Seznam výzkumných témat pro studenty 1. r. P-PooL v AR 2022-23
Ústav /
klinika
Č. Téma Anotace Školitel
BiofyzikálníústavLF
1 Bezkontaktní termografie v
oblasti péče o lidské zdraví
Bezkontaktní termografie (IRT) je jednou z moderních a stále se dynamicky rozvíjejících neinvazivních zobrazovacích
metod. Svojí podstatou umožňuje kvalitativní i kvantitativní popis povrchových teplot studovaných objektů, lidské tělo
nevyjímaje. V rámci navrženého tématu bude zájemci z řad studentů blíže zpřístupněna termografická technika a
student bude aktivně zapojen do experimentální práce termografického výzkumného týmu, včetně publikační aktivity.
Jedním z recentních nosných témat výzkumu je studium možnosti využití bezkontaktní termografie v oblasti střevní
anastomózy a přidružených chirurgických zákroků (spolupráce s Chirurgickou klinikou FN Brno), či při měření změn
povrchových teplot po emocionálních stimulech (spolupráce s Ústavem psychologie a psychosomatiky LF MU). Cílem
plánovaných studií je nalézt limity této zobrazovací metody a optimalizovat postupy měření a vyhodnocení dat. Pozice
nabízí možnost přímé experimentální práce v podobě spoluplánování experimentů, obsluhy IRT přístrojů a snímání
povrchových teplot, aktivní seznámení se s IRT software, analýzu IRT dat a jejich statistické zpracování, spoluautorská
pomoc při přípravě publikačních výstupů.
doc. Mgr. Vladan Bernard,
Ph.D.
(vbernard@med.muni.cz)
BiologickýústavLF
MU
2 Diagnostika cílových
antigenů u autoimunitních
puchýřnatých onemocnění
kůže a sliznice, se
zaměřením na antigeny u
jizvícího slizničního
pemfigoidu
Autoimunitní puchýřnatá onemocnění jsou vzácná onemocnění s incidencí od 0,5-5 pacientů na milion obyvatel za rok.
Do skupiny chorob s tvorbou subepidermálního puchýře patří bulózní pemfigoid, jizvící pemfigoid, IgA lineární
dermatóza a epidermolysis bullosa acquisita (EBA). Ačkoliv většina cílových antigenů je u těchto chorob již známa,
diagnostiku je možno provádět pouze u bulózního pemfigoidu a nově u EBA. Detekce protilátek u jizvícího pemfigoidu,
který má závažnou oční formu a pacienti mají vyšší pravděpodobnost vzniku určitých typů nádorů, je vyhrazena pouze
specializovaným výzkumným laboratořím. Cílem práce je vypracování vlastního diagnostického postupu využívajícího
wetern blot analýzu a mikroskopii k detekci protilátek proti antigenům jizvícího pemfigoidu - integrinům a lamininu.
Diagnostická metoda bude využívána pro potřeby specializovaného centra pro léčbu těchto chorob na LF MU.
Prof. MUDr. Iva Slaninová,
Ph.D
(ipokorna@med.muni.cz)
odborná konzultantka:
prof. MUDr. Hana Jedličková,
Ph.D., 1.dermatovenerol.
klinika LF MU a FNUSA
(hana.jedlickova@fnusa.cz)
ÚstavhistologieaembryologieLFMU
3 Buněčná plasticita v
morfogenezi plicních tkání
(rezervace pro konkrétního
studenta)
Buněčná plasticita představuje biologický fenomén, kdy dochází ke změně buněčného fenotypu diferencovaných
buněk, obvykle jako součást reparativní odpovědi na poškození tkání. Klíčovou organelou zapojenou regulace mnoha
buněčných procesů, včetně udržení diferencovaného fenotypu a tkáňové morfologie je endoplazamtické retikulum
(ER). ER představuje klíčovou organelu pro tvorbu membránových a sekretovaných proteinů, jejíž deregulace je
asociovaná s různými onemocněními, včetně fibrotických a nádorových. Využijeme unikátní model expandovatelných
plicních epitelií vytvořených na našem pracovišti, a zaměříme se na molekulární mechanismy asociovaných s ER, které
mohou ovlivňovat morfologii a fenotyp definitivních plicních epitelů. Student se naučí základy plánování experimentů
a vědecké práce. Laboratorní metody pak budou zahrnovat základní molekulárně biologické metody, pokročilé
kultivační techniky a světelnou a elektronovou mikroskopii.
doc. RNDr. Petr Vaňhara,
Ph.D.
(pvanhara@med.muni.cz)
4 Buněčné interakce a
signální dráhy ve vývoji
mléčné žlázy a rakovině
prsu
(rezervace pro konkrétního
studenta)
Buněčné interakce a signální dráhy hrají zásadní roli v regulaci vývoje epitelu mléčné žlázy i ve vzniku a rozvoji rakoviny
prsu. V této práci se student/ka zapojí do probíhajícího výzkumu buněk stromatu mléčné žlázy – fibroblastů. Bude
zkoumat procesy a signální dráhy, kterými tyto buňky řídí vývoj mléčné žlázy, a patologickou aktivitu těchto buněk v
nádorech prsu, kde tvoři až 80% nádorové masy. Získané poznatky mohou přispět ke vzniku nových terapeutických
přístupů v léčbě rakoviny prsu. Student/ka se naučí a bude ve své práci používat metody izolace buněk ze živých tkání
(z myších modelů i vzorků pacientů – klinická spolupráce s FNUSA a MOU), kultivaci buněk a mini-orgánů – organoidů,
molekulárně-biologické metody (qPCR, Western blot…), histologické a imunobarvící metody, pokročilé zobrazovací
metody (např. fluorescenční, konfokální a časosběrnou mikroskopii). Dále se student/ka může v případě zájmu naučit
pracovat s genetickými myšími modely, včetně metod genové indukce in vivo a transplantačních technik.
Mgr. Zuzana Sumbalova
Koledová, Ph.D.
(koledova@med.muni.cz)
5 Mechanismy laktace a
laktační nedostatečnost
Laktační nedostatečnost je problémem veřejného zdraví se závažným socioekonomickým dopadem. Lidské (mateřské)
mléko poskytuje nejlepší, druhově specifickou výživu pro lidské potomstvo. Zajišťuje nejen nutriční potřeby pro
optimální růst a vývoj dítěte, ale i ochranu proti závažným nemocem a působí preventivně proti vzniku obezity a
diabetu. Laktace je taktéž prospěšná pro zdraví matky snižováním rizika vzniku rakoviny prsu a taky podporuje vznik
mateřského pouta. Jenomže až 40-60% žen je postiženo laktační nedostatečností a následně až 50% dětí ve světě není
dostatečně kojeno, co vede k úmrtí stovek tisíc dětí. Komerčně dostupné náhrady mléka plně nepokrývají nutriční
potřeby dítěte pro zdravý vývoj. Proto je důležité odhalit příčiny laktační nedostatečnosti u žen, napomoci vyvinout
nové terapeutické postupy pro zajištění laktace, ale i vytvořit postupy pro produkci lidského mléka v laboratoři
technologií založenou na buňkách mléčné žlázy.
V této práci se student/ka zapojí do probíhajícího výzkumu mechanizmů laktace, včetně modelování laktace in vitro a
zjišťování příčin laktační nedostatečnosti u žen. Bude zkoumat procesy a signální dráhy, kterými epitelové buňky
mléčné žlázy získávají schopnost tvořit mléko, a snažit se tyto procesy zrekapitulovat v laboratoři. Získané poznatky
přispějí k odhalení příčin laktační nedostatečnosti jako i k vývoji technologie na tvorbu lidského mléka v laboratoři.
Student/ka se naučí a bude ve své práci používat metody izolace buněk ze živých tkání (především z tkání pacientů –
klinická spolupráce s FNUSA), kultivaci buněk a mini-orgánů – organoidů, molekulárně-biologické metody (qPCR,
Western blot…), histologické a imunobarvící metody, pokročilé zobrazovací metody (např. fluorescenční, konfokální a
časosběrnou mikroskopii).
FyziologickýústavLFMU
6 Vývoj autonomní regulace
kardiovaskulárního systému
Projekt zahrnuje seznámení se s vědeckovýzkumnými a etickými zásadami práce při získávání experimentálních i
klinických dat (se zaměřením na oblast dětského věku a dospívání), procesy jejich zpracování, analýzy a prezentace
(literární rešerše, statistické hodnocení, prezentace). Cílem práce je srovnání zvířecích modelů člověka ve vývoji
autonomní regulace kardiovaskulárního systému. V práci budou využity neinvazivní metody získávání parametrů pro
hodnocení regulace kardiovaskulárního systému – měření krevního tlaku (standardní metody, kontinuální metoda dle
Peňáze, stanovení citlivosti baroreflexu), hodnocení stavu výživy, ultrazvukové vyšetření srdce a cév. Téma je možné
doplnit i experimentální prací na schválených animálních modelech (telemetrické měření laboratorních zvířat v
různých stádiích vývoje).
RNDr. Miriam Nývltová
Fišáková, PhD.
(miriam.nyvltova@med.muni
.cz)
7 Fotoindukovaná translokace
styrylových fluorescenčních
sond do jádra živých buněk
a jejich terapeutický
potenciál při fotodynamické
léčbě nádorů
Styrylové fluorescenční sloučeniny jsou často využívány jako sondy pro zviditelnění RNA a DNA v živých nebo
fixovaných buňkách a tkáňových řezech. V naší laboratoři jsme identifikovali nezvyklé chování těchto látek v živých
buňkách, kde jsou tyto látky primárně detekovatelné v cytoplasmě (pravděpodobně v komplexu s RNA), ale po ozáření
zeleným světlem dojde k jejich přesunu do jádra v důsledku vazby na DNA a výraznému zvýšení intenzity fluorescence.
Cílem práce bude ověřit, zda styrylové sondy navázané na DNA interferuji s genovou expresí nebo negativně ovlivňují
genové regulace, které mohou vyústit v buněčnou smrt. Tento systém bude využít jako model fotodynamické terapie
povrchových nádorů, převážné melanomů. Metodicky bude většina experimentů prováděna na tkáňových kulturách s
pomocí fluorescenční mikroskopie. Photoindukovaná toxicita bude analyzována z pohledu tvorby kyslíkových radikálů
a z hlediska změny exprese apoptotických markerů. Dále bude analyzována možnost vzniku dvouřetezcových zlomu
DNA (TUNEL assay)..
Mgr. Vladimír Pekařík, Dr.
(pekarikv@mail.muni.cz)
8 Kardiovaskulární systém ve
zdraví i nemoci patologie
(rezervace pro konkrétního
studenta)
Projekt zahrnuje seznámení se s vědeckovýzkumnými a etickými zásadami práce při získávání klinických dat (zaměření
bude upřesněno dle aktuálních projektů pracoviště), procesy jejich zpracování, analýzy a prezentace (literární rešerše,
statistické hodnocení, prezentace). Příklady metod pro sběr dat: neinvazivní metody získávání parametrů pro
hodnocení změn v regulaci kardiovaskulárního systému - měření krevního tlaku (standardní metody, kontinuální
metoda dle Peňáze, stanovení citlivosti baroreflexu, další matematicko-statistické analýzy), ultrazvukové vyšetření
srdce a cév, stanovení metabolismu nepřímou kalorimetrií. Je možno zahrnout i problematiku práce na animálním
experimentu.
MUDr. Nováková Zuzana,
Ph.D.
(znovak@med.muni.cz)
9 Kardiotoxicita cytostatik u
pacientů s
kardiovaskulárním
onemocněním: od pacientů
k animálnímu modelu a zpět
Narůstající incidence zhoubných nádorů u pacientů vyššího věku, kteří jsou současně léčeni pro různá kardiovaskulární
onemocnění, vyžaduje nové přístupy ke studiu současného působení léků na kardiovaskulární a onkologické nemoci.
Přesné mechanismy vlivu kombinace těchto léků na srdeční sval nebyly dosud prostudovány. Jako perspektivní se jeví
komplexní animální modely, doplněné o studie molekulárních mechanismů potenciálně angažovaných v současném
působení léčiv. Student/ka bude seznámen/a s obecnou metodologií práce s buněčnými liniemi, se stanovením
viability buněk a dalšími relevantními metodami genomických a proteomických studií. Student/ka bude dále
participovat na animálních experimentech, bude vyhodnocovat získaná data a analyzovat výsledky. Student/ka bude
veden/a k etickým přístupům k vědecké práci, ke správnému nakládání s primárními daty, ke správné interpretaci
výsledků a formulaci závěrů. Student/ka se bude podílet na přípravě vědecké publikace a konferenčního příspěvku,
včetně aktivní účasti na mezinárodní konferenci.
prof. MUDr. Marie
Nováková, Ph.D.
(majka@med.muni.cz)
10 Snímání a hodnocení EKG u
pokusných zvířat
Elektrokardiografie (EKG) je standardní metodou vyšetření elektrické aktivity srdce. EKG má v klinické praxi
nezastupitelnou roli v diagnostice nejrůznějších kardiovaskulárních onemocnění. V různých animálních modelech je
snímání a hodnocení elektrické aktivity srdeční také široce využíváno. Na rozdíl od humánní medicíny v experimentální
praxi chybí standardy jak pro záznam, tak také pro hodnocení EKG u pokusných zvířat. Cílem práce bude přispět ke
standardizaci registrace a hodnocení EKG u různých animálních modelů. Student/ka se seznámí se základními postupy
manipulace s pokusnými zvířaty (pod dozorem osoby oprávněné k práci s pokusnými zvířaty podle zákona č. 246/1992
Sb. na ochranu zvířat proti týrání, ve znění pozdějších předpisů). Student/ka bude participovat na práci v laboratoři,
osvojí si různé metody snímání EKG u běžně užívaných animálních modelů, detailně se seznámí s hodnocením EKG
záznamů manuálně i pomocí automatické analýzy. Student/ka bude veden/a k správné interpretaci výsledků a
formulaci závěrů. Student/ka bude seznámen/a s procesem přípravy vědecké publikace a přípravy konferenčního
příspěvku, včetně aktivní účasti na mezinárodní konferenci.
11 Úloha sigma 1 receptorů v
remodelaci myokardu
Sigma 1 receptor je rezidentní protein endoplazmatického retikula, který slouží jako pluripotentní modulátor
buněčných funkcí. V minulosti bylo potvrzeno, že sigma 1 receptor může přes aktivaci kardioprotektivní dráhy AkteNOS
zmírnit patologickou přestavbu (remodelaci) srdečního svalu. Právě remodelace je u mnoha kardiovaskulárních
nemocí prvním krokem ke snížení čerpací schopnosti srdce a eventuálně i k rozvoji srdečního selhání. Navzdory
pokrokům ve farmakoterapii je srdeční selhání stále fatální diagnóza. Sigma 1 receptor se jeví jako možný molekulární
cíl pro ovlivnění myokardiální remodelace. Student/ka se zapojí do výzkumu úlohy sigma 1 receptorů v remodelaci
myokardu. Seznámí se se základními postupy manipulace s pokusnými zvířaty (pod dozorem osoby oprávněné k práci
s pokusnými zvířaty podle zákona č. 246/1992 Sb. na ochranu zvířat proti týrání, ve znění pozdějších předpisů), bude
participovat na práci v laboratoři, osvojí si různé metody snímání biologických signálů (EKG, arteriální krevní tlak,
tělesnou teplotu apod.) u běžně používaných animálních modelů a seznámí se s jejich hodnocením. Student/ka bude
veden/a k samostatné práci, k správné interpretaci výsledků a formulaci závěrů. Student/ka bude seznámen/a s
procesem přípravy vědecké publikace a přípravy konferenčního příspěvku, včetně aktivní účasti na mezinárodní
konferenci.
MUDr. Tibor Stračina, Ph.D.
(stracina@med.muni.cz)
ÚstavpatologickéfyziologieLFMU
21 Vliv kovového implantátu
na expresi proteinů a mRNA
v cirkulaci
Projekt bude sledovat vliv těžkých kovů (zejména titanu a niklu) na expresi proteinů v cirkulaci u pacientů po náhradě
kyčelního a kolenního kloubu ve follow-up studii v délce jednoho roku. Pro studii budou využity základní molekulárněbiologické
metody, a to sledování exprese RNA a proteinů (např. RT-PCR, ELISA, Western blot).
prof. RNDr. Monika Pávková
Goldbergová, Ph.D.
(goldberg@med.muni.cz)
13 Patofyziologie efektu
nanočástic kovů užívaných v
implantologii
Projekt bude sledovat nanočástice těžkých kovů (titanu, zirkonu, tantalu a niklu) se zaměřením na model chování
buněk in vitro. Pro studii budou využity nejen základní molekulárně-biologické metody (např. RT-PCR, ELISA, Western
blot), avšak i hodnocení morfologických změn, laserovou ablaci, fluorescenční barvení a další mikroskopické techniky.
14 Role proximálních
tubulárních epiteliálních
buněk (PTECs) v patogenezi
diabetické choroby ledvin
(DKD)
PTECs představují kvantitativně velmi významnou buněčnou populaci v ledvině, která je zodpovědná – díky expresi
velkého množství transportérů - za celou řadu důležitých transportních procesů a endokrinních funkcí jako např.
reabsorpce cca dvou třetin filtrovaných elektrolytů a vody, veškerého bikarbonátu, tvorba aktivní formy vitaminu D
pomocí 1-α-hydroxylázy a syntéza erytropoetinu. Nově se ukazuje, že PTECs disponují také potentními intrinsickými
imunitními funkcemi a představují tak významný prvek „intrarenální komunikace“ mnoha buněčných typů. Např.
megalin/cubilinem zprostředkovaná endocytóza filtrovaných proteinů v PTECs, nepřiměřeně zvýšená při proteinurii u
mnoha glomerulárních postižení, může evokovat buněčnou stresovou odpověď v podobě pro-zánětových cytokinů a
akcelerovat tubulointersticiální zánět a fibrózu. Cílem projektu je (1) studovat in vitro PTECs v podmínkách simulujících
diabetické mikroprostředí se zaměřením na expresi senescence-associated secretory phenotype (SASP) a
extracelulárních vezikul (EVs) po expozici různým látkám s potenciálně renoprotektivním efektem, (yejm. SGLT2
inhibitorů – gliflozinů) a (2) in vivo pomocí observační studie u T2DM pacientů indikovaných k léčbě glifloziny (k
intenzifikaci anti-diabetické terapie první linie) vybrané močové biomarkery renoprotektivity vč. vybraných
exozomálních mRNA a proteinů (student se bude podílet na vývoji a optimalizaci metody).
Prof. MUDr. Kateřina
Kaňková, Ph.D.
(kankov@med.muni.cz)
Farmakologický
ústav,LFMU
15 Léčba rakoviny zaměřená na
mutace na základě přístupu
kombinujícího vyhledávání
léků a analýzy dat z
klinických studií a registrů
pacientů
U onkologických pacientů, a to nejen dospělých, ale i dětských, u kterých je identifikována léčivy cílitelná mutace
vedoucí k rozvoji nádorového onemocnění, je zásadním krokem výběr vhodného léčiva či kombinace více účinných
látek zasahujícími různými mechanismy. Jednou z možností je výběr již registrovaných léčiv na základě znalosti jejich
mechanismu účinku a zasažitelných cílů. V tomto případě jsou s výhodou využívány databáze léčiv, které nám
usnadňují orientaci v molekulárních cílech daného léčiva a evidenci pro danou indikaci. Další možností je zařazení
takového pacienta do klinické studie, která hodnotí účinek a bezpečnost nově vyvíjeného cíleného léku či jejích
kombinací. V každém případě pro tyto pacienty hraje zásadní roli čas. Aby došlo k návrhu optimalizace farmakoterapie
PharmDr. Lenka Součková
Ph.D.
(lsouckova@med.muni.cz)
v reálném čase, je potřeba využít všech možností včetně vytvoření databáze dobrovolníků, registrů klinických
hodnocení a registrů dat výsledků genetických vyšetření. Výzkumným záměrem je jednak vytvoření takových databází,
ale také studie proveditelnosti a vyhodnocení úspěšnosti přiřazení vhodného léku konkrétnímu pacientovi.
NeurologickáklinikaLFMUaFNUSA
16 Cévní rizikové faktory
kognitivního deficitu
Vyšetření pomocí dotazníků, škál, magnetické rezonance mozku a dalších biomarkerů u starších osob z kohorty
Kardiovize. Bude se jednat o jedince bez kognitivního deficitu i s kognitivním deficitem dle skríningového kognitivního
vyšetření (MOCA test). Jedinci (n=200) budou následně vyšetřovaní z hlediska přítomnosti neurodegenerativního
onemocnění mozku a budeme hodnotit, jak přítomnosti cévních rizikových a genetických faktorů a parametrů
kardiovaskulárních onemocnění souvisí s rozvojem neurodegenerace mozku a jejími konkrétními projevy.
Prof. MUDr. Irena Rektorová,
CSc, FCMA, FANA, FEAN
(irektor@med.muni.cz)
17 Neinvazivní stimulace
hlubokých struktur pro
zlepšení epizodické a
pracovní paměti u pacientů
s mírnou kognitivní
poruchou (rezervováno pro
konkrétního studenta)
Jedná se o elektrickou neinvazivní stimulaci mozkové kůry i hlubokých mozkových struktur a mozečkovou stimulace
pomocí pulzního magnetického pole pro ovlivnění epizodické a pracovní paměti u pacientů s mírnou kognitivní poruchou
při degenerativním onemocnění mozku (Alzheimerova nemoc, Parkinsonova nemoc, demence s Lewyho tělísky). Bude
stimulováno celkem 50 pacientů několika typy neinvazivní mozkové stimulace a hodnotit efekt intervence na kognici,
ale také vliv stimulace na plasticitu mozku (pomocí magnetické rezonance mozku a EEG).
18 Vysokofrekvenční oscilace
v epileptochirurgie
(rezervováno pro
konkrétního studenta)
V současnosti je část pacientů s epilepsií léčená chirurgicky, tj. podstupují operaci mozku, jejímž hlavním cílem je úplné
vymizení epileptických záchvatů. Pro přesné naplánování operace je velmi často využíváno invazivní EEG, při němž se
intracerebrální elektrody implantují do mozku pacienta. Invazivní EEG hodnotíme v rámci standardních frekvenčních
pásem, nicméně se zaměřujeme rovněž na hodnocení vysokofrekvenčních oscilací. Vysokofrekvenční oscilace jsou nyní
již standardně využívány I v rámci klinické praxe. V současnosti v rámci I. neurologické klinicky Fakultní nemocnice u
svaté Anny a Lékařské fakulty Masarykovi university ve spolupráci s Akademií věd České republiky a International Clinical
Research Center (ICRC) university probíhá intenzivní výzkum týkající se této problematiky. Předpokládáme zapojení
studenta do již probíhajících aktivit, v první fázi se bude jednat o doplnění klinických dat do již existujícího systému.
Posléze bude naplánován projekt, který se bude věnovat problematice vysokofrekvenčních oscilací. Design projektu
bude vytvořen dle domluvy se studentem, je možné jak hodnocení klinických údajů pacientů, tak i vice technicky
zaměřený projekt.
doc. MUDr. Irena Doležalová
Ph.D.
(irena.dolezalova@fnusa.cz)
19 Klinické a
elektrofyziologické markery
léčby hlubokou mozkovou
stimulací u Parkinsonovy
nemoci
Hluboká mozková stimulace (DBS - deep brain stimulation) je moderní chirurgická léčba některých příznaků různých
neurologických onemocnění, především Parkinsonovy nemoci. Tato léčba se neustále dynamicky vyvíjí tak, aby bylo
dosaženo co největší účinnosti a bylo minimalizováno riziko nežádoucích účinků. Současný výzkum je zaměřen na
zpřesnění indikačních kritérií pomocí potenciálních prediktivních elektrofyziologických a klinických biomarkerů. Dále
jsou zkoumány elektrofyziologické koreláty jednotlivých neurologických příznaků, které by mohly do budoucna sloužit
jako vstupní signály pro tzv. chytrou neboli adaptivní stimulaci reflektující aktuální klinický stav a potřeby pacienta.
Student bude participovat na experimentech, vyhodnocovat a analyzovat výsledky a připravovat podklady pro
prezentace a publikace. DBS elektrofyziologický výzkum je v současnosti podpořen dvěma granty: elektrofyziologicky
zaměřený GAČR 21-25953S a klinicky zaměřený AZV NU21-04-00445. Pro studenta je možnost úvazku 0,1 na jednom z
projektů (nad rámec programu P-PooL LF MU).
doc. MUDr. Martina
Bočková, Ph.D.
(martina.bockova@fnusa.cz
20 Kardio-cerebrální vztahy u
Parkinsonovy nemoci
Kromě hlavních a dobře známých hybných příznaků je Parkinsonova nemoc spojena i s celou řadou tzv. nemotorických
symptomů. Patří k nim i kardiální autonomní dysfunkce, především nejčastější ortostatická dysfunkce, ale také další
poruchy srdečního rytmu, o kterých se příliš neví a není znám jejich vliv na průběh onemocnění a úspěšnost různých
léčebných metod.
Hluboká mozková stimulace (DBS - deep brain stimulation) je moderní chirurgická léčba pozdních příznaků Parkinsonovy
nemoci. U těchto pacientů jsou nyní nově studovány také vlivy kardiálních dysfunkcí pomocí komplexního
kardiologického vyšetření – ultrazvukové vyšetření srdce (echo), ergometrie, EKG Holter a MRI srdce. Získaná data
budou následně korelována s klinickými škálami, výsledky neuropsychologického vyšetření a MRI mozku se zvláštním
zaměřením na vaskulární změny.
Student bude participovat na experimentech, vyhodnocovat a analyzovat výsledky a připravovat podklady pro
prezentace a publikace. Tento výzkum je v současnosti podpořen projektem: AZV NU21-04-00445. Pro studenta je
možnost úvazku 0,1 na tomto projektu (nad rámec programu P-PooL LF MU).
Neurologickáklinika
LFMUaFNB
21 Neurologické komplikace
neurointenzivní péče
Projekt se bude zaměřovat na dvě nejvýznamnější neurologické komplikace kritického stavu a intenzivní péče, a to
delirium jako nejčastější manifestaci akutní encefalopatie, a dále neuromyopatii kritického stavu (CIPM). Obě
komplikace predikují vyšší morbiditu a mortalitu a jsou poddiagnostikovány. Projekt se zaměří zejména na nalezení
optimálních screeningových metod těchto komplikací, jejich standardizaci a optimální timing a dále na diferenciální
diagnostiku oproti dalším komorbiditám, které mohou delirium či CIPM napodobovat. Výzkum bude primárně probíhat
na pacientech v neurointenzivní péči (např. cévní mozkové příhody), případně ve spolupráci s KARIM na kritických
pacientech s jiným než neurologickým základním onemocněním
Prof. MUDr. Josef Bednařík,
CSc., FCMA, FEAN
(bednarik.josef@fnbrno.cz)
Int.Hemato-
onkologickáklinikaLF
MUaFNB
22 Studium klonální
architektury u pacientů s
akutní myeloidní leukémií
Akutní myeloidní leukémie (AML) je maligní onemocnění hematopoetické tkáně
charakteristické klonální expanzí nediferencovaných myeloidních prekurzorů. Sekvenování nové generace (NGS)
nedávno identifikovalo řadu somatických aberací, které se spolupodílejí na vzniku AML (leukemogenezi). Analýzy
realizované na úrovni celé nádorové populace (tj. bulku) nicméně mají své limitace – získávána je průměrná informace
za všechny studované buňky ve vzorku. Nově přicházející NGS analýzy single cell však nabízí možnost hlubšího studia
provedením jednotlivých analýz buňky po buňce.
Cílem práce bude využít moderní metody molekulární biologie vč. NGS analýzy single cell pro studium získaných aberací
a klonální architektury u pacientů s akutní myeloidní leukémií.
Ing. Ivana Ježíšková, Ph. D.
(Jeziskova.Ivana@fnbrno.cz)
Centrum molekulární
biologie a genetiky
Klin.interní,
geriatrieaprakt.
lék.LFMUaFNB
23 Poruchy dýchání ve spánku
u obézních pacientů
Jedná se o vysoce aktuální téma, které krom diagnostiky ve spánkovém centrum zahrnuje i následné nastavení léčby
pomocí pozitivního přetlaku v dýchacích cestách a současně i sledování v naší nově vznikající obezitologické
ambulanci, která je zodpovědná nejen za farmakoterapii obezity, ale i za změnu stravovacích a pohybových návyků.
Jedná se tedy o komplexní přístup k této skupině pacientů, který není dosud ještě popsán, navíc tuková tkáň je vysoce
metabolicky aktivní a v naší práci budeme zkoumat celou řadu biochemických parametrů, které mohou být naším
přístupem ovlivněny. Student by byl odpovědný za sběr dat pacientů, pomoc při diagnostice a léčbě a dále dle
možností i za statistické zpracovávání údajů a přípravu článku. Předpokládá se více výstupů v impaktovaných
časopisech a taktéž prezentace na národní i mezinárodní úrovni + zapojení do European Sleep Apnea Database.
prof. MUDr. Ondřej Ludka,
Ph.D.
(ludka.ondrej@fnbrno.cz)
Klinikaústní,čelistní
aobličejové
chirurgie
FNBrnoaLFMU
24 Plánování osteotomie
mandibuly před
ortognátním chirurgickým
výkonem
Během osteotomie větve dolní čelisti při ortognátně chirurgickém výkonu BSSO (Bilateral Sagittal Split Osteotomy) je
důležitá správná poloha a hloubka osteotomie. Při příliš hlubokém řezu hrozí poranění n. alvolaris inferior. Pokud je
osteotomie vedena příliš povrchově hrozí vznik „bad splitu“ nebo tříštivého lomu jednoho ze segmentů mandibuly.
Nyní lze v předoperačním plánování použít ConeBeamCT (CBCT – specializovaná 3D zobrazovací technika), ale přesná
metodologie vyšetření není doposud vypracována. Cílem práce je vypracovat vhodné parametry hodnotitelné na před
operačním CBCT. Jednak vztah mandibulárního kanálu k povrchu těla mandibuly, jednak strukturu kostní tkáně (vztah
kompakty a spongiózy). Ověřit jejich klinickou použitelnost v běžném provozu. Přínos bude standardizace
předoperační analýzy RTG vyšetření a zvýšení bezpečnosti chirurgického zákroku.
MUDr. Vojtěch Peřina, Ph.D.
(perina.vojtech@fnbrno.cz)
Klinikadětskéanesteziologiearesuscitace,
FNBaLFMU
25 Optimalizace bezpečnosti
intenzivní a perioperační
péče u dětí
Cílem projektu je zhodnotit výskyt nežádoucích fluktuací hloubky celkové anestezie (příliš mělké, ale taky příliš
hluboké anestezie) v podmínkách běžné anesteziologické péče. Pro zvýšení validity daného hodnocení je měření
Bispektrálního indexu (BIS) prováděno 3. osobou a pro anesteziologický tým jsou výsledky měření zaslepeny (s
výjimkou tzv. kritických hodnot, které jsou identifikovaný jako rizikové pro pacienta – kdy dojde k upozornění
anesteziologického týmu). Hypotéza studie je postavena na již publikovaných datech týkající se fluktuace hloubky
anestezie u kojenců a batolat (doi: 10.1213/ANE.0000000000004221 a doi:
https://doi.org/10.1097/ALN.0000000000004262). Dané studie nicméně sledovali jenom nadměrnou hloubku
anestezie, a ne taky nedostatečnou (definovanou hodnotou BIS). Aktuální předkládaný projekt je designován jako
pilotní monocentrická studie s předpokládaným počtem pacientů n=100. Další fáze projektu je plánovaná jako
multicentrická národní studie, zahrnující všechna centra dětské anestezie (>1000 anestezii/rok) s cílem zhodnotit
rizikové fluktuace hloubky anestezie u dětských pacientů. Sekundární cíl studie je zhodnotit vliv fluktuací na výskyt
pooperačního deliria u pediatrických pacientů (emergence delirium). K hodnocení výskytu pooperačního deliria budou
využiti především pregraduální studenti, kteří budou hodnotit delirium na JIP/ARO a dospávacím pokoji pomocí škály
PAED. Iniciální fáze studie (1.) je designovaná jako pilotní prospektivní observační studie s cílem zařadit 100 pacientů.
Na podkladě analýzy pilotních dat by byla následně provedena národní observační studie s cílem zhodnotit výskyt
rizikových fluktuací mezi jednotlivými centry. Dalším předpokládaným výstupem by měl být doporučený postup
podpořen Českou společností anesteziologie resuscitace a intenzivní medicíny (ČSARIM) k prováděná tzv. bezpečné
doc. MUDr. Jozef Klučka,
Ph.D.
(klucka.jozef@fnbrno.cz)
anesteziologické péče v ČR, kterého součástí by mělo být použití kvantitativní monitorace hloubky anestezie. Části
projektu Optimalizace bezpečnosti intenzivní a perioperační péče:
1. Hloubka anestezie: prospektivní observační studie
2. Hloubka anestezie: národní observační studie
3. Validace měření anestezie pomocí BIS vs. entropie vs. Connox
4. Doporučený postup bezpečné anesteziologické péče (včetně monitorace hloubky anestezie) v ČR – ve spolupráci s
odbornou společností ČSARIM
PřFMUNI
26 Studium a predikce
rozpustnosti proteinů
Rozpustnost proteinů je klíčovou vlastností ovlivňující jejich úspěšné využití v terapii a diagnostice. Snížená
rozpustnost proteinů je také příčinou řady vazných onemocnění. V oblasti medicínského a farmaceutického výzkumu
je proto velký zájem o vyvinutí výpočetních metod, které by pomáhaly predikovat rozpustnost proteinů na základě
jejich sekvence. Nedostatek kvalitních experimentálních dat však brání vývoji dostatečně přesných predikčních
nástrojů. Tato práce se zabývá využitím vysokokapacitní metody pro studium rozpustnosti proteinů v mikrotitračních
destičkách využívající in vitro split-GFP reportérový systém. V rámci projektu budou analyzovány mutantní knihovny
modelových proteinů, hodnocen bude vliv mutací na rozpustnost. Výsledné experimentální data budou využity při
vývoji výpočetních nástrojů využívajících strojové učení k predikci proteinové rozpustnosti.
Prof. Zbynek Prokop, Ph.D.
Loschmidt Laboratories
Department of Experimental
Biology and RECETOX
Faculty of Science, MUNI
Kamenice 5/C13, 625 00
Brno, Czech Republic
(zbynek@chemi.muni.cz)