Analýza dat pro Neurovědy

Analýza obrazových dat

Tato kapitola je věnována praktickým ukázkám analýzy rozsáhlých obrazových dat v softwaru MATLAB. Ukázkové příkazy jsou uvedeny v souboru analyza_obrazu_ukazky.m. Obrazy mozku pacientů s Alzheimerovou chorobou a zdravých subjektů (potřebné pro zodpovězení otázek 1 - 9 v dotazníku) naleznete v souboru PacientiAD_kontroly.zip. Kovariáty (potřebné pro zodpovězení otázek 4 - 9 v dotazníku) naleznete v souboru covariates.zip. Obrazy šedých mozkových hmot pacientů se schizofrenií a zdravých subjektů (potřebné pro zodpovězení otázek 10 - 12 v dotazníku) naleznete v souboru PacientiSCHZ_kontroly.zip. Dvě funkce, které nejsou součástí základní instalace MATLABu a které budete při analýze obrazů potřebovat, naleznete v souboru Matlab_funkce.zip. Funkce pro načtení dat ve formátu NIFTI lze stáhnout zde: http://research.baycrest.org/~jimmy/NIfTI/. Všechny zazipované složky je nutné po stáhnutí rozbalit.

Následující