ZÁKLADY KLINICKÉ MIKROBIOLOGIE M.Hanslianová OKM FN Brno ¡ Klinická mikrobiologie- poskytuje servis vyšetření klinickým lékařům v úzké spolupráci s nimi!! ¡ Konzultace mikrobiologického nálezu ¡ Konzultace antibiotické terapie ¡ Vzájemná komunikace!! ¡ Nález primárního patogena- většinou jednoznačná situace ¡ Nález oportunního patogena- nutná komunikace s klinikem!! častější situace Běžná mikroflóra lidského těla • Kůže- grampozitivní a anaerobní mikroflóra- koaguláza negativní stafylokoky (S.epidermidis), anaerobní propionibakteria (rezidentní), S.aureus (transientní) Nákazy projevující se na kůži, nejčastější patogeny ¡ Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, anaerobní baktérie ¡ Pseudomonas aeruginosa u popálených ¡ Bradavice ¡ Virové exantematické infekce ¡ Dermatomykózy Běžná mikroflóra lidského těla • Dutina ústní- nepatogenní viridující streptokoky,beta hemolytické streptokoky,neisserie, hemofily vč. H.influenzae,S.aureus,četné anaeroby(bakteroidy, aktinomycety,trepone-my,peptokoky..) Nejčastější patogeny, tonsilofaryngitidy ¡ Streptococcus pyogenes,příp. jiné beta hemolytické streptokoky,Arcanobacterium haemolyticum,pneumokoky, gonokoky vzácně,etiologická úlohy H.influenzae a S.aureus sporná!! ¡ Tonzilitidy u viróz- EB viry,adenoviry,coxsackieviry Arcanobacterium haemolyticum ¡ Mykotické infekce dutiny ústní u oslabených pacientů ¡ Gramnegativní mikroby se ve většině případů jako původci infekcí dutiny ústní neuplatňují!!! Běžná mikroflóra lidského těla • Nos- koaguláza negativní stafylokoky,difteroidy,alfa hemolytické streptokoky,S. aureus S.pneumoniae, B.catarrhalis zejména u dětí Nejčastější patogeny ¡ Respirační viry!! (rhinoviry, koronaviry…) Běžná mikroflóra lidského těla • Larynx- může se kultivovat podobná mikroflóra jako z nosohltanu • Dolní cesty dýchací- fyziologicky bez mikrobů Nejčastější patogeny ¡ Larynx, trachea- H.influenzae, Corynebacterium diphtheriae, viry (chřipka, parainfluenza, RS viry, adenoviry) Nejčastější patogeny ¡ Plíce- pneumonie Ø Komunitní pneumonie (CAP)- S.pneumoniae, H.influenzae, S.aureus,Kl. pneumoniae u starých pacientů Ø Nosokomiální pneumonie (HAP)- enterobaktérie, Ps.aeruginosa, S.aureus (včetně MRSA) Ø V obou případech se uplatňují mikroby vyvolávající tzv. atypické pneumonie- Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila Ø Virová etiologie!! (influenza A,B, parainfluenza, RS viry…) ¡ Tři čtvrtiny respiračních infekcí jsou vyvolány viry!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! Běžná mikroflóra lidského těla • GIT- osídleno zejména tlusté střevo,v 1g stolice asi 10 na 12 mikrobů zejména anerobní tyčinky a koky, E.coli enterokoky,ostatní enterobaktérie kandidy,komenzální prvoci Nejčastější patogeny ¡ Salmonely ¡ Shigely ¡ Campylobactery ¡ Yersinie ¡ Vibrio cholerae ¡ Aeromonas, plesiomonas ¡ Některé kmeny E.coli (enteropatogenní, enterotoxické, enteroinvazivní, enterohemoragické) ¡ Virová etiologie ( rotaviry, adenoviry, koronaviry, astroviry, noroviry) ¡ Parazity- Giardia lamblia, Cryptosporidium parvum ¡ Etiologická úloha příslušníků normální mikroflóry při vzniku průjmů je nejistá (endogenní superinfekce u oslabených pacientů) ¡ Clostridium difficile Běžná mikroflóra lidského těla • Urogenitální trakt-zevní ústí uretry- laktobacily, koaguláza negativní stafylokoky,enterokoky viridující koky močové cesty a močový měchýř za normálních podmínek sterilní poševní sliznice- osídlena mikroflórou měnící se v závislosti na hormonální situaci dospělé ženy-lactobacillus,stafylokokyenterokoky, enterobaktérie,anaeroby mykoplasmata, ureoplasmata…. Nejčastější patogeny- uroinfekce ¡ E.coli- 70-80% všech uroinfekcí (často hemolytické kmeny) ¡ Enterococcus faecalis, faecium(obtížná atb terapie) ¡ Streptococcus agalactiae ¡ Ostatní enterobaktérie (proteus, klebsiely,serratie) ¡ Chlamydie (uretritidy, prostatitidy) Nejčastější patogeny- STD • Klasické venerické infekce: ü Neisseria gonorrhoeae (kapavka) ü Chlamydia trachomatis ü Treponema pallidum (syfilis) ü Haemophilus ducreyi (ulcus molle) ü Calymmatobacterium granulomatis (granuloma inguinale) • Ostatní sexuálně přenosné choroby ü Streptococcus agalactiae ü enterokoky ü anaeroby, zejména Gardnerella vaginalis (bakteriální vaginóza) ü méně často enterobaktérie ü Virová etiologie- HIV, HSV, HPV ü candidy ü parazitární- Trichomonas vaginalis Další fyziologicky sterilní místa ¡ Likvor (ochrana CNS lebkou a hematoencefalickou bariérou) ¡ Krev Neuroinfekce ¡ Průnik infekce do CNS: ü Hematogenní cestou (meningokoky) ü Per continuitatem ze sousedních orgánů (pneumokoky, hemofily) ü Podél nervů (virus vztekliny) ü Po poranění lebky 1) Purulentní meningitidy 2) Aseptické meningitidy ¡ Nejčastěji enteroviry (echoviry, coxsackieviry) ¡ Herpes simplex, varicella-zoster ¡ Virus klíšťové encefalitidy ¡ Parotitida ¡ Vzácně mykotická nebo tuberkulózní etiologie 3) Encefalitidy ¡ Prakticky jen virová etiologie- klíšťová meningoencefalitida, herpes simplex, enteroviry, parotitida 4) Mozkový absces ¡ Bakteriální původ ¡ Většinou smíšená aerobní a anaerobní mikroflóra ¡ S.aureus, beta hemolytické streptokoky, enterokoky, méně enterobaktérie ¡ Parazitární absces (cysticerkóza, echinokokóza) ¡ Vzácně mykotické abscesy Septické stavy ¡ Sepse =systémová odpověď organismu na infekci charakterizovaná orgánovým selháním a hemodynamickými změnami ¡ Sepse těžká sepse septický šok ¡ Může být vyvolaná jakýmkoliv mikrobem ¡ Nutná komplexní léčba pacienta!! ¡ Důležité včasné podání antibiotik!! Děkuji za pozornost