Zdravotnická data
Martin Komenda
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)2
Nosná témata
Zdravotnická data a jejich
zpracování
(definice, smysl, význam v praxi,
klasifikace, katalog)
Zdravotní gramotnost
(definice, význam pro praxi, datově
orientované rozhodování, Národní
zdravotnický informační portál)
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)3
Cíle a výstupy z učení
̶ Zdravotnická data
̶ Pochopit, jaké formáty dat existující, co jsou a nejsou otevřená data
̶ Naučit se zdravotnická data používat
̶ Základy zpracování dat (z metodického pohledu)
̶ Zdravotní gramotnost
̶ Získat přehled o dostupných zdrojích
̶ Porozumět konceptu nástrojů na podporu rozvoje zdravotní gramotnosti
Představení
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)4
www.webstudio.team
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)5
Zdravotnická data
Základní koncept
Laická
veřejnost
Poučená
veřejnost
Odborná
veřejnost
Pro koho je NZIP určen?
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)8
Cílové skupiny
Metodické
pozadí
Personální
zázemí
Technické
řešení
Cesta k cíli
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)11
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)12
Národní zdravotnický informační systém
údaje o determinantách
zdraví, o potřebě
a spotřebě zdravotních
služeb
údaje o zdravotnických
pracovnících a jiných
odborných pracovnících
údaje o rozsahu a kvalitě
poskytovaných zdravotních
služeb
údaje pro statistické účely
a k poskytování údajů
a statistických informací
údaje pro potřeby vědy
a výzkumu v oblasti
zdravotnictví
údaje o činnosti
poskytovatelů a jejich
ekonomice
údaje k vedení Národních
zdravotních registrů
údaje pro řízení
zdravotnictví a tvorbu
zdravotní politiky
údaje o zdravotním stavu
obyvatelstva
13
FN Plzeň
Nemocnice
Chomutov
Masarykova
nemocnice
Ústí nad Labem
Nemocnice
Liberec
FN Hradec
Králové
Nemocnice
Pardubice
Nemocnice
České
Budějovice
Nemocnice
Jihlava
FN Olomouc
Nemocnice
Zlín
Nemocnice
Nový Jičín
FN Ostrava
MOÚ Brno
FN Brno
FN u sv. Anny
Brno
FN Motol Praha
FN KV Praha
KOC Praha a
Středočeský kraj
Referenční sítě PZS
Zdravotní
pojišťovny
NR-PZS
NR-ZP
z. 48/1997Sb.
Zákon o veřejném
zdravotním pojištění
NR-HZS NR-HOSP
CZ-DRG
z. 325/2021Sb.
Zákon o elektronizaci
zdravotnictví
z. 372/2011Sb.
Zákon o zdravotních
službách
z. 372/2011Sb.
Zákon o zdravotních
službách
Národní
registry
a informační
systémy
Prevence
a screeningy
Statistická
šetření
a průzkumy
Národní zdravotnický informační systém
https://www.nzip.cz/data-nzis
Katalog zdravotnických dat
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)15
https://data.gov.cz/
Národní katalog otevřených dat
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)16
Jak to funguje v praxi
Podpora zdravotní gramotnosti (nejen na základě dat)
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)17
Národní zdravotnický informační portál
https://www.nzip.cz
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)19
Definice zdravotní gramotnosti
Zdravotní gramotnost představuje schopnost orientovat se
v záplavě informací o zdraví a zdravotní péči. Neznamená tedy
množství informací, které si člověk osvojí, ale schopnost informace
vyhledat, porozumět jim, vyhodnotit je a na jejich základně se
rozhodnout ve prospěch vlastního zdraví.
Zdroj: https://www.nzip.cz/clanek/226-zdravotni-gramotnost
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)20
https://forms.office.com/e/ZRvv1iZz0D
Porozumění informacím o zdraví a zdravotní péči v ČR
… se psalo někde na internetu.
… nám někdo řekl.
… jsme někdy viděli v televizi.
… se řešilo v jedné skupině na Facebooku.
… máme dojem, že jsme někde slyšeli.
Proti dezinformacím
Portál pro pacienty
a pacientské organizace
Národní zdravotnický informační portál
sdružuje garantovaný obsah napříč odbornými portály a přináší aktuality ze světa medicíny
Datové zpravodajství NZIS
www.nzip.cz/data-nzis
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)31
https://www.nzip.cz/hry/
Hra: Semestr s otevřenými daty
Otevřená data Datový souhrn Syntetická data
Interaktivní
vizualizace
Webové portály
Ročenky, publikace,
analytické studie
Datové zpravodajství
Počet provedených
screeningových mamografií
Základní sazby poskytovatelů
akutní lůžkové péče
Průběh těhotenství
a nejčastější komplikace
Vakcinace hrazené
z veřejného zdravotního pojištění
Co jsou otevřená data?
Základní principy
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)39
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)40
Definice otevřených dat
̶ Zákonná definice otevřených dat je upravena v zákoně o svobodném přístupu
k informacím (106/1999 Sb.) ve znění pozdějších předpisů. Ten v § 3 odst. 11
vymezuje otevřená data jako
„informace zveřejňované způsobem umožňujícím dálkový
přístup v otevřeném a strojově čitelném formátu, jejichž
způsob ani účel následného využití není omezen a které jsou
evidovány v národním katalogu otevřených dat“.
Zdroj: https://opendata.gov.cz/definition_opendata
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)41
Definice otevřených dat
̶ Přístupná jako datové soubory ve strojově čitelném
̶ Opatřená neomezujícími podmínkami užití
̶ Evidovaná v Národním katalogu otevřených dat
̶ Opatřená dokumentací
̶ Dostupná ke stažení bez technických překážek
Klasifikace otevřených dat?
Základní principy
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)42
5hvězdičkový model otevřených dat
Zdroj: https://5stardata.info/cs/)
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)43
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)44
Data is available on the Web, in whatever format.
One-Star Open Data
Zdroj: https://www.ontotext.com/knowledgehub/fundamentals/five-star-linked-open-data/, https://www.w3.org
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)45
Available as machine-readable structured data.
Two-Star Open Data
Zdroj: https://www.ontotext.com/knowledgehub/fundamentals/five-star-linked-open-data/, https://www.w3.org
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)46
Available in a non-proprietary format, (i.e, CSV, not Microsoft Excel).
Three-Star Open Data
Zdroj: https://www.ontotext.com/knowledgehub/fundamentals/five-star-linked-open-data/, https://www.w3.org
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)47
Published using open standards from the W3C (RDF* and SPARQL).
Four-Star Open Data
Zdroj: https://www.ontotext.com/knowledgehub/fundamentals/five-star-linked-open-data/, https://www.w3.org
* Resource Description Framework
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)48
All of the above and links to other Linked Open Data.
Five-Star Linked Open Data
Zdroj: https://www.ontotext.com/knowledgehub/fundamentals/five-star-linked-open-data/, https://www.w3.org
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)49
Otevřená datová sada („metodický popis“)
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)50
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)51
Úkol
1. Vyhledejte data o nežádoucích událostech v čase
2. Vyhledejte popis dat a pochopte význam jednotlivých atributů.
Otevřená data
Potenciální problémy
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)52
Několik příkladů z praxe
̶ Velikost datové sady
̶ kB, MB, GB
̶ Interval aktualizace
̶ Denně, týdně, měsíčně, kvartálně, ročně, bez aktualizace
̶ Interpretace dat
̶ Atribut / datový typ / popis
̶ Otevřená data vs. Zabezpečená data
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)53
Zapamatujte si
̶ Otevřená data = strojově čitelný formát
̶ Katalog otevřených dat
̶ Lokální
̶ Národní
̶ Schéma datového zdroje = vysvětlení a následné pochopení
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)54
Životní cyklus otevřených datových sad
Základní schéma
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)55
Životní cyklus datové sady
Návrh konceptu
Posouzení konceptu
Návrh analytické přípravy
Vytvoření datové sady
Recenze
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)56
Otázka do publika
Lze po zveřejnění průběžně měnit struktury datové sady?
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)57
Klíčové vlastnosti otevřených dat
Správnost
a garance
Technická
dostupnost
Komunita
a validace
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)58
Zpracování otevřených dat ve
zdravotnictví a jejich využití
Reálná zkušenost
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)59
Zpracování dat a jejich využití
Zdroj dat Exploratorní
analýza
Stanovení
otázek
Příprava dat,
vyhodnocení,
validace
Tvorba
výstupů
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)60
Otázka do publika
Jak mohou (otevřená) zdravotnická data pomoci v běžném životě?
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)61
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)62
Reálné příklady z praxe
̶ Otevřená (zabezpečená) data
̶ CSV, JSON, …
̶ Statické výstupy
̶ MS PowerPoint, PDF, …
̶ Interaktivní vizualizace
̶ Webová aplikace
̶ Infografika
https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19
COVID-19: Přehled aktuální situace v ČR
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)63
https://psychiatrie.uzis.cz/
Národní portál psychiatrické péče
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)64
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)65
https://nsc-data.uzis.cz/
Datový portál screeningových programů
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)66
Indikátory psychiatrické péče
Národní portál psychiatrické péče
https://psychiatrie.uzis.cz/cs/psychiatrie-v-datech/psychiatricka-pece-v-cr/indikatory/
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)67
Ročenka psychiatrická péče
Národní portál psychiatrické péče
https://psychiatrie.uzis.cz/cs/rocenka/
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)68
Duševní onemocnění v Česku
Národní portál psychiatrické péče
https://www.nzip.cz/infografika-dusevni-onemocneni-v-cesku
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)69
Metodický přístup ke zpracování dat
CRISP-DM
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)70
Cross-industry standard process for data mining
CRISP-DM
Zdroj: https://www.datascience-pm.com/crisp-dm-2/
Data-driven decision-making
in medical education and healthcare
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)71
Data-driven decision-making
in medical education and healthcare
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)72
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)73
Národní zdravotnický informační portál
Pro laickou i odbornou veřejnost
Kolik je na NZIP obsahu?
Tipněte si
Zdroj: Vygenerováno prostřednictvím OpenArt (https://openart.ai/)
Zdravotnická informatika, statistika a e-health (podzim 2024)74
Hlavní výhody
Úspora zdrojů
Jednotná komunikace
Dlouhodobá udržitelnost
Dohledatelnost na internetu
Podpora spolupráce
=
7 288 076 znaků = 4 048,9 normostran