Téma 3 Přehled klinicky nejvýznamnějších bakterií 3.0 Úvod Smyslem této a následující kapitoly je, abyste měli základní přehled systematického rozdělení bakterií (a virů), a abyste při probírání infekcí jednotlivých orgánových soustav měli alespoň základní představu o jejich zařazení a rozdělení. Základní znalosti budou vyžadovány i u zkoušky. 3.1 Nejdůležitější grampozitivní koky 3.1.1 Staphylococcus Grampozitivní koky uspořádané zpravidla do malých či větších shluků · Staphylococcus aureus („zlatý stafylokok“) – výrazný patogen, způsobuje hnisavé záněty kůže, ale i abscesy ve tkáních, případně i další infekce (například záněty plic) · koaguláza-negativní stafylokoky, které nacházíme na kůži za fyziologických okolností, ale mohou způsobovat i močové infekce a infekce krevního řečiště. 3.1.2 Streptococcus Grampozitivní koky uspořádané zpravidla do řetízků, ale někdy (pneumokok) i do dvojic · hemolytické (betahemolytické) streptokoky o S. pyogenes neboli „streptokok skupiny A“ – způsobuje angínu, spálu, spálovou angínu, flegmóny ve tkáních, záněty fascií – fasciitidy („masožravý streptokok“) o S. agalactiae neboli „streptokok skupiny B“ – způsobuje močové infekce, infekce pohlavních orgánů a také novorozence (od matky) o takzvané „non-A-non-B“ streptokoky – způsobují např. nespecifické záněty hrtanu · viridující (alfahemolytické) streptokoky o S. pneumoniae = pneumokok – způsobuje záněty středního ucha, dutin (sinusitidy), záněty plic, mozkových blan, ohrožení jsou lidé, kteří přišli o slezinu o takzvané „ústní“ streptokoky – dnes se ještě dělí do velkého počtu podskupin. Všechny se mohou vyskytovat v ústní dutině, jejich úloha je tam ale sporná (kdy se podílejí například na zubním kazu, a kdy jsou neutrální či prospěšné). Více o této skupině je uvedeno v tématech 12 a 13. · málo významné streptokoky bez hemolýzy (gamahemolytické) 3.1.3 Enterococcus Enterokoky byly dříve považovány za pouhou skupinu streptokoků. Tvoří krátké řetízky. Nejvýznamnější druhy jsou Enterococcus faecalis a E. faecium – oba dva jsou normálním nálezem ve střevě, ale způsobují močové infekce, někdy i sepse a další nákazy Zajímavost: existuje „moravský“ enterokok E. moraviensis, objevený brněnskými badateli. 3.2 Nejdůležitější grampozitivní tyčinky 3.2.1 Listeria Nejdůležitější druh je Listeria monocytogenes, způsobuje většinou bezpříznakové nákazy, ale nebezpečná je pro těhotné ženy. Zdrojem jsou sýry, sýrové saláty apod. 3.2.2 Corynebacterium · Corynebacterium diphtheriae – původce záškrtu · kožní druhy korynebakterií – prakticky nepatogenní, vzácně ale způsobují sepse 3.2.3 Bacillus Tato grampozitivní tyčinka je sporulující, tj. tvoří spory. Významný je · Bacillus anthracis – původce anthraxu (uhláku), možný nástroj bioterorismu · Bacillus cereus – způsobuje enterotoxikózy hlavně z potravin z mouky · Ostatní bacily se v klinickém materiálu zpravidla najdou jako kontaminace z okolí 3.2.4 Nocardia Je to větvená tyčinka způsobující nokardiózu (podobné aktinomykóze, viz dále) 3.2.5 Grampozitivní tyčinky a oko Listeria monocytogenes a Corynebacterium diphtheriae patří mezi ty vzácné bakterie, které jsou schopné proniknout skrz neporušenou rohovku, dochází k tomu ale spíše vzácně. Výjimečně, u oslabených osob, mohou infekce rohovky způsobit i zástupci rodu Bacillus. 3.3 Nejdůležitější gramnegativní koky: 3.3.1 Neisseria · N. gonorrhoeae – „gonokok“ – původce kapavky · N. meningitidis – „meningokok“ – i zdraví ho mohou mít v krku, ale způsobuje zápaly mozkových blan s velice rychlým průběhem, často končící smrtí po několika hodinách. Gonokok i meningokok jsou uspořádány ve dvojicích. · Takzvané „ústní“ neisserie – navzdory názvu jsou spíše než v ústní dutině normálně přítomny v krku (v hltanu). Patogenní působení (mimo tato místa) je vzácné. 3.3.2 Moraxella – podrody Branhamella a Moraxella · Moraxella (Branhamella) catarrhalis – infekce HCD (ale i bezpříznakově v krku) · Moraxella (Moraxella) lacunata a podobné – oční infekce 3.4 Nejdůležitější gramnegativní tyčinky 3.4.1 Enterobakterie Jde o bakterie, které mají vztah ke střevu člověka a jiných obratlovců. Patří mezi nejvýznamnější klinicky významné bakterie, zároveň jsou ale významné i pro jiné oblasti mikrobiologie než je ta klinická. Lze je rozdělit například podle patogenity (viz kapitola 1.4.2): · Obligátně patogenní enterobakterie (způsobující nemoci běžně) o Salmonella – antropopatogenní (lidské) typy způsobují tyfus a paratyfy (sepse) o Salmonella – zoopatogenní (zvířecí) způsobují průjmové nemoci – salmonelózy o Shigella – způsobuje jinou průjmovou nemoc, tzv. bacilární úplavici o Yersinia pestis – původce moru o Yersinia enterocolitica, Y. pseudotuberculosis – původci průjmových nemocí · Oportunně patogenní enterobakterie (za normálních okolností se vyskytují ve střevě zdravých osob, jako náhodný nález je nacházíme i v ústní dutině) o Escherichia coli – nejběžnější, přítomná ve střevě, ale patogen v močových cestách i jinde, některé serovary nebezpečné i ve střevě o Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Proteus, Providencia, Morganella, Serratia – podobná charakteristika jako E. coli, některé (Klebsiella, Serratia) často způsobují nozokomiální (nemocniční) infekce · Nepatogenní enterobakterie existují, ale nemají význam pro člověka 3.4.2 Gramnegativní nefermentující tyčinky · Pseudomonas aeruginosa – způsobuje popáleninové infekce, nozokomiální infekce, zápaly plic u dětí s cystickou fibrózou, ale nález může být i kontaminace z prostředí · Acinetobacter, Burkholderia, Stenotrophomonas – podobná charakteristika jako u Pseudomonas aeruginosa Poznámka: Acinetobacter je spíš kokotyčinka až kok, ne tyčinka, ale z praktických důvodů bývá řazen sem. 3.4.3 Ostatní gramnegativní tyčinky: · Haemophilus (H. influenzae, H. parainfluenzae) – přítomen v dýchacích cestách i u zdravých, může ale působit infekce dýchacích cest. Haemophilus influenzae serovar b způsobuje vzácně zánět příklopky hrtanové a může způsobovat záněty mozkových blan, hlavně u batolat; v poslední době toho všeho ubylo, díky očkování. Haemophilus parainfluenzae je velmi běžná bakterie v hrtanu i v ústní dutině. Považuje se za součást běžné mikroflóry, i když při přemnožení se snad i podílí na infekcích · Pasteurella – nachází se v psích tlamách a infikuje rány po pokousání psem · Campylobacter – původce průjmových onemocnění (podobné jako salmonelóza, ale zdrojem je spíš kuřecí maso než vajíčka) · Helicobacter – podílí se na vzniku žaludečních vředů · Vibrio – nejvýznamnější je Vibrio cholerae, původce těžkého průjmu – cholery, dnes spíše mimo Evropu; další druhy vibrií a příbuzných aeromonád způsobují také průjmy, nebo také infekce ran např. při kuchání ryb · Legionella – původce legionářské nemoci (dýchací infekce seniorů, z vody a klimatizace) · Bordetella – význam má především Bordetella pertussis a Bordetella parapertussis, původci dávivého kašle · Francisella – především Francisella tularensis, původce tularémie neboli zaječího moru 3.5 Nejdůležitější anaeroby: 3.5.1 Clostridium Jsou to grampozitivní sporulující tyčinky. Ve stádiu spory vydrží i v prostředí s kyslíkem. · C. tetani – původce tetanu (produkuje tetanické toxiny) · C. botulinum – původce botulismu (produkuje botulotoxin – „klobásový jed“) · C. difficile – jeho toxin způsobuje enterotoxikózu, především po léčbě širokospektrými (hlavně linkosamidovými) antibiotiky · C. perfringens a jiná tzv. „klostridia plynatých snětí – působí plynatou sněť a enterotoxikózy. 3.5.2 Actinomyces Jsou to grampozitivní dlouhé tyčinky až větvená vlákna – způsobuje aktinomykózu (pozor, neplést s houbovou infekcí – mykózou). Aktinomycety se běžně vyskytují v ústní dutině a podílejí se na patogenních procesech nejen zde (viz kapitoly 13 a 14), ale i v měkkých tkáních v okolí (tkáně krku) i jinde (například v oblasti hrudníku). Tradičně se aktinomycety považují za anaeroby, ale ve skutečnosti jsou mikroaerofilní. Ovšem nízká množství kyslíku v nedokonale anaerobním prostředí běžných anaerobních boxů mikrobiologických laboratoří jim vyhovují. 3.5.3 Ostatní anaeroby Většinou působí ve směsi. Jejich názvy nejsou zvlášť důležité. Mohou to být grampozitivní tyčinky (Propionibacterium) či koky (Peptococcus), nebo také tyčinky (Bacteroides, Prevotella, Fusobacterium) či koky (Veillonella) gramnegativní. Anaerobní bakterie se běžně vyskytují v ústní dutině; nejdůležitější jsou zde rody Prevotella a Porphyromonas. Za zvláště významnou se považují bakterie Porphyromonas gingivalis a Tanerella forsythia, které jsou součástí takzvaného červeného komplexu (red komplex); tento komplex zahrnuje bakterie, které jsou pravděpodobně velmi rizikové z hlediska onemocnění závěsného aparátu zubů. 3.6 Nejdůležitější spirochety: 3.6.1 Treponema Nejvýznamnější je druh T. pallidum – původce syfilis (pohlavně přenosná celková nemoc). Z hlediska orální mikrobiologie je velmi významným druhem Treponema denticola, která je třetím druhem z trojice, podílející se na „červeném komplexu“. 3.6.2 Borrelia Patří sem druh B. burgdorferi sensu lato, který se rozpadá na několik druhů „v užším slova smyslu“, u nás se vyskytuje hlavně B. afzelii a B. garinii. Všechny tyto druhy jsou původci lymeské boreliózy (klíšťaty přenášená infekce, projevující se v počátečních stádiích červenými skvrnami a postihující hlavně nervovou soustavu, případně klouby) 3.6.3 Leptospira Je to původce leptospirózy (infekce ran či dýchacích cest, zpravidla od potkanů a jiných hlodavců, člověk se nakazí přímým kontaktem nebo konzumací potřísněných potravin) 3.7 Nejdůležitější z ostatních bakterií: 3.7.1 Mykobakteria Tyto bakterie mají atypickou buněčnou stěnu, obsahující vosky; špatně na ně proto působí všechno, co je rozpuštěno ve vodě (kyseliny, louhy, barviva, běžná antibiotika, mnohé desinfekční prostředky). Takovým bakteriím říkáme acidorezistentní. Částečně acidorezistentní jsou i aktinomycety a nokardie. · M. tuberculosis – původce tuberkulózy (TBC mohou vzácně způsobovat i jiné druhy) · M. leprae – původce lepry (nemoc, která stále ohrožuje obyvatelstvo tropů) · Atypická mykobakteria mohou způsobovat různé typy infekcí, především infekce ran například u akvaristů, plavců a podobně · Nepatogenní mykobakteria se nacházejí na různých místech těla (například M. smegmatis v předkožkovém vaku muže). Některá mykobakteria se podílí i na ústním biofilmu. 3.7.2 Mykoplasmata (a ureaplasmata) Tyto bakterie vůbec nemají buněčnou stěnu. Jejich diagnostika je obtížná, také léčbu je nutno přizpůsobit nepřítomnosti buněčné stěny · M. pneumoniae způsobuje atypické záněty plic · M. hominis a U. urealyticum jsou přítomny na pohlavních orgánech, jejich vztah k onemocnění je však nejistý, protože jsou často přítomny i u zdravých 3.7.3 Rickettsie a chlamydie Potřebují k životu cizí buňku. To znamená, že i diagnostika je podobná diagnostice virů. · Chlamydophila pneumoniae – další původce atypického zápalu plic · Chlamydophila psittaci – způsobuje ptačí nebo papouščí nemoc · Chlamydia trachomatis – patogenita se liší podle serovarů. Některé způsobují tropickou slepotu (trachom), jiné tropickou pohlavní nemoc (lymphogranuloma venereum) a další pohlavní infekce ve vyspělých zemích · Rickettsia prowazeki je původcem skvrnitého tyfu · Rochalimea, Ehrlichia jsou příbuzné rickettsiím. Způsobují rozličné nemoci, často přenášené členovci. Totéž platí pro rody Bartonella a Coxiella,o kterých dnes již víme, že rickettsiím příbuzné nejsou (ale některými vlastnostmi se jim podobají)