Mikrobiologický ústav MUMikrobiologický ústav MU, Brno, Brno Vladana WoznicováVladana Woznicová Miroslav VotavaMiroslav Votava Ondřej ZahradníčekOndřej Zahradníček Klinická mikrobiologieKlinická mikrobiologie Zubní lékařství - podzim 2016Zubní lékařství - podzim 2016 Původci respiračních infekcíPůvodci respiračních infekcí Význam respiračních infekcíVýznam respiračních infekcí • nejčastějšínejčastější infekce (dýchací trakt = inkubátor)infekce (dýchací trakt = inkubátor) • ekonomický dopadekonomický dopad • častéčasté epidemieepidemie • 75 %75 % (u dětí i více) působí(u dětí i více) působí viryviry LokalizaceLokalizace • klinická symptomatologie + specifická agensklinická symptomatologie + specifická agens A) Infekce HCDA) Infekce HCD a oka, ucha, dutina oka, ucha, dutin B) Infekce DCDB) Infekce DCD (dolních cest dýchacích a(dolních cest dýchacích a plic)plic) Infekce HCDInfekce HCD – infekceinfekce nosu a nasopharynxunosu a nasopharynxu – infekceinfekce oropharynxu aoropharynxu a tonsiltonsil – infekceinfekce paranasálních sinusůparanasálních sinusů – otitis mediaotitis media – conjunctivitisconjunctivitis Infekce DCD a plicInfekce DCD a plic - infekce- infekce epiglottisepiglottis - infekce- infekce larynxularynxu andand tracheytrachey - infekce- infekce bronchůbronchů - infekce- infekce bronchiolůbronchiolů • infekceinfekce plicplic Běžná flóra dýchacích cestBěžná flóra dýchacích cest • Dutina nosní:Dutina nosní: S. epidermidisS. epidermidis, koryneformní tyčinky, S. aureusS. aureus, pneumokokypneumokoky • Pharynx:Pharynx: vždyvždy neisseriae a streptokokyneisseriae a streptokoky (viridující)(viridující), obvykle hemofily, vzácněji pneumokoky, meningokoky, enterobacteriae, kvasinkykvasinky • DCDDCD sterilnísterilní, klinický materiál často kontminován flórou HCD Běžná flóra dýchacích cestBěžná flóra dýchacích cest • Dutina nosní:Dutina nosní: S. epidermidisS. epidermidis, koryneformní tyčinky, S. aureusS. aureus, pneumokokypneumokoky • Pharynx:Pharynx: vždyvždy neisseriae a streptokokyneisseriae a streptokoky (viridující)(viridující), obvykle hemofily, vzácněji pneumokoky, meningokoky, enterobacteriae, kvasinkykvasinky • DCDDCD sterilnísterilní, klinický materiál často kontminován flórou HCD Rhinitis/nasopharyngitis - ETIOLOGIERhinitis/nasopharyngitis - ETIOLOGIE • ViryViry –– „nachlazení“„nachlazení“:: – Víc než 50 % rhinoviryVíc než 50 % rhinoviry – koronavirykoronaviry – další respirační viry (ne chřipka!)další respirační viry (ne chřipka!) • BakterieBakterie:: – AkutníAkutní infekce: obvykle sekundárníinfekce: obvykle sekundární • S. aureus, H. influenzae, S. pneumoniae,S. aureus, H. influenzae, S. pneumoniae, Moraxella catarrhalisMoraxella catarrhalis – ChronickéChronické infekce:infekce: • Klebsiella ozaenae, Kl. rhinoscleromatisKlebsiella ozaenae, Kl. rhinoscleromatis Rhinitis/nasopharyngitis - LÉČBARhinitis/nasopharyngitis - LÉČBA • Nevyžaduje antibiotikaNevyžaduje antibiotika aa bakteriologické vyšetřeníbakteriologické vyšetření • Polymorfonukleáry, vysoké CRPPolymorfonukleáry, vysoké CRP  markery bakt.markery bakt. Infekce, léčba podleInfekce, léčba podle výsledků bakteriologickéhovýsledků bakteriologického vyšetřenívyšetření • Lokální terapie - nosičiLokální terapie - nosiči epidemiolgicky závažnýchepidemiolgicky závažných patogenůpatogenů - např. MRSA – mupirocin (Bactroban)- např. MRSA – mupirocin (Bactroban) Sinusitis/otitis media – ETIOLOGIESinusitis/otitis media – ETIOLOGIE • AkutníAkutní sinusitis a otitis začínají infekcemisinusitis a otitis začínají infekcemi respiračními viryrespiračními viry,, M. pneumoniaeM. pneumoniae (myringitis)(myringitis) • SekundárníSekundární pyogenní infekcepyogenní infekce:: S.S. pneumoniaepneumoniae,, H. influenzaeH. influenzae bb, Moraxella, Moraxella catarrhalis, S. aureus, S. pyogenes,catarrhalis, S. aureus, S. pyogenes, anaerobyanaeroby ((BacteroidesBacteroides,, PrevotellaPrevotella,, Porphyromonas...Porphyromonas...)) KomplikaceKomplikace: mastoiditis, purulentní meningitis: mastoiditis, purulentní meningitis Sinusitis/otitis media – ETIOLOGIESinusitis/otitis media – ETIOLOGIE • SinusitisSinusitis maxillarismaxillaris chronicachronica, sinusitis, sinusitis frontalis chronica:frontalis chronica: S. aureusS. aureus,, PeptostreptococcusPeptostreptococcus • OtitisOtitis mediamedia chronicachronica:: PseudomonasPseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilisaeruginosa, Proteus mirabilis Sinusitis/otitis media - LÉČBASinusitis/otitis media - LÉČBA • Vhodný vzorekVhodný vzorek –– punktát ze středního ucha apunktát ze středního ucha a paranasálního sinu; NE výtěr z nosu, uchaparanasálního sinu; NE výtěr z nosu, ucha (kontaminanty)(kontaminanty) • SinusitisSinusitis ATB pouze uATB pouze u bolestivé sinusitidybolestivé sinusitidy, s bolestí, s bolestí zubůzubů,, hlavy, horečkou, trvající nejmíň týden, ev. neuralgiehlavy, horečkou, trvající nejmíň týden, ev. neuralgie trigeminutrigeminu • Otitis mediaOtitis media - ATB u zánětu (bolest, zarudnutí, horečka),- ATB u zánětu (bolest, zarudnutí, horečka), když antiinflamatorní léčba nedostačujekdyž antiinflamatorní léčba nedostačuje • Aminopenicilin nebo cefalosporin 1.generaceAminopenicilin nebo cefalosporin 1.generace http://www.drgreene.org/body.cfm?xyzpdqabc=0&id=21&action=detail&ref=1285 Otitis media http://www.medem.com/Me dLB/article_detaillb.cfm? article_ID=ZZZPMV6D1AC &sub_cat=544 http://www.otol.uic.edu/rese arch/microto/Microtoscopy/ acute1.htm • Agens jako u sinusitidy Konjunktivitis - ETIOLOGIEKonjunktivitis - ETIOLOGIE • ObvykleObvykle virová,virová, u akutních infekcí HCDu akutních infekcí HCD adenovirus, enterovirusadenovirus, enterovirus - hemorrhagická conjunctivitis,- hemorrhagická conjunctivitis, HSVHSV - herpetic keratoconjunctivitis- herpetic keratoconjunctivitis • BakteriálníBakteriální a.a. Akutní:Akutní: hnisavá konjunktivitis:hnisavá konjunktivitis: S. pneumoniae, S. aureusS. pneumoniae, S. aureus inkluzní konjunkt.:inkluzní konjunkt.: C. trachomatisC. trachomatis D – KD – K b.b. Chronická:Chronická: S. aureusS. aureus,, C. trachomatisC. trachomatis A – C (trachoma)A – C (trachoma) • Alergická, mechanickáAlergická, mechanická (cizí těleso)(cizí těleso) • ObvykleObvykle topickátopická léčbaléčba Orofaryngeální infekce - ETIOLOGIEOrofaryngeální infekce - ETIOLOGIE • Akutní tonsillitis a pharyngitis:Akutní tonsillitis a pharyngitis: obvykleobvykle virovávirová (rhinoviry, coronaviry, adenoviry,(rhinoviry, coronaviry, adenoviry, EBV – inf. mononucleosis, coxsackieviry –EBV – inf. mononucleosis, coxsackieviry – herpangina)herpangina) Nejvýznamnější bakteriálníNejvýznamnější bakteriální:: S. pyogenesS. pyogenes (=(= ββ-- hemol. streptokokhemol. streptokok skupiny Askupiny A)) • Streptokoky skupiny C, F, G, pneumokoky,Streptokoky skupiny C, F, G, pneumokoky, H. influenzaeH. influenzae,, N. meningitidisN. meningitidis • Vzácné, aleVzácné, ale důležitédůležité:: Corynebacterium diphtheriae,Corynebacterium diphtheriae, Neisseria gonorrhoeaeNeisseria gonorrhoeae Orofaryngeální infekce - LÉČBAOrofaryngeální infekce - LÉČBA • Výtěr z krku u všech případůVýtěr z krku u všech případů , vč. „typické, vč. „typické tonsilitidy“tonsilitidy“ • Streptococcus pyogenesStreptococcus pyogenes -- penicilinpenicilin • Makrolidy u alergických pacientů (rezistence)Makrolidy u alergických pacientů (rezistence) • stanovení CRPstanovení CRP (marker bakteriální infekce)(marker bakteriální infekce) Tonsillopharyngitis http://medicine.ucsd.edu/Clinicalimg/He ad-Pharyngitis.htm http://www.newagebd.com/2005/sep/12 /img2.html Virová tonsillopharyngitis http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b1/Pharyngitis.jpg/250px- Pharyngitis.jpg Hnisavá bakt. tonsillitis http://www.meddean.luc.edu/lumen/MedEd/medicine/PULMONAR/diseases/pul43b.htm Epiglottitis http://health.allrefer.com/health/epiglottitis-throat- anatomy.html de.wikipedia.org/wiki/E piglottitis George Washington www.fathom.com/course/10701018/session4.html EpiglottitisEpiglottitis • Riziko udušení!Riziko udušení! • Haemophilus influenzaeHaemophilus influenzae typ btyp b - vakcinace- vakcinace Laryngitis a tracheitisLaryngitis a tracheitis RespiračníRespirační viryviry (jiné než u(jiné než u nasopharyngitis):nasopharyngitis): parainfluenza/influenzaparainfluenza/influenza AA && RSVRSV Symptomatická léčba –Symptomatická léčba – NE ATBNE ATB BakteriálníBakteriální • Chlamydophila pneumoniaeChlamydophila pneumoniae,, MycoplasmaMycoplasma pneumoniaepneumoniae, sekundární:, sekundární: S. aureusS. aureus aa HaemophilusHaemophilus influenzae,influenzae, laryngotracheitis pseudomembranosalaryngotracheitis pseudomembranosa (záškrt):(záškrt): Corynebacterium diphtheriaCorynebacterium diphtheria • Výtěr z krku obvykle bezcennýVýtěr z krku obvykle bezcenný Lagyngitis acuta http://www.emedicine.com/asp/image_search.a sp?query=Acute%20Laryngitis www.cartoonstock.com/directory/l/laryngitis.asp Bronchitis - ETIOLOGIEBronchitis - ETIOLOGIE • Akutní bronchitisAkutní bronchitis Virová: chřipkaVirová: chřipka, parainfluenza, adenoviry, RSV, parainfluenza, adenoviry, RSV Bakteriální:Bakteriální: -- sekundární: pneumokoky, haemofily, stafylokoky,sekundární: pneumokoky, haemofily, stafylokoky, moraxelymoraxely -- primární:primární: MycoplasmaMycoplasma pneumoniae,pneumoniae, ChlamydophilaChlamydophila pneumoniae,pneumoniae, BordetellaBordetella pertussispertussis • Chronická bronchitisChronická bronchitis (cystická fibrosa)(cystická fibrosa) Pseudomonas aeruginosa, Burholderia cepaciaPseudomonas aeruginosa, Burholderia cepacia Bronchitis acutaBronchitis acuta http://www.yourlungheal th.org/lung_disease/cop d/nutshell/index.cfm http://www.lhsc.on.ca/resptherapy/students/ patho/brnchit5.htm BronchiolitisBronchiolitis • Izolovaná bronchiolitida uIzolovaná bronchiolitida u novorozencůnovorozenců a kojencůa kojenců:: PneumovirusPneumovirus (=(= RSVRSV)) MetapneumovirusMetapneumovirus https://www.nlm.nih.gov PneumoniePneumonie www.medicin enet.com/pn eumonia/arti cle.htm Typy pneumoniíTypy pneumonií • Akutní – komunitní (community-acquired pneumoniaAkutní – komunitní (community-acquired pneumonia CAP)CAP) – u původně zdravých • dospělých • dětí – u oslabených – Po kontaktu se zvířaty (Pasteurella multocida, Coxiella burnetii - Q-horečka, Chlamydophila psittaci - psittakóza) • Akutní – nosokomiálníAkutní – nosokomiální pneumoniepneumonie - ventilátorové a) časné b) pozdní • Subakutní a chronické pneumonieSubakutní a chronické pneumonie PneumoniePneumonie http://www.uspharmacist.com/in dex.asp? page=ce/105057/default.htm Pneumoniae – ETIOLOGIEPneumoniae – ETIOLOGIE AkutníAkutní komunitníkomunitní • bronchopneumoniabronchopneumonia a lobární pneumonia:a lobární pneumonia: – Streptococcus pneumoniaeStreptococcus pneumoniae – S. aureusS. aureus – Haemophilus influenzaeHaemophilus influenzae typ btyp b • atypická pneumonie:atypická pneumonie: – Mycoplasma pneumoniaeMycoplasma pneumoniae – Chlamydophila pneumoniaeChlamydophila pneumoniae – Influenza A virusInfluenza A virus Pneumoniae – ETIOLOGIE IIPneumoniae – ETIOLOGIE II AkutníAkutní komunitní, u oslabenýchkomunitní, u oslabených:: – pneumokoky, stafylokoky, haemofilypneumokoky, stafylokoky, haemofily – KlebsiellaKlebsiella pneumoniaepneumoniae (alkoholici)(alkoholici) – LegionellaLegionella pneumophilapneumophila • ImunodeficicityImunodeficicity:: – Pneumocystis jiroveciiPneumocystis jirovecii – CMVCMV – atypical mycobacteriaatypical mycobacteria – Nocardia asteroidesNocardia asteroides – aspergilli, candidaeaspergilli, candidae Pneumoniae – ETIOLOGIE IIIPneumoniae – ETIOLOGIE III AkutníAkutní nosokomiální:nosokomiální: • VentilátorováVentilátorová - VAP:- VAP: – časnáčasná (do 4. dne hospitalizace):(do 4. dne hospitalizace): citlivécitlivé komunitníkomunitní kmenykmeny – pozdnípozdní (od 5. dne):(od 5. dne): rezistentnírezistentní nemocniční kmenynemocniční kmeny • DalšíDalší – viry (RSV, CMV)viry (RSV, CMV) – LegionellaLegionella Pneumoniae – ETIOLOGIE IVPneumoniae – ETIOLOGIE IV • Subakutní a chronické:Subakutní a chronické: – aspiračníaspirační pneumonie a plicní abscespneumonie a plicní absces • PrevotellaPrevotella melaninogenicamelaninogenica • BacteroidesBacteroides fragilisfragilis • peptokoky apeptokoky a peptostreptokokypeptostreptokoky – plicní tuberkulóza a mykobakteriózyplicní tuberkulóza a mykobakteriózy • Mycobacterium tuberculosisMycobacterium tuberculosis • Mycobacterium bovisMycobacterium bovis • atypická mykobaktériaatypická mykobaktéria BronchopneumoniaBronchopneumonia www.szote.u-szeged.hu/radio/mellk1/amelk4a.htm See the inhomogenous shadow in the lower and middle lobes of the right lung Lobární a lobulární pneumonie www.supplementnews.org/ pneumonia Infekce plic - vyšetřeníInfekce plic - vyšetření • Klinické vyšetření a RTG, rozlišení klasická×Klinické vyšetření a RTG, rozlišení klasická× atypická pneumonieatypická pneumonie • Klasická pneumonie -Klasická pneumonie - sputumsputum, krev =, krev = hemokultura,hemokultura, Ag pneumokoka v močiAg pneumokoka v moči • Atypická pneumonie -Atypická pneumonie - serologieserologie - mykoplasma a- mykoplasma a chlamydophila (+ „virologický screening“).chlamydophila (+ „virologický screening“). • Nemocniční pneumonieNemocniční pneumonie LegionellaLegionella – Ag v moči– Ag v moči Bronchitis a pneumonie - léčbaBronchitis a pneumonie - léčba • CAPCAP amoxicilinamoxicilin + ev. makrolid+ ev. makrolid • Atypická pneumoniaeAtypická pneumoniae tetracyklin nebotetracyklin nebo (děti < 8)(děti < 8) makrolidymakrolidy • Kombinovaná terapieKombinovaná terapie • U nemocničníchU nemocničních infekcí -infekcí - citlivostcitlivost - rezistence!- rezistence! • TB kombinační terapieTB kombinační terapie Gerrit Dou (1613 - 1675)Gerrit Dou (1613 - 1675) LékařLékař