je souhrnné označení pro určení exprese významných proteinů a receptorů v nádorových buňkách. Imunohistochemicky se stanovují například následující markery:

-         markery proliferace a její regulace: Ki-67, p53

-         hormonální receptory: estrogenové a progesteronové receptory (karcinom prsu), receptory pro androgeny (karcinom            prostaty)

-         receptory významné pro terapii: HER-2/neu (karcinom prsu)