Definice
Mikrobiom
u člověka Doc. MUDr. Jan Šimůnek, CSc.
Ústav ochrany a podpory zdraví
5. prosince 2017
n      9       -       »       S *)<KQ-
Význam mikrobiomu
Dlouhodobě známé účinky
► Ochrana před napadením konkurenční mikroflórou superinfekce
► Tvorba některých biofaktorů vitamín K
► Podíl na trávení
► Podíl na rozkladu potu a kožního mazu tělesný pach
► Podíl na přítomnosti / nepřítomnosti některých chorob minimálně zubní kaz, žaludeční a dvanáctníkové vředy, chrinická onemocnění střev vč. nádorů
n      a       -       -      < Dít*
Fenomén superinfekce
Pozorován po léčbě širokospektrými antibiotiky
Velmi závažné infekce „exotickou" mikroflórou (vč. virů), často
fatální
Co není sterilní
► Celé GIT
► Kůže
► Horní cesty dýchací
► Ucho po bubínek
► Ženský genitál od krčku děložního po vulvu
► Ústí mlékovodů
Několik procent hmotnosti lidského těla, avšak kolem 90 % počtu buněk představují buňky symbiotických bakterií
► Vedle toho existují v lidském organismu viry (jak pro lidské buňky, tak i pro buňky symbiotických bakterií). Některé z nich existují jako úseky DNA, navázané na DNA plnohodnotných buněk.
► Dále prvoci, minimálně 30 - 60 % lidí nosí toxoplasmy, ovlivňující chování.
► Některé kvasinky a vláknité houby
► Sporné jsou nanobakterie.
□      9      -      »      S -O^O
Význam z hlediska potravinářského
► Je nesterilní vše, čeho se dotkla lidská ruka bez speciálních opatření (chirurgické mytí a desinfekce)
► Indikátorová mikroflóra jako signál
>■ Nenáležitého zacházení s potravinou / surovinou v době přípravy (může být zavlečeno z předchozích stupňů přípravy surovin viz:
„Mikrobiologický obraz koření připomíná mikrobiologický obraz sušené lidské stolice" >■ Nenáležitého zacházení následujícího (indikátorová mikroflóra se pomnožila)
Co je na lidském organismu sterilní
► Spojivkový vak (proud slz, lysozym, pohotovost k uvolňování imunitních buněk)
► Močové ústrojí (až po ústí uretry, u žen osazovaného vaginální mikroflórou), někdy jsou na konci močové trubice i jiné nepatogenní bakterie
Přítomnost vaginální mikroflóry v moči u dospělé ženy může být použita jako indikátor korektního provedení mikrobiologického vyšetření moče
► Dolní cesty dýchací
► Střední ucho
► Mužský genitál
► Vnitřní prostředí organismu
Vývoj v čase
1. Sterilita před narozením - výskyt mikrobů v plodu = patologie
Využití Sterilní porod při očekávání vrozených těžkých
defektů imunity „děti v bublině".
Sterilní porody u experimentálních zvířat.
2. Kontaminace kožní mikroflórou + mikroflórou genitálu během porodu
3. Osídlování GIT
* Během kojení
>■ Přechodem na „dospělou" stravu •■ Ovlivnění další dietou, terapií apod.
n      9       -       »       1 ^Q.C*
n      9       ~       »       1 O<K0-
Osídlení kůže
Dýchací ústrojí
celkový počet bakterií je ± srovnatelný s počtem buněk v těle
dominuje Staphylococcus epidermidis následují streptokoky a G+ tyčky („difteroidy") Propionobacterium acne v mazových žlázách densita stoupá v místech s vlhkou zapářkou až o 4 řády v lezích bývá Staphylococcus aureus
Nosní dírky podobne jako kůže, k tomu ještě Branhamella catarrhalls a Haemophyllus Influensae
Průchody nosní - difteroidy + záchyt mikrobů ze vzduchu, především vázaných na prach
Paranasální dutiny by měly být téměř či zcela sterilní Nosohltan Proti nosním dírkám navíc Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes a u části populace Neisseria meningitidis
Urogenital
Usta
Močové cesty jsou až na sám konec sterilní, na konci bývají G+ koky a Corynebacterium sp., případně mycoplasmata
Zevní genital Mycobacterium smegmatis Pochva Lactobacillus sp. (Dordeleinův bacil), také kvasinky, difteroidy a mycoplasmata. Četnost a zastoupení druhů reagují na cyklus
Pochva dětská a v seniu - jako kůže v oblasti vlhké zapářky (funkce hymenu)
Densita cca 107.g~1 viridující streptokoky Neisseria sp. laktobacily mikrokoky
nehemolyzující streptokoky
možnost patogenů ve výměšcích slinných žláz (vzteklina)
Jícen
Žaludek
Jen zavlečená mikroflóra, nemá vlastní
Problémy spojené s Helicobacter pylori, jinak většina bakterií zavlečená s potravou hyne (přežití některých bakterií z fermentovaných výrobků)
Tenké střevo
Tlusté střevo a konečník
Vysoké density druhů Bacteroides sp., bifidobakterie, kvasinky, enterobakterie, laktobacily. Rovněž neznámé druhy, nepěstovatelné, známe jen fragmenty DNA. Do vývodných cest žlučníku a pancreatu mohou proniknout bakterie z rodu Enterobacteriaceae, přičemž významné je přežívání druhů Salmonella typhi a S. Paratyphi- podklad vzniku tyfového bacilonosičství
Laktobacily, bifidobakterie, některé streptokoky, enterobakterie, Candida albicans
99% + jsou striktní anaerobi Bacteroides, Fusobacterium, Clostridium, Peptostreptococcus a Eubacterium sp.
n      9       -       »       1 O<K0-
Střevní viry
Relativně nově objevené funkce
Pomocí analýzy DNA a RNA byly nalezeny genomy četných virů, parazitujících na rostlinách. Nemělo by jít jen o viry požité s potravou, ale o viry množící se v lidských buňkách a střídající člověka a rostlinu jako hostitele.
Likvidace prionů Vztah k obezitě Vztah k diabetu
Zubní kaz
Toxoplasma
Bakterie schopné:
► Vytvářet plak
► Vytvářet kyseliny pod vrstvou plaku a rozpouštět sklovinu
Popsáno u člověka
Výrazně vyšší prevalence chronické infekce u obětí dopravních úrazů
Známo o zvířatech
Výrazně vyšší pravděpodobnost sežrání predátorem
Střevní dysmikrobie
Ovlivnění mikroflóry střeva
Výpadky vitamínu K
Chronické potíže typu zácpy a průjmu (případně chaotické střídání obou stavů)
Chronické záněty s akutními exacerbacemi Vztah k nádorům, především kolorektální CA Řešení výživou, vč. přirozených zdrojů bakterií ve výživě (fermentované potraviny)
Někdy (řešení akutních potíží) „transplantace" střevního obsahu
Složení stravy - zavlečení bakterií Složení stravy - probiotika
Antibiotika - především dlouhá léčba, dříve problém reziduí antibiotik
Umělá sladidla (nová záležitost)
Výskyt ATB rezistentních bakterií
Kožní problémy
Krátkodobé podávání ATB Ovlivní, ale málo a krátkodobě
Dlouhodobé podávání ATB Ovlivní silně
Dlouhodobý kontakt s bakteriemi Ovlivní rovněž významně
Dysmikrobie kůže v souvislosti s pubertou / seniem
Rozklad lipidů na těkavé substance - podíl na tělesném pachu
„Nemoci z nadměrného mytí"
Periorální dermatitída (především nadužívaní kosmetiky spolu s kortikoidy)
n      9       -       »       1 O<K0-
Děkuji vám za pozornost