P11 Bakteriální biofilm K nastudování: Biofilm (z učebnic, www atd.) Z jarního semestru: Mikroskopie, Kultivace, Biochemická identifikace, stanovení citlivosti k antibiotikům Úkol 1: Mikroskopie orálního biofilmu Sterilní špachtlí setřete si zubní plak. Natřete na dvě podložní skla a fixujte je. První sklo obarvěte podle Grama, druhé obarvěte alciánovou modří (barvivo selektivně se vážící na polysacharidy). Fixovaný preparát polijte alciánovou modří a barvěte asi 5 minut, poté sklo lehce opláchněte, opatrně osušte a kápněte kapku parafinového oleje. Popište a zakreslete sledované útvary. Všímejte si shluků bakterií a v preparátu barveném alciánovou modří obarvené extracelulární polysacharidové substance (v preparátu barveném Gramem je neuvidíte) Gramovo barvení Alciánová modř Úkol 2: Vliv čištění zubů na orální biofilm Vypláchněte si ústa roztokem předloženého barviva dle pokynů vyučujícího a prohlédněte. Zbarvená místa jsou pokryta biofilmem. Popište místa, kde se biofilm usazuje nejvíce, případně kde nebyl biofilm odstraněn při čištění zubů. Poté si zuby vyčistěte, máte-li čím. Výsledek: Biofilm se nejvíce usadil na těchto místech: ______________________________________ __________________________________________________________________________________ Úkol 3: Průkaz mikrobů kolonizujících katétry a) Kvalitativní metoda pomnožení v bujonu Vytažený centrální venosní katétr (CVK) byl ponořen do kultivačního média a kultivován 24 hodin. Poté bylo zakalené kultivační médium vyočkováno na krevní agar. Zhodnoťte nárůst mikroorganismů na krevním agaru. b) Semikvantitativní metoda (Makiho metoda) Vytažený CVK byl válen po povrchu krevního agaru, který byl poté kultivován. Zhodnoťte nárůst mikroorganismů a spočítejte narostlé kolonie. Za signifikantní se považuje množství kolonií >15, menší množství je možno považovat za kontaminaci. Je-li kolonií evidentně více než 100, nepočítejte a napište „> 100“. c) Kvantifikace pomocí sonifikace katétru Vytažený CVK se ponoří do 10 ml fyziologického roztoku a poté vystaví účinku ultrazvuku, který rozrušuje strukturu biofilmu a jednotlivé bakteriální buňky tak z biofilmu uvolňuje. 100 mikrolitrů takto vzniklé suspenze se naočkuje přímo na krevní agar a rozočkuje sterilní kličkou po celém povrchu krevního agaru. Dle pokynů vyučujícího proveďte metodu sonifikace katétru. Naočkované krevní agary umístěte do termostatu do 37 °C. Na připravené Petriho misce spočítejte množství kolonií narostlých na krevním agaru a vypočítejte počet bakterií adherujících na povrch katétru. Je-li kolonií evidentně více než 100, napište „> 100“. Výsledky: 3a 3b 3c Odhad počtu mikrobů Kterým z uvedených postupů je možno detekovat a kvantifikovat bakterie nejen z biofilmu přítomného na povrchu katétru, ale i v jeho lumen? _________________________________________________ __________________________________________________________________________________________ Které metody umožňují kvantifikovat množství bakterií adherovaných na povrchu katétru? __________________________________________________________________________________________ Jaký má smysl kvantifikace mikroba izolovaného z katétru? _______________________________ Úkol 4: Vliv přítomnosti sacharidů na dynamiku růstu biofilmu Do jednotlivých důlků mikrotitrační destičky obsahující BHI médium doplněné 0 %, 2 %, 4 %, 8 % glukózy byl inokulován kmen Streptococcus mutans. Po 2, 8, 16, 24 hodinách kultivace při 37 °C byly příslušné důlky třikrát promyty. Vrstva vytvořeného biofilmu, která zůstala pevně adherovaná na stěnách jamek mikrotitrační destičky, byla obarvena 20minutovým působením genciánové violeti. Přebytečné barvivo bylo odstraněno z jamek opatrným promytím. Intenzita zbarvení jamek se měří spektrofotometrem a odpovídá tloušťce vytvořené biofilmové vrstvy. Na přiloženém papíře jsou výsledky spektrofotometrického měření intenzity zbarvení důlků. Z předložených výsledků sestrojte prostorový graf dynamiky tvorby biofilmu v závislosti na čase a koncentraci glukózy. (Pro každou koncentraci a čas je změřeno šest důlků, vyberte vždy hodnotu přibližně průměrnou, není nutno počítat průměr přesně.) Průměrné hodnoty* 2 h 8 h 16 h 24 h 0 % 2 % 4 % 8 % * hodnoty absorbance, přibližný průměr ze všech šesti důlků, které byly podrobeny stejné koncentraci glukózy po stejný čas Jak ovlivňuje doplnění média glukózou tvorbu biofilmu? Úkol 5: Citlivost biofilmpozitivních mikrobů k antimikrobiálním látkám (srovnání planktonické a biofilmové formy mikroba) V destičce č. 1 je stanovena MIC pro planktonickou formu S. epidermidis. Stejný kmen byl kultivován tak, aby vytvořil biofilm na stěnách důlků mikrotitrační destičky. Na tento biofilm poté působila antibiotika ve stejných koncentracích jako v destičce č. 1. Po 18 hod. působení byla antibiotika odstraněna a do důlků bylo přidáno kolorimetrické médium (destička č. 2) Přítomnost živých bakteriálních buněk vede ke změně barvy tohoto média (z červené na žlutou). Dle přiložených interpretačních tabulek zjistěte MIC pro planktonickou formu a koncentrace antibiotik schopných zasáhnout buňky v biofilmu a tak je eradikovat (minimální biofilm eradikující koncentrace, MBEC). Pokud jsou v případě MBEC všechny důlky žluté, zapište u MBEC např. „> 1024“, bude-li 1024 mg/l největší koncentrace daného antibiotika ve druhé destičce. Antibiotikum S. epidermidis – planktonická forma S. epidermidis – růst v biofilmové formě MIC MBEC