Genetika sluchových vad pohled foniatra MUDr. Radan Havlík, Ph.D. Lidský genom = 25 000 kódujících genů zdroj: web - viz slide 78 Gen  Gen je jednotka informace, dle níž je vytvářena podoba organismu = fenotyp  Každý gen je tvořen jednou nebo více alelami.  Alela je konkrétní forma genu 2 základní typy genů  Majorgeny - mají velký efekt na fenotyp - zevní vlivy jejich expresi ovlivňují jen nepatrně - kódují kvalitativní znaky (barva očí, tvar boltce, struktura hemoglobinu)  Minorgeny - malý efekt na fenotyp - samotný gen má obvykle malý význam - složité mezialelové interakce - kódují kvantitativní znaky (např.velikost těla) Mezialelové interakce 1. Úplná dominance a úplná recesivita Dominantní (A) x recesivní (a) Přítomnost dominantní alely jednoznačně určuje výsledný fenotypový projev "A" Nepřítomnost dominantní alely má za následek výsledný fenotypový projev "a" Např. AA, Aa, aA = červený květ, aa = bílý květ (fenotypově nelze odlišit heterozygota Aa, aA od homozygota AA) Mezialelové interakce 2. Neúplná dominance a neúplná recesivita Dominantní (A) x recesivní (a) Přítomnost dominantní alely zcela nepotlačí fenotypový projev alely recesivní Např. AA = červený květ, Aa, aA = růžový květ, aa = bílý květ (fenotypově lze odlišit heterozygota Aa, aA od homozygota AA) Mezialelové interakce 3. Kodominance Každá alela se projevuje fenotypově nezávisle na druhé Typickým příkladem jsou krevní skupiny A,B,AB, 0 Mutace = dědičná změna genotypu A. spontánní - vznik chybou v replikačním a reparačním mechanismu DNA B. indukovaná - vznik působením mutagenů Druhy mutací  genové = změny v molekule DNA  chromozomové = změny struktury a tvaru chromozomů (chromozomové aberace)  genomové = změny počtu chromozomů Genové mutace = změny sekvence nukleotidů v molekule DNA  delece = chybění jednoho či více po sobě následujících párů bazí Před mutací A - A - A - G - G - A - T - T - A - C - C - T .......... PHENYLALANIN PROLIN ASPARAGIN GLYCIN  Deleční mutace A - A - A - G - G - A - T - T - A - C - C - T .......... Po mutaci A - A - A - G - A - T - T - A - C - C - T ................ PHENYLALANIN LEUCIN METHIONIN Genové mutace = změny sekvence nukleotidů v molekule DNA  inzerce = včlenění jednoho či více po sobě následujících párů bazí Před mutací A - A - A - G - G - A - T - T - A - C - C - T .......... PHENYLALANIN PROLIN ASPARAGIN GLYCIN  Inzerční mutace A - A - A - G - G - G - A - T - T - A - C - C - T .......... Po mutaci A - A - A - G - G - G - A - T - T - A - C - C - T .......... PHENYLALANIN PROLIN LEUCIN TRYPTOFAN Genové mutace = změny sekvence nukleotidů v molekule DNA  substituce = náhrada jednoho či více po sobě následujících párů bazí bazemi jinými Před mutací A - A - A - G - G - A - T - T - A - C - C - T .......... PHENYLALANIN PROLIN ASPARAGIN GLYCIN  Substituční mutace A - A - A - C - A - G - T - T - A - C - C - T .......... Po mutaci A - A - A - C - A - G - T - T - A - C - C - T .......... PHENYLALANIN VALIN ASPARAGIN GLYCIN Genové mutace = změny sekvence nukleotidů v molekule DNA  inverze = záměna pořadí jednoho či více po sobě následujících párů bazí Před mutací A - A - A - G - G - A - T - T - A - C - C - T .......... PHENYLALANIN PROLIN ASPARAGIN GLYCIN  Inverzní mutace A - A - A - G - A - G - T - T - A - C - C - T .......... Po mutaci A - A - A - G - A - G - T - T - A - C - C - T .......... PHENYLALANIN LEUCIN ASPARAGIN GLYCIN Modelace pro recesivní gen A… zdravý dominantní gen a … vadný recesivní gen Přítomnost či nepřítomnost dominantního genu určuje, zda znak bude či nebude přítomen ve fenotypu 2 zdraví rodiče AA + AA AA AA AA AA Všichni potomci zdraví 1 přenašeč + 1 zdravý rodič Aa + AA AA AA aA aA Všichni potomci zdraví, ale 50% přenašečů Oba rodiče přenašeči Aa + Aa AA Aa aA aa 25% potomků zdravých 50% zdravých přenašečů, 25% s vadou 1 přenašeč + 1 rodič s vadou Aa + aa Aa Aa aa aa 50% zdravých přenašečů, 50% s vadou Oba rodiče s vadou aa + aa aa aa aa aa Všichni potomci s vadou Sluchové vady  Hereditární = dědičné histologicky - normální nález - typ Mondiniho - typ Scheibeho Geneticky podmíněné - syndromální - nesyndromální  Nehereditární Sluchové vady  Hereditární = dědičné histologicky - normální nález - typ Mondiniho - typ Scheibeho Geneticky podmíněné - syndromální - nesyndromální  Nehereditární http://uwmsk.org/temporal bone/congenital.html Sluchové vady  Hereditární = dědičné histologicky - normální nález - typ Mondiniho - typ Scheibeho Geneticky podmíněné - syndromální - nesyndromální  Nehereditární Negenetické příčiny vady sluchu  extrémně nízká porodní hmotnost  pre-, peri- a postnatální infekce  krvácení do CNS  novorozenecký ikterus  traumata  ototoxické látky  ... Genetické příčiny vady sluchu  monogenní (cca 50%)  polygenní  multifaktoriální Syndromické vady sluchu  Pendredův sy (75 : 100 000)  Goldenharův sy (17 : 100 000)  Charge (8 : 100 000)  Waardenburgův sy (5 : 100 000)  Usherův sy (4 : 100 000)  Treacher-Collins (2 : 100 000)  Alportův sy (0,5 : 100 000)  ... Výskyt sluchové vady u dětí  cca 50% vrozených sluch.vad má genetickou etiologii  výskyt cca 1/1000 dětí  Autosomálně recesivní 75%  Autosomálně dominantní 20%  Vazba na X-chromosom 4%  Mitochondriální 1% Monogenní sluchová vada  Skupina genů DFN (for DeaFNess) DFNA = autosomálně dominantní DFNB = autosomálně recesivní X DFN = recesivně vázané na X  Bezpečně identifikováno již více než 100 lokusů (první gen nalezen r. 1995) 26 genů (42 lokusů) DFNA 40 genů (74 lokusů) DFNB 3 geny (5 lokusů) X Smith & van Camp (1999)  AR typy nedoslýchavosti - prelinguální - těžké  AD typy nedoslýchavosti - postlinguální - mírnější - progresivní Duphar Pharma, 1983: Bild-Atlas "Innenohr" http://www.answers.com/topic/scala-vestibuli?cat=health Engström, H., Engström, B.: The Ear. Uppsala, Sweden, June 1988 Duphar Pharma, 1983: Bild-Atlas "Innenohr" Duphar Pharma, 1983: Bild-Atlas "Innenohr" Engström, H., Engström, B.: The Ear. Uppsala, Sweden, June 1988 Engström, H., Engström, B.: The Ear. Uppsala, Sweden, June 1988 M. Eybalin, M. Lavigne-Rebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 IHC OHC M. Eybalin, M. Lavigne-Rebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang: INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 Apical transduction channels M. Eybalin, M. Lavigne-Rebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang: INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 Apical transduction channels M. Eybalin, M. Lavigne-Rebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang: INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 Apical transduction channels M. Eybalin, M. Lavigne-Rebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang: INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 Apical transduction channels M. Eybalin, M. Lavigne-Rebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang: INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 Apical transduction channels http://openlearn.open.ac.uk/mod/reso urce/view.php?id=263162 Synaptický přenos z OHC Depolarizace otevírá voltagegated calcium channels Vstup kalciových iontů z perilymfy do OHC má 2 efekty: 1. Uvolnění neurotransmiteru (glutamát) AKČNÍ POTENCIÁL 2. Otevření calcium activated potassium channels K+ vystupuje z OHC REPOLARIZACE M. Eybalin, M. LavigneRebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 M. Eybalin, M. Lavigne-Rebillard, M. Lenoir, J.L. Puel, G. Rebillard, J. Ruel, N. Trigueiros-Cunha, J. Wang INSERM Unit 254 (up to 2002), now INSERM Unit 583 Iontové kanály zdroj: web - viz slide 78 Autosomálně dominantní (DFNA) (příklady) Gen Protein Lokalizace DFNA1 Diaphanous 5q31 DFNA2 Connexin 31 a KCNQ4 1p34 DFNA5 ICERE-1 7p15 DFNA8 alfa-tectorin 11q22-24 DFNA9 COCH 14q11-13 DFNA15 POU4F3 5q31 Autosomálně recesivní (DFNB) (příklady) Gen Protein Lokalizace DFNB1 Connexin 26 13q12.11 DFNB2 Myosin 7A 11q13 DFNB3 Myosin 15A 17p11.2 DFNB4 Pendrin 7q31 DFNB9 Otoferlin 2p23.1 DFNB  Connexin 26 - transmembránový protein - prelinguální, obvykle těžká nedoslýchavost - viz dále  Myosin 7A a 15A - motorická molekula - prelinguální těžká nedoslýchavost - snížená nebo chybějící funkce vestibulárního aparátu - alelická identita s Usherovým syndromem typu 1B  Pendrin - transportní protein aniontů - prelinguální s těžkým postižením vysokých frekvencí - dilatace aquaeductus vestibuli a ductus cochlearis - alelická identita s Pendredovým syndromem  Otoferlin - komponenta synapt. vesikulu - prelinguální, těžká nedoslýchavost - auditory neuropathy X-vázané recesivní (DFN) (příklady) Gen Protein Lokalizace DFN1 DDP Xq22 DFN3 POU3F4 Xq21 Connexin 26 Nejčastější nesyndromová geneticky podmíněná sluchová vada Celosvětový výskyt  50% AR případů vrozené nesyndromové hereditární sluchové vady způsobeno mutací 13q12.11 (DFNB1)  Gen GJB2 kóduje protein Connexin 26 (Cx26)  Popsáno 1997  Stacionární kongenitální percepční sluchové vady ???  Tíže vady je extrémně variabilní a nemůže být predikována  Výskyt mutace v genofondu evropské populace 1:30 – 1:60 Výskyt v ČR  V ČR bialelická mutace v GJB2 u 43% pacientů s kongenitální percepční sluchovou vadou – Euro-kavkazská populace: c.35delG (82,8%) – Romská populace: p.Trp24Stop (9,7%) – Aškenázové: p.del167T 13q11-12 Od páru bazí 20,761,601 po pár 20,767,113 http://ghr.nlm.nih.gov/gene/GJB2 upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb http://www.nature.com/nrn/journal/v1/n1/images/nrn1000_021a_f4.gif Cirkulace draslíku v kochlei OHC: apical transduction channel OHC-perilymfa: basolateral K+ channel (KCNQ4) Perilymfa-fibrocyty lig.spirale: GJB2, GJB3, GJB6 Intermediate bb.-intrastrial space: KCNJ10 – generuje EP Intrastrial space-marginal bb.: SLC12A2 Marginal bb-endolymfa: KCNQ1/KCNE1 http://fluidsresearch.com/~fluidsre/Joomla/images/stories/cochlea/CochleaTubeXSection.jpg Nejčastější syndromové geneticky podmíněné sluchové vady  Pendredův sy (75 : 100 000)  Goldenharův sy (17 : 100 000)  Charge (8 : 100 000)  Waardenburgův sy (5 : 100 000)  Usherův sy (4 : 100 000)  Treacher-Collins (2 : 100 000)  Alportův sy (0,5 : 100 000) Pendredův syndrom  Defektní gen SLC26A4  Produktem exprese tohoto genu je protein pendrin  Pendrin = přenašeč aniontů přes buněčnou stěnu  Vrozená porucha sluchu a později porucha funkce štítné žlázy  Typickými anomáliemi je rozšíření kanálku vestibulárního akvaduktu (EVA - enlarged vestibular aqueduct) a/nebo chybění posledního závitu hlemýždě, tzv. Mondiniho dysplázie. Pendredův syndrom  Defektní gen SLC26A4  Produktem exprese tohoto genu je protein pendrin  Pendrin = přenašeč aniontů přes buněčnou membránu  Vrozená porucha sluchu a později porucha funkce štítné žlázy  Typickými anomáliemi je rozšíření kanálku vestibulárního akvaduktu (EVA - enlarged vestibular aqueduct) a/nebo chybění posledního závitu hlemýždě, tzv. Mondiniho dysplázie. Goldenharův syndrom  předpokládá se kombinace genetických faktorů a zevních vlivů působících na dítě v děloze  deformace s narušeným vývojem nosu, očí, čelistí, rtů, měkkého patra a uší typicky na jedné polovině obličeje  často jsou přítomny rozštěpy patra, poruchy zraku a deformity páteře https://www.genetickesyndromy.sk/syndromy/goldenharov-syndrom/ Syndrom CHARGE  Coloboma of the eye  Heart defects  Atresia of the choanae  Retardation of the growth/development  Genital/urinal abnormalities  Ear abnormalities Syndrom CHARGE  Coloboma of the eye  Heart defects  Atresia of the choanae  Retardation of the growth/development  Genital/urinal abnormalities  Ear abnormalities https://www.chargeacrosseurope.com/cms/pages/pictures-charge-syndrome.php?lang=EN Waardenburgův syndrom  Typ I – IV  porucha sluchu  deformace obličeje  narušená pigmentace kůže, očí a vlasů Waardenburgův syndrom  Typ I – IV  porucha sluchu  deformace obličeje  narušená pigmentace kůže, očí a vlasů https://en.wikipedia.org/wiki/Waardenburg_syndrome https://www.medweiser.com/healthfeed/heterochromia-iridis/ Usherův syndrom  I – IV  I-III autosomálně recesivní IV vazba na X chromozom  Percepční nedoslýchavost + retinitis pigmentosa https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1155 3/figure/ch36clinicalerg.F12b/ Treacher Collins syndrom  genová mutace v TCOF1 genu na chromozomu 5q32-q33.1  zešikmené oči  zapadlá brada  orofaciální rozštěp dle stupně postižení (rozštěp patra, čelisti, rtu nebo kombinace), čelistní anomálie, mikrocie  Porucha sluchu Treacher Collins syndrom  genová mutace v TCOF1 genu na chromozomu 5q32-q33.1  zešikmené oči  zapadlá brada  orofaciální rozštěp dle stupně postižení (rozštěp patra, čelisti, rtu nebo kombinace), čelistní anomálie, mikrocie  Porucha sluchu https://cs.wikipedia.org/wiki/Treacher_Collins%C5%AFv_syndrom Alportův syndrom  Typicky mutace genu COL4A5 na X chromozomu  Výsledkem je defektní kolagen  Dědičnost může být X-vázaná, autosomálně recesivní i autosomálně dominantní  Progresivní porucha funkce ledvin – mikrohematurie, proteinurie, hypertenze, renální insuficience  Progresivní porucha sluchu – percepční nedoslýchavost  Porucha zraku – přední lentikonus, perimakulární hyperpigmentace Alportův syndrom  Typicky mutace genu COL4A5 na X chromozomu  Výsledkem je defektní kolagen  Dědičnost může být X-vázaná, autosomálně recesivní i autosomálně dominantní  Progresivní porucha funkce ledvin – mikrohematurie, proteinurie, hypertenze, renální insuficience  Progresivní porucha sluchu – percepční nedoslýchavost  Porucha zraku – přední lentikonus, perimakulární hyperpigmentace LEOPARD syndrom  Lentigines  Electrocardiographic conduction defects  Ocular hypertelorism  Pulmonary stenosis  Abnormalities of the genitalia  Retarded  Deafness  Autosomálně dominantní, více typů postižení, více genů LEOPARD syndrom  Lentigines  Electrocardiographic conduction defects  Ocular hypertelorism  Pulmonary stenosis  Abnormalities of the genitalia  Retarded  Deafness https://www.semanticscholar.org/paper/LEOPARD-Syndrome%3A-Clinical-Features-and-Gene-Mart%C3%ADnez-Quintana- Rodr%C4%B1%CC%81guez-Gonz%C3%A1lez/3932eb367c379e114a385bc1e79ab8c61ce9349e/figure/1 Klinické úvahy  Genetické x negenetické  Syndromální x nesyndromální  Prognóza (Pendredův sy, Alportův sy, Usherův sy ...)  Genetické riziko přenosu na potomstvo  Terapeutické možnosti (defekt CX26 vhodný pro CI, otoferlin problematický)  Vysvětlení příčiny postižení Možnosti genetického vyšetření  Viz přednáška paní prim.Gaillyová Význam informace pro indikaci kochleární implantace u malých dětí ??? Genetické riziko hluchoty při neznámé etiologii Postižený příbuzný Riziko Jediné dítě 1:10 Jedno dítě příbuzných rodičů 1:4 Dvě děti nepříbuzných rodičů 1:4 Jeden rodič + jedno dítě 1:2 Jeden rodič 1:20 Prarodiče ev. příbuzní 1:100 Příbuzní víc než 1:100 Literatura  Kelsell,D.P. et al.: Connexin 26 mutations in hereditary non-syndromic sensorineural deafness. Nature 387, 1997, 80-83  Kopp, P. et al: Pendred syndrome and iodide transport in the thyroid. Trends Endocrinol.Metab.TEM 19, 2008, 260-268  Lalani, S.R. et al: SEMA3E mutation in a patient with CHARGE syndrome. J.Med.Genet. 41, 2004, 94  Pourová, R.: Molekulárně genetická vyšetření u českých pacientů a rodin s vrozenou ztrátou sluchu a bez mutací v GJB2 genu. Disertační práce, 2014, 135s  Seeman, P. et al.: Spectrum and frequencies of mutations in th GJB2 (Cx26) gene among 156 Czech patients with pre-lingua deafness. Clin.Genet.66, 2004, 152-157  Smith, R.J. et al.: Non-syndromic hearing impairment: linkage and cloning. Int. J. Pediatr. Otorhinolaryngol. 491999, 159-163  Zelante,L. et al: Connexin26 mutations associated with the most common form of non-syndromic neurosensory autosomal recessive deafness (DFNB1) in Mediterraneans. Hum. Mol. Genet. 6, 1997, 1605-1609 Webové zdroje  http://www.dsch.univ.trieste.it  http://ghr.nlm.nih.gov/handbook/illustrations  http://library.thinkquest.org/C006188/basics/pictures  http://library.thinkquest.org/C004535/media  http://en.wikibooks.org/wiki/Human_Physiology/Genetics_and_inheritance  http://blog-di-j.blogspot.com/2007/09/effect-of-sequence-level-mutations-on.html  http://academic.brooklyn.cuny.edu  http://www.molecularstation.com/molecular-biology-images/500-member-galleries/65- gene  http://en.wikipedia.org/wiki/Gene  http://ghr.nlm.nih.gov/handbook/illustrations  http://commons.wikimedia.org/wiki/Image:Connexon_and_connexin_structure_cs.svg Děkuji za pozornost a otevírám diskusi