ucha – otitis media •Střední ucho anatomicky souvisí s dýchacím systémem, proto je jeho zánět zmíněn zde. •Častý u dětí (krátká vodorovná Eustachova trubice) •Původci: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis •U chronických se mohou uplatnit i některé gramnegativní tyčinky •Nutno odlišit záněty boltce a zevního zvukovodu: tady je původcem hlavně Staphylococcus aureus (jako u jiných zánětů kůže), léčba lokálně např. framykoin kapky. Naopak záněty vnitřního ucha jsou velmi vzácné a zpravidla souvisejí s mozkovými infekcemi Vyšetřování a léčba infekcí středního ucha •Léčba má smysl, pokud jde o skutečně prokázaný zánět (bolest, zarudnutí, horečka) a nereaguje na protizánětlivou léčbu •Lékem volby je amoxicilin (např. AMOCLEN), alternativou může být kotrimoxazol •Vyšetřovat výtěr ze zvukovodu má smysl pouze po provedené paracentéze (propíchnutí bubínku) •Jinak má samozřejmě smysl vyšetřit hnisavou tekutinu, která je při paracentéze odebrána Infekce hltanu a mandlí (pharyngitis, tonsilophyryngitis •Akutní záněty hltanu a mandlí: • většinou (70–85 %) virové (rhinoviry, koronaviry, adenoviry, ale i při infekční mononukleóze) •Z bakteriálních nejvýznamnější (více než 95 % případů): akutní tonsilitida (povlaková angína) vyvolaná Streptococcus pyogenes (hemolytický streptokok skupiny A) Další bakterie: arkanobakteria, snad také další hemolytické streptokoky, pneumokoky aj. •Vzácné, ale důležité: záškrt, kapavka Vyšetřování a léčba infekcí z krku •Vždy by měl být proveden výtěr z krku (tonsil) k ověření bakteriálního původu a případně určení původce. (To, že mnozí lékaři výtěry nedělají, ještě neznamená, že je to tak dobře.) •Protože ale zpravidla není možné čekat na výsledek kultivace, provede se také vyšetření CRP (zvýšený u bakteriálních infekcí), jehož výsledek je k dispozici mnohem dříve •Léčba by měla být cílená. U angín způsobených Streptococcus pyogenes (a těch je naprostá většina) je lékem první volby V-penicilin. Makrolidy (RULID, KLACID, SUMAMED, AZITROX) by se měly používat pouze u alergických pacientů. •Případně serologie EB viru a cytomegaloviru (vyloučení infekční mononukleózy a cytomegalovirózy) Co může být nebezpečné •Mnozí lékaři jsou přesvědčeni, že jsou schopni rozpoznat bakteriální tonsilitidu od virové. Výzkumy ale ukazují, že to často není pravda. Je potřeba provést alespoň vyšetření CRP. •Často se také místo penicilinu používají makrolidy (KLACID, SUMAMED, RULID), ačkoli pacient není alergický. Přitom jsou to jen bakteriostatická antibiotika a účinnost je jen 90 % oproti 100 % u penicilinu. (Makrolidy se obecně nadužívají.) •Chybou je i podání ampicilinu či amoxicilinu míso penicilinu, zejména tam, kde není prokázán původ nemoci. Podání aminopenicilinu u infekční mononukleózy může vyvolat velmi těžké reakce! [USEMAP] Infekce DCD Akutní zánět příklopky hrtanové •Zánět příklopky hrtanové (epiglottitis) je závažné onemocnění, které postihuje hlavně děti ve věku 1–5 let. Dítě nepije, huhňá, v krku je vidět „třešeň“ •Hrozí, že se dítě udusí! •Prakticky jediný významný původce: • Haemophilus influenzae typ b •Léčba: převoz na JIP, zajištění životních funkcí dítěte, z antibiotik i. v. cefalosporiny III. generace (u tak výjimečného a závažného onemocnění se na rezistence nebere ohled). Raději se nevyšetřuje, popřípadě se provede kultivace krve (hemokultura) •Díky zavedení očkování se vyskytuje vzácně Původci zánětů hrtanu, případně hrtanu a průdušnice (laryngitis, laryngotracheitis) •Nejčastěji onemocní kojenci a batolata, nemoc se projevuje štěkavým kašlem s namáhavým vdechem •Opět jsou mezi původci respirační viry, ale jiné než u zánětů nosohltanu: parachřipka, chřipka A a respirační synciciální (RS) viry •Z bakterií vzácně chlamydie, mykoplasmata • Pablánový zánět hltanu a průdušnice (tzv. croup): Corynebacterium diphtheriae Vyšetřování a léčba zánětů hrtanu (a průdušnice) •Není co vyšetřit. Dělat např. výtěr z krku je nesmyslné, protože v krku jsou úplně jiné bakterie. Mikrobiologické vyšetření se tedy až na výjimky (chronické stavy) neprovádí •Léčba je jen symptomatická. Antibiotika nejsou indikována prakticky za žádných okolností Akutní bronchitis, případně tracheobronchitis (záněty průdušnice a průdušek) •Akutní bronchitis: –Onemocnění je vyvoláno téměř výlučně viry, typickým představitelem onemocnění je chřipka. –Epidemicky související případy u školních dětí a mladších dospělých mohou být způsobeny Mycoplasma pneumoniae. –Jiné bakteriální druhy, jako Streptococcus pneumoniae a Haemophilus influenzae, jsou v této diagnóze nevýznamné a pokud jsou izolovány ze sputa, jejich původ je v horních cestách dýchacích Chronická bronchitis Bronchiolitis •Chronické bronchitidy (cystická fibróza, oslabení lidé): –Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia, Staphylococcus aureus •Bronchiolotis (zánět průdušinek): postihuje kojence, batolata a seniory. Původci viroví, někdy je nutná hospitalizace. Cílená léčba není možná. •Výjimečný je černý kašel (vždy léčit antibiotiky) Vyšetřování a léčba zánětů průdušek a průdušinek •Základem je klinické vyšetření, které prokáže rozvoj kašle s vykašláváním, bez nálezu na plicní tkáni (podle rentgenu a klinického vyšetření) •Laboratorní vyšetřování je většinou zbytečné. U vykašlávání hnisu se zasílá sputum (chrchel), neboť je pravděpodobná sekundární bakteriální infekce. V tom případě má také smysl vyšetřit CRP. Dále je možno poslat krev na serologické vyšetření protilátek proti mykoplasmatům a chlamydiím. •Léčba antibiotiky je většinou zbytečná, u mykoplasmat a chlamydií se použijí tetracykliny nebo makrolidy Zvláštní případ: akutní zhoršení chronické bronchitidy •Charakterizována –zhoršením kašle –zvýšenou expektorací a změnou charakteru sputa i jeho barvy –často zhoršením dušnosti. •Původci jsou do 40% viry •Z baktérií jsou nejčastějšími vyvolavateli H. influenzae, Streptococcus pneumoniae či Moraxella catarrhalis. •Rutinní antibiotická léčba pacientů se nedoporučuje •Podání atb má prokazatelný účinek pouze pokud jsou u pacientů přítomny současně všechny tři příznaky onemocnění [USEMAP] Infekce plic Rozdělení zánětů plic (podle toho různí původci) •Akutní – komunitní (ambulantní pacienti) •u původně zdravých (ještě lze rozdělit – u dětí se poněkud liší poměr původců) •u oslabených osob a imunodeficitů •po kontaktu se zvířaty •Akutní – nemocniční •ventilátorové (pacienti s umělou plicní ventilací) lčasné (do 4. dne) lpozdní (později) •jiné než ventilátorové •Subakutní a chronické Původci klasických komunitních pneumonií (zánětů plic) •Streptococcus pneumoniae: převládající (zvláště věk nad 65 let) •Haemophilus influenzae: méně obvyklý •Moraxella catarrhalis: vzácný •Legionella pneumophila: vzácný, průběh mezi klasickými a atypickými pneumoniemi •Staphylococcus aureus: velmi vzácný (výskyt se zvyšuje při chřipkové epidemii) •U novorozenců též Streptococcus agalactiae Původci atypických komunitních pneumonií •U dospělých nejčastěji atypické bakterie (není možno je prokazovat ze sputa, pouze protilátky v séru): •Mycoplasma pneumoniae •Chlamydia pneumoniae •U malých dětí převládají respirační viry (RSV, chřipka A, adenoviry) •U novorozenců případně Chlamydia trachomatis, serotypy D až K (perinatálně získaný) U oslabených je jiná skladba patogenů •Menší stupeň oslabení: •pneumokoky, stafylokoky, hemofily •Klebsiella pneumoniae (alkoholici) •Legionella pneumophila •Těžší postižení imunity: •Pneumocystis jiroveci (zvláštní houba) •cytomegalovirus •atypická mykobakteria (příbuzná TBC) •vláknitá bakterie Nocardia asteroides •houby (aspergily, kandidy) Zvláštní případ: kontakt se zvířaty •Bronchopneumonie •Pasteurella multocida (kontakt s psy a kočkami) •Francisella tularensis (tularémie – kontakt se zajíci nebo vodou či senem kontaminovaným zajíci) •Atypické pneumonie •Chlamydia psittaci (psitakóza, ornitóza) •Coxiella burnetii (Q-horečka) Nemocniční pneumonie akutní •VAP (ventilátorové) •časné (do 4. dne hospitalizace): • citlivé terénní kmeny běžných původců •pozdní (od 5. dne hospitalizace): • rezistentní nemocniční kmeny •Jiné •viry (RS virus, cytomegalovirus) •legionely Nemocniční pneumonie subakutní a chronické •Aspirační pneumonie (vdechnutí např. žaludečního obsahu) a plicní abscesy lrůzné anaerobní bakterie •Plicní tuberkulóza a mykobakteriózy lMycobacterium tuberculosis lMycobacterium bovis latypická mykobakteria Mikrobiologické vyšetřování u infekcí plic •U klasických komunitních pneumonií –krev na hemokultivaci (hemokultura) –sputum – mikroskopické a základní kultivační vyšetření –sputum – kultivační průkaz Legionella pneumophila –moč – průkaz antigenu Legionella pneumophila •U atypických pneumonií –krev – sérologické vyšetření (průkaz protilátek) –hemokultura a sputum na bakteriologii (pro jistotu) –virologické vyšetření (sérologie, přímý průkaz) –sputum – přímý průkaz původce (EIA, PCR) [USEMAP] Léčba infekcí DCD a plic •U klasických komunitních pneumonií amoxicilin, případně dle původce a jeho citlivosti •U atypických pneumonií tetracykliny či (zejména u dětí < 8) makrolidová antibiotika. •U nemocničních infekcí nutná léčba podle citlivosti – zejména pseudomonády a burkholderie jsou často velmi rezistentní! •U tuberkulózy nutná troj- či častěji čtyřkombinace antituberkulotik • Vyšetřování u dýchacích infekcí Odběr vzorků na vyšetření z dýchacích cest obecně (1) •Na bakteriologii posíláme –výtěry – (z krku, tonzil, nosu apod.), vždy na tamponu v transportní půdě (např. Amiesově), popsat odkud je výtěr –sputum, tracheální aspirát či bronchoalveolární laváž, případně také různé endotracheální kanyly a podobné vzorky, u bronchitid a pneumonií (požadavek vyšetření TBC musí být na žádance!) –hemokulturu u pneumonií –moč na legionelový antigen •Na mykologické vyšetření volíme výtěr na tamponu v soupravě FungiQuick Odběr vzorků na vyšetření z dýchacích cest obecně (2) •Viroví původci se většinou nevyšetřují. •Je-li výjimečně potřeba je vyšetřit, volíme např. výplachy z nosohltanu a bronchoalveolární laváže speciálním médiem, či krev na serologii respiračních virů (tj. na protilátky – je ale třeba počítat s tím, že protilátky se vytvoří až za týden či dva po propuknutí nemoci) •U viru chřipky se používá výtěr ze zadní stěny faryngu do speciálního transportního média Výtěr z krku – technika •Odběrový materiál: Tampon na tyčince v transportním mediu podle Amiese. •Způsob odběru: –Tampon se zavede za pomoci špátle za patrové oblouky, aniž by došlo k dotyku se sliznicí dutiny ústní. –Válivým pohybem se razantně setře povrch obou tonsil a patrových oblouků tak, aby se do tamponu nasálo dostatečné množství slizničního sekretu. –Současně se provede výtěr ze zadní stěny faryngu. –Tampon se opatrně vyjme, aby se zabránilo jeho kontaminaci, a vloží se do sterilního obalu, nejlépe s transportním médiem. •Uchovávání: Do 24 hodin při pokojové teplotě (na kapavku neuchovávat a zaslat okamžitě) •Transport: Do 2 hodin při pokojové teplotě. Výtěr z nosohltanu („pertussoidní“ syndrom, podezření na dávivý kašel) •Odběrový materiál: Tampon na drátu; na bordetely nutno ihned naočkovat na speciální kultivační půdu, na hemofily stačí zaslat v transportní půdě •Způsob odběru: Koncová část (asi 3 až 4 cm) tamponu na drátě se ohne o hranu odběrové zkumavky do úhlu 90°, zavede se ústní dutinou za patrové oblouky k zadní stěně nasopharyngu, aniž by došlo k dotyku se sliznicí dutiny ústní nebo tonsil. Krouživým, vějířovitým pohybem se provede stěr z faryngeální sliznice (tamponem vzhůru). •Uchovávání: Okamžitý transport do laboratoře. •Transport: Do 2 hodin od odběru při pokojové teplotě. Odběr sputa •Odběrový materiál: Sterilní průhledný kontejner z umělé hmoty se šroubovacím víčkem. •Způsob odběru: –Odběr se provádí vždy za dohledu sestry nebo lékaře. –Pacient si vypláchne ústa a vykloktá vodou (omezení kontaminace ústními bakteriemi) –Poté pacient zhluboka zakašle tak, aby vykašlal sekret z dolních dýchacích cest, nikoliv sliny či sekret z nosohltanu. –Takto získané sputum zachytí do sterilního kontejneru v objemu nejméně 1ml. •Uchovávání: Do 24 hodin při chladničkové teplotě •Transport: Do 2 hodin při pokojové teplotě. Možná vyšetření u plicních infekcí •Základem je klinické vyšetření a rentgen, důležité je rozlišení klasické × atypické pneumonie (zcela jiné spektrum původců) •U klasických pneumonií má smysl správně odebrané sputum, případně (u septického průběhu) krev na hemokultivaci •U atypických pneumonií serologie mykoplasmat a chlamydií (případně v rámci „serologie respiračních virů“). •U nemocničních pneumonií může připadat v úvahu navíc cílené vyšetření na legionely. Kromě kultivačního vyšetření je možné i vyšetření moče na legionelový antigen, případně serologie Co napsat na žádanku o vyšetření •Kromě vyplnění obvyklých polí (jméno, číslo pojištěnce…) je důležité pole požadavku, co má být vyšetřeno. •Příklady formulací na žádance: –Výtěr z krku na bakteriologii –Punktát čelní dutiny na bakteriologii + kvasinky –Krev na serologii původců atypických pneumonií –Sputum na bakteriologii –Sputum na TBC (kultivace + PCR) –Hemokultura č. II z periferie –BAL na Pneumocystis jirovecii Co se se vzorky děje v laboratoři •Většina výtěrů se kultivuje na krevním agaru. Na ten se umisťují disky, jejichž cílem je odclonit běžnou flóru a umožnit záchyt patogenů. Kvůli hemofilovi, který na KA roste jen v přítomnosti např. zlatého stafylokoka, se na agar očkuje stafylokoková čára •U sput apod. se také provádí mikroskopie •Kromě KA se užívají další půdy, např. Endova •Virologické vzorky se izolují na vajíčkách či tkáňových kulturách, nebo se hledá antigen •V serologických vzorcích se hledají protilátky Kultivační výsledek výtěru z krku s běžnou flórou Klin7 Klin9a V těchto místech pátráme po hemofilech Foto: archiv MÚ Co je potřeba vědět •Na průvodku je nutno uvést, o jaký vzorek jde, jaké vyšetření je požadováno, a případně další podstatné údaje •Mikrobiolog má právo odmítnout špatně odebraný vzorek sputa (nehnisavý, neobsahuje leukocyty, jen epitelie à jsou to sliny!!!) •Kultivace tuberkulózy trvá několik týdnů, stejně tak kultivace některých hub •U virologie a průkazů různých antigenů závisí rychlost vyšetření hlavně na organizaci práce Konec prezentace KORO 4 [USEMAP] Foto O. Z.